Molecular mechanisms of mitochondrial enzymes, and their role in health and diseases

Tutkimustuotos

Tutkimustuotoksia vuodessa 2018 2018 2019 2022

• 20 Artikkeli
• 13 Konferenssiabstrakti
• 7 Posteri
• 3 Kirjan luku tai artikkeli
• 3 Muut aineistot
  • 2 Katsausartikkeli
  • 1 Pääkirjoitus

Tutkimustuotoksia vuodessa

Tutkimustuotoksia vuodessa

Hakutulokset

• 2022

  Threshold of heteroplasmic truncating MT-ATP6 mutation in reprogramming, Notch hyperactivation and motor neuron metabolism

  Kenvin, S., Torregrosa-Munumer, R., Reidelbach, M., Pennonen, J., Turkia, J. J., Rannila, E., Kvist, J., Sainio, M. T., Huber, N., Herukka, S.-K., Haapasalo, A., Auranen, M., Trokovic, R., Sharma, V., Ylikallio, E. & Tyynismaa, H., 15 maalisk. 2022, julkaisussa: Human Molecular Genetics. 31, 6, s. 958-974 17 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2021

  A novel approach to the detection of unusual mitochondrial protein change suggests hypometabolism of ancestral simians

  Akpinar, A., Sharma, V. & Dunn, C., 2021, (Julkaisematon) julkaisussa: bioRxiv. 36 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen

• Editorial: Computational and Experimental Insights in Redox-Coupled Proton Pumping in Proteins

  Sharma, V., Imhof, P. & Hellwig, P., 15 syysk. 2021, julkaisussa: Frontiers in Chemistry. 9, 2 Sivumäärä, 762612.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Pääkirjoitus › Tieteellinen

  Open access

  Tiedosto

• Electron Transfer Coupled to Conformational Dynamics in Cell Respiration

  Reidelbach, M., Zimmer, C., Meunier, B., Rich, P. R. & Sharma, V., 6 elok. 2021, julkaisussa: Frontiers in Molecular Biosciences. 8, 12 Sivumäärä, 711436.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• High-resolution structure and dynamics of mitochondrial complex I-Insights into the proton pumping mechanism

  Parey, K., Lasham, J., Mills, D. J., Djurabekova, A., Haapanen, O., Yoga, E. G., Xie, H., Kuhlbrandt, W., Sharma, V., Vonck, J. & Zickermann, V., marrask. 2021, julkaisussa: Science Advances. 7, 46, 12 Sivumäärä, 3221.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Hydrogen bonding rearrangement by a mitochondrial disease mutation in cytochrome bc1 perturbs heme bH redox potential and spin state

  Kuleta, P., Lasham, J., Sarewicz, M., Ekiert, I., Sharma, V., Ekiert, R. & Osyczka, A., 17 elok. 2021, julkaisussa: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 118, 33, 10 Sivumäärä, 2026169118.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Redox- and protonation-state driven substrate-protein dynamics in respiratory complex I

  Haapanen, O. & Sharma, V., lokak. 2021, julkaisussa: Current opinion in electrochemistry. 29, 6 Sivumäärä, 100741.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Targeting respiratory complex I – molecular mechanism and drug design

  Sharma, V., Lasham, J. & Haapanen, O., 2021, Clinical Bioenergetics. Ostojic, S. (toim.). London: Academic Press, s. 327-340 14 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen

  Open access

  Tiedosto
• 2020

  An Unusual Amino Acid Substitution Within Hummingbird Cytochrome c Oxidase Alters a Key Proton-Conducting Channel

  Dunn, C., Akpinar, A. & Sharma, V., 1 heinäk. 2020, julkaisussa: G3 - Genes genomes genetics. 10, 7, s. 2477-2485 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• A spontaneous mitonuclear epistasis converging on Rieske Fe-S protein exacerbates complex III deficiency in mice

  Purhonen, J., Grigorjev, V., Ekiert, R., Aho, N., Rajendran, J., Pietras, R., Truve, K., Wikström, M., Sharma, V., Osyczka, A., Fellman, V. & Kallijärvi, J., 16 tammik. 2020, julkaisussa: Nature Communications. 11, 1, 12 Sivumäärä, 322.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Coupling of quinone dynamics to proton pumping in respiratory complex I

  Haapanen, O., Reidelbach, M. & Sharma, V., 1 jouluk. 2020, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1861, 12, 6 Sivumäärä, 148287.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Essential role of accessory subunit LYRM6 in the mechanism of mitochondrial complex I

  Galemou Yoga, E., Parey, K., Djurabekova, A., Haapanen, O., Siegmund, K., Zwicker, K., Sharma, V., Zickermann, V. & Angerer, H., 26 jouluk. 2020, julkaisussa: Nature Communications. 11, 1, 8 Sivumäärä, 6008.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Mechanism of homodimeric cytokine receptor activation and dysregulation by oncogenic mutations

  Wilmes, S., Hafer, M., Vuorio, J., Tucker, J. A., Winkelmann, H., Loechte, S., Stanly, T. A., Prieto, K. D. P., Poojari, C., Sharma, V., Richter, C. P., Kurre, R., Hubbard, S. R., Garcia, K. C., Moraga, I., Vattulainen, I., Hitchcock, I. S. & Piehler, J., 7 helmik. 2020, julkaisussa: Science. 367, 6478, s. 643-+ 58 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Oversized ubiquinones as molecular probes for structural dynamics of the ubiquinone reaction site in mitochondrial respiratory complex I

  Uno, S., Masuya, T., Shinzawa-Itoh, K., Lasham, J., Haapanen, O., Shiba, T., Inaoka, D. K., Sharma, V., Murai, M. & Miyoshi, H., 21 helmik. 2020, julkaisussa: Journal of Biological Chemistry. 295, 8, s. 2449-2463 15 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Proton motive function of the terminal antiporter-like subunit in respiratory complex I

  Djurabekova, A., Haapanen, O. & Sharma, V., 1 heinäk. 2020, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1861, 7, 7 Sivumäärä, 148185.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto
• 2019

  After all, how many catalytically active quinone molecules are bound to the respiratory complex I?

  Haapanen, O., Parey, K., Yoga, E. G., Zickermann, V. & Sharma, V., kesäk. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri

• After all, how many catalytically active quinone molecules are bound to the respiratory complex I?

  Haapanen, O., Parey, K., Yoga, E. G., Zickermann, V. & Sharma, V., elok. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Atomistic insights into cardiolipin binding sites of cytochrome c oxidase

  Malkamäki, A. E. M. & Sharma, V., 1 maalisk. 2019, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1860, 3, s. 224-232 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Cytochrome c Oxidase: Remaining Questions About the Catalytic Mechanism

  Wikström, M. & Sharma, V., 2019, Oxygen Production and Reduction in Artificial and Natural Systems. Barber, J., Ruban, A. V. & Nixon, P. J. (toim.). Singapore: World Scientific, s. 135-145 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen

  Open access

  Tiedosto

• High-resolution cryo-EM structures of respiratory complex I: Mechanism, assembly, and disease

  Parey, K., Haapanen, O., Sharma, V., Köfeler, H., Züllig, T., Prinz, S., Siegmund, K., Wittig, I., Mills, D. J., Vonck, J., Kühlbrandt, W. & Zickermann, V., jouluk. 2019, julkaisussa: Science Advances. 5, 12, 10 Sivumäärä, 9484.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Modelling insights into the function of respiratory complex cytochrome bc1

  Lasham, J., Osyczka, A. & Sharma, V., 20 elok. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri › vertaisarvioitu

• Multiscale simulation approaches to understand biological energy conversion in the inner mitochondrial membrane

  Sharma, V., Haapanen, O., Djurabekova, A., Yoga, E. G., Parey, K. & Zickermann, V., elok. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Mutations in a conserved loop in the PSST subunit of respiratory complex I affect ubiquinone binding and dynamics

  Yoga, E. G., Haapanen, O., Wittig, I., Siegmund, K., Sharma, V. & Zickermann, V., 1 heinäk. 2019, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1860, 7, s. 573-581 9 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• NMR structure of a non-conjugatable, ADP-ribosylation associated, ubiquitin-like domain from Tetrahymena thermophila polyubiquitin locus

  Chiarini, V., Tossavainen, H., Sharma, V. & Colotti, G., huhtik. 2019, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects. 1863, 4, s. 749-759 11 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Proton Transfer in Cytochrome c Oxidase

  Reidelbach, M., Sharma, V. & Rich, P. R., 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu

• Proton Transfer in Cytochrome c Oxidase

  Reidelbach, M., Sharma, V. & Rich, P. R., 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri › vertaisarvioitu

• Proton transfer in cytochrome c oxidase studied by multiscale simulations

  Reidelbach, M., Sharma, V. & Rich, P. R., 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu

• Proton transfer in cytochrome c oxidase studied by multiscale simulations

  Reidelbach, M., Sharma, V. & Rich, P. R., 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri › vertaisarvioitu

• Proton transfer pathways in the antiporter-like subunits of complex I revealed by multiscale simulations

  Djurabekova, A., Haapanen, O. & Sharma, V., elok. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Proton transfer pathways in the antiporter-like subunits of complex I revealed by multiscale simulations

  Djurabekova, A., Haapanen, O. & Sharma, V., 1 heinäk. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Role of Second Quinone Binding Site in Proton Pumping by Respiratory Complex I

  Haapanen, O., Djurabekova, A. & Sharma, V., 9 huhtik. 2019, julkaisussa: Frontiers in Chemistry. 7, 14 Sivumäärä, 221.

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• The H channel is not a proton transfer path in yeast cytochrome c oxidase

  Malkamäki, A., Meunier, B., Reidelbach, M., Rich, P. R. & Sharma, V., 1 syysk. 2019, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1860, 9, s. 717-723 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• The high-resolution cryo-EM structure of respiratory complex I from the aerobic yeast Yarrowia lipolytica

  Zickermann, V., Parey, K., Haapanen, O., Sharma, V., Mills, D. J., Vonck, J. & Kuhlbrandt, W., elok. 2019.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• 2018

  A Common Core Coupling Mechanism for Mitochondrial and Bacterial A-type Cytochrome c Oxidases?

  Rich, P. R., Sharma, V., Meunier, B. & Marechal, A., 2018, s. e21. 1 Sivumäärä.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu

• A highly conserved loop in the PSST subunit of complex I is essential for ubiquinone binding and reduction

  Yoga, E. G., Haapanen, O., Sharma, V. & Zickermann, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• A modeling and simulation perspective on the mechanism and function of respiratory complex I

  Haapanen, O. & Sharma, V., heinäk. 2018, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1859, 7, s. 510-523 14 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Katsausartikkeli › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Cytochrome c oxidase – a molecular machine

  Wikström, M. K. F. & Sharma, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu

• Large scale atomistic simulations unveil key role of ubiquinone dynamics in proton pumping by mitochondrial complex I

  Haapanen, O. & Sharma, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri

• Multi-scale simulation approaches to understand biological energy conversion in the inner mitochondrial membrane

  Sharma, V., Djurabekova, A. & Haapanen, O., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Multiscale simulations on quinone binding sites in respiratory complex

  Lasham, J. F., Haapanen, O. A. & Sharma, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri › vertaisarvioitu

• Novel insights in to lipid-protein interactions from large scale atomistic molecular dynamics simulations of cytochrome c oxidase

  Malkamäki, A. & Sharma, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti › vertaisarvioitu

• Oxygen Reduction and Proton Translocation by Respiratory Cytochrome c Oxidase

  Wikström, M. K. F. & Sharma, V., 2018, Dioxygen-dependent Heme Enzymes. Ikeda-Saito, M. & Raven, E. (toim.). Cambridge: Royal Society of Chemistry, s. 311-333 23 Sivumäärä (RSC Metallobiology Series; Vuosikerta 13).

  Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussa › Kirjan luku tai artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

• Proton pumping by cytochrome c oxidase: A 40 year anniversary

  Wikström, M. & Sharma, V., syysk. 2018, julkaisussa: Biochimica et Biophysica Acta. Bioenergetics. 1859, 9, s. 692-698 7 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto

• Proton Transfer in Cytochrome c Oxidase

  Reidelbach, M. U. & Sharma, V., 2018.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Posteri › vertaisarvioitu

• Quinone Dynamics Coupled to Proton Pumping in Bacterial and Mammalian Respiratory Complex I

  Haapanen, O., Djurabekova, A. & Sharma, V., 2018. 1 Sivumäärä.

  Tutkimustuotos: Konferenssimateriaalit › Konferenssiabstrakti

• Redox-coupled quinone dynamics in the respiratory complex I

  Warnau, J., Sharma, V., Gamiz-Hernandez, A. P., Di Luca, A., Haapanen, O., Vattulainen, I., Wikström, M., Hummer, G. & Kaila, V. R. I., 4 syysk. 2018, julkaisussa: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 36, s. E8413-E8420 8 Sivumäärä

  Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

  Open access

  Tiedosto