Bacterial and Fungal Profiles as Markers of Infliximab Drug Response in Inflammatory Bowel Disease

Rebecka Ventin-Holmberg, Anja Eberl, Schahzad Saqib, Katri Korpela, Seppo Virtanen, Anne Salonen, Taina Marianne Sipponen, Päivi Saavalainen, Eija Nissilä

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Abstrakti

Tulehdukselliset suolistosairaudet (IBD) Crohnin tauti (CD) ja haavainen paksusuolentulehdus (UC) ovat maailmanlaajuisesti lisääntyviä sairauksia, joihin liittyy muuntunut suoliston mikrobisto. Infliksimabi (IFX) on TNF-alfan estäjä, jota käytetään IBD:n hoidossa, vaikkakin kolmas osa potilaista voi jäädä ilman hoitovastetta tai menettää sen. Luotettavia testejä

hoitovasteen ennustamiseksi ei ole vielä saatavilla. Tutkimuksemme tavoitteena oli selvittää potilaiden ulosteen bakteerit, sienet ja hiivat infliksimabihoidon aikana sekä etsiä hoitovastetta ennustavia mittareita IBD potilailta. Tutkimuksessamme 72 IBD-potilasta (25 CD ja 47 UC) aloitti infliksimabihoidon ja heitä seurattiin vuoden ajan hoidon aloituksesta tai hoidon keskeytykseen saakka. Potilaiden ulostenäytteistä määritettiin sekvensointia hyödyntäen erikseen suoliston bakteerit (16S rRNA geenistä) sekä hiivat ja sienet (ITS1 geenin alueesta). Mikrobiston profiilit määritettiin ennen hoidon aloitusta, 2, 6, 12 viikkoa sekä 1 vuosi hoidon aloituksen jälkeen. IFX hoidon vaste määritettiin kolonoskopialla ja kliinisesti 12 viikon hoidon jälkeen. Tutkimuksessa havaittiin, että potilaiden ulosteen bakteerit sekä sienet ja hiivat erosivat merkittävästi toisistaan infliksimabihoitovasteen mukaan jo ennen hoidon aloitusta. Potilailla, jotka eivät saaneet vastetta hoidosta, oli vähemmän lyhytketjuisia rasvahappoja tuottavia bakteereja erityisesti Clostridia-luokasta sekä enemmän tulehdusta aiheuttavia bakteereja ja sieniä mm. Candida-suvusta. Tämä tulos testattiin bakteerien osalta myös ennustetestillä (ROC), joka erotti toisistaan ne potilaat, jotka saivat hyvän vasteen ja ne, jotka eivät saaneet vastetta (area under the curve > 0.8). Tulosten perusteella ulosteen bakteerit ja hiivat voisivat sopia ennustaviksi mittareiksi IBD-potilaiden infliksimabihoidon vasteen ennustamiseen.

Alkuperäiskielisuomi
LehtiJournal of Crohn's and Colitis
ISSN1873-9946
DOI - pysyväislinkit
TilaE-pub ahead of print - 10 joulukuuta 2020
OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä, vertaisarvioitu

Siteeraa tätä