Valokuva Tomi Mäkelä
  • PL 63 (Haartmaninkatu 8)

    00014

    Suomi

  • Viikinkaari 5, Biocenter 2

    00790 Helsinki

    Suomi

1986 …2020

Tutkimustuotoksia vuodessa

Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Ansioluettelo

Flagship Executive Officer, 1.4.2019-31.12.2026, iCAN Digital Precision Cancer Medicine Flagship

Director, Helsinki Institute of Life Science HiLIFE,  14.9.2015-31.3.2019

Vice Director, Academy of Finland Center of Excellence in Translational Genome-Scale Biology, 2014-2019

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Kinase signaling linking metabolism and growth control

Major human diseases such as diabetes and cancer are due to deregulat- ed signaling stemming from genetic alterations and extrinsic factors. Signaling in pathways and in larger networks typically involves sequential activation of kinases phosphorylating substrates and thus relaying and amplifying signals ultimately mod- ulating transcriptional responses in target gene sets. Our longstanding interest is to characterize signaling pathways regulating mammalian cell growth and how these impinge on transcriptional responses in human disease.

tabolism are the transcriptional kinases Cdk7 and Cdk8 mediating signals to RNA polymerase II. We are investigating the molecular mechanisms and in vivo functions of Cdk7 and Cdlk8 combining mouse molecular genetics with Drosophila knockdown strategies and cell-based screening approaches. Recent discoveries include identify- ing that Cdk7 acts as a roadblock to adipogenesis and that this presumed ubiquitous basal transcription factor is not expressed in fat tissues. Our goal is to understand the basis for the specificity of transcriptional regulation by metazoan Cdk7 and Cdk8 and their contribution to growth control and differentiation.

One of the rare kinases acting normally to restrict tumor growth is the LKB1ser- ine/threonine kinase critical for activation of at least 14 related kinases involved in metabolism and polarity regulation. We are interested in how LKB1 mediates its tumor suppressing function, and recently identified that LKB1 signaling in mesen- chymal cells is required for suppression of epithelial hyperproliferation in a mouse polyposis model and likely also in the human Peutz-Jeghers syndrome. We are cur- rently extending investigations of tumor suppression mechanisms of the LKB1 tu- mor suppressor kinase from hereditary polyposis to sporadic cancer (lung, uterine cervix). For this a combination of tissue- and cell type specific targeting approaches in vivo (conditional mouse models) and in vitro (2D and 3D RNAi & conditional dele- tions) of LKB1 and LKB1 substrate mutations will be used with a specific interest in the Nuak2 and AMPK kinases and cytoskeletal regulation.

 

 

Tieteenalat

  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut

  • 84 Artikkeli
  • 4 Katsausartikkeli
  • 2 Konferenssiartikkeli

The LKB1 tumor suppressor kinase in human disease

Katajisto, P., Vallenius, T., Vaahtomeri, K., Ekman, N., Udd, L., Tiainen, M. & Makela, T. P., 2007, julkaisussa : Biochimica et Biophysica Acta. Reviews on Cancer. 1775, 1, s. 63-75 13 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

LKB1 Represses ATOH1 via PDK4 and Energy Metabolism and Regulates Intestinal Stem Cell Fate

Gao, Y., Yan, Y., Tripathi, S., Pentinmikko, N., Amaral, A., Päivinen, P., Domenech-Moreno, E., Andersson, S., Wong, I. P. L., Clevers, H., Katajisto, P. & Mäkelä, T. P., huhtikuuta 2020, julkaisussa : Gastroenterology. 158, 5, s. 1389-+ 23 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Genetic architecture of human plasma lipidome and its link to cardiovascular disease

FinnGen Project, Tabassum, R., Rämö, J. T., Ripatti, P., Koskela, J. T., Kurki, M., Karjalainen, J., Palta, P., Hassan, S., Nunez-Fontarnau, J., Kiiskinen, T. T. J., Söderlund, S., Matikainen, N., Laivuori, H., Havulinna, A. S., Pirinen, M., Jalanko, A., Kaprio, J., Donner, K., Kaunisto, M. & 70 muuta, Mars, N., Dada, A., Shcherban, A., Ganna, A., Lehisto, A., Kilpeläinen, E., Brein, G., Awaisa, G., Harju, J., Pärn, K., Parolo, P. D. B., Kajanne, R., Lemmelä, S., Sipilä, T. P., Sipilä, T., Lyhs, U., Llorens, V., Niiranen, T., Kristiansson, K., Jiménez, M. G., Perola, M., Hiekkalinna, T., Mattsson, H., Laiho, P., Soini, S., Lehtonen, A., Pulkki, K., Heikkinen, S., Laukkanen, J., Laaksonen, R., Ritari, J., Partanen, J., Hyvärinen, K., Auro, K., Pitkänen, K., Mäkelä, T., Loukola, A., Joensuu, H., Sinisalo, J., Eklund, K., Aaltonen, L., Färkkilä, M., Carpen, O., Kauppi, P., Tienari, P., Ollila, T., Tuomi, T., Meretoja, T., Pitkäranta, A., Turunen, J., Hannula-Jouppi, K., Pikkarainen, S., Seitsonen, S., Koskinen, M., Palomäki, A., Voutilainen, M., Kettunen, J., Pelkonen, M., Julkunen, V., Lehtonen, H., Parkkinen, J., Linden, K., Jussila, A., Laitinen, T., Palin, K., Jauhiainen, M., Daly, M. J., Palotie, A., Taskinen, M-R. & Ripatti, S., 24 syyskuuta 2019, julkaisussa : Nature Communications. 10, 1, 14 Sivumäärä, 4329.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Depletion of Mediator Kinase Module Subunits Represses Superenhancer-Associated Genes in Colon Cancer Cells

Kuuluvainen, E., Domenech-Moreno, E., Niemela, E. H. & Makela, T. P., kesäkuuta 2018, julkaisussa : Molecular and Cellular Biology. 38, 12, 15 Sivumäärä, UNSP e00573-17.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Increased alpha-actinin-1 destabilizes E-cadherin-based adhesions and associates with poor prognosis in basal-like breast cancer

Kovac, B., Makela, T. P. & Vallenius, T., 9 toukokuuta 2018, julkaisussa : PLoS One. 13, 5, 20 Sivumäärä, 0196986.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Palkinnot

Anders Jahre Young Investigator Award

Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 1 tammikuuta 2005

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Membeship of the Finnish Academy of Science and Letters

Mäkelä, Tomi (Vastaanottaja), 2002

Palkinto: Palkinnot ja kunnianosoitukset

Aktiviteetit

Univ Helsinki (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Hallituksen jäsen)

2010

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

ENFIN (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Puheenjohtaja)

5 lokakuuta 20106 lokakuuta 2010

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli kansallisessa/kansainvälisessä komiteassa, toimikunnassa tai hallituksessa

Scientific Reports (Lehti)

Tomi Mäkelä (Arvioitsija (reviewer))

6 joulukuuta 2010 → …

Aktiviteetti: Julkaisun vertaisarvioinnin ja toimituksellisen työn tyypitTiedelehden toimittaja

Biocenter Finland (Ulkoinen yksikkö)

Tomi Mäkelä (Hallituksen jäsen)

1 tammikuuta 2010 → …

Aktiviteetti: JäsenyystyypitJäsenyys tai muu rooli suomalaisessa tai kansainvälisessä julkisen sektorin organisaatiossa

Lehtileikkeet

Radiaattori: telomeraasista Nobel / Sisko Loikkanen

Tomi Mäkelä

21/10/2010

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Tomi Mäkelä Helsingin biotekniikan instituutin johtoon

Tomi Mäkelä

16/01/2009

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Kiinnostus tutkijan työhön uhkaa hiipua

Tomi Mäkelä

01/01/2009

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media

Science Days Finland 2007: Opportunities from Cancer Biology

Tomi Mäkelä

10/01/2007

1 Median myötävaikutus

Lehdistö/media