Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Julkaisut 2011 2019

Suodatin
Artikkeli
2019

Candidate susceptibility variants in angioimmunoblastic T-cell lymphoma

Donner, I., Katainen, R., Kaasinen, E., Aavikko, M., Sipilä, L. J., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., tammikuuta 2019, julkaisussa : Familial Cancer. 18, 1, s. 113-119 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Exome and immune cell score analyses reveal great variation within synchronous primary colorectal cancers

Hanninen, U. A., Wirta, E-V., Katainen, R., Tanskanen, T., Hamberg, J., Taipale, M., Böhm, J., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Forsström, L. M., Pitkänen, E., Palin, K., Seppälä, T. T., Mäkinen, N., Mecklin, J-P. & Aaltonen, L. A., 30 huhtikuuta 2019, julkaisussa : British Journal of Cancer. 120, 9, s. 922-930 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Impact of constitutional TET2 haploinsufficiency on molecular and clinical phenotype in humans

Kaasinen, E., Kuismin, O., Rajamäki, K., Ristolainen, H., Aavikko, M., Kondelin, J., Saarinen, S., Berta, D. G., Katainen, R., Hirvonen, E. A. M., Karhu, A., Taira, A., Tanskanen, T., Alkodsi, A., Taipale, M., Morgunova, E., Franssila, K., Lehtonen, R., Mäkinen, M., Aittomäki, K. & 15 muutaPalotie, A., Kurki, M., Pietiläinen, O., Hilpert, M., Saarentaus, E., Niinimäki, J., Junttila, J., Kaikkonen, K., Vahteristo, P., Skoda, R. C., Seppänen, M. R. J., Eklund, K. K., Taipale, J., Kilpivaara, O. & Aaltonen, L. A., 19 maaliskuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 17 Sivumäärä, 1252.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Retrotransposon insertions can initiate colorectal cancer and are associated with poor survival

Cajuso, T., Sulo, P., Tanskanen, T., Katainen, R., Taira, A., Hanninen, U. A., Kondelin, J., Forsstrom, L., Valimaki, N., Aavikko, M., Kaasinen, E., Ristimaki, A., Koskensalo, S., Lepisto, A., Renkonen-Sinisalo, L., Seppala, T., Kuopio, T., Bohm, J., Mecklin, J-P., Kilpivaara, O. & 3 muutaPitkanen, E., Palin, K. & Aaltonen, L. A., 6 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 9 Sivumäärä, 4022.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Comprehensive evaluation of coding region point mutations in microsatellite-unstable colorectal cancer

Kondelin, J., Salokas, K., Saarinen, L., Ovaska, K., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M., Hamberg, J., Liu, X., Yadav, L., Gylfe, A. E., Cajuso, T., Hänninen, U. A., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Tanskanen, T., Aavikko, M., Taipale, M., Taipale, J. & 17 muutaRenkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Koskensalo, S., Böhm, J., Mecklin, J-P., Ongen, H., Dermitzakis, E. T., Kilpivaara, O., Vahteristo, P., Turunen, M., Hautaniemi, S., Tuupanen, S., Karhu, A., Välimäki, N., Varjosalo, M., Pitkänen, E. & Aaltonen, L. A., 2018, julkaisussa : EMBO molecular medicine. 10, 9, 20 Sivumäärä, e8552.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer

Palin, K., Pitkänen, E., Turunen, M., Sahu, B., Pihlajamaa, P., Kivioja, T., Kaasinen, E., Välimäki, N., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Aavikko, M., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., van den Berg, L., Kondelin, J., Tanskanen, T., Katainen, R., Grau, M., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M. & 20 muutaTaira, A., Sulo, P., Hartonen, T., Dave, K., Schmierer, B., Botla, S., Sokolova, M., Vähärautio, A., Gladysz, K., Ongen, H., Dermitzakis, E., Bramsen, J. B., Orntoft, T. F., Andersen, C. L., Ristimäki, A., Lepistö, A., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Taipale, J. & Aaltonen, L. A., 10 syyskuuta 2018, julkaisussa : Nature Communications. 9, 9 Sivumäärä, 3664.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Discovery of potential causative mutations in human coding and noncoding genome with the interactive software BasePlayer

Katainen, R., Donner, I., Cajuso, T., Kaasinen, E., Palin, K., Mäkinen, V., Aaltonen, L. A. & Pitkänen, E., marraskuuta 2018, julkaisussa : Nature Protocols. 13, 11, s. 2580-2600 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Exome-wide somatic mutation characterization of small bowel adenocarcinoma

Hänninen, U. A., Katainen, R., Tanskanen, T., Plaketti, R-M., Laine, R., Hamberg, J., Ristimäki, A., Pukkala, E., Taipale, M., Mecklin, J-P., Forsström, L. M., Pitkänen, E., Palin, K., Välimäki, N., Mäkinen, N. & Aaltonen, L. A., maaliskuuta 2018, julkaisussa : PLoS Genetics. 14, 3, 23 Sivumäärä, 1007200.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Germline mutations in young non-smoking women with lung adenocarcinoma

Donner, I., Katainen, R., Sipilä, L. J., Aavikko, M., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., elokuuta 2018, julkaisussa : Lung Cancer. 122, s. 76-82 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

Candidate susceptibility variants for esophageal squamous cell carcinoma

Donner, I., Katainen, R., Tanskanen, T., Kaasinen, E., Aavikko, M., Ovaska, K., Artama, M., Pukkala, E. & Aaltonen, L. A., kesäkuuta 2017, julkaisussa : Genes, Chromosomes & Cancer. 56, 6, s. 453-459 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Comprehensive Evaluation of Protein Coding Mononucleotide Microsatellites in Microsatellite-Unstable Colorectal Cancer

Kondelin, J., Gylfe, A. E., Lundgren, S., Tanskanen, T., Hamberg, J., Aavikko, M., Palin, K., Ristolainen, H., Katainen, R., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Jarvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Aaltonen, L. A. & Pitkanen, E., 1 elokuuta 2017, julkaisussa : Cancer Research. 77, 15, s. 4078-4088 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Detection of subclonal L1 transductions in colorectal cancer by long-distance inverse-PCR and Nanopore sequencing

Pradhan, B., Cajuso, T., Katainen, R., Sulo, P., Tanskanen, T., Kilpivaara, O., Pitkanen, E., Aaltonen, L. A., Kauppi, L. & Palin, K., 6 marraskuuta 2017, julkaisussa : Scientific Reports. 7, 12 Sivumäärä, 14521.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Systematic Analysis of Human Protein Phosphatase Interactions and Dynamics

Yadav, L., Tamene, F., Goos, H., van Drogen, A., Katainen, R., Aebersold, R., Gstaiger, M. & Varjosalo, M., 26 huhtikuuta 2017, julkaisussa : Cell Systems. 4, 4, s. 430-+ 20 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

AIP inactivation leads to pituitary tumorigenesis through defective G alpha(i)-cAMP signaling

Tuominen, I., Heliovaara, E., Raitila, A., Rautiainen, M-R., Mehine, M., Katainen, R., Donner, I., Aittomaki, V., Lehtonen, H. J., Ahlsten, M., Kivipelto, L., Schalin-Jantti, C., Arola, J., Hautaniemi, S. & Karhu, A., 26 helmikuuta 2015, julkaisussa : Oncogene. 34, 9, s. 1174-1184 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Autoimmunity, hypogammaglobulinemia, lymphoproliferation, and mycobacterial disease in patients with activating mutations in STAT3

Haapaniemi, E. M., Kaustio, M., Rajala, H. L. M., van Adrichem, A. J., Kainulainen, L., Glumoff, V., Doffinger, R., Kuusanmaki, H., Heiskanen-Kosma, T., Trotta, L., Chiang, S., Kulmala, P., Eldfors, S., Katainen, R., Siitonen, S., Karjalainen-Lindsberg, M-L., Kovanen, P. E., Otonkoski, T., Porkka, K., Heiskanen, K. & 7 muutaHanninen, A., Bryceson, Y. T., Uusitalo-Seppala, R., Saarela, J., Seppanen, M., Mustjoki, S. & Kere, J., 22 tammikuuta 2015, julkaisussa : Blood. 125, 4, s. 639-648 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Clonally related uterine leiomyomas are common and display branched tumor evolution

Mehine, M., Heinonen, H-R., Sarvilinna, N., Pitkanen, E., Makinen, N., Katainen, R., Tuupanen, S., Butzow, R., Sjoberg, J. & Aaltonen, L. A., 1 elokuuta 2015, julkaisussa : Human Molecular Genetics. 24, 15, s. 4407-4416 10 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

CTCF/cohesin-binding sites are frequently mutated in cancer

Katainen, R., Dave, K., Pitkänen, E., Palin, K., Kivioja, T., Valimaki, N., Gylfe, A. E., Ristolainen, H., Hanninen, U. A., Cajuso, T., Kondelin, J., Tanskanen, T., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Lepisto, A., Kaasinen, E., Kilpivaara, O., Tuupanen, S., Enge, M. & 2 muutaTaipale, J. & Aaltonen, L. A., 1 heinäkuuta 2015, julkaisussa : Nature Genetics. 47, 7, s. 818-+

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Systematic search for rare variants in Finnish early-onset colorectal cancer patients

Tanskanen, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Bohm, J., Kilpivaara, O., Pitkanen, E., Palin, K., Vahteristo, P., Tuupanen, S. & Aaltonen, L. A., 2015, julkaisussa : Cancer Genetics. 208, 1-2, s. 35-U100 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2014

Exome sequencing reveals frequent inactivating mutations in ARID1A, ARID1B, ARID2 and ARID4A in microsatellite unstable colorectal cancer

Julkaisun otsikon käännös: Exome sequencing reveals frequent inactivating mutations in ARID1A, ARID1B, ARID2 and ARID4A in microsatellite unstable colorectal cancerCajuso Pons, T., Hänninen, U. A., Kondelin, J., Gylfe, A. E., Tanskanen, T., Katainen, R., Pitkanen, E., Ristolainen, H., Kaasinen, E., Taipale, M., Taipale, J., Bohm, J., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Jarvinen, H., Tuupanen, S., Kilpivaara, O. & Vahteristo, P., 1 elokuuta 2014, julkaisussa : International Journal of Cancer. 135, 3, s. 611-623 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Frequent L1 retrotranspositions originating from TTC28 in colorectal cancer

Pitkanen, E., Cajuso Pons, T., Katainen, R., Kaasinen, E., Valimaki, N., Palin, K., Taipale, J., Aaltonen, L. A. & Kilpivaara, O., 2014, julkaisussa : Oncotarget. 5, 3, s. 853-859 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of 33 candidate oncogenes by screening for base-specific mutations

Tuupanen, S., Hanninen, U. A., Kondelin, J., von Nandelstadh, P., Cajuso, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Tanskanen, T., Ristolainen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Renkonen-Sinisalo, L., Andersen, C. L., Taipale, M., Taipale, J., Vahteristo, P., Lehti, K., Pitkanen, E. & Aaltonen, L. A., 14 lokakuuta 2014, julkaisussa : British Journal of Cancer. 111, 8, s. 1657-1662 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The Glanville fritillary genome retains an ancient karyotype and reveals selective chromosomal fusions in Lepidoptera

Ahola, V., Lehtonen, R., Somervuo, P., Salmela, L., Koskinen, P., Rastas, P., Valimaki, N., Paulin, L., Kvist, J., Wahlberg, N., Tanskanen, J., Hornett, E. A., Ferguson, L. C., Luo, S., Cao, Z., de Jong, M. A., Duplouy, A., Smolander, O-P., Vogel, H., McCoy, R. C. & 27 muutaQian, K., Wong, S. C., Zhang, Q., Ahmad, F., Haukka, J. K., Joshi, A., Salojarvi, J., Wheat, C. W., Grosse-Wilde, E., Hughes, D., Katainen, R., Pitkanen, E., Ylinen, J., Waterhouse, R. M., Turunen, M., Vaharautio, A., Ojanen, S. P., Schulman, A. H., Taipale, M., Lawson, D., Ukkonen, E., Makinen, V., Goldsmith, M. R., Holm, L., Auvinen, P., Frilander, M. J. & Hanski, I., syyskuuta 2014, julkaisussa : Nature Communications. 5, 9 Sivumäärä, 4737.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2013

Characterization of Uterine Leiomyomas by Whole-Genome Sequencing

Mehine, M., Kaasinen, E., Mäkinen, N., Katainen, R., Kämpjärvi, K., Pitkänen, E., Heinonen, H-R., Butzow, R., Kilpivaara, O., Kuosmanen, A., Ristolainen, H., Gentile, M., Sjöberg, J., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 4 heinäkuuta 2013, julkaisussa : New England Journal of Medicine. 369, 1, s. 43-53 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Eleven Candidate Susceptibility Genes for Common Familial Colorectal Cancer

Gylfe, A. E., Katainen, R., Kondelin, J., Tanskanen, T., Cajuso Pons, T., Hänninen, U., Taipale, J., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Kilpivaara, O., Pitkänen, E., Vahteristo, P., Tuupanen, S., Karhu, A. & Aaltonen, L. A., 18 lokakuuta 2013, julkaisussa : PLoS Genetics. 9, 10, 8 Sivumäärä, e1003876.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Exome sequencing in diagnostic evaluation of colorectal cancer predisposition in young patients

Tanskanen, T., Gylfe, A. E., Katainen, R., Taipale, M., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Järvinen, H., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., kesäkuuta 2013, julkaisussa : Scandinavian Journal of Gastroenterology. 48, 6, s. 672-678 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of Candidate Oncogenes in Human Colorectal Cancers With Microsatellite Instability

Gylfe, A. E., Kondelin, J., Turunen, M., Ristolainen, H., Katainen, R., Pitkänen, E., Kaasinen, E., Rantanen, V., Tanskanen, T., Varjosalo, M., Lehtonen, H., Palin, K., Taipale, M., Taipale, J., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Bohm, J., Mecklin, J-P., Ristimäki, A., Kilpivaara, O. & 4 muutaTuupanen, S., Karhu, A., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., syyskuuta 2013, julkaisussa : Gastroenterology. 145, 3, s. 540-+ 26 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Primary mediastinal large B-cell lymphoma segregating in a family: exome sequencing identifies MLL as a candidate predisposition gene

Saarinen, S., Kaasinen, E., Karjalainen-Lindsberg, M., Vesanen, K., Aavikko, M., Katainen, R., Taskinen, M., Kytola, S., Leppä, S. M., Hietala, M., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 25 huhtikuuta 2013, julkaisussa : Blood. 121, 17, s. 3428-3430 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2011

MED12, the Mediator Complex Subunit 12 Gene, Is Mutated at High Frequency in Uterine Leiomyomas

Mäkinen, N., Mehine, M., Tolvanen, J., Kaasinen, E., Li, Y., Lehtonen, H. J., Gentile, M., Yan, J., Enge, M., Taipale, M., Aavikko, M., Katainen, R., Virolainen, E., Böhling, T., Koski, T. A., Launonen, V., Sjöberg, J., Taipale, J., Vahteristo, P. & Aaltonen, L. A., 2011, julkaisussa : Science Progress. 334, 6053, s. 252-255 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu