Tero Aittokallio — Helsingin yliopisto

Henkilökohtainen profiili

Koulutus / tieteellinen pätevyys

Applied Mathematics, PhD, University of Turku

Asemat yliopiston ulkopuolella

Professor of Statistics and Applied Mathematics, University of Turku

1 elokuuta 2015 → …

Keywords

3111 Biolääketieteet
111 Matematiikka
113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
112 Tilastotiede

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Publications and projects within past five years.

Julkaisut 2001 2019

92 Artikkeli
8 Katsausartikkeli
3 Konferenssiesitelmän abstrakti
2 Kirjan luku tai artikkeli
5 Muut aineistot

Community assessment to advance computational prediction of cancer drug combinations in a pharmacogenomic screen

Menden, M. P., Wang, D., Mason, M. J., Szalai, B., Bulusu, K. C., Guan, Y., Yu, T., Kang, J., Jeon, M., Wolfinger, R., Nguyen, T., Zaslavskiy, M., Abante, J., Abecassis, B. S., Aben, N., Aghamirzaie, D., Aittokallio, T., Akhtari, F. S., Al-lazikani, B., Alam, T. & 280 muutaAllam, A., Allen, C., de Almeida, M. P., Altarawy, D., Alves, V., Amadoz, A., Anchang, B., Antolin, A. A., Ash, J. R., Aznar, V. R., Ba-alawi, W., Bagheri, M., Bajic, V., Ball, G., Ballester, P. J., Baptista, D., Bare, C., Bateson, M., Bender, A., Bertrand, D., Wijayawardena, B., Boroevich, K. A., Bosdriesz, E., Bougouffa, S., Bounova, G., Brouwer, T., Bryant, B., Calaza, M., Calderone, A., Calza, S., Capuzzi, S., Carbonell-Caballero, J., Carlin, D., Carter, H., Castagnoli, L., Celebi, R., Cesareni, G., Chang, H., Chen, G., Chen, H., Chen, H., Cheng, L., Chernomoretz, A., Chicco, D., Cho, K-H., Cho, S., Choi, D., Choi, J., Choi, K., Choi, M., Cock, M. D., Coker, E., Cortes-Ciriano, I., Cserzö, M., Cubuk, C., Curtis, C., Daele, D. V., Dang, C. C., Dijkstra, T., Dopazo, J., Draghici, S., Drosou, A., Dumontier, M., Ehrhart, F., Eid, F-E., ElHefnawi, M., Elmarakeby, H., van Engelen, B., Engin, H. B., de Esch, I., Evelo, C., Falcao, A. O., Farag, S., Fernandez-Lozano, C., Fisch, K., Flobak, A., Fornari, C., Foroushani, A. B. K., Fotso, D. C., Fourches, D., Friend, S., Frigessi, A., Gao, F., Gao, X., Gerold, J. M., Gestraud, P., Ghosh, S., Gillberg, J., Godoy-Lorite, A., Godynyuk, L., Godzik, A., Goldenberg, A., Gomez-Cabrero, D., Gonen, M., de Graaf, C., Gray, H., Grechkin, M., Guimera, R., Guney, E., Haibe-Kains, B., Han, Y., Hase, T., He, D., He, L., Heath, L. S., Hellton, K. H., Helmer-Citterich, M., Hidalgo, M. R., Hidru, D., Hill, S. M., Hochreiter, S., Hong, S., Hovig, E., Hsueh, Y-C., Hu, Z., Huang, J. K., Huang, R. S., Hunyady, L., Hwang, J., Hwang, T. H., Hwang, W., Hwang, Y., Isayev, O., Don’t Walk, O. B., Jack, J., Jahandideh, S., Ji, J., Jo, Y., Kamola, P. J., Kanev, G. K., Karacosta, L., Karimi, M., Kaski, S., Kazanov, M., Khamis, A. M., Khan, S. A., Kiani, N. A., Kim, A., Kim, J., Kim, J., Kim, K., Kim, K., Kim, S., Kim, Y., Kim, Y., Kirk, P. D. W., Kitano, H., Klambauer, G., Knowles, D., Ko, M., Kohn-Luque, A., Kooistra, A. J., Kuenemann, M. A., Kuiper, M., Kurz, C., Kwon, M., van Laarhoven, T., Laegreid, A., Lederer, S., Lee, H., Lee, J., Lee, Y. W., Lepp_aho, E., Lewis, R., Li, J., Li, L., Liley, J., Lim, W. K., Lin, C., Liu, Y., Lopez, Y., Low, J., Lysenko, A., Machado, D., Madhukar, N., Maeyer, D. D., Malpartida, A. B., Mamitsuka, H., Marabita, F., Marchal, K., Marttinen, P., Mason, D., Mazaheri, A., Mehmood, A., Mehreen, A., Michaut, M., Miller, R. A., Mitsopoulos, C., Modos, D., Moerbeke, M. V., Moo, K., Motsinger-Reif, A., Movva, R., Muraru, S., Muratov, E., Mushthofa, M., Nagarajan, N., Nakken, S., Nath, A., Neuvial, P., Newton, R., Ning, Z., Niz, C. D., Oliva, B., Olsen, C., Palmeri, A., Panesar, B., Papadopoulos, S., Park, J., Park, S., Park, S., Pawitan, Y., Peluso, D., Pendyala, S., Peng, J., Perfetto, L., Pirro, S., Plevritis, S., Politi, R., Poon, H., Porta, E., Prellner, I., Preuer, K., Pujana, M. A., Ramnarine, R., Reid, J. E., Reyal, F., Richardson, S., Ricketts, C., Rieswijk, L., Rocha, M., Rodriguez-Gonzalvez, C., Roell, K., Rotroff, D., de Ruiter, J. R., Rukawa, P., Sadacca, B., Safikhani, Z., Safitri, F., Sales-Pardo, M., Sauer, S., Schlichting, M., Seoane, J. A., Serra, J., Shang, M-M., Sharma, A., Sharma, H., Shen, Y., Shiga, M., Shin, M., Shkedy, Z., Shopsowitz, K., Sinai, S., Skola, D., Smirnov, P., Soerensen, I. F., Soerensen, P., Song, J-H., Song, S. O., Soufan, O., Spitzmueller, A., Steipe, B., Suphavilai, C., Tamayo, S. P., Tamborero, D., Tang, J., Tanoli, Z-R., Tarres-Deulofeu, M., Tegner, J., Thommesen, L., Tonekaboni, S. A. M., Tran, H., Troyer, E. D., Truong, A., Tsunoda, T., Turu, G., Tzeng, G-Y., Verbeke, L., Videla, S. & Consortium, A-S. D. C. DREAM., 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

DNMT Inhibitors Increase Methylation in the Cancer Genome

Giri, A. K. & Aittokallio, T., 24 huhtikuuta 2019, julkaisussa : Frontiers in Pharmacology. 10, 11 Sivumäärä, 385.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

Matrix and Tensor Factorization Methods for Toxicogenomic Modeling and Prediction

Khan, S. A., Aittokallio, T., Scherer, A., Grafström, R. & Kohonen, P., toukokuuta 2019, Advances in Computational Toxicology: Methodologies and Applications in Regulatory Science. Hong, H. (toim.). Springer Nature Switzerland, s. 57-74 16 Sivumäärä (Challenges and Advances in Computational Chemistry and Physics; Vuosikerta 30).

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Network pharmacology modeling identifies synergistic Aurora B and ZAK interaction in triple-negative breast cancer

Tang, J., Gautam, P., Gupta, A., He, L., Timonen, S., Akimov, Y., Wang, W., Szwajda, A., Jaiswal, A., Turei, D., Yadav, B., Kankainen, M., Saarela, J., Saez-Rodriguez, J., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 2019, julkaisussa : npj Systems Biology and Applications. 5, 1

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Pharmacological reactivation of MYC-dependent apoptosis induces susceptibility to anti-PD-1 immunotherapy

Haikala, H. M., Anttila, J. M., Marques, E., Raatikainen, T., Ilander, M., Hakanen, H., Ala-Hongisto, H., Savelius, M., Balboa, D., Von Eyss, B., Eskelinen, V., Munne, P., Nieminen, A. I., Otonkoski, T., Schüler, J., Laajala, T. D., Aittokallio, T., Sihto, H., Mattson, J., Heikkilä, P. & 7 muutaLeidenius, M., Joensuu, H., Mustjoki, S., Kovanen, P., Eilers, M., Leverson, J. D. & Klefström, J., 6 helmikuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 17 Sivumäärä, 620.

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Open access

Tiedosto

Projektit 2011 2018

1 Aktiivinen
13 Päättynyt

Elucidation of mechanisms of action of the natural stilbenoid pinosylvin via network pharmacology computational methods

Kibble, M. M., Aittokallio, T., Mäkelä, S., Saarinen, N. & Martinez Chacon , G.

01/01/2014 → …

Projekti: Tutkimusprojekti

Predicting disease specific effects and mechanisms of action of compound combinations in phytotherapy

Kibble, M. M., Aittokallio, T., Tang, J., Sultan Khan, S. & Peddinti, G.

18/05/2015 → 18/12/2017

Projekti: Tutkimusprojekti

Personalizing health and care - creating medically-driven integrative bioinformatics applications focused on oncology, CNS disorders and their comorbidities

Aittokallio, T. & Tang, J.

01/05/2015 → 30/04/2017

Projekti: Tutkimusprojekti

Creating medically-driven integrative bioinformatics applications focused on oncology, CNS disorders and their comorbidities (MedBioinformatics)

Aittokallio, T.

European Commission / Horizon 2020

01/05/2015 → 30/04/2018

Projekti: Tutkimusprojekti

Cancer society of Finland - Individualized drug target combinations: prediction, testing and translation

Tang, J., Aittokallio, T. & Wennerberg, K.

01/01/2015 → 31/12/2016

Projekti: Tutkimusprojekti

Palkinnot

Helsinki Challenge

Jing Tang (Vastaanottaja), Samu Kurki (Vastaanottaja), Tero Aittokallio (Vastaanottaja), Emma I. Andersson (Vastaanottaja), Evgeny Kulesskiy (Vastaanottaja), Ashwini Kumar (Vastaanottaja), Dimitrios Tsallos (Vastaanottaja), Muntasir Majumder (Vastaanottaja), Olli Dufva (Vastaanottaja) & Mikko Keränen (Vastaanottaja), 22 marraskuuta 2017

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Aktiviteetit 2011 2019

7 Väitöskirjan esitarkastaja
2 Väitöskirjan ohjaaja tai sivuohjaaja
1 Public Talks
1 Isännöity akateeminen vierailu Helsingin yliopistossa
2 Muut aineistot
- 1 Jäsenyys tai muu rooli tutkimusverkostossa
- 1 Akateeminen vierailu toiseen organisaatioon