Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data

Matti Pirinen, Tuuli Lappalainen, Noah A. Zaitlen, Emmanouil T. Dermitzakis, Peter Donnelly, Mark I. McCarthy, Manuel A. Rivas, GTEx Consortium

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Alkuperäiskielienglanti
LehtiBioinformatics
Vuosikerta31
Numero15
Sivut2497-2504
Sivumäärä8
ISSN1367-4803
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 1 elokuuta 2015
OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä, vertaisarvioitu

Tieteenalat

  • 3111 Biolääketieteet
  • 318 Lääketieteen bioteknologia
  • 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet

Lainaa tätä

Pirinen, M., Lappalainen, T., Zaitlen, N. A., Dermitzakis, E. T., Donnelly, P., McCarthy, M. I., ... GTEx Consortium (2015). Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data. Bioinformatics, 31(15), 2497-2504. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv074
Pirinen, Matti ; Lappalainen, Tuuli ; Zaitlen, Noah A. ; Dermitzakis, Emmanouil T. ; Donnelly, Peter ; McCarthy, Mark I. ; Rivas, Manuel A. ; GTEx Consortium. / Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data. Julkaisussa: Bioinformatics. 2015 ; Vuosikerta 31, Nro 15. Sivut 2497-2504.
@article{49aa595d4636461da8b525229d32687d,
title = "Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data",
keywords = "GENE-EXPRESSION, STATISTICAL FRAMEWORK, TRANSCRIPTOME, VARIANTS, ASSOCIATION, DISEASE, EQTL, 3111 Biomedicine, 318 Medical biotechnology, 113 Computer and information sciences",
author = "Matti Pirinen and Tuuli Lappalainen and Zaitlen, {Noah A.} and Dermitzakis, {Emmanouil T.} and Peter Donnelly and McCarthy, {Mark I.} and Rivas, {Manuel A.} and {GTEx Consortium}",
year = "2015",
month = "8",
day = "1",
doi = "10.1093/bioinformatics/btv074",
language = "English",
volume = "31",
pages = "2497--2504",
journal = "Bioinformatics",
issn = "1367-4803",
publisher = "Oxford University Press",
number = "15",

}

Pirinen, M, Lappalainen, T, Zaitlen, NA, Dermitzakis, ET, Donnelly, P, McCarthy, MI, Rivas, MA & GTEx Consortium 2015, 'Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data', Bioinformatics, Vuosikerta 31, Nro 15, Sivut 2497-2504. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv074

Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data. / Pirinen, Matti; Lappalainen, Tuuli; Zaitlen, Noah A.; Dermitzakis, Emmanouil T.; Donnelly, Peter; McCarthy, Mark I.; Rivas, Manuel A.; GTEx Consortium.

julkaisussa: Bioinformatics, Vuosikerta 31, Nro 15, 01.08.2015, s. 2497-2504.

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

TY - JOUR

T1 - Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data

AU - Pirinen, Matti

AU - Lappalainen, Tuuli

AU - Zaitlen, Noah A.

AU - Dermitzakis, Emmanouil T.

AU - Donnelly, Peter

AU - McCarthy, Mark I.

AU - Rivas, Manuel A.

AU - GTEx Consortium

PY - 2015/8/1

Y1 - 2015/8/1

KW - GENE-EXPRESSION

KW - STATISTICAL FRAMEWORK

KW - TRANSCRIPTOME

KW - VARIANTS

KW - ASSOCIATION

KW - DISEASE

KW - EQTL

KW - 3111 Biomedicine

KW - 318 Medical biotechnology

KW - 113 Computer and information sciences

U2 - 10.1093/bioinformatics/btv074

DO - 10.1093/bioinformatics/btv074

M3 - Article

VL - 31

SP - 2497

EP - 2504

JO - Bioinformatics

JF - Bioinformatics

SN - 1367-4803

IS - 15

ER -

Pirinen M, Lappalainen T, Zaitlen NA, Dermitzakis ET, Donnelly P, McCarthy MI et al. Assessing allele-specific expression across multiple tissues from RNA-seq read data. Bioinformatics. 2015 elo 1;31(15):2497-2504. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv074