Functional data analysis for endoscopic spectral measurements

Vladimir Bochko, Maarit Luukkainen-Soilu, Petri Valisuo, Olli A. T. Peltoniemi, Per H. Rosenberg, Antti K. Sukura, Pernilla Syrja, Thomas Spillmann, Jarmo Alander

Tutkimustuotos: Artikkeli kirjassa/raportissa/konferenssijulkaisussaKonferenssiartikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Abstrakti

We use endoscopy for VIS-NIR spectral analysis of the porcine gastrointestinal wall. A flexible endoscope was implemented with a fiber optic probe for measuring spectra. The spectral data were measured by a spectrophotometer (Ocean Optics HR4000). The presented measurements are the spectra from three locations of the gastrointestinal wall of a healthy pig (gastric corpus and antrum, duodenum) taken in a retrograde order. We tested several features obtained by functional data analysis. The features were linearly combined using principal component analysis (PCA) and partial least squares (PLS). Finally, the support vector classifier (SVC) and PLS were used to classify spectra from corpus, antrum and duodenum. The experiments confirm the feasibility of our methods for classification of spectra of pig intestines.
Alkuperäiskielienglanti
OtsikkoSaratov fall meeting 2009: international school for junior scientists and students on optics, laser physics, and biophotonics
Sivumäärä6
JulkaisupaikkaBellingham
KustantajaSPIE
Julkaisupäivä2010
SivutART 754702
ISBN (painettu)978-0-8194-7943-3
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 2010
OKM-julkaisutyyppiA4 Artikkeli konferenssijulkaisuussa
TapahtumaSaratov Fall Meeting 2009 - Saratov, Venäjä
Kesto: 1 tammikuuta 1800 → …

Julkaisusarja

NimiProceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering
Vuosikerta7547
ISSN (painettu)0277-786X

Lisätietoja


Volume:
Proceeding volume:

Tieteenalat

  • 114 Fysiikka

Siteeraa tätä

Bochko, V., Luukkainen-Soilu, M., Valisuo, P., Peltoniemi, O. A. T., Rosenberg, P. H., Sukura, A. K., Syrja, P., Spillmann, T., & Alander, J. (2010). Functional data analysis for endoscopic spectral measurements. teoksessa Saratov fall meeting 2009: international school for junior scientists and students on optics, laser physics, and biophotonics (Sivut ART 754702). (Proceedings of SPIE, the International Society for Optical Engineering; Vuosikerta 7547). SPIE. https://doi.org/10.1117/12.852750