Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2023
Surfactant Proteins SP-B and SP-C in Pulmonary Surfactant Monolayers: Physical Properties Controlled by Specific Protein-Lipid Interactions
Liekkinen, J., Olzynska, A., Cwiklik, L., de la Serna, J. B., Vattulainen, I. & Javanainen, M., 28 maalisk. 2023, julkaisussa: Langmuir. 39, 12, s. 4338–4350 13 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2022
Accurate Simulations of Lipid Monolayers Require a Water Model with Correct Surface Tension
Tempra, C., Ollila, O. H. S. & Javanainen, M., 8 maalisk. 2022, julkaisussa: Journal of Chemical Theory and Computation. 18, 3, s. 1862-1869 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Ionic Strength and Solution Composition Dictate the Adsorption of Cell-Penetrating Peptides onto Phosphatidylcholine Membranes
Nguyen, M. T. H., Biriukov, D., Tempra, C., Baxova, K., Martinez-Seara, H., Evci, H., Singh, V., Sachl, R., Hof, M., Jungwirth, P., Javanainen, M. & Vazdar, M., 20 syysk. 2022, julkaisussa: Langmuir. 38, 37, s. 11284-11295 12 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
The Two Faces of the Liquid Ordered Phase
Schachter, I., Paananen, R. O., Fabian, B., Jurkiewicz, P. & Javanainen, M., 10 helmik. 2022, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry Letters. 13, 5, s. 1307-1313 7 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2021
Inverse Conformational Selection in Lipid-Protein Binding
Bacle, A., Buslaev, P., Garcia-Fandino, R., Favela-Rosales, F., Ferreira, T. M., Fuchs, P. F. J., Gushchin, I., Javanainen, M., Kiirikki, A. M., Madsen, J. J., Melcr, J., Rodriguez, P. M., Miettinen, M. S., Ollila, O. H. S., Papadopoulos, C. G., Peon, A., Piggot, T. J., Pineiro, A. & Virtanen, S., 1 syysk. 2021, julkaisussa: Journal of the American Chemical Society. 143, 34, s. 13701-13709 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2020
Pulmonary Surfactant Lipid Reorganization Induced by the Adsorption of the Oligomeric Surfactant Protein B Complex
Liekkinen, J., Enkavi, G., Javanainen, M., Olmeda, B., Pérez-Gil, J. & Vattulainen, I., 1 toukok. 2020, julkaisussa: Journal of Molecular Biology. 432, 10, s. 3251-3268 18 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Rotational Diffusion of Membrane Proteins in Crowded Membranes
Javanainen, M., Ollila, O. H. S. & Martinez-Seara, H., 16 huhtik. 2020, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry B. 124, 15, s. 2994-3001 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Understanding the Functional Properties of Lipid Heterogeneity in Pulmonary Surfactant Monolayers at the Atomistic Level
Liekkinen, J., de Santos Moreno, B., Paananen, R. O., Vattulainen, I., Monticelli, L., Bernardino de la Serna, J. & Javanainen, M., 16 marrask. 2020, julkaisussa: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 16 Sivumäärä, 581016.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2019
Crystalline Wax Esters Regulate the Evaporation Resistance of Tear Film Lipid Layers Associated with Dry Eye Syndrome
Paananen, R. O., Javanainen, M., Holopainen, J. M. & Vattulainen, I., 18 heinäk. 2019, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry Letters. 10, 14, s. 3893-3898 11 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Multiscale Simulations of Biological Membranes: The Challenge To Understand Biological Phenomena in a Living Substance
Enkavi, G., Javanainen, M., Kulig, W., Róg, T. & Vattulainen, I., 8 toukok. 2019, julkaisussa: Chemical Reviews. 119, 9, s. 5607-5774 168 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Reduced level of docosahexaenoic acid shifts GPCR neuroreceptors to less ordered membrane regions
Javanainen, M., Enkavi, G., Guixa-Gonzalez, R., Kulig, W., Martinez-Seara, H., Levental, I. & Vattulainen, I., toukok. 2019, julkaisussa: PLoS Computational Biology. 15, 5, 16 Sivumäärä, 1007033.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
The Devil Is in the Details: What Do We Really Track in Single-Particle Tracking Experiments of Diffusion in Biological Membranes?
