Jos olet muokannut tietoja Puressa, ne näkyvät pian tässä.

Henkilökohtainen profiili

Tutkimuksen ja opetuksen kuvaus

Background

My background is in statistics and bioinformatics. I joined the MRG group in 2009. Before that I have been working in various research projects starting from medical and pharmaceutical research in the University of Turku, and continuing to genomics research in the Agrifood Research Finland MTT. I have defended my PhD thesis in the University of Turku. My PhD thesis dealt with biological sequence analysis, more specially, conservation of protein sequence alignments and alignment quality.

Research

I have broad interests in bioinformatics and statistical genomics. Currently, I am interested in the use of next generation sequencing to study natural populations, especially in studying natural selection and adaptive evolution of Glanville fritillary butterfly.

In the MRG group, I participate in the large genome project of the Glanville fritillary butterfly. The aim of this project is to sequence, assemble and annotate the whole genome of the Glanville fritillary, and to make a genetic map. Genomic sequence will be used, for instance, for studying influence of genomic variation to various life-history traits. The other projects include studying differences in variation among different Glanville fritillary populations using next generation transcriptome sequencing. These projects aim at identifying genomic regions responsible to selection in the Glanville fritillary butterfly.

Keywords

  • 1181 Ekologia, evoluutiobiologia
  • 1184 Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia
  • 112 Tilastotiede

Kansainvälinen ja kotimainen yhteistyö Viimeisin maatasolla toteutettu yhteistyö. Saat syvempiä lisätietoja pisteitä napsauttamalla.

Julkaisut 1996 2018

  • 31 Artikkeli
  • 2 Konferenssiartikkeli
  • 1 Katsausartikkeli
  • 1 Väitöskirja

Sheep and cattle population dynamics based on ancient and modern DNA reflects key events in the human history of the North-East Baltic Sea Region

Niemi, M., Sajantila, A., Ahola, V. & Vilkki, J., 2018, julkaisussa : Journal of Archaeological Science: Reports. 18, s. 169-173 5 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Butterfly genomics: insights from the genome of Melitaea cinxia

Ahola, V., Wahlberg, N. & Frilander, M. J., huhtikuuta 2017, julkaisussa : Annales Zoologici Fennici. 54, 1-4, s. 275-291 17 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuKatsausartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Ecological and genetic basis of metapopulation persistence of the Glanville fritillary butterfly in fragmented landscapes

Hanski, I., Schulz, T., Wong, S. C., Ahola, V., Ruokolainen, A. & Ojanen, S. P., 17 helmikuuta 2017, julkaisussa : Nature Communications. 8, 11 Sivumäärä, 14504.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Karyotypes versus genomes: the nymphalid butterflies Melitaea cinxia, Danaus plexippus and D. chrysippus

Traut, W., Ahola, V. M., Smith, D., Gordon, I. & ffrench-Constant, R., 2 marraskuuta 2017, julkaisussa : Cytogenetic and Genome Research. 153, 1, s. 46-53

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

RNA sequencing reveals differential thermal regulation mechanisms between sexes of Glanville fritillary butterfly in the Tianshan Mountains, China

Lei, Y., Wang, Y., Ahola, V., Luo, S., Xu, C. & Wang, R., joulukuuta 2016, julkaisussa : Molecular Biology Reports. 43, 12, s. 1423-1433 11 Sivumäärä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Projektit 2009 2013

  • 1 Päättynyt

Aktiviteetit 2008 2017

OIKOS Finland pre-conference symposium in memory of Academician of Science, Professor Ilkka Hanski

Virpi Ahola (Osallistuja)
30 tammikuuta 2017

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

16th Congress of the European Society for Evolutionary Biology

Virpi Ahola (Puhuja)
20 elokuuta 201725 elokuuta 2017

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

MRC Scientific Advisory Board (SAB) Meeting

Virpi Ahola (Osallistuja)
14 elokuuta 201716 elokuuta 2017

Aktiviteetti: Tapahtumaan osallistumisen ja tapahtuman järjestämisen tyypitKonferensseihin, kursseille ja seminaareihin osallistuminen ja näiden järjestäminen

Butterflies as Genomic Models in Ecology and Evolution

Virpi Ahola (Puhuja)
27 heinäkuuta 201728 heinäkuuta 2017

Aktiviteetti: Puhe- tai esitystyypitSuullinen esitys

Max Plank Institute for Chemical Ecology

Virpi Ahola (Vieraileva tutkija)
4 syyskuuta 20167 syyskuuta 2016

Aktiviteetti: Ulkoisessa instituutiossa vierailun tyypitAkateeminen vierailu toiseen organisaatioon