Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT)

J Alneberg, BS Bjarnason, I de Bruijn, M Schirmer, J Quick, Umer Ijaz, Leo Mikael Lahti, NJ Loman, AF Andersson, Christopher Quince

Tutkimustuotos: Ei-tekstimuotoinenOhjelmistoTieteellinen

Kuvaus

A program for unsupervised binning of metagenomic contigs by using nucleotide composition, coverage data in multiple samples and linkage data from paired end reads.
Alkuperäiskielienglanti
TilaJulkaistu - 2014
OKM-julkaisutyyppiI2 Tieto- ja viestintätekniset sovellukset

Tieteenalat

  • 113 Tietojenkäsittely- ja informaatiotieteet

Lainaa tätä

Alneberg, J. (Kirjoittaja), Bjarnason, BS. (Kirjoittaja), de Bruijn, I. (Kirjoittaja), Schirmer, M. (Kirjoittaja), Quick, J. (Kirjoittaja), Ijaz, U. (Kirjoittaja), ... Quince, C. (Kirjoittaja). (2014). Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT). Ohjelmisto, Haettu kohteesta https://github.com/BinPro/CONCOCT
Alneberg, J (Kirjoittaja) ; Bjarnason, BS (Kirjoittaja) ; de Bruijn, I (Kirjoittaja) ; Schirmer, M (Kirjoittaja) ; Quick, J (Kirjoittaja) ; Ijaz, Umer (Kirjoittaja) ; Lahti, Leo Mikael (Kirjoittaja) ; Loman, NJ (Kirjoittaja) ; Andersson, AF (Kirjoittaja) ; Quince, Christopher (Kirjoittaja). / Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT). [Ohjelmisto].
@misc{6da760b355f749d0bd6fb6f1921d2b04,
title = "Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT)",
abstract = "A program for unsupervised binning of metagenomic contigs by using nucleotide composition, coverage data in multiple samples and linkage data from paired end reads.",
keywords = "113 Computer and information sciences, bioinformatics, sequencing, metagenomics",
author = "J Alneberg and BS Bjarnason and {de Bruijn}, I and M Schirmer and J Quick and Umer Ijaz and Lahti, {Leo Mikael} and NJ Loman and AF Andersson and Christopher Quince",
year = "2014",
language = "English",

}

Alneberg, J, Bjarnason, BS, de Bruijn, I, Schirmer, M, Quick, J, Ijaz, U, Lahti, LM, Loman, NJ, Andersson, AF & Quince, C, Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT), 2014, Ohjelmisto.
Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT). Alneberg, J (Kirjoittaja); Bjarnason, BS (Kirjoittaja); de Bruijn, I (Kirjoittaja); Schirmer, M (Kirjoittaja); Quick, J (Kirjoittaja); Ijaz, Umer (Kirjoittaja); Lahti, Leo Mikael (Kirjoittaja); Loman, NJ (Kirjoittaja); Andersson, AF (Kirjoittaja); Quince, Christopher (Kirjoittaja). 2014.

Tutkimustuotos: Ei-tekstimuotoinenOhjelmistoTieteellinen

TY - ADVS

T1 - Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT)

AU - Alneberg, J

AU - Bjarnason, BS

AU - de Bruijn, I

AU - Schirmer, M

AU - Quick, J

AU - Ijaz, Umer

AU - Lahti, Leo Mikael

AU - Loman, NJ

AU - Andersson, AF

AU - Quince, Christopher

PY - 2014

Y1 - 2014

N2 - A program for unsupervised binning of metagenomic contigs by using nucleotide composition, coverage data in multiple samples and linkage data from paired end reads.

AB - A program for unsupervised binning of metagenomic contigs by using nucleotide composition, coverage data in multiple samples and linkage data from paired end reads.

KW - 113 Computer and information sciences

KW - bioinformatics

KW - sequencing

KW - metagenomics

M3 - Software

ER -

Alneberg J (Kirjoittaja), Bjarnason BS (Kirjoittaja), de Bruijn I (Kirjoittaja), Schirmer M (Kirjoittaja), Quick J (Kirjoittaja), Ijaz U (Kirjoittaja) et al. Clustering cONtigs with COverage and ComposiTion (CONCOCT) 2014.