QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability

Sanaz Jamalzadeh; Antti Häkkinen; Noora Andersson; Kaisa Huhtinen; Anna Laury; Sakari Hietanen; Johanna Hynninen; Jaana Oikkonen; Olli Carpen; Anni Virtanen; Sampsa Hautaniemi

doi:10.1038/s41374-022-00743-5

QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability

Sanaz Jamalzadeh, Antti Häkkinen, Noora Andersson, Kaisa Huhtinen, Anna Laury, Sakari Hietanen, Johanna Hynninen, Jaana Oikkonen, Olli Carpen, Anni Virtanen, Sampsa Hautaniemi

Tutkimustuotos: Artikkelijulkaisu › Artikkeli › Tieteellinen › vertaisarvioitu

Alkuperäiskieli	englanti
Lehti	Laboratory Investigation
Vuosikerta	102
Numero	7
Sivut	753-761
Sivumäärä	9
ISSN	0023-6837
DOI - pysyväislinkit	https://doi.org/10.1038/s41374-022-00743-5
Tila	Julkaistu - heinäk. 2022
OKM-julkaisutyyppi	A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä, vertaisarvioitu

Tieteenalat

3111 Biolääketieteet

Pääsy asiakirjaan

10.1038/s41374-022-00743-5Lisenssi: CC BY

s41374-022-00743-5Lopullinen julkaistu versio, 2,79 MBLisenssi: CC BY

Siteeraa tätä

Jamalzadeh, S., Häkkinen, A., Andersson, N., Huhtinen, K., Laury, A., Hietanen, S., Hynninen, J., Oikkonen, J., Carpen, O., Virtanen, A., & Hautaniemi, S. (2022). QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability. Laboratory Investigation, 102(7), 753-761. https://doi.org/10.1038/s41374-022-00743-5

@article{324c4c80fe5148f3a3e009585c807c6f,

title = "QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability",

keywords = "GENE AMPLIFICATION, CANCER, 3111 Biomedicine",

author = "Sanaz Jamalzadeh and Antti H{\"a}kkinen and Noora Andersson and Kaisa Huhtinen and Anna Laury and Sakari Hietanen and Johanna Hynninen and Jaana Oikkonen and Olli Carpen and Anni Virtanen and Sampsa Hautaniemi",

year = "2022",

month = jul,

doi = "10.1038/s41374-022-00743-5",

language = "English",

volume = "102",

pages = "753--761",

journal = "Laboratory Investigation",

issn = "0023-6837",

publisher = "Williams & Wilkins",

number = "7",

}

Jamalzadeh, S , Häkkinen, A , Andersson, N, Huhtinen, K, Laury, A, Hietanen, S, Hynninen, J, Oikkonen, J , Carpen, O , Virtanen, A & Hautaniemi, S 2022, 'QuantISH: RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability', Laboratory Investigation, Vuosikerta 102, Nro 7, Sivut 753-761. https://doi.org/10.1038/s41374-022-00743-5

TY - JOUR

T1 - QuantISH

T2 - RNA in situ hybridization image analysis framework for quantifying cell type-specific target RNA expression and variability

AU - Jamalzadeh, Sanaz

AU - Häkkinen, Antti

AU - Andersson, Noora

AU - Huhtinen, Kaisa

AU - Laury, Anna

AU - Hietanen, Sakari

AU - Hynninen, Johanna

AU - Oikkonen, Jaana

AU - Carpen, Olli

AU - Virtanen, Anni

AU - Hautaniemi, Sampsa

PY - 2022/7

Y1 - 2022/7

KW - GENE AMPLIFICATION

KW - CANCER

KW - 3111 Biomedicine

U2 - 10.1038/s41374-022-00743-5

DO - 10.1038/s41374-022-00743-5

M3 - Article

SN - 0023-6837

VL - 102

SP - 753

EP - 761

JO - Laboratory Investigation

JF - Laboratory Investigation

IS - 7

ER -