Genome, transcriptome and proteome of the wood-decay fungus Phlebia radiata

Projektin yksityiskohdat

Kuvaus

Sequencing the nuclear and mitochondrial genome of the wild type heterokaryon Finnish isolate 79 of the wood-decaying white rot Basidiomycota genus type species Phlebia radiata. Analysis of the wood-decaying proteome and secretome.

Avaintulokset (älä täytä)

Mitochondrial genome is the second largest among fungi with exceptional features. High-quality genome assembly of the wild type heterokaryon isolate.
Lyhennetty nimiPrad genome
TilaPäättynyt
Todellinen alku/loppupvm03/01/201131/12/2017

Tieteenalat

  • 1183 Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia
  • 1181 Ekologia, evoluutiobiologia
  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia
  • 1184 Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia

Projektit

  • 2 Päättynyt

Tutkimustuotos

  • 4 Artikkeli
  • 1 Kirjan luku tai artikkeli

Hypoxia is regulating enzymatic wood decomposition and intracellular carbohydrate metabolism in filamentous white rot fungus

Mattila, H., Mäkinen, M. & Lundell, T., 24 helmikuuta 2020, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 13, 1, 17 Sivumäärä, 26.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Time-scale dynamics of proteome and transcriptome of the white-rot fungus Phlebia radiata: growth on spruce wood and decay effect on lignocellulose

Kuuskeri, J., Häkkinen, M., Laine, P., Smolander, O-P., Tamene, F., Miettinen, S., Nousiainen, P., Kemell, M., Auvinen, P. & Lundell, T., 5 syyskuuta 2016, julkaisussa : Biotechnology for Biofuels. 9, 22 Sivumäärä, 192.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto

Lignocellulose-converting enzyme activity profiles correlate with molecular systematics and phylogeny grouping in the incoherent genus Phlebia (Polyporales, Basidiomycota)

Kuuskeri, J. T., Mäkelä, M. R., Isotalo, J. M., Oksanen, I. M. & Lundell, T. K., 19 lokakuuta 2015, julkaisussa : BMC Microbiology. 15, 18 Sivumäärä, 217.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Open access
Tiedosto