Projekt per år
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
Personer
-
Jarno Alanko
- Avdelningen för datavetenskap - forskardoktor
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
Manuel Ariel Caceres Reyes
- Avdelningen för datavetenskap - doktorand
- Algorithmic Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science
Person: U1 Undervisnings- och forskningspersonal, Doktorand
-
Fernando Hugo Cunha Dias
- Avdelningen för datavetenskap - forskardoktor
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Diego Alejandro Diaz Dominguez, Postdoctoral researcher
- Avdelningen för datavetenskap - forskardoktor
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal
-
SAFEBIO: Safe and Complete Algorithms for Bioinformatics
Khan, S., Schmidt, S. S. & Ma, J.
01/03/2020 → 28/02/2025
Projekt: Forskningsprojekt
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekt: Forskningsprojekt
-
Syöpägenetiikan tutkimuksen huippuyksikkö / Mäkinen
01/01/2015 → 31/12/2017
Projekt: Forskningsprojekt
-
-
Accurate isoform discovery with IsoQuant using long reads
Prjibelski, A. D., Mikheenko, A., Joglekar, A., Smetanin, A., Jarroux, J., Lapidus, A. L. & Tilgner, H. U., 2 jan. 2023, (!!E-pub ahead of print) I: Nature Biotechnology.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
3coSoKu and its declarative modeling
Rizzo, N. & Dovier, A., 26 feb. 2022, I: Journal of Logic and Computation. 32, 2, s. 307-330 24 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Computing all-vs-all MEMs in run-length encoded collections of HiFi reads
Díaz-Domínguez, D., Puglisi, S. & Salmela, L., 2022, String Processing and Information Retrieval. SPIRE 2022. Cham: Springer, s. 198-213 (Lecture Notes in Computer Science; vol. 13617).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Computing Longest (Common) Lyndon Subsequences
Bannai, H., Tomohiro, I., Kociumaka, T., Koppl, D. & Puglisi, S. J., 2022, IWOCA 2022: Combinatorial Algorithms. Bazgan, C. & Fernau, H. (red.). Springer, s. 128-142 15 s. (Lecture Notes in Computer Science; vol. 13270).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
-
Efficient Minimum Flow Decomposition via Integer Linear Programming
Dias, F. H. C., Williams, L., Mumey, B. & Tomescu, A. I., 2022, I: Journal of Computational Biology. 29, 11, s. 1155-1267Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
Brendan Mumey
Alexandru Tomescu (Värd)
14 maj 2022 → 21 maj 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms (SODA 2023) (Evenemang)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
aug. 2022Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Efficient solutions to biological problems using de Bruijn graphs
Leena Salmela (!!Speaker)
7 sep. 2022Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Invited talk
-
Massimo Cairo
Alexandru Tomescu (Värd)
20 mars 2022 → 2 apr. 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
Algorithms for Molecular Biology (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
jan. 2022Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
Priser
-
Alberto Apostolico Best Paper Award
Puglisi, Simon (!!Recipient), Raman, Rajeev (!!Recipient), Belazzougui, Djamal (!!Recipient) & Kosolobov, Dmitry (!!Recipient), 6 juli 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Researcher of the Year Award for junior researchers
Caceres Reyes, Manuel Ariel (!!Recipient), 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
Tidningsurklipp
-
The daily brief: 4 September 2019
Federico Bianchi & Alexandru Tomescu
04/09/2019
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
-UNIVERSITY OF HELSINKI: An algorithm shedding light on the evolution of tumours helps individualise cancer therapies
05/02/2019
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
An algorithm shedding light on the evolution of tumours helps individualise cancer therapies
04/02/2019 → 05/02/2019
2 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media