Fine-mapping analysis including over 254,000 East Asian and European descendants identifies 136 putative colorectal cancer susceptibility genes

Chen, Z., Guo, X., Tao, R., Huyghe, J. R., Law, P. J., Fernandez-Rozadilla, C., Ping, J., Jia, G., Long, J., Li, C., Shen, Q., Xie, Y., Timofeeva, M. N., Thomas, M., Schmit, S. L., Díez-Obrero, V., Devall, M., Moratalla-Navarro, F., Fernandez-Tajes, J., Palles, C., & 185 muutaSherwood, K., Briggs, S. E. W., Svinti, V., Donnelly, K., Farrington, S. M., Blackmur, J., Vaughan-Shaw, P. G., Shu, X. O., Lu, Y., Broderick, P., Studd, J., Harrison, T. A., Conti, D. V., Schumacher, F. R., Melas, M., Rennert, G., Obón-Santacana, M., Martín-Sánchez, V., Oh, J. H., Kim, J., Jee, S. H., Jung, K. J., Kweon, S. S., Shin, M. H., Shin, A., Ahn, Y. O., Kim, D. H., Oze, I., Wen, W., Matsuo, K., Matsuda, K., Tanikawa, C., Ren, Z., Gao, Y. T., Jia, W. H., Hopper, J. L., Jenkins, M. A., Win, A. K., Pai, R. K., Figueiredo, J. C., Haile, R. W., Gallinger, S., Woods, M. O., Newcomb, P. A., Duggan, D., Cheadle, J. P., Kaplan, R., Kerr, R., Kerr, D., Kirac, I., Böhm, J., Mecklin, J. P., Jousilahti, P., Knekt, P., Aaltonen, L. A., Rissanen, H., Pukkala, E., Eriksson, J. G., Cajuso, T., Hänninen, U., Kondelin, J., Palin, K., Tanskanen, T., Renkonen-Sinisalo, L., Männistö, S., Albanes, D., Weinstein, S. J., Ruiz-Narvaez, E., Palmer, J. R., Buchanan, D. D., Platz, E. A., Visvanathan, K., Ulrich, C. M., Siegel, E., Brezina, S., Gsur, A., Campbell, P. T., Chang-Claude, J., Hoffmeister, M., Brenner, H., Slattery, M. L., Potter, J. D., Tsilidis, K. K., Schulze, M. B., Gunter, M. J., Murphy, N., Castells, A., Castellví-Bel, S., Moreira, L., Arndt, V., Shcherbina, A., Bishop, D. T., Giles, G. G., Southey, M. C., Idos, G. E., McDonnell, K. J., Abu-Ful, Z., Greenson, J. K., Shulman, K., Lejbkowicz, F., Offit, K., Su, Y. R., Steinfelder, R., Keku, T. O., van Guelpen, B., Hudson, T. J., Hampel, H., Pearlman, R., Berndt, S. I., Hayes, R. B., Martinez, M. E., Thomas, S. S., Pharoah, P. D. P., Larsson, S. C., Yen, Y., Lenz, H. J., White, E., Li, L., Doheny, K. F., Pugh, E., Shelford, T., Chan, A. T., Cruz-Correa, M., Lindblom, A., Hunter, D. J., Joshi, A. D., Schafmayer, C., Scacheri, P. C., Kundaje, A., Schoen, R. E., Hampe, J., Stadler, Z. K., Vodicka, P., Vodickova, L., Vymetalkova, V., Edlund, C. K., Gauderman, W. J., Shibata, D., Toland, A., Markowitz, S., Kim, A., Chanock, S. J., van Duijnhoven, F., Feskens, E. J. M., Sakoda, L. C., Gago-Dominguez, M., Wolk, A., Pardini, B., FitzGerald, L. M., Lee, S. C., Ogino, S., Bien, S. A., Kooperberg, C., Li, C. I., Lin, Y., Prentice, R., Qu, C., Bézieau, S., Yamaji, T., Sawada, N., Iwasaki, M., Le Marchand, L., Wu, A. H., Qu, C., McNeil, C. E., Coetzee, G., Hayward, C., Deary, I. J., Harris, S. E., Theodoratou, E., Reid, S., Walker, M., Ooi, L. Y., Lau, K. S., Zhao, H., Hsu, L., Cai, Q., Dunlop, M. G., Gruber, S. B., Houlston, R. S., Moreno, V., Casey, G., Peters, U., Tomlinson, I. & Zheng, W., 2024, julkaisussa: Nature Communications. 15, 1, 17 Sivumäärä, 3557.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Deciphering colorectal cancer genetics through multi-omic analysis of 100,204 cases and 154,587 controls of European and east Asian ancestries

Fernandez-Rozadilla, C., Timofeeva, M., Chen, Z., Law, P., Thomas, M., Bien, S., Diez-Obrero, V., Li, L., Fernandez-Tajes, J., Palles, C., Sherwood, K., Harris, S., Svinti, V., McDonnell, K., Farrington, S., Studd, J., Vaughan-Shaw, P., Shu, X., Long, J., Cai, Q., & 190 muutaGuo, X., Lu, Y., Scacheri, P., Studd, J., Huyghe, J., Harrison, T., Shibata, D., Haiman, C., Devall, M., Schumacher, F., Melas, M., Rennert, G., Obon-Santacana, M., Martin-Sanchez, V., Moratalla-Navarro, F., Oh, J. H., Kim, J., Jee, S. H., Jung, K. J., Kweon, S-S., Shin, M-H., Shin, A., Ahn, Y-O., Kim, D-H., Oze, I., Wen, W., Matsuo, K., Matsuda, K., Tanikawa, C., Ren, Z., Gao, Y-T., Jia, W-H., Potter, J., Jenkins, M., Win, A. K., Pai, R., Figueiredo, J., Haile, R., Gallinger, S., Woods, M., Newcomb, P., Shibata, D., Cheadle, J., Kaplan, R., Maughan, T., Kerr, R., Kerr, D., Kirac, I., Boehm, J., Mecklin, L-P., Jousilahti, P., Knekt, P., Aaltonen, L., Rissanen, H., Pukkala, E., Eriksson, J., Cajuso, T., Hanninen, U., Kondelin, J., Palin, K., Tanskanen, T., Renkonen-Sinisalo, L., Zanke, B., Männistö, S., Albanes, D., Weinstein, S., Ruiz-Narvaez, E., Palmer, J., Buchanan, D., Platz, E., Visvanathan, K., Ulrich, C., Siegel, E., Brezina, S., Gsur, A., Campbell, P., Chang-Claude, J., Hoffmeister, M., Brenner, H., Slattery, M., Potter, J., Tsilidis, K., Schulze, M., Gunter, M., Murphy, N., Castells, A., Castellvi-Bel, S., Moreira, L., Arndt, V., Shcherbina, A., Stern, M., Pardamean, B., Bishop, T., Giles, G., Southey, M., Idos, G., McDonnell, K., Abu-Ful, Z., Greenson, J., Shulman, K., Lejbkowicz, F., Offit, K., Su, Y-R., Steinfelder, R., Keku, T., van Guelpen, B., Hudson, T., Hampel, H., Pearlman, R., Berndt, S., Hayes, R., Martinez, M. E., Thomas, S., Corley, D., Pharoah, P., Larsson, S., Yen, Y., Lenz, H-J., White, E., Li, L., Doheny, K., Pugh, E., Shelford, T., Chan, A., Cruz-Correa, M., Lindblom, A., Shibata, D., Joshi, A., Schafmayer, C., Scacheri, P., Kundaje, A., Nickerson, D., Schoen, R., Hampe, J., Stadler, Z., Vodicka, P., Vodickova, L., Vymetalkova, V., Papadopoulos, N., Edlund, C., Gauderman, W., Thomas, D., Shibata, D., Toland, A., Markowitz, S., Kim, A., Gruber, S., van Duijnhoven, F., Feskens, E., Sakoda, L., Gago-Dominguez, M., Wolk, A., Naccarati, A., Pardini, B., FitzGerald, L., Lee, S. C., Ogino, S., Bien, S., Kooperberg, C., Li, C., Lin, Y., Prentice, R., Qu, C., Bezieau, S., Tangen, C., Mardis, E., Yamaji, T., Sawada, N., Iwasaki, M., Haiman, C., Le Marchand, L., Wu, A., Qu, C., McNeil, C., Coetzee, G., Hayward, C., Deary, I., Harris, S., Theodoratou, E., Reid, S., Walker, M., Ooi, L. Y., Moreno, V., Casey, G., Gruber, S., Tomlinson, I., Zheng, W., Dunlop, M., Houlston, R. & Peters, U., tammik. 2023, julkaisussa: Nature Genetics. 55, 1, s. 89-+ 18 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Inherited mutations affecting the SRCAP complex are central in moderate-penetrance predisposition to uterine leiomyomas

Välimäki, N., Jokinen, V., Cajuso, T., Kuisma, H., Taira, A., Dagnaud, O., Ilves, S., Kaukomaa, J., Pasanen, A., Palin, K., Heikinheimo, O., Bützow, R., Aaltonen, L. A. & Karhu, A., 2 maalisk. 2023, julkaisussa: American Journal of Human Genetics. 110, 3, s. 460-474 16 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Deficient H2A.Z deposition is associated with genesis of uterine leiomyoma

Berta, D. G., Kuisma, H., Välimäki, N., Räisänen, M., Jäntti, M., Pasanen, A., Karhu, A., Kaukomaa, J., Taira, A., Cajuso, T., Nieminen, S., Penttinen, R-M., Ahonen, S., Lehtonen, R., Mehine, M., Vahteristo, P., Jalkanen, J., Sahu, B., Ravantti, J., Mäkinen, N., & 7 muutaRajamäki, K., Palin, K., Taipale, J., Heikinheimo, O., Bützow, R., Kaasinen, E. & Aaltonen, L. A., 19 elok. 2021, julkaisussa: Nature. 596, 7872, 34 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

No evidence of EMAST in whole genome sequencing data from 248 colorectal cancers

Kondelin, J., Martin, S., Katainen, R., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Koskensalo, S., Böhm, J., Mecklin, J-P., Cajuso, T., Hänninen, U. A., Välimäki, N., Ravantti, J., Rajamäki, K., Palin, K. & Aaltonen, L. A., heinäk. 2021, julkaisussa: Genes, Chromosomes & Cancer. 60, 7, s. 463-473 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu