19962019
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Julkaisut 1996 2019

Suodatin
Artikkeli
2019

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Menden, M. P., Wang, D., Mason, M. J., Szalai, B., Bulusu, K. C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B. S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F. S., Al-lazikani, B., Alam, T. & 280 muutaAllam, A., Allen, C., de Almeida, M. P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A. A., Ash, J. R., Aznar, V. R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P. J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K. A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M. D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D. V., Dang, C. C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H. B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A. O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A. B. K., Fotso, D. C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J. M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L. S., Hellton, K. H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M. R., Hidru, D., Hill, S. M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y-C., Hu, Z., Huang, J. K., Huang, R. S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T. H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O. B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P. J., Kanev, G. K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A. M., Khan, S. A., Kiani, N. A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P. D. W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A. J., Kuenemann, M. A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y. W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W. K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D. D., Malpartida, A. B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R. A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M. V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C. D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M. A., Ramnarine, R., Reid, J. E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J. R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J. A., Serra, J., Shang, M-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I. F., Soerensen, P., Song, J-H., Song, S. O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S. P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S. A. M., Tran, H., Troyer, E. D., Truong, A., Tsunoda, T., Turu, G., Tzeng, G-Y., Verbeke, L., Videla, S. & Consortium, A-S. D. C. DREAM., 17 kesäkuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 17 Sivumäärä, 2674.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Integrating neurophysiologic relevance feedback in intent modeling for information retrieval

Jacucci, G., Barral, O., Daee, P., Wenzel, M., Serim, B., Ruotsalo, T., Pluchino, P., Freeman, J., Gamberini, L., Kaski, S. & Blankertz, B., syyskuuta 2019, julkaisussa : Journal of the Association for Information Science and Technology. 70, 9, s. 917-930 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Representation transfer for differentially private drug sensitivity prediction

Niinimaki, T., Heikkila, M. A., Honkela, A. & Kaski, S., 5 heinäkuuta 2019, julkaisussa : Bioinformatics. 35, 14, s. i218-i224 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2018

Improving genomics-based predictions for precision medicine through active elicitation of expert knowledge

Sundin, I., Peltola, T., Micallef, L., Afrabandpey, H., Soare, M., Majumder, M. M., Daee, P., He, C., Serim, B., Havulinna, A., Heckman, C., Jacucci, G., Marttinen, P. & Kaski, S., 1 heinäkuuta 2018, julkaisussa : Bioinformatics. 34, 13, s. 395-403 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Interactive Intent Modeling for Exploratory Search

Ruotsalo, T., Peltonen, J., Eugster, M. J. A., Glowacka, D., Floréen, P., Myllymäki, P., Jacucci, G. & Kaski, S., lokakuuta 2018, julkaisussa : ACM Transactions on Information Systems. 36, 4, s. 44:1-46 46 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Likelihood-free inference via classification

Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., maaliskuuta 2018, julkaisussa : Statistics and Computing. 28, 2, s. 411-425 15 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2017

A Community Challenge for Inferring Genetic Predictors of Gene Essentialities through Analysis of a Functional Screen of Cancer Cell Lines

Gönen, M., Weir, B. A., Cowley, G. S., Vazquez, F., Guan, Y., Jaiswal, A., Karasuyama, M., Uzunangelov, V., Wang, T., Tsherniak, A., Howell, S., Marbach, D., Hoff, B., Norman, T. C., Airola, A., Bivol, A., Bunte, K., Carlin, D., Chopra, S., Deran, A. & 26 muutaEllrott, K., Gopalacharyulu, P., Graim, K., Kaski, S., Khan, S. A., Newton, Y., Ng, S., Pahikkala, T., Paull, E., Sokolov, A., Tang, H., Tang, J., Wennerberg, K., Xie, Y., Zhan, X., Zhu, F., Aittokallio, T., Mamitsuka, H., Stuart, J. M., Boehm, J. S., Root, D. E., Xiao, G., Stolovitzky, G., Hahn, W. C., Margolin, A. A. & Broad-DREAM Community, 22 marraskuuta 2017, julkaisussa : Cell Systems. 5, 5, s. 485-+ 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

A transcriptomics data-driven gene space accurately predicts liver cytopathology and drug-induced liver injury

Kohonen, P., Parkkinen, J. A., Willighagen, E. L., Ceder, R., Wennerberg, K., Kaski, S. & Grafstrom, R. C., 3 heinäkuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 15 Sivumäärä, 15932.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Fundamentals and Recent Developments in Approximate Bayesian Computation

Lintusaari, J., Gutmann, M. U., Dutta, R., Kaski, S. & Corander, J., tammikuuta 2017, julkaisussa : Systematic Biology. 66, 1, s. E66-E82 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

MediSyn: uncertainty-aware visualization of multiple biomedical datasets to support drug treatment selection

He, C., Micallef, L., Tanoli, Z-R., Kaski, S., Aittokallio, T. & Jacucci, G., 2017, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 18, 12 Sivumäärä, 393.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2016

Crowdsourced assessment of common genetic contribution to predicting anti-TNF treatment response in rheumatoid arthritis

Sieberts, S. K., Zhu, F., Garcia-Garcia, J., Stahl, E., Pratap, A., Pandey, G., Pappas, D., Aguilar, D., Anton, B., Bonet, J., Eksi, R., Fornes, O., Guney, E., Li, H., Marin, M. A., Panwar, B., Planas-Iglesias, J., Poglayen, D., Cui, J., Falcao, A. O. & 31 muutaSuver, C., Hoff, B., Balagurusamy, V. S. K., Dillenberger, D., Neto, E. C., Norman, T., Aittokallio, T., Ammad-ud-din, M., Azencott, C-A., Bellon, V., Boeva, V., Bunte, K., Chheda, H., Cheng, L., Corander, J., Dumontier, M., Goldenberg, A., Gopalacharyulu, P., Hajiloo, M., Hidru, D., Jaiswal, A., Kaski, S., Khalfaoui, B., Khan, S. A., Kramer, E. R., Marttinen, P., Pirinen, M., Saarela, J., Tang, J., Wennerberg, K. & Rheumatoid Arth Challenge, elokuuta 2016, julkaisussa : Nature Communications. 7, 9 Sivumäärä, 12460.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Drug response prediction by inferring pathway-response associations with kernelized Bayesian matrix factorization

Ammad-ud-din, M., Khan, S. A., Malani, D., Murumägi, A., Kallioniemi, O., Aittokallio, T. & Kaski, S., 1 syyskuuta 2016, julkaisussa : Bioinformatics. 32, 17, s. 455-463 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access

Extracting relevance and affect information from physiological text annotation

Barral Mery de Bellegarde, O., Kosunen, I. J., Ruotsalo, T., Spapé, M., Eugster, M., Ravaja, J. N., Kaski, S. J. I. & Jacucci, G., 2016, julkaisussa : User Modeling and User-Adapted Interaction. 26, 5, s. 493-520 28 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Natural brain-information interfaces: Recommending information by relevance inferred from human brain signals

Eugster, M. J. A., Ruotsalo, T., Spape, M. M., Barral, O., Ravaja, N., Jacucci, G. & Kaski, S., 8 joulukuuta 2016, julkaisussa : Scientific Reports. 6, 10 Sivumäärä, 38580.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

On the Identifiability of Transmission Dynamic Models for Infectious Diseases

Lintusaari, J., Gutmann, M. U., Kaski, S. & Corander, J., maaliskuuta 2016, julkaisussa : Genetics. 202, 3, s. 911-918 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2015

Group Factor Analysis

Klami, A., Virtanen, S., Leppäaho, E. & Kaski, S., syyskuuta 2015, julkaisussa : IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems. 26, 9, s. 2136-2147 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Interactive intent modeling: Information discovery beyond search

Ruotsalo, T., Jacucci, G., Myllymäki, P. & Kaski, S., tammikuuta 2015, julkaisussa : Communications of the ACM. 58, 1, s. 86-92 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Towards brain-activity-controlled information retrieval: Decoding image relevance from MEG signals

Kauppi, J-P., Kandemir, M., Saarinen, V-M., Hirvenkari, L., Parkkonen, L., Klami, A., Hari, R. & Kaski, S., 15 toukokuuta 2015, julkaisussa : NeuroImage. 112, s. 288-298 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2014

A community effort to assess and improve drug sensitivity prediction algorithms

Costello, J. C., Heiser, L. M., Georgii, E., Gonen, M., Menden, M. P., Wang, N. J., Bansal, M., Ammad-ud-din, M., Hintsanen, P., Khan, S. A., Mpindi, J-P., Kallioniemi, O., Honkela, A., Aittokallio, T., Wennerberg, K., Collins, J. J., Gallahan, D., Singer, D., Saez-Rodriguez, J., Kaski, S. & 3 muutaGray, J. W., Stolovitzky, G. & NCI DREAM Community, joulukuuta 2014, julkaisussa : Nature Biotechnology. 32, 12, s. 1202-U57 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Assessing multivariate gene-metabolome associations with rare variants using Bayesian reduced rank regression

Julkaisun otsikon käännös: Assessing multivariate gene-metabolome associations with rare variants using Bayesian reduced rank regressionMarttinen, P., Pirinen, M., Sarin, A-P., Gillberg, J., Kettunen, J., Surakka, I., Kangas, A. J., Soininen, P., O'Reilly, P., Kaakinen, M., Kahonen, M., Lehtimaki, T., Ala-Korpela, M., Raitakari, O. T., Salomaa, V., Jarvelin, M-R., Ripatti, S. & Kaski, S., 15 heinäkuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 14, s. 2026-2034 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Cross-organism toxicogenomics with group factor analysis

Suvitaival, T., Parkkinen, J., Virtanen, S. & Kaski, S., 2014, julkaisussa : Systems Biomedicine. 2, 4, s. 71-80 10 Sivumäärä, e29291.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Exploration and retrieval of whole-metagenome sequencing samples

Seth, S., Valimaki, N., Kaski, S. & Honkela, A., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 17, s. 2471-2479 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identification of structural features in chemicals associated with cancer drug response: a systematic data-driven analysis

Khan, S. A., Virtanen, S., Kallioniemi, O. P., Wennerberg, K., Poso, A. & Kaski, S., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 17, s. I497-I504 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Integrative and Personalized QSAR Analysis in Cancer by Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Amnnad-ud-din, M., Georgii, E., Gonen, M., Laitinen, T., Kallioniemi, O., Wennerberg, K., Poso, A. & Kaski, S., elokuuta 2014, julkaisussa : Journal of Chemical Information and Modeling. 54, 8, s. 2347-2359 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Kernelized Bayesian Matrix Factorization

Gönen, M. & Kaski, S., lokakuuta 2014, julkaisussa : IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence. 36, 10, s. 2047-2060 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Multi-task and multi-view learning of user state

Kandemir, M., Vetek, A., Gönen, M., Klami, A. & Kaski, S., 2 syyskuuta 2014, julkaisussa : Neurocomputing. 139, s. 97-106

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Probabilistic drug connectivity mapping

Parkkinen, J. A. & Kaski, S., 17 huhtikuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 10 Sivumäärä, 113.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Stronger findings for metabolomics through Bayesian modeling of multiple peaks and compound correlations

Suvitaival, T., Rogers, S. & Kaski, S., 1 syyskuuta 2014, julkaisussa : Bioinformatics. 30, 17, s. I461-I467 7 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Stronger findings from mass spectral data through multi-peak modeling

Suvitaival, T., Rogers, S. & Kaski, S., 19 kesäkuuta 2014, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 15, 11 Sivumäärä, 208.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Toward computational cumulative biology by combining models of biological datasets

Faisal, A., Peltonen, J., Georgii, E., Rung, J. & Kaski, S., 2014, julkaisussa : PLoS One. 9, 11, e113053.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto
2013

Bayesian Canonical Correlation Analysis

Klami, A., Virtanen, S. & Kaski, S., huhtikuuta 2013, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 14, s. 965-1003 39 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Bayesian Information Sharing Between Noise And Regression Models Improves Prediction of Weak Effects

Gillberg, J., Marttinen, P., Pirinen, M., Kangas, A. J., Soininen, P., Järvelin, M-R., Ala-Korpela, M. & Kaski, S., 16 lokakuuta 2013, julkaisussa : arXiv.org . 1310.4362v1 , 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

Genome-wide association studies with high-dimensional phenotypes

Marttinen, P., Gillberg, J., Havulinna, A., Corander, J. & Kaski, S., 2013, julkaisussa : Statistical applications in genetics and molecular biology. 12, 4, s. 413-431 19 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Identifying fragments of natural speech from the listener's MEG signals

Koskinen, M., Viinikanoja, J., Kurimo, M., Klami, A., Kaski, S. & Hari, R., kesäkuuta 2013, julkaisussa : Human Brain Mapping. 34, 6, s. 1477-1489 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2012

Comprehensive data-driven analysis of the impact of chemoinformatic structure on the genome-wide biological response profiles of cancer cells to 1159 drugs

Khan, S. A., Faisal, A., Mpindi, J. P., Parkkinen, J. A., Kalliokoski, T., Poso, A., Kallioniemi, O. P., Wennerberg, K. & Kaski, S., 30 toukokuuta 2012, julkaisussa : BMC Bioinformatics. 13, s. Article Number: 112 14 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Data-driven information retrieval in heterogeneous collections of transcriptomics data links SIM2s to malignant pleural mesothelioma

Caldas, J., Gehlenborg, N., Kettunen, E., Faisal, A., Rönty, M., Nicholson, A. G., Knuutila, S., Brazma, A. & Kaski, S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 2, s. 246-253 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Focused multi-task learning in a Gaussian process framework

Leen, G., Peltonen, J. & Kaski, S., 1 lokakuuta 2012, julkaisussa : Machine Learning. 89, 1-2, SI, s. 157-182 26 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Targeted retrieval of gene expression measurements using regulatory models

Georgii, E., Salojärvi, J. T., Brosche, M., Kangasjärvi, J. & Kaski, S., 2012, julkaisussa : Bioinformatics. 28, 18, s. 2349-2356 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

The rocky road to personalized medicine: computational and statistical challenges

Corander, J., Aittokallio, T., Ripatti, S. & Kaski, S., 2012, julkaisussa : Personalized Medicine. 9, 2, s. 109-114 6 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

2011

An Augmented Reality Interface to Contextual Information

Ajanki, A., Billinghurst, M., Gamper, H., Järvenpää, T., Kandemir, M., Kaski, S., Koskela, M., Kurimo, M., Laaksonen, J., Puolamäki, K., Ruokolainen, T. & Tossavainen, T., 2011, julkaisussa : Virtual Reality. 15, 2-3, s. 161-173

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Dimensionality Reduction for Data Visualization

Kaski, S. & Peltonen, J., 2011, julkaisussa : IEEE - Signal Processing Magazine. 28, 2, s. 100-104

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Hierarchical generative biclustering for MicroRNA Expression Analysis

Caldas, J. & Kaski, S., 2011, julkaisussa : Journal of Computational Biology. 118, 3, s. 251-261

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

High Density Lipoprotein Structural Changes and Drug Response in Lipidomic Profiles following the Long-Term Fenofibrate Therapy in the FIELD Substudy

Yetukuri, L., Huopaniemi, I., Koivuniemi, A., Maranghi, M., Hiukka, A., Nygren, H., Kaski, S., Taskinen, M-R., Vattulainen, I., Jauhiainen, M. & Oresic, M., 2011, julkaisussa : PLoS One. 6, s. e23589 12 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Introduction to the special issue on mining and learning with graphs

Vishwanathan, S. V. N., Kaski, S., Neville, J. & Wrobel, S., 2011, julkaisussa : Machine Learning. 82, 2, s. 91-93 3 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinen

Matching samples of multiple views

Tripathi, A., Klami, A., Oresic, M. & Kaski, S., 2011, julkaisussa : Data Mining and Knowledge Discovery. 23, 2, s. 300-321 22 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Metabolic regulation in progression to autoimmune diabetes

Sysi-Aho, M., Ermolov, A., Gopalacharyulu, P. V., Tripathi, A., Seppänen-Laakso, T., Maukonen, J., Mattila, I., Ruohonen, S. T., Vähätalo, L., Yetukuri, L., Härkönen, T., Lindfors, E., Nikkilä, J., Ilonen, J., Simell, O., Saarela, M., Knip, M., Kaski, S., Savontaus, E. & Oresic, M., 2011, julkaisussa : PLoS Computational Biology. 7, 10, s. e1002257 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Probabilistic analysis of probe reliability in differential gene expression studies with short oligonucleotide arrays

Lahti, L., Elo, L. L., Aittokallio, T. & Kaski, S., 2011, julkaisussa : IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 8, 1, s. 217-225 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

2010

Global modeling of transcriptional responses in interaction networks

Julkaisun otsikon käännös: Global modeling of transcriptional responses in interaction networksLahti, L. M., Knuuttila, J. E. A. & Kaski, S., 2010, julkaisussa : Bioinformatics. 26, s. 2713-2720 8 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Infinite factorization of multiple non-parametric views

Rogers, S., Kaski, S., Klami, A., Sinkkonen, J. & Girolami, M., 2010, julkaisussa : Machine Learning. 79, 1-2, s. 201-226 26 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Information retrieval perspective to nonlinear dimensionality reduction for data visualization

Venna, J., Kaski, S., Peltonen, J., Nybo, K. & Aidos, H., 2010, julkaisussa : Journal of Machine Learning Research. 11, s. 451-490 40 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu