Projekt per år
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
Personer
-
Tero Aittokallio
- Institutet för molekylärmedicin i Finland - äldre forskare
- Forskningsinstitutet för informationsteknologi
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Biomedicine - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Clinical Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Drug Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
Sampsa Hautaniemi
- Avdelningen för biokemi och utvecklingsbiologi - professor
- Sampsa Hautaniemi / Ansvarig forskare
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Biomedicine - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Clinical Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Liisa Holm
- Forskningsprogrammet för organism- och evolutionsbiologi - professor
- Institutet för bioteknik
- Bioinformatics
- Computational genomics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Juha Kärkkäinen
- Avdelningen för datavetenskap - universitetslektor
- Forskningsinstitutet för informationsteknologi
- Algorithmic Bioinformatics
- Juha Kärkkäinen / Ansvarig forskare
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Handledare för doktorandprogram
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
Ari Löytynoja
- Institutet för bioteknik - forskningsdirektör
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
Utrustning
-
Biodata Analytics Unit
Ville Mustonen (Chef), Mirkka Jones (Annat), Pasi Rastas (Annat), Jukka Siren (Annat) & Fatemehsadat Seyednasrollah (Annat)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Forsknings-laboratorium
-
DECIDER: DECIDER (Clinical Decision via Integrating Multiple Data Levels to Overcome Chemotherapy Resistance in High-Grade Serous Ovarian Cancer)
Korpisaari (ex. Tiilikka), P., Hautaniemi, S. & Mansnérus, J.
01/02/2021 → 31/01/2026
Projekt: Forskningsprojekt
-
Suomalais-Ugrilainen muinaisgenomi
Onkamo, P., Oikkonen, J., Översti, S., Salmela, E., Salo, K. H., Nordqvist, K. & Junno, A.
Koneen Säätiö, Jane and Aatos Erkko Foundation
01/01/2016 → …
Projekt: Forskningsprojekt
-
Elucidation of mechanisms of action of the natural stilbenoid pinosylvin via network pharmacology computational methods
Kibble, M. M., Aittokallio, T., Mäkelä, S., Saarinen, N. & Martinez Chacon , G.
01/01/2014 → …
Projekt: Forskningsprojekt
-
Gene-culture evolution in music
Ukkola-Vuoti, L., Oikkonen, J., Onkamo, P., Raijas, P. & Karma, K.
01/04/2002 → …
Projekt: Forskningsprojekt
-
HiLIFE Grand Challenge: Combatting Antimicrobial Drug Resistance
01/10/2018 → 31/12/2021
Projekt: Forskningsprojekt
-
Artificial intelligence for drug response prediction in disease models
Ballester, P. J., Stevens, R., Haibe-Kains, B., Huang, R. S. & Aittokallio, T., 17 jan. 2022, I: Briefings in Bioinformatics. 23, 1, 3 s., 450.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Ledare › Vetenskaplig › Peer review
-
Fully-automated and ultra-fast cell-type identification using specific marker combinations from single-cell transcriptomic data
Ianevski, A., Giri, A. K. & Aittokallio, T., 10 mars 2022, I: Nature Communications. 13, 10 s., 1246.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Implementing a Functional Precision Medicine Tumor Board for Acute Myeloid Leukemia
Malani, D., Kumar, A., Brück, O., Kontro, M., Yadav, B., Hellesoy, M., Kuusanmäki, H., Dufva, O., Kankainen, M., Eldfors, S., Potdar, S., Saarela, J., Turunen, L., Parsons, A., Västrik, I., Kivinen, K., Saarela, J., Räty, R., Lehto, M., Wolf, M. & 7 andra, , feb. 2022, I: Cancer Discovery. 12, 2, s. 388-401 14 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Longitudinal single-cell RNA-seq analysis reveals stress-promoted chemoresistance in metastatic ovarian cancer
Zhang, K., Erkan, E. P., Jamalzadeh, S., Dai, J., Andersson, N., Kaipio, K., Lamminen, T., Mansuri, N., Huhtinen, K., Carpen, O., Hietanen, S., Oikkonen, J., Hynninen, J., Virtanen, A., Häkkinen, A., Hautaniemi, S. & Väharautio, A., feb. 2022, I: Science Advances. 8, 8, 18 s., 1831.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
POIBM: batch correction of heterogeneous RNA-seq datasets through latent sample matching
Holmström, S., Hautaniemi, S. & Häkkinen, A., 28 apr. 2022, I: Bioinformatics. 38, 9, s. 2474-2480 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Aktiviteter
-
Founder graphs and sequences for pangenomics
Veli Mäkinen (!!Speaker)
feb. 2022Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Massimo Cairo
Alexandru Tomescu (Värd)
20 mars 2022 → 2 apr. 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
33rd International Workshop on Combinatorial Algorithms
Veli Mäkinen (Medlem av vetenskaplig kommitté)
jan. 2022 → apr. 2022Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Davide Martincigh
Alexandru Tomescu (Värd)
2 maj 2022 → 1 juni 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
Brendan Mumey
Alexandru Tomescu (Värd)
14 maj 2022 → 21 maj 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
Priser
-
Alberto Apostolico Best Paper Award
Puglisi, Simon (!!Recipient), Raman, R. (!!Recipient), Belazzougui, D. (!!Recipient) & Kosolobov, D. (!!Recipient), 6 juli 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
Tidningsurklipp
-
University of Helsinki: Researchers Identified Factors That Turn Normal Cells Into Liver Cancer Cells
Sampsa Hautaniemi & Biswajyoti Sahu
08/09/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
388123-2021: Finland-Helsingin yliopisto: Services provided by medical laboratories
30/07/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
118211-2021: Finland-Helsinki: Services provided by medical laboratories
09/03/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Tender Notice: HELSINGIN YLIOPISTO Seeks "Next Generation Sequencing Services for Decider" (118211-2021)
09/03/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Next Generation Sequencing Services for Decider
09/03/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media