Gurtovenko, A. A., Javanainen, M., Lolicato, F. & Vattulainen, I., 7 maalisk. 2019, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry Letters. 10, 5, s. 1005-1011 13 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2018
Arginine-rich cell-penetrating peptides induce membrane multilamellarity and subsequently enter via formation of a fusion pore
Allolio, C., Magarkar, A., Jurkiewicz, P., Baxova, K., Javanainen, M., Mason, P. E., Sachl, R., Cebecauer, M., Hof, M., Horinek, D., Heinz, V., Rachel, R., Ziegler, C. M., Schröfel, A. & Jungwirth, P., 20 marrask. 2018, julkaisussa: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 47, s. 11923-11928 6 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Atomistic model for nearly quantitative simulations of Langmuir monolayers
Javanainen, M., Lamberg, A., Cwiklik, L., Vattulainen, I. T. & Ollila, S., 20 helmik. 2018, julkaisussa: Langmuir. 34, 7, s. 2565–2572 8 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
How to minimize dye-induced perturbations while studying biomembrane structure and dynamics: PEG linkers as a rational alternative
Mobarak, E., Javanainen, M., Kulig, W., Honigmann, A., Sezgin, E., Aho, N., Eggeling, C., Rog, T. & Vattulainen, I., marrask. 2018, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Biomembranes. 1860, 11, s. 2436-2445 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Quantitative Assessment of Methods Used To Obtain Rate Constants from Molecular Dynamics Simulations-Translocation of Cholesterol across Lipid Bilayers
Filipe, H. A. L., Javanainen, M., Salvador, A., Galvao, A. M., Vattulainen, I., Loura, L. M. S. & Moreno, M. J., heinäk. 2018, julkaisussa: Journal of Chemical Theory and Computation. 14, 7, s. 3840-3848 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2017
Diffusion of Integral Membrane Proteins in Protein-Rich Membranes
Javanainen, M., Martinez-Seara, H., Metzler, R. & Vattulainen, I., 7 syysk. 2017, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry Letters. 8, 17, s. 4308-4313 6 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Excessive aggregation of membrane proteins in the Martini model
Javanainen, M., Martinez-Seara, H. & Vattulainen, I., 13 marrask. 2017, julkaisussa: PLoS One. 12, 11, 20 Sivumäärä, 0187936.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Long-chain GM1 gangliosides alter transmembrane domain registration through interdigitation
Manna, M., Javanainen, M., Monne, H. M-S., Gabius, H-J., Rog, T. & Vattulainen, I., toukok. 2017, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Biomembranes. 1859, 5, s. 870-878 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Nanoscale Membrane Domain Formation Driven by Cholesterol
Javanainen, M., Martinez-Seara, H. & Vattulainen, I., 25 huhtik. 2017, julkaisussa: Scientific Reports. 7, 10 Sivumäärä, 1143.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
The Effect of Membrane Polyunsaturated Fatty Acids on Receptor Partitioning to Ordered Domains
Javanainen, M., Enkavi, G., Guixa-Gonzalez, R., Kulig, W., Martinez-Seara, H. & Vattulainen, I., 3 helmik. 2017, julkaisussa: Biophysical Journal. 112, 3, Suppl. 1, s. 230A-231A 2 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiesitelmän abstrakti › vertaisarvioitu
-
The role of hydrophobic matching on transmembrane helix packing in cells
Grau, B., Javanainen, M., Jesús García-Murria, M., Kulig, W., Vattulainen, I. T., Mingarro, I. & Martinez-Gil, L., 2017, julkaisussa: Cell Stress. 1, 2, s. 90-106 17 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Two cations, two mechanisms: interactions of sodium and calcium with zwitterionic lipid membranes
Javanainen, M., Melcrova, A., Magarkar, A., Jurkiewicz, P., Hof, M., Jungwirth, P. & Martinez-Seara, H., 14 toukok. 2017, julkaisussa: Chemical Communications. 53, 39, s. 5380-5383 4 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2016
Molecular electrometer and binding of cations to phospholipid bilayers
Catte, A., Girych, M., Javanainen, M., Loison, C., Melcr, J., Miettinen, M. S., Monticelli, L., Maatta, J., Oganesyan, V. S., Ollila, O. H. S., Tynkkynen, J. & Vilov, S., 2016, julkaisussa: Physical Chemistry Chemical Physics. 18, 47, s. 32560-32569 10 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
On Atomistic Models for Molecular Oxygen
Javanainen, M., Vattulainen, I. T. & Monticelli, L., 2016, julkaisussa: Journal of Physical Chemistry B. 121, 3, s. 518–528 11 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu