Valokuva: Pekka Varmanen
  • PL 66 (Agnes Sjöbergin katu 2)

    00014

    Suomi

1994 …2020
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Our research is focused on molecular biology and functional genomics of non-pathogenic (dairy starters, probiotic lactobacilli, propionibacteria) and pathogenic bacteria (streptococci, staphylococci) that are adapted to food-environment.

We exploit gene and omics-level approaches combined with microbiological and biochemical analyses to study cell-physiology in beneficial and pathogenic bacteria in diverse food systems and materials. The ultimate goal of these research projects is to provide novel information to gain maximal benefit of beneficial bacteria as well as to combat pathogens in foods.

Tieteenalat

  • 416 Elintarviketieteet
  • 412 Kotieläintiede, maitotaloustiede
  • 1183 Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia
  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut 1994 2019

  • 59 Artikkeli
  • 3 Konferenssiartikkeli
  • 2 Kirjan luku tai artikkeli

Growth Mode and Carbon Source Impact the Surfaceome Dynamics of Lactobacillus rhamnosus GG

Savijoki, K., Nyman, T. A., Kainulainen, V., Miettinen, I., Siljamäki, P., Fallarero, A., Sandholm, J., Satokari, R. & Varmanen, P., 5 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Frontiers in Microbiology. 10, 17 Sivumäärä, 1272.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Acidipropionibacterium virtanenii sp. nov., isolated from malted barley

Deptula, P., Smolander, O-P. A., Laine, P. K. S., Roberts, R. J., Edelmann, J. M., Peltola, P., Piironen, V. I., Paulin, L. G., Storgårds, E., Savijoki, K., Laitila, A., Auvinen, P. O. V. & Varmanen, P. K., lokakuuta 2018, julkaisussa : International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 68, 10, s. 3175-3183 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

De novo assembly of genomes from long sequence reads reveals uncharted territories of Propionibacterium freudenreichii

Deptula, P., Laine, P. K., Roberts, R. J., Smolander, O-P., Vihinen, H., Piironen, V., Paulin, L., Jokitalo, E., Savijoki, K., Auvinen, P. & Varmanen, P., 16 lokakuuta 2017, julkaisussa : BMC Genomics. 18, 24 Sivumäärä, 790.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
Open access
Tiedosto

Genomics and Proteomics Provide New Insight into the Commensal and Pathogenic Lifestyles of Bovine- and Human-Associated Staphylococcus epidermidis Strains

Savijoki, K., Iivanainen, A., Siljamaki, P., Laine, P. K., Paulin, L., Karonen (os. Miettinen), T., Pyörälä, S., Kankainen, M., Nyman, T. A., Salomaki, T., Koskinen, P., Holm, L., Simojoki, H., Taponen, S., Sukura, A., Kalkkinen, N., Auvinen, P. & Varmanen, P., elokuuta 2014, julkaisussa : Journal of Proteome Research. 13, 8, s. 3748-3762 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Projektit 2004 2020

Aktiviteetit 2002 2018

Review of PhD-thesis

Pekka Varmanen (Esitarkastaja)
2018

Aktiviteetti: TutkimustyypitVäitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen

12th International Symposium on Lactic Acid Bacteria

Pekka Varmanen (Posteriesitys)
27 elokuuta 201731 elokuuta 2017

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Review of a research project -proposals

Pekka Varmanen (Osallistuja)
2017

Aktiviteetti: Muiden aktiviteettien tyypitMuu

Microbial biofilms: environmental, pharmaceutical, medical & industrial research in Finland

Pekka Varmanen (Puhuja: esitelmän pitäjä)
26 tammikuuta 2016

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Review of a research project -proposals

Pekka Varmanen (Osallistuja)
2016

Aktiviteetti: Muiden aktiviteettien tyypitTyypit: Muut aktiviteetit - Muut