Tutkimustuotoksia vuodessa
Tutkimustuotoksia vuodessa
Hakutulokset
-
2024
Elastic founder graphs improved and enhanced
Rizzo, N., Equi, M., Norri, T. & Mäkinen, V., 8 tammik. 2024, julkaisussa: Theoretical Computer Science. 982, 27 Sivumäärä, 114269.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Tackling reference bias in genotyping by using founder sequences with PanVC 3
Norri, T. & Maekinen, V., 5 tammik. 2024, julkaisussa: Bioinformatics advances. 4, 1, 7 Sivumäärä, vbae027.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2023
Algorithms and Complexity on Indexing Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Makinen, V., kesäk. 2023, julkaisussa: Algorithmica. 85, 6, s. 1586-1623 38 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2022
On Founder Segmentations of Aligned Texts
Norri, T., 2022, Helsinki: Helsingin yliopisto.Tutkimustuotos: Opinnäyte › Väitöskirja › Artikkelikokoelma
Open access -
2021
Algorithms and Complexity on Indexing Elastic Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Mäkinen, V., 30 marrask. 2021, 32nd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2021). Ahn, H-K. & Sadakane, K. (toim.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 18 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 212).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Founder reconstruction enables scalable and seamless pangenomic analysis
Norri, T., Cazaux, B., Dönges, S., Valenzuela, D. & Mäkinen, V., 15 jouluk. 2021, julkaisussa: Bioinformatics. 37, 24, s. 4611-4619 9 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2020
Linear Time Construction of Indexable Founder Block Graphs
Mäkinen, V., Cazaux, B., Equi, M., Norri, T. & Tomescu, A., 25 elok. 2020, 20th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2020). Kingsford, C. & Pisanti, N. (toim.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1-18 18 Sivumäärä 7. (Leibniz International Proceedings in Informatics; Vuosikerta 172).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2019
Applying the Positional Burrows–Wheeler Transform to All-Pairs Hamming distance
Mäkinen, V. & Norri, T., kesäk. 2019, julkaisussa: Information Processing Letters. 146, s. 17-19 3 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Linear Time Maximum Segmentation Problems in Column Stream Model
Cazaux, B., Kosolobov, D., Mäkinen, V. & Norri, T., 2019, String Processing and Information Retrieval : 26th International Symposium, {SPIRE} 2019, Segovia, Spain, October 7-9, 2019, Proceedings. Brisaboa, N. R. & Puglisi, S. J. (toim.). Cham: Springer Nature Switzerland, s. 322-336 15 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 11811).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Linear time minimum segmentation enables scalable founder reconstruction
Norri, T., Cazaux, B., Kosolobov, D. & Mäkinen, V., 17 toukok. 2019, julkaisussa: Algorithms for Molecular Biology. 14, 15 Sivumäärä, 12.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2018
Evaluating approaches to find exon chains based on long reads
Kuosmanen, A., Norri, T. & Mäkinen, V., toukok. 2018, julkaisussa: Briefings in Bioinformatics. 19, 3, s. 404-414 11 SivumääräTutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Minimum Segmentation for Pan-genomic Founder Reconstruction in Linear Time
Norri, T., Cazaux, B., Kosolobov, D. & Mäkinen, V., 2018, 18th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2018). Parida, L. & Ukkonen, E. (toim.). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl Leibniz Center for Informatics, s. 15:1-15:15 15 Sivumäärä (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); Vuosikerta 113).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
Towards pan-genome read alignment to improve variation calling
Valenzuela, D., Norri, T., Välimäki, N., Pitkänen, E. & Mäkinen, V., 9 toukok. 2018, julkaisussa: BMC Genomics. 19, 8 Sivumäärä, 87.Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto -
2017
Greedy Shortest Common Superstring Approximation in Compact Space
Alanko, J. & Norri, T., 6 syysk. 2017, String Processing and Information Retrieval: 24th International Symposium, SPIRE 2017, Palermo, Italy, September 26-29, 2017, Proceedings. Fici, G., Sciortino, M. & Venturini, R. (toim.). Cham: Springer International Publishing AG, s. 1-13 13 Sivumäärä (Lecture Notes in Computer Science; Vuosikerta 10508).Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Konferenssiartikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu
Open accessTiedosto