Aligning optical maps to de Bruijn graphs

Kingshuk Mukherjee, Bahar Alipanahi, Tamer Kahveci, Leena Salmela, Christina Boucher

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Alkuperäiskielienglanti
LehtiBioinformatics
Vuosikerta35
Numero18
Sivut3250-3256
Sivumäärä7
ISSN1367-4803
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 15 syyskuuta 2019
OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä, vertaisarvioitu

Tieteenalat

  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia
  • 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet

Lainaa tätä

Mukherjee, K., Alipanahi, B., Kahveci, T., Salmela, L., & Boucher, C. (2019). Aligning optical maps to de Bruijn graphs. Bioinformatics, 35(18), 3250-3256. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz069
Mukherjee, Kingshuk ; Alipanahi, Bahar ; Kahveci, Tamer ; Salmela, Leena ; Boucher, Christina. / Aligning optical maps to de Bruijn graphs. Julkaisussa: Bioinformatics. 2019 ; Vuosikerta 35, Nro 18. Sivut 3250-3256.
@article{97c582b16cdd42c083b419284f03afb5,
title = "Aligning optical maps to de Bruijn graphs",
keywords = "ORDERED RESTRICTION MAPS, GENOME, ALIGNMENT, SEQUENCE, ALGORITHM, SEARCH, 1182 Biochemistry, cell and molecular biology, 113 Computer and information sciences",
author = "Kingshuk Mukherjee and Bahar Alipanahi and Tamer Kahveci and Leena Salmela and Christina Boucher",
year = "2019",
month = "9",
day = "15",
doi = "10.1093/bioinformatics/btz069",
language = "English",
volume = "35",
pages = "3250--3256",
journal = "Bioinformatics",
issn = "1367-4803",
publisher = "Oxford University Press",
number = "18",

}

Mukherjee, K, Alipanahi, B, Kahveci, T, Salmela, L & Boucher, C 2019, 'Aligning optical maps to de Bruijn graphs', Bioinformatics, Vuosikerta 35, Nro 18, Sivut 3250-3256. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz069

Aligning optical maps to de Bruijn graphs. / Mukherjee, Kingshuk; Alipanahi, Bahar; Kahveci, Tamer; Salmela, Leena; Boucher, Christina.

julkaisussa: Bioinformatics, Vuosikerta 35, Nro 18, 15.09.2019, s. 3250-3256.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

TY - JOUR

T1 - Aligning optical maps to de Bruijn graphs

AU - Mukherjee, Kingshuk

AU - Alipanahi, Bahar

AU - Kahveci, Tamer

AU - Salmela, Leena

AU - Boucher, Christina

PY - 2019/9/15

Y1 - 2019/9/15

KW - ORDERED RESTRICTION MAPS

KW - GENOME

KW - ALIGNMENT

KW - SEQUENCE

KW - ALGORITHM

KW - SEARCH

KW - 1182 Biochemistry, cell and molecular biology

KW - 113 Computer and information sciences

U2 - 10.1093/bioinformatics/btz069

DO - 10.1093/bioinformatics/btz069

M3 - Article

VL - 35

SP - 3250

EP - 3256

JO - Bioinformatics

JF - Bioinformatics

SN - 1367-4803

IS - 18

ER -

Mukherjee K, Alipanahi B, Kahveci T, Salmela L, Boucher C. Aligning optical maps to de Bruijn graphs. Bioinformatics. 2019 syys 15;35(18):3250-3256. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btz069