Immunogenomic Landscape of Hematological Malignancies

Olli Dufva, Petri Pölönen, Oscar Brück, Mikko A. I. Keränen, Jay Klievink, Juha Mehtonen, Jani Huuhtanen, Ashwini Kumar, Disha Malani, Sanna Siitonen, Matti Kankainen, Bishwa Ghimire, Jenni Lahtela, Pirkko Mattila, Markus Vähä-Koskela, Krister Wennerberg, Kirsi Granberg, Suvi-Katri Leivonen, Leo Meriranta, Caroline HeckmanSirpa Leppä, Matti Nykter, Olli Lohi, Merja Heinäniemi, Satu Mustjoki

Tutkimustuotos: ArtikkelijulkaisuArtikkeliTieteellinenvertaisarvioitu

Abstrakti

Understanding factors that shape the immune landscape across hematological malignancies is essential for immunotherapy development. We integrated over 8,000 transcriptomes and 2,000 samples with multilevel genomics of hematological cancers to investigate how immunological features are linked to cancer subtypes, genetic and epigenetic alterations, and patient survival, and validated key findings experimentally. Infiltration of cytotoxic lymphocytes was associated with TP53 and myelodysplasia-related changes in acute myeloid leukemia, and activated B cell-like phenotype and interferon-γ response in lymphoma. CIITA methylation regulating antigen presentation, cancer type-specific immune checkpoints, such as VISTA in myeloid malignancies, and variation in cancer antigen expression further contributed to immune heterogeneity and predicted survival. Our study provides a resource linking immunology with cancer subtypes and genomics in hematological malignancies.

Alkuperäiskielienglanti
LehtiCancer Cell
Vuosikerta38
Numero3
Sivut380-399
Sivumäärä33
ISSN1535-6108
DOI - pysyväislinkit
TilaJulkaistu - 14 syyskuuta 2020
OKM-julkaisutyyppiA1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä, vertaisarvioitu

Tieteenalat

  • 3122 Syöpätaudit
  • 3111 Biolääketieteet
  • 1182 Biokemia, solu- ja molekyylibiologia

Siteeraa tätä