DALI shines a light on remote homologs: one hundred discoveries

Holm, L., Laiho, A. H. T., Törönen, P. & Guedes Salgado, M. P., tammik. 2023, julkaisussa: Protein Science. 32, 1, 18 Sivumäärä, e4519.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Global analysis of aging-related protein structural changes uncovers enzyme-polymerization-based control of longevity

Paukštytė, J., López Cabezas, R. M., Feng, Y., Tong, K., Schnyder, D., Elomaa, E., Gregorova, P., Doudin, M., Särkkä, M., Sarameri, J., Lippi, A., Vihinen, H., Juutila, J., Nieminen, A., Törönen, P., Holm, L., Jokitalo, E., Krisko, A., Huiskonen, J., Sarin, L. P., & 4 muutaHietakangas, V., Picotti, P., Barral, Y. & Saarikangas, J., 21 syysk. 2023, julkaisussa: Molecular Cell. 83, 18, s. 3360-3376

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

The giant diploid faba genome unlocks variation in a global protein crop

Jayakodi, M., Golicz, A. A., Kreplak, J., Fechete, L. I., Angra, D., Bednář, P., Bornhofen, E., Zhang, H., Boussageon, R., Kaur, S., Cheung, K., Čížková, J., Gundlach, H., Hallab, A., Imbert, B., Keeble-Gagnère, G., Koblížková, A., Kobrlová, L., Krejčí, P., Mouritzen, T. W., & 34 muutaNeumann, P., Nadzieja, M., Nielsen, L. K., Novák, P., Orabi, J., Padmarasu, S., Robertson-Shersby-Harvie, T., Robledillo, L. Á., Schiemann, A., Tanskanen, J., Törönen, P., Warsame, A. O., Wittenberg, A. H. J., Himmelbach, A., Aubert, G., Courty, P. E., Doležel, J., Holm, L. U., Janss, L. L., Khazaei, H., Macas, J., Mascher, M., Smýkal, P., Snowdon, R. J., Stein, N., Stoddard, F. L., Stougaard, J., Tayeh, N., Torres, A. M., Usadel, B., Schubert, I., O’Sullivan, D. M., Schulman, A. H. & Andersen, S. U., 8 maalisk. 2023, julkaisussa: Nature. 615, 7953, s. 652-659 27 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Novel split quality measures for stratified multilabel cross validation with application to large and sparse gene ontology datasets

Tiittanen, H. E., Holm, L. & Törönen, P., 1 tammik. 2022, julkaisussa: Applied computing and intelligence. 2, 1, s. 49-62

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Optimizing InterProScan representation generates a surprisingly good protein function prediction method

Tiittanen, H. E., Holm, L. & Törönen, P., 26 elok. 2022, (Hyväksytty/In press) julkaisussa: bioRxiv : the preprint server for biology .

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen