Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

My background is in computer science and bioinformatics. I have a PhD degree in computer science from the University of Helsinki, where I defended my PhD thesis in 2009. I have worked in the Metapopulation Reserch Group (MRG) in 2010-2015. Currently I am working on the Saimaa ringed seal gemomics in Petri Auvinen's lab in the Institute of Biotechnology. My research interests include (population) genomics, linkage mapping and similar topics.

Keywords

  • 1181 Ekologia, evoluutiobiologia
  • 118 Biotieteet
  • Bioinformatics
  • 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Julkaisut 2005 2019

Kermit: Linkage map guided long read assembly

Walve, R., Rastas, P. & Salmela, L., 20 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Algorithms for Molecular Biology. 14, 1, 10 Sivumäärä, 8.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A Genome-Wide Association Study for Host Resistance to Ostreid Herpesvirus in Pacific Oysters (Crassostrea gigas)

Gutierrez, A. P., Bean, T. P., Hooper, C., Stenton, C. A., Sanders, M. B., Paley, R. K., Rastas, P., Bryrom, M., Matika, O. & Houston, R. D., huhtikuuta 2018, julkaisussa : G3 - Genes genomes genetics. 8, 4, s. 1273-1280 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

A High-Resolution Genetic Map for the Laboratory Rat

Littrell, J., Tsaih, S-W., Baud, A., Rastas, P., Solberg-Woods, L. & Flister, M. J., heinäkuuta 2018, julkaisussa : G3 - Genes genomes genetics. 8, 7, s. 2241-2248 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Bracketing phenogenotypic limits of mammalian hybridization

Savriama, Y., Valtonen, M., Kammonen, J. I., Rastas, P., Smolander, O-P., Lyyski, A., Häkkinen, T. J., Corfe, I. J., Gerber, S., Salazar-Ciudad, I., Paulin, L., Holm, L., Löytynoja, A., Auvinen, P. & Jernvall, J., 28 marraskuuta 2018, julkaisussa : Royal Society Open Science. 5, 11, 12 Sivumäärä, 180903.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Evolution at two time frames: Polymorphisms from an ancient singular divergence event fuel contemporary parallel evolution

Van Belleghem, S. M., Vangestel, C., De Wolf, K., De Corte, Z., Most, M., Rastas, P., De Meester, L. & Hendrickx, F., marraskuuta 2018, julkaisussa : PLoS Genetics. 14, 11, 26 Sivumäärä, 1007796.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto