Biomolecular Complex Purification Core Facility (Biocomplex)

Forskningsresultat

Forskningsresultat per år 2012 2021

• 41 Artikel
• 14 Översiktsartikel
• 1 Kapitel
• 1 Ledare

Forskningsresultat per år

Forskningsresultat per år

Sökresultat

• 2021

  Structure Unveils Relationships between RNA Virus Polymerases

  Mönttinen, H., Ravantti, J. & Poranen, M., 2021, I : Viruses-Basel. 13, 2, 313.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång
• 2020

  Analysis of spounaviruses as a case study for the overdue reclassification of tailed phages

  Barylski, J., Enault, F., Dutilh, B. E., Schuller, M. B. P., Edwards, R. A., Gillis, A., Klumpp, J., Knezevic, P., Krupovic, M., Kuhn, J. H., Lavigne, R., Oksanen, H. M., Sullivan, M. B., Jang, H. B., Simmonds, P., Aiewsakun, P., Wittmann, J., Tolstoy, I., Brister, J. R., Kropinki, A. & 1 andra, Adriaenssens, E. M., jan 2020, I : Systematic Biology. 69, 1, s. 110-123 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Enzymatically synthesized 2'-fluoro-modified Dicer-substrate siRNA swarms against herpes simplex virus demonstrate enhanced antiviral efficacy and low cytotoxicity

  Levanova, A., Kalke, K., Lund, L., Sipari, N., Sadeghi, M., Nyman, M., Paavilainen, H., Hukkanen, V. & Poranen, M., okt 2020, I : Antiviral Research. 182, 8 s., 104916.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

• Pleomorphic archaeal viruses: the family Pleolipoviridae is expanding by seven new species

  Demina, T. A. & Oksanen, H. M., nov 2020, I : Archives of Virology. 165, 11, s. 2723-2731 9 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Temperature controlled high-throughput magnetic tweezers show striking difference in activation energies of replicating viral RNA-dependent RNA polymerases

  Seifert, M., van Nies, P., Stal Papini, F., Arnold, J., Poranen, M., Cameron, C. E., Depken, M. & Dulin, D., jun 2020, I : Nucleic Acids Research. 48, 10, s. 5591–5602 12 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2019

  Microbial production of lipid-protein vesicles using enveloped bacteriophage phi6

  Lyytinen, O. L., Starkova, D. & Poranen, M. M., 7 feb 2019, I : Microbial Cell Factories. 18, 29, 9 s., 29.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Multiple liquid crystalline geometries of highly compacted nucleic acid in a dsRNA virus

  Ilca, S., Sun, X., El Omari, K., Kotecha, A., Haas, F. D., DiMaio, F., Grimes, J. M., Stuart, D. I., Poranen, M. M. & Huiskonen, J. T., 13 jun 2019, I : Nature. 570, s. 252-+

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Novel haloarchaeal viruses from Lake Retba infecting Haloferax and Halorubrum species

  Mizuno, C. M., Prajapati, B., Lucas-Staat, S., Sime-Ngando, T., Forterre, P., Bamford, D. H., Prangishvili, D., Krupovic, M. & Oksanen, H. M., jun 2019, I : Environmental Microbiology. 21, 6, s. 2129-2147 19 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Structural basis for assembly of vertical single β-barrel viruses

  Santos-Perez, I., Charro, D., Gil-Carton, D., Azkargorta, M., Elortza, F., Bamford, D. H., Oksanen, H. M. & Abrescia, N. G. A., 12 mar 2019, I : Nature Communications. 10, 9 s., 1184.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The structure of a prokaryotic viral envelope protein expands the landscape of membrane fusion proteins

  El Omari, K., Li, S., Kotecha, A., Walter, T. S., Bignon, E., Harlos, K., Somerharju, P., Haas, F. D., Clare, D., Molin, M., Hurtado, F., Li, M., Grimes, J. M., Bamford, D. H., Tischler, N. D., Huiskonen, J. T., Stuart, D. I. & Roine, E., 19 feb 2019, I : Nature Communications. 10, 11 s., 846.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2018

  Application of steric exclusion chromatography on monoliths for separation and purification of RNA molecules

  Levanova, A. & Poranen, M. M., 2 nov 2018, I : Journal of Chromatography. A. 1574, s. 50-59 10 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Asymmetrical flow field-flow fractionation in purification of an enveloped bacteriophage φ 6

  Lampi, M., Oksanen, H. M., Meier, F., Moldenhauer, E., Poranen, M. M., Bamford, D. H. & Eskelin, K., 15 sep 2018, I : Journal of Chromatography. B. 1095, s. 251-257 7 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Controlled Disassembly and Purification of Functional Viral Subassemblies Using Asymmetrical Flow Field-Flow Fractionation (AF4)

  Eskelin, K. J. & Poranen, M. M., nov 2018, I : Viruses-Basel. 10, 11, 13 s., 579.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Dual Role of a Viral Polymerase in Viral Genome Replication and Particle Self-Assembly

  Sun, X., Ilca, S. L., Huiskonen, J. T. & Poranen, M. M., 2018, I : mBio. 9, 5, 14 s., ARTN e01242-18.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Extremely halophilic pleomorphic archaeal virus HRPV9 extends the diversity of pleolipoviruses with integrases

  Atanasova, N. S., Demina, T. A., Krishnam Rajan Shanthi, S. N. V., Oksanen, H. M. & Bamford, D. H., nov 2018, I : Research in Microbiology. 169, 9, s. 500-504 5 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Genome Sequence of PM2-Like Phage Cr39582, Induced from a Pseudoalteromonas sp. Isolated from the Gut of Ciona robusta

  Leigh, B., Breitbart, M., Oksanen, H. M., Bamford, D. H. & Dishaw, L., maj 2018, I : Genome Announcements. 6, 21, 2 s., UNSP e00368-18.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Membrane-containing virus particles exhibit the mechanics of a composite material for genome protection

  Azinas, S., Bano, F., Torca, I., Bamford, D. H., Schwartz, G. A., Esnaola, J., Oksanen, H. M., Richter, R. P. & Abrescia, N. G., 28 apr 2018, I : Nanoscale. 10, 16, s. 7769-7779 11 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The first known virus isolates from Antarctic sea ice have complex infection patterns

  Luhtanen, A-M., Eronen-Rasimus, E. L., Oksanen, H. M., Tison, J-L., Delille, B., Dieckmann, G. S., Rintala, J-M. & Bamford, D. H., apr 2018, I : FEMS Microbiology Ecology. 94, 4, 15 s., 028.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The unexplored diversity of pleolipoviruses: the surprising case of two viruses with identical major structural modules

  Atanasova, N. S., Heiniö, C. H., Demina, T. A., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., mar 2018, I : Genes. 9, 3, 18 s., 131.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2017

  Halophilic viruses with varying biochemical and biophysical properties are amenable to purification with asymmetrical flow field-flow fractionation

  Eskelin, K., Lampi, M., Meier, F., Moldenhauer, E., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., nov 2017, I : Extremophiles. 21, 6, s. 1119-1132 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Membrane-assisted viral DNA ejection

  Santos-Perez, I., Oksanen, H. M., Bamford, D. H., Goni, F. M., Reguera, D. & Abrescia, N. G. A., mar 2017, I : Biochimica et Biophysica Acta. General Subjects. 1861, 3, s. 664-672 9 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Newly isolated Nodularia phage influences cyanobacterial community dynamics

  Coloma, S. E., Dienstbier, A., Bamford, D. H., Sivonen, K., Roine, E. & Hiltunen, T., jan 2017, I : Environmental Microbiology. 19, 1, s. 273-286 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

• Nucleic and Amino Acid Sequences Support Structure-Based Viral Classification

  Sinclair, R. M., Ravantti, J. J. & Bamford, D. H., apr 2017, I : Journal of Virology. 91, 8, 13 s., 02275.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2016

  Archaeal Haloarcula californiae Icosahedral Virus 1 highlights conserved elements in icosahedral membrane-containing DNA viruses from extreme environments

  Demina, T., Pietilä, M. K., Svirskaite, J., Ravantti, J. J., Atanasova, N. S., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., 2016, I : mBio. 7, 4, 12 s., e00699-16.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Asymmetric flow field flow fractionation methods for virus purification

  Eskelin, K. J., Lampi, M., Meier, F., Moldenhauer, E., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., 2016, I : Journal of Chromatography. A. 1469, s. 108–119

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• K2 killer toxin-induced physiological changes in the yeast Saccharomyces cerevisiae

  Orentaite, I., Poranen, M. M., Oksanen, H. M., Daugelavicius, R. & Bamford, D. H., 2016, I : FEMS Yeast Research. 16, 2, 8 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

• Monitoring physiological changes in haloarchaeal cell during virus release

  Svirskaite, J., Oksanen, H. M., Daugelavicius, R. & Bamford, D. H., mar 2016, I : Viruses-Basel. 8, 3, 15 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Vesicle-like virion of Haloarcula hispanica pleomorphic virus 3 preserves high infectivity in saturated salt

  Demina, T. A., Atanasova, N. S., Pietilä, M. K., Oksanen, H. M. & Bamford, D. H., 2016, I : Virology. 499, s. 40-51 12 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2015

  Archaeal viruses multiply: temporal screening in a solar saltern

  Atanasova, N. S., Demina, T. A., Buivydas, A., Bamford, D. H. & Oksanen, H. M., 2015, I : Viruses-Basel. 7, 4, s. 1902-1926 25 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Cold-active bacteriophages from the Baltic Sea ice have diverse genomes and virus-host interactions.

  Sencilo, A., Luhtanen, A-M., Saarijärvi, M., Bamford, D. & Roine, E., okt 2015, I : Environmental Microbiology. 17, 10, s. 3628-3641 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Identification and characterization of SNJ2, the first temperate pleolipovirus integrating into the genome of the SNJ1-lysogenic archaeal strain

  Liu, Y., Wang, J., Liu, Y., Wang, Y., Zhang, Z., Oksanen, H. M., Bamford, D. H. & Chen, X., 2015, I : Molecular Microbiology. 98, 6, s. 1002-1020 19 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Insight into the assembly of viruses with vertical single beta-barrel major capsid proteins

  Gil-Carton, D., Jaakkola, S. T., Charro, D., Peralta, B., Castano-Diez, D., Oksanen, H. M., Bamford, D. H. & Abrescia, N. G. A., 6 okt 2015, I : Structure. 23, 10, s. 1866-1877 12 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Non-structural proteins P17 and P33 are involved in the assembly of the internal membrane-containing virus PRD1

  Karttunen, J., Mäntynen, S., Ihalainen, T. O., Bamford, J. KH. & Oksanen, H., 2015, I : Virology. 482, s. 225-233 9 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Probing protein interactions in the membrane-containing virus PRD1

  Mattila, S., Oksanen, H. M. & Bamford, J. K. H., feb 2015, I : Journal of General Virology. 96, s. 453-462 10 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Salaisuus on muodossa

  Matti, M. & Bamford, D., 6 mar 2015, I : Helsingin Sanomat. B12

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Allmänheten

• Sulfolobus spindle-shaped virus 1 contains glycosylated capsid proteins, a cellular chromatin protein, and host-derived lipids

  Quemin, E. R. J., Pietilä, M. K., Oksanen, H. M., Forterre, P., Rijpstra, W. I. C., Schouten, S., Bamford, D. H., Prangishvili, D. & Krupovic, M., 2015, I : Journal of Virology. 89, 22, s. 11681-11691 11 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2014

  Automated structural comparisons clarify the phylogeny of the right-hand-shaped polymerases

  Mönttinen, H. A. M., Ravantti, J. J., Stuart, D. I. & Poranen, M. M., 2014, I : Molecular Biology and Evolution. 31, 10, s. 2741-2752 12 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Conservation of major and minor jelly-roll capsid proteins in Polinton (Maverick) transposons suggests that they are bona fide viruses

  Krupovic, M., Bamford, D. H. & Koonin, E. V., 29 apr 2014, I : Biology Direct. 9, 7 s., 6.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Electrostatic interactions drive the self-assembly and the transcription activity of the Pseudomonas phage phi6 procapsid

  Sun, X., Bamford, D. & Poranen, M., 2014, I : Journal of Virology. 88, 12, s. 7112-7116 5 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2013

  Rescue of maturation off-pathway products in the assembly of pseudomonas phage φ6

  Sun, X., Pirttimaa, M., Bamford, D. & Poranen, M., 2013, I : Journal of Virology. 87, 24, s. 13279-13286 8 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2012

  Probing, by self-assembly, the number of potential binding sites for minor protein subunits in the procapsid of double-stranded RNA bacteriophage phi6

  Sun, X., Bamford, D. & Poranen, M., 2012, I : Journal of Virology. 86, 22, s. 12208-12216 9 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review