Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Henkilökohtainen profiili
Ansioluettelo
Educations:
- (2016-2019) MSc in Life Science - Bioinformatics Major, Aalto University, Espoo, Finland
- thesis title: Application of variation of sparse non-linear CCA for feature selection in cancer cell lines sensitivity prediction
- (2013-2016) MSc in Computer Science, Åbo Akademi University, Turku, Finland
- thesis title: Quantitative refinement of EGFR signaling pathway
Work Experiences:
- (05.2020-04.2022) Research Assistant, Network pharmacology for personalized medicine, University
of Helsinki, Finland - (2017-2019) Research Assistant, Kernel Methods, Pattern Analysis, and Computational Metabolomics (KEPACO) research GROUP, Aalto University - Helsinki Institute for Information Technology, Espoo, Finland
- (2014-2016) Research Assistant, Computational Biomodeling Laboratory (Combio), Åbo Akademi University, Turku, Finland
- Teaching in courses such as Data Science, Machine Learning Basic Principles, Kernel Methods In Machine Learning, and Informatics Approaches for Life Science Omics.
Research Interests:
- Machine Learning and Data Science for medical and biological data
- Prognoses and Diagnoses with AI
- Multi-modals
- Precision Medicine
- Drug Sensitivity and Resistance
Asemat yliopiston ulkopuolella
Department of computer science; Research assistant and master student., Aalto University
1 toukok. 2017 → 15 toukok. 2020
Tieteenalat
- 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet
Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö
Viimeisin maa-/aluetasolla toteutettu yhteistyö. Saat tarkempia lisätietoja pisteitä napauttamalla, tai
-
BPR3P0128, a non-nucleoside RNA-dependent RNA polymerase inhibitor, inhibits SARS-CoV-2 variants of concern and exerts synergistic antiviral activity in combination with remdesivir
Tang, W.-F., Chang, Y.-H., Lin, C.-C., Jheng, J.-R., Hsieh, C.-F., Chin, Y.-F., Chang, T.-Y., Lee, J.-C., Liang, P.-H., Lin, C.-Y., Lin, G.-H., Cai, J.-Y., Chen, Y.-L., Chen, Y.-S., Tsai, S.-K., Liu, P.-C., Yang, C.-M., Shadbahr, T., Tang, J. & Hsu, Y.-L. & 8 muuta, , huhtik. 2024, julkaisussa: Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 68, 4, 26 Sivumäärä, e00956-23.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Recent methodological advances in federated learning for healthcare
BloodCounts! consortium, Zhang, F., Kreuter, D., Chen, Y., Shadbahr, T. & Schönlieb, C. B., 14 kesäk. 2024, julkaisussa: Patterns. 5, 6, 16 Sivumäärä, 101006.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
A pipeline to further enhance quality, integrity and reusability of the NCCID clinical data
Breger, A., Selby, I., Roberts, M., Babar, J., Gkrania-Klotsas, E., Preller, J., Escudero Sánchez, L., Dittmer, S., Thorpe, M., Gilbey, J., Jefferson, E., Langs, G., Yang, G., Xing, X., Nan, Y., Li, M., Prosch, H., Stanczuk, J., Tang, J. & Teare, P. & 14 muuta, , 27 heinäk. 2023, julkaisussa: Scientific data . 10, 1, 16 Sivumäärä, 493.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Navigating the development challenges in creating complex data systems
Dittmer, S., Roberts, M., Gilbey, J., Biguri, A., Selby, I., Breger, A., Thorpe, M., Weir-McCall, J. R., Gkrania-Klotsas, E., Korhonen, A., Jefferson, E., Langs, G., Yang, G., Prosch, H., Stanczuk, J., Tang, J., Babar, J., Escudero Sánchez, L., Teare, P. & Patel, M. & 10 muuta, , heinäk. 2023, julkaisussa: Nature Machine Intelligence. 5, 7, s. 681-686 6 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
-
Prognostic impact of prostate cancer grade inflation in targeted biopsies
Batouche, A. O., Czeizler, E., Lehto, T.-P., Erickson, A., Shadbahr, T., Mirtti, T., Pohjonen, J. S. & Rannikko, A. S., helmik. 2023, julkaisussa: European Urology. 83, s. S1371-S1372 2 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Konferenssiesitelmän abstrakti › vertaisarvioitu
Open access
Projektit
- 1 Aktiivinen
-
Tuomas Mirtti Jusélius 1/3 2024-25
Mirtti, T. (Projektinjohtaja), Batouche, A. O. (osallistuja), Jaakkola, O. A. A. (osallistuja), Laajala, T. D. (osallistuja), Lehto, T.-P. (osallistuja), Pirinen, I. E. (osallistuja) & Shadbahr, T. (osallistuja)
Sigrid Juséliuksen Säätiö @003701165704@
01/05/2024 → 30/04/2025
Projekti: Rahastot ja säätiöt