19962019
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Julkaisut 1996 2019

2019

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Menden, M. P., Wang, D., Mason, M. J., Szalai, B., Bulusu, K. C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B. S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F. S., Al-lazikani, B., Alam, T. & 280 muuta, Allam, A., Allen, C., de Almeida, M. P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A. A., Ash, J. R., Aznar, V. R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P. J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K. A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M. D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D. V., Dang, C. C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H. B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A. O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A. B. K., Fotso, D. C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J. M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L. S., Hellton, K. H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M. R., Hidru, D., Hill, S. M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y-C., Hu, Z., Huang, J. K., Huang, R. S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T. H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O. B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P. J., Kanev, G. K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A. M., Khan, S. A., Kiani, N. A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P. D. W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A. J., Kuenemann, M. A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y. W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W. K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D. D., Malpartida, A. B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R. A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M. V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C. D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M. A., Ramnarine, R., Reid, J. E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J. R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J. A., Serra, J., Shang, M-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I. F., Soerensen, P., Song, J-H., Song, S. O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S. P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S. A. M., Tran, H., Troyer, E. D., Truong, A., Tsunoda, T., Turu, G., Tzeng, G-Y., Verbeke, L., Videla, S. & Consortium, A-S. D. C. DREAM., 17 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 17 Sivumäärä, 2674.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Integrating neurophysiologic relevance feedback in intent modeling for information retrieval

Jacucci, G., Barral, O., Daee, P., Wenzel, M., Serim, B., Ruotsalo, T., Pluchino, P., Freeman, J., Gamberini, L., Kaski, S. & Blankertz, B., syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Association for Information Science and Technology. 70, 9, s. 917-930 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
Open access
Tiedosto

Representation transfer for differentially private drug sensitivity prediction

Niinimäki, T., Heikkilä, M. A., Honkela, A. & Kaski, S., 5 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i218-i224 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Improving genomics-based predictions for precision medicine through active elicitation of expert knowledge

Sundin, I., Peltola, T., Micallef, L., Afrabandpey, H., Soare, M., Majumder, M. M., Daee, P., He, C., Serim, B., Havulinna, A., Heckman, C., Jacucci, G., Marttinen, P. & Kaski, S., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. 395-403 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Interactive Intent Modeling for Exploratory Search

Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M. J. A., Glowacka, D., Floréen, P., Myllymäki, P., Jacucci, G. & Kaski, S., lokakuuta 2018, julkaisussa : ACM Transactions on Information Systems. 36, 4, s. 44:1-46 46 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Likelihood-free inference via classification

Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Statistics and Computing. 28, 2, s. 411-425 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Method and apparatus for information retrieval

Eugster, M., Ruotsalo, T., Sovijärvi-Spapé, M., Jacucci, G., Kaski, S., Ravaja, N. & Barral, O., 2018, Google Patents, Patenttinumero US20180082017A1

Tutkimustuotos: Patentti

2017

A Community Challenge for Inferring Genetic Predictors of Gene Essentialities through Analysis of a Functional Screen of Cancer Cell Lines

Gönen, M., Weir, B. A., Cowley, G. S., Vazquez, F., Guan, Y., Jaiswal, A., Karasuyama, M., Uzunangelov, V., Wang, T., Tsherniak, A., Howell, S., Marbach, D., Hoff, B., Norman, T. C., Airola, A., Bivol, A., Bunte, K., Carlin, D., Chopra, S., Deran, A. & 26 muuta, Ellrott, K., Gopalacharyulu, P., Graim, K., Kaski, S., Khan, S. A., Newton, Y., Ng, S., Pahikkala, T., Paull, E., Sokolov, A., Tang, H., Tang, J., Wennerberg, K., Xie, Y., Zhan, X., Zhu, F., Aittokallio, T., Mamitsuka, H., Stuart, J. M., Boehm, J. S., Root, D. E., Xiao, G., Stolovitzky, G., Hahn, W. C., Margolin, A. A. & Broad-DREAM Community, 22 marraskuuta 2017, julkaisussa : Cell Systems. 5, 5, s. 485-+ 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A transcriptomics data-driven gene space accurately predicts liver cytopathology and drug-induced liver injury

Kohonen, P., Parkkinen, J. A., Willighagen, E. L., Ceder, R., Wennerberg, K., Kaski, S. & Grafstrom, R. C., 3 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 15 Sivumäärä, 15932.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

BCI for physiological text annotation

Barral, O., Kosunen, I., Ruotsalo, T., Spapé, M. M., Eugster, M. J. A., Ravaja, N., Kaski, S. & Jacucci, G., 13 maaliskuuta 2017, Proceedings of the 2017 ACM Workshop on An Application-oriented Approach to BCI out of the laboratory. New York, NY: ACM, s. 9-13 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Differentially private Bayesian learning on distributed data

Heikkila, M., Lagerspetz, E., Kaski, S., Shimizu, K., Tarkoma, S. & Honkela, A., 2017, Advances in Neural Information Processing Systems 30 (NIPS 2017). Guyon, I., Luxburg, U. V., Bengio, S., Wallach, H., Fergus, R., Vishwanathan, S. & Garnett, R. (toim.). NEURAL INFORMATION PROCESSING SYSTEMS (NIPS), Vuosikerta 30. 10 Sivumäärä (Advances in Neural Information Processing Systems; Vuosikerta 30).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fundamentals and Recent Developments in Approximate Bayesian Computation

Lintusaari, J., Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., tammikuuta 2017, julkaisussa : Systematic Biology. 66, 1, s. E66-E82 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Interactive Elicitation of Knowledge on Feature Relevance Improves Predictions in Small Data Sets

Micallef, L., Sundin, I., Marttinen, P., Ammad-ud-din, M., Peltola, T., Soare, M., Jacucci, G. & Kaski, S., 2017, Proceedings of the 22nd International Conference on Intelligent User Interfaces (IUI '17). ACM

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Low-dimensional information discovery and presentation system, apparatus and method

Ruotsalo, T. J., Peltonen, J. T., Eugster, M. J. A., Myllymäki, P. J., Jacucci, G., Kaski, S. & Glowacka, D., 1 lokakuuta 2017, Google Patents, Patenttinumero US9798780B2

Tutkimustuotos: Patentti

MediSyn: uncertainty-aware visualization of multiple biomedical datasets to support drug treatment selection

He, C., Micallef, L., Tanoli, Z-R., Kaski, S., Aittokallio, T. & Jacucci, G., 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 12 Sivumäärä, 393.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

Crowdsourced assessment of common genetic contribution to predicting anti-TNF treatment response in rheumatoid arthritis

Sieberts, S. K., Zhu, F., Garcia-Garcia, J., Stahl, E., Pratap, A., Pandey, G., Pappas, D., Aguilar, D., Anton, B., Bonet, J., Eksi, R., Fornes, O., Guney, E., Li, H., Marin, M. A., Panwar, B., Planas-Iglesias, J., Poglayen, D., Cui, J., Falcao, A. O. & 31 muuta, Suver, C., Hoff, B., Balagurusamy, V. S. K., Dillenberger, D., Neto, E. C., Norman, T., Aittokallio, T., Ammad-ud-din, M., Azencott, C-A., Bellon, V., Boeva, V., Bunte, K., Chheda, H., Cheng, L., Corander, J., Dumontier, M., Goldenberg, A., Gopalacharyulu, P., Hajiloo, M., Hidru, D., Jaiswal, A., Kaski, S., Khalfaoui, B., Khan, S. A., Kramer, E. R., Marttinen, P., Pirinen, M., Saarela, J., Tang, J., Wennerberg, K. & Rheumatoid Arth Challenge, elokuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 9 Sivumäärä, 12460.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Drug response prediction by inferring pathway-response associations with kernelized Bayesian matrix factorization

Ammad-ud-din, M., Khan, S. A., Malani, D., Murumägi, A., Kallioniemi, O., Aittokallio, T. & Kaski, S., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 17, s. 455-463 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Extracting relevance and affect information from physiological text annotation

Barral Mery de Bellegarde, O., Kosunen, I. J., Ruotsalo, T., Spapé, M., Eugster, M., Ravaja, J. N., Kaski, S. J. I. & Jacucci, G., 2016, julkaisussa : User Modeling and User-Adapted Interaction. 26, 5, s. 493-520 28 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Interactive Intent Modeling from Multiple Feedback Domains

Pyykkö, J., Kaski, S., Glowacka, D. & Daee, P., 7 maaliskuuta 2016, Proceedings of the 21st International Conference on Intelligent User Interfaces. New York, NY: ACM, Association for Computing Machinery, s. 71-75 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Natural brain-information interfaces: Recommending information by relevance inferred from human brain signals

Eugster, M. J. A., Ruotsalo, T., Spape, M. M., Barral, O., Ravaja, N., Jacucci, G. & Kaski, S., 8 joulukuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 10 Sivumäärä, 38580.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

On the Identifiability of Transmission Dynamic Models for Infectious Diseases

Lintusaari, J., Gutmann, M. U., Kaski, S. & Corander, J., maaliskuuta 2016, julkaisussa : Genetics. 202, 3, s. 911-918 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

Advances in Independent Component Analysis and Learning Machines

Bingham, E. E. (toim.), Kaski, S. J. I. (toim.), Laaksonen, J. (toim.) & Lampinen, J. (toim.), 2015, Amsterdam: Elsevier Scientific Publ. Co. 296 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Kirja/raporttiKokoomateos tai erikoisnumero

Developing a Symbiotic System for Scientific Information Seeking: The MindSee Project

Gamberini, L., Spagnolli, A., Blankertz, B., Kaski, S., Freeman, J., Acqualagna, L., Barral, O., Bellio, M., Chech, L., Eugster, M., Ferrari, E., Negri, P., Orso, V., Pluchino, P., Minelle, F., Serim, B., Wenzel, M. & Jacucci, G., 2015, Symbiotic Interaction : 4th International Workshop, Symbiotic 2015 Berlin, Germany, October 7–8, 2015 Proceedings. Blankertz, B., Jacucci, G., Gamberini, L., Spagnolli, A. & Freeman, J. (toim.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 68-80 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 9359).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Exploring Peripheral Physiology As a Predictor of Perceived Relevance in Information Retrieval

Barral, O., Eugster, M. J. A., Ruotsalo, T., Spapé, M. M., Kosunen, I., Ravaja, N., Kaski, S. & Jacucci, G., 2015, Proceedings of the 20th International Conference on Intelligent User Interfaces. Atlanta, Georgia, USA: ACM, s. 389-399 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Group Factor Analysis

Klami, A., Virtanen, S., Leppäaho, E. & Kaski, S., syyskuuta 2015, julkaisussa : IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems. 26, 9, s. 2136-2147 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Improving controllability and predictability of interactive recommendation interfaces for exploratory search

Kangasrääsiö, A., Głowacka, D. & Kaski, S., 2015, IUI '15 Proceedings of the 20th International Conference on Intelligent User Interfaces . New York, NY: ACM , s. 247-251 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Interactive intent modeling: Information discovery beyond search

Ruotsalo, T., Jacucci, G., Myllymäki, P. & Kaski, S., tammikuuta 2015, julkaisussa : Communications of the ACM. 58, 1, s. 86-92 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Majorization-Minimization for Manifold Embedding

Yang, Z., Peltonen, J. T. & Kaski, S. J. I., 10 toukokuuta 2015, Proceedings of the Eighteenth International Conference on Artificial Intelligence and Statistics. Lebanon, G. & Vishwanathan, S. V. N. (toim.). Cambridge, MA: Journal of Machine Learning Research, s. 1088-1097 10 Sivumäärä (JMLR: Workshop and Conference Proceedings series; Vuosikerta 38).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Predicting Relevance of Text from Neuro-Physiology

Eugster, M., Ruotsalo, T., Spape, M., Kosunen, I. J., Barral Mery de Bellegarde, O., Ravaja, J. N., Jacucci, G. & Kaski, S. J. I., 2015, Unknown host publication. 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

SciNet: Interactive Intent Modeling for Information Discovery

Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M. JA., Glowacka, D., Reijonen, A., Jacucci, G., Myllymäki, P. & Kaski, S., 2015, Proceedings of the 38th International ACM SIGIR Conference on Research and Development in Information Retrieval, Santiago, Chile, August 9-13, 2015. New York, NY: ACM, s. 1043-1044 2 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Towards brain-activity-controlled information retrieval: Decoding image relevance from MEG signals

Kauppi, J-P., Kandemir, M., Saarinen, V-M., Hirvenkari, L., Parkkonen, L., Klami, A., Hari, R. & Kaski, S., 15 toukokuuta 2015, julkaisussa : NeuroImage. 112, s. 288-298 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2014

A community effort to assess and improve drug sensitivity prediction algorithms

Costello, J. C., Heiser, L. M., Georgii, E., Gonen, M., Menden, M. P., Wang, N. J., Bansal, M., Ammad-ud-din, M., Hintsanen, P., Khan, S. A., Mpindi, J-P., Kallioniemi, O., Honkela, A., Aittokallio, T., Wennerberg, K., Collins, J. J., Gallahan, D., Singer, D., Saez-Rodriguez, J., Kaski, S. & 3 muuta, Gray, J. W., Stolovitzky, G. & NCI DREAM Community, joulukuuta 2014, julkaisussa : Nature Biotechnology. 32, 12, s. 1202-U57 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Assessing multivariate gene-metabolome associations with rare variants using Bayesian reduced rank regression

Julkaisun otsikon käännös: Assessing multivariate gene-metabolome associations with rare variants using Bayesian reduced rank regressionMarttinen, P., Pirinen, M., Sarin, A-P., Gillberg, J., Kettunen, J., Surakka, I., Kangas, A. J., Soininen, P., O'Reilly, P., Kaakinen, M., Kahonen, M., Lehtimaki, T., Ala-Korpela, M., Raitakari, O. T., Salomaa, V., Jarvelin, M-R., Ripatti, S. & Kaski, S., 15 heinäkuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 14, s. 2026-2034 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Bayesian multi-view tensor factorization

Khan, S. A. & Kaski, S., 2014, Machine Learning and Knowledge Discovery in Databases: European Conference, ECML PKDD 2014, Nancy, France, September 15-19, 2014. Proceedings. Calders, T., Esposito, F., Hüllermeier, E. & Meo, R. (toim.). Heidelberg: Springer-Verlag, Vuosikerta 1. s. 656-671 16 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 8724).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Computational statistics approaches to study metabolic syndrome

Huopaniemi, I. & Kaski, S., 2014, A systems biology approach to study metabolic syndrome. Orešic, M. & Vidal-Puig, A. (toim.). Dordrecht: Springer, s. 319-339 21 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKirjan luku tai artikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cross-organism toxicogenomics with group factor analysis

Suvitaival, T., Parkkinen, J., Virtanen, S. & Kaski, S., 2014, julkaisussa : Systems Biomedicine. 2, 4, s. 71-80 10 Sivumäärä, e29291.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Exploration and retrieval of whole-metagenome sequencing samples

Seth, S., Valimaki, N., Kaski, S. & Honkela, A., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 17, s. 2471-2479 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of structural features in chemicals associated with cancer drug response: a systematic data-driven analysis

Khan, S. A., Virtanen, S., Kallioniemi, O. P., Wennerberg, K., Poso, A. & Kaski, S., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 17, s. I497-I504 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Integrative and Personalized QSAR Analysis in Cancer by Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Amnnad-ud-din, M., Georgii, E., Gonen, M., Laitinen, T., Kallioniemi, O., Wennerberg, K., Poso, A. & Kaski, S., elokuuta 2014, julkaisussa : Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2347-2359 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Intentradar: search user interface that anticipates user's search intents

Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M., Glowacka, D., Reijonen, A., Jacucci, G., Myllymäki, P. & Kaski, S., 2014, CHI EA '14 CHI '14 Extended Abstracts on Human Factors in Computing Systems . New York: ACM, s. 455-458 4 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Gönen, M. & Kaski, S., lokakuuta 2014, julkaisussa : IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 36, 10, s. 2047-2060 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Multi-task and multi-view learning of user state

Kandemir, M., Vetek, A., Gönen, M., Klami, A. & Kaski, S., 2 syyskuuta 2014, julkaisussa : Neurocomputing. 139, s. 97-106

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Optimal Neighborhood Preserving Visualization by Maximum Satisfiability

Bunte, K., Järvisalo, M., Berg, O., Myllymäki, P., Peltonen, J. & Kaski, S., 2014, Proceedings of the 28th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI 2014). Brodley, C. E. & Stone, P. (toim.). AAAI Press, s. 1694-1700 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Optimization Equivalence of Divergences Improves Neighbor Embedding

Yang, Z., Peltonen, J. & Kaski, S., 2014, Proceedings of ICML 2014, the 31st International Conference on Machine Learning. Xing, E. P. & Jebara, T. (toim.). Journal of Machine Learning Research, s. 460-468 9 Sivumäärä (JMLR Workshop and Conference Proceedings; Vuosikerta 32).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Predicting term-relevance from brain signals

Eugster, M., Ruotsalo, T., Spape, M., Kosunen, I., Barral Mery de Bellegarde, O., Ravaja, N., Jacucci, G. & Kaski, S., 2014, SIGIR '14 Proceedings of the 37th international ACM SIGIR conference on Research & development in information retrieval. New York, NY, USA: ACM, s. 425-434

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Probabilistic drug connectivity mapping

Parkkinen, J. A. & Kaski, S., 17 huhtikuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 10 Sivumäärä, 113.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Retrieval of experiments by efficient comparison of marginal likelihoods

Seth, S., Shawe-Taylor, J. & Kaski, S., 2014, Neural Information Processing: 21st International Conference, ICONIP 2014, Kuching, Malaysia, November 3-6, 2014 : Proceedings. Loo, C. K., Yap, K. S., Wong, K. W., Teon, A. & Huang, K. (toim.). Cham: Springer, Vuosikerta II. s. 135-142 8 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 8835).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu