20022017
Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

 

Research interests

 My research interests focus on plant cell walls and cell wall modifying enzymes. In my PhD thesis, I studied lignin biosynthesis in spruce, concentrating especially on the last polymerisation step and the oxidative enzymes (peroxidases, laccases) that catalyse the polymerisation. During my post-doctoral work I have turned to the carbohydrate component of the cell walls, focusing on the structure, localisation and enzymatic hydolysis of xylan, as well as the effect of xylan on the breakdown of other cell wall carbohydrates. Currently, I am combining the oxidative methods from my PhD work to the modification of oligosaccharides for the creation of novel functional groups on carbohydrates.

 

Teaching

 I am regularly involved in the teaching of both undergraduate and graduate students, teaching on laboratory courses and occasionally giving lectures. Additionally, I have been involved in the supervision of several master’s theses. The courses I have been teaching during the years include:

  • Basic biochemistry lab course
  • Basic plant physiology lab course
  • Basic gene technology lab course
  • Advanced laboratory course on plant molecular biology
  • Advanced laboratory course for graduate students on enzymes in lignocellulose hydrolysis
  • Lecture course on field crop quality (visiting lecturer on lignin as a quality determinant)
  • Lecture course on metabolism (partly; coenzymes, glycolysis and lipid metabolism)

 

Koulutustiedot

FT, fysiologinen kasivitiede (Helsingin yliopisto)
FM, biokemia (Turun yliopisto)

Tieteenalat

  • 118 Biotieteet
  • 414 Maatalouden bioteknologia

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut 2002 2017

Distinct roles of carbohydrate esterase family CE16 acetyl esterases and polymer-acting acetyl xylan esterases in xylan deacetylation

Koutaniemi, S., van Gool, M. P., Juvonen, M., Jokela, J., Hinz, S. W., Schols, H. A. & Tenkanen, M., 2013, julkaisussa : Journal of Biotechnology. 168, 4, s. 684– 692 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Action of three GH51 and one GH54 α-arabinofuranosidases on internally and terminally located arabinofuranosyl branches

Koutaniemi, S. M. & Tenkanen, T. M., 2016, julkaisussa : Journal of Biotechnology. 229, July, s. 22-30 9 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Novel substituent specific antibody against 4-O-methylglucuronoxylan reveals close association of glucopyranosyluronic acid and acetyl substituents and novel labelling patterns in tree species

Koutaniemi, S., Guilloin, F., Tranquet, O., Bouchet, B., Tuomainen, P., Virkki, M-L., Petersen, H. L., Willats, W. G. T., Saulnier, L. & Tenkanen, M., 2012, julkaisussa : Planta. 236, 2, s. 739-751 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Quantitation of 4-O-methylglucuronic acid from plant cell wall

Chong, S-L., Koutaniemi, S., Virkki, M-L., Pynnönen, H., Tuomainen, P. & Tenkanen, M., 2013, julkaisussa : Carbohydrate Polymers. 91, 2, s. 626-630 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Peroxidases bound to the growing lignin polymer produce natural like extracellular lignin in a cell culture of Norway spruce.

Warinowski, T., Koutaniemi, S., Kärkönen, A., Sundberg, I., Toikka, M., Simola, L. K., Kilpeläinen, I. & Teeri, T., 18 lokakuuta 2016, julkaisussa : Frontiers in plant science. 7, 12 Sivumäärä, 1523.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Projektit 2008 2014

  • 4 Päättynyt

Aktiviteetit 1999 2013

  • 21 Konferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen
  • 4 Muun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)
  • 3 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon
  • 2 Väitöskirjatyön seurantaryhmän jäsen

Speaker, Plant Cell Wall Conference

Sanna Koutaniemi (Puhuja: esitelmän pitäjä)
2010

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Speaker, Biomass-derived pentoses: from biotechnology to fine chemistry

Sanna Koutaniemi (Puhuja: esitelmän pitäjä)
2010

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

MSc thesis co-supervisor, Ying Su

Sanna Koutaniemi (Sivuohjaaja)
2012

Aktiviteetti: TutkimustyypitMuun opinnäytteen ohjaus (pro gradu, lisensiaattityö)

Poster presentation, 10th Carbohydrate Bioengineering Meeting

Sanna Koutaniemi (Posteriesitys)
2013

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Poster presentation, 10th Carbohydrate Bioengineering Meeting

Sanna Koutaniemi (Posteriesitys)
2013

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen