Publikationer 2001 2020

2020

High-dimensional structure learning of binary pairwise Markov networks: A comparative numerical study

Pensar, J., Xu, Y., Puranen, S., Pesonen, M., Kabashima, Y. & Corander, J., 2020, I : Computational Statistics & Data Analysis. 141, s. 62-76 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2019

A comprehensive evaluation of predictive performance of 33 species distribution models at species and community levels

Norberg, A., Abrego Antia, N., Blanchet, F. G., Adler, F. R., Anderson, B. J., Anttila, J., Araújo, M. B., Dallas, T. A., Dunson, D., Elith, J., Foster, S., Fox, R., Franklin, J., Godsoe, W., Guisan, A., O'Hara, B., Hill, N. A., Holt, R. D., Hui, F. K. C., Husby, M. & 15 andraKålås, J. A., Lehikoinen, A., Luoto, M., Mod, H. K., Newell, G., Renner, I., Roslin, T. V., Soininen, J., Thuiller, W., Vanhatalo, J. P., Warton, D., White, M., Zimmermann, N. E., Gravel, D. & Ovaskainen, O. T., aug 2019, I : Ecological Monographs. 89, 3, 24 s., 01370.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Additive multivariate Gaussian processes for joint species distribution modeling with heterogeneous data

Vanhatalo, J. P., Hartmann, M. & Veneranta, L., 2019, I : Bayesian analysis.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

A Gaussian process model and Bayesian variable selection for mapping function-valued quantitative traits with incomplete phenotype data

Vanhatalo, J. P., Li, Z. & Sillanpää, M., 2019, I : Bioinformatics.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

A Logical Approach to Context-Specific Independence

Corander, J., Hyttinen, A., Kontinen, J., Pensar, J. & Väänänen, J., sep 2019, I : Annals of Pure and Applied Logic. 170, 9, s. 975-992 18 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Association analyses identify 31 new risk loci for colorectal cancer susceptibility

PRACTICAl Consortium, Law, P. J., Timofeeva, M., Fernandez-Rozadilla, C., Palin, K., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Tanskanen, T., Kondelin, J., Kaasinen, E., Sarin, A-P., Eriksson, J. G., Jousilahti, P., Ripatti, S., Palotie, A., Renkonen-Sinisalo, L., Lepistö, A., Aaltonen, L. A., Rissanen, H., Salomaa, V. & 3 andraBöhm, J., Mecklin, J-P. & Pukkala, E., 14 maj 2019, I : Nature Communications. 10, 15 s., 2154.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Bayesian inference of atomistic structure in functional materials

Todorovic, M., Gutmann, M. U., Corander, J. & Rinke, P., 18 mar 2019, I : Npj computational materials. 5, 7 s., 35.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Bayesian meta-analysis across genome-wide association studies of diverse phenotypes

Trochet, H., Pirinen, M., Band, G., Jostins, L., McVean, G. & Spencer, C. C. A., jul 2019, I : Genetic Epidemiology. 43, 5, s. 532-547 16 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Disentangling the genetics of lean mass

Karasik, D., Zillikens, M. C., Hsu, Y-H., Aghdassi, A., Akesson, K., Amin, N., Barroso, I., Bennett, D. A., Bertram, L., Bochud, M., Borecki, I. B., Broer, L., Buchman, A. S., Byberg, L., Campbell, H., Campos-Obando, N., Cauley, J. A., Cawthon, P. M., Chambers, J. C., Chen, Z. & 137 andraCho, N. H., Choi, H. J., Chou, W-C., Cummings, S. R., de Groot, L. C. P. G. M., De Jager, P. L., Demuth, I., Diatchenko, L., Econs, M. J., Eiriksdottir, G., Enneman, A. W., Eriksson, J., Eriksson, J. G., Estrada, K., Evans, D. S., Feitosa, M. F., Fu, M., Gieger, C., Grallert, H., Gudnason, V., Lenore, L. J., Hayward, C., Hofman, A., Homuth, G., Huffman, K. M., Husted, L. B., Illig, T., Ingelsson, E., Ittermann, T., Jansson, J-O., Johnson, T., Biffar, R., Jordan, J. M., Jula, A., Karlsson, M., Khaw, K-T., Kilpelainen, T. O., Klopp, N., Kloth, J. S. L., Koller, D. L., Kooner, J. S., Kraus, W. E., Kritchevsky, S., Kutalik, Z., Kuulasmaa, T., Kuusisto, J., Laakso, M., Lahti, J., Lang, T., Langdahl, B. L., Lerch, M. M., Lewis, J. R., Lill, C., Lind, L., Lindgren, C., Liu, Y., Livshits, G., Ljunggren, O., Loos, R. J. F., Lorentzon, M., Luan, J., Luben, R. N., Malkin, I., McGuigan, F. E., Medina-Gomez, C., Meitinger, T., Melhus, H., Mellstrom, D., Michaelsson, K., Mitchell, B. D., Morris, A. P., Mosekilde, L., Nethander, M., Newman, A. B., O'Connell, J. R., Oostra, B. A., Orwoll, E. S., Palotie, A., Peacock, M., Perola, M., Peters, A., Prince, R. L., Psaty, B. M., Räikkönen, K., Ralston, S. H., Ripatti, S., Rivadeneira, F., Robbins, J. A., Rotter, J. I., Rudan, I., Salomaa, V., Satterfield, S., Schipf, S., Shin, C. S., Smith, A. V., Smith, S. B., Soranzo, N., Spector, T. D., Stancakova, A., Stefansson, K., Steinhagen-Thiessen, E., Stolk, L., Streeten, E. A., Styrkarsdottir, U., Swart, K. M. A., Thompson, P., Thomson, C. A., Thorleifsson, G., Thorsteinsdottir, U., Tikkanen, E., Tranah, G. J., Uitterlinden, A. G., van Duijn, C. M., van Schoor, N. M., Vandenput, L., Vollenweider, P., Volzke, H., Wactawski-Wende, J., Walker, M., Wareham, N. J., Waterworth, D., Weedon, M. N., Wichmann, H-E., Widen, E., Williams, F. M. K., Wilson, J. F., Wright, N. C., Yerges-Armstrong, L. M., Yu, L., Zhang, W., Zhao, J. H., Zhou, Y., Nielson, C. M., Harris, T. B., Demissie, S., Kiel, D. P. & Ohlsson, C., feb 2019, I : American Journal of Clinical Nutrition. 109, 2, s. 276-287 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Diversification of Colonization Factors in a Multidrug-Resistant Escherichia coli Lineage Evolving under Negative Frequency-Dependent Selection

McNally, A., Kallonen, T., Connor, C., Abudahab, K., Aanensen, D. M., Horner, C., Peacock, S. J., Parkhill, J., Croucher, N. J. & Corander, J., 30 apr 2019, I : mBio. 10, 2, s. e00644-19

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Does Evaluation of Tumour Budding in Diagnostic Biopsies have a Clinical Relevance? A Systematic Review

Almangush, A., Youssef, O., Pirinen, M., Sundström, J., Leivo, I. & Mäkitie, A. A., mar 2019, I : Histopathology. 74, 4, s. 536-544 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Exome-Derived Adiponectin-Associated Variants Implicate Obesity and Lipid Biology

Spracklen, C. N., Karaderi, T., Yaghootkar, H., Schurmann, C., Fine, R. S., Kutalik, Z., Preuss, M. H., Lu, Y., Wittemans, L. B. L., Adair, L. S., Allison, M., Amin, N., Auer, P. L., Bartz, T. M., Blueher, M., Boehnke, M., Borja, J. B., Bork-Jensen, J., Broer, L., Chasman, D. I. & 84 andraChen, Y-D. I., Chirstofidou, P., Demirkan, A., van Duijn, C. M., Feitosa, M. F., Garcia, M. E., Graff, M., Grallert, H., Grarup, N., Guo, X., Haesser, J., Hansen, T., Harris, T. B., Highland, H. M., Hong, J., Ikram, M. A., Ingelsson, E., Jackson, R., Jousilahti, P., Kahonen, M., Kizer, J. R., Kovacs, P., Kriebel, J., Laakso, M., Lange, L. A., Lehtimaki, T., Li, J., Ruifang Li-Gao, Lind, L., Luan, J., Lyytikainen, L-P., MacGregor, S., Mackey, D. A., Mahajan, A., Mangino, M., Männistö, S., McCarthy, M. I., McKnight, B., Medina-Gomez, C., Meigs, J. B., Molnos, S., Mook-Kanamori, D., Morris, A. P., de Mutsert, R., Nalls, M. A., Nedeljkovic, I., North, K. E., Pennell, C. E., Pradhan, A. D., Province, M. A., Raitakari, O. T., Raulerson, C. K., Reiner, A. P., Ridker, P. M., Ripatti, S., Roberston, N., Rotter, J. I., Salomaa, V., Sandoval-Zarate, A. A., Sitlani, C. M., Spector, T. D., Strauch, K., Stumvoll, M., Taylor, K. D., Thuesen, B., Toenjes, A., Uitterlinden, A. G., Venturini, C., Walker, M., Wang, C. A., Wang, S., Wareham, N. J., Willems, S. M., van Dijk, K. W., Wilson, J. G., Wu, Y., Yao, J., Young, K. L., Langenberg, C., Frayling, T. M., Kilpelainen, T. O., Lindgren, C. M., Loos, R. J. F. & Mohlke, K. L., 3 jul 2019, I : American Journal of Human Genetics. 105, 1, s. 15-28 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Exome sequencing of Finnish isolates enhances rare-variant association power

FinnGen Project, Locke, A. E., Havulinna, A. S. & Pirinen, M., 15 aug 2019, I : Nature. 572, 7769, s. 323–+ 21 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Fast and flexible bacterial genomic epidemiology with PopPUNK

Lees, J. A., Harris, S. R., Tonkin-Hill, G., Gladstone, R. A., Lo, S. W., Weiser, J. N., Corander, J., Bentley, S. D. & Croucher, N. J., feb 2019, I : Genome Research. 29, 2, s. 304-316 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Fast hierarchical Bayesian analysis of population structure

Tonkin-Hill, G., Lees, J. A., Bentley, S. D., Frost, S. D. W. & Corander, J., 20 jun 2019, I : Nucleic Acids Research. 47, 11, s. 5539-5549 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

FINEMAP - a statistical software for identifying causal genetic variants

Benner, C., 2019, Helsinki : Helsingin yliopisto. 81 s.

Forskningsoutput: AvhandlingDoktorsavhandlingSamling av artiklar

Öppen tillgång

Genetic Influences on Patient-Oriented Outcomes in Traumatic Brain Injury: A Living Systematic Review of Non-Apolipoprotein E Single-Nucleotide Polymorphisms

Zeiler, F. A., McFadyen, C., Newcombe, V. F. J., Synnot, A., Donoghue, E. L., Ripatti, S., Steyerbere, E. W., Gruen, R. L., McAllister, T. W., Rosand, J., Palotie, A., Maas, A. I. R. & Menon, D. K., 7 jun 2019, I : Journal of Neurotrauma. 17 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Genome-wide association analyses of risk tolerance and risky behaviors in over 1 million individuals identify hundreds of loci and shared genetic influences

23and Me Res Team, eQTLGen Consortium, Int Cannabis Consortium, Soc Sci Genetic Association Con, Linner, R. K., Perola, M., Ripatti, S., Gupta, R., Lahti, J., Eklund, N., Koskinen, S., Latvala, A., Loukola, A., Mäki-Opas, T., Palotie, A., Sarin, A-P., Räikkönen, K., Eriksson, J. G., Kaprio, J., Perola, M. & 3 andraSalomaa, V., Kaasik, K. & Keltikangas-Järvinen, L., feb 2019, I : Nature Genetics. 51, 2, s. 245-+ 16 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genome-wide association study identifies eight risk loci and implicates metabo-psychiatric origins for anorexia nervosa

Anorexia Nervosa Genetics Initiati, Psychiat Genomics Consortium, Watson, H. J., Yilmaz, Z., Kaprio, J., Keski-Rahkonen, A., Palotie, A., Raevuori, A., Ripatti, S. & Widen, E., aug 2019, I : Nature Genetics. 51, 8, s. 1207-+ 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genome-wide association study in Finnish twins highlights the connection between nicotine addiction and neurotrophin signaling pathway

Hällfors, J., Palviainen, T., Surakka, I., Gupta, R., Buchwald, J., Raevuori, A., Ripatti, S., Korhonen, T., Jousilahti, P., Madden, P. A. F., Kaprio, J. & Loukola, A., maj 2019, I : Addiction Biology. 24, 3, s. 549-561 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genomic and Functional Analysis of Emerging Virulent and Multidrug-Resistant Escherichia coli Lineage Sequence Type 648

Schaufler, K., Semmler, T., Wieler, L. H., Trott, D. J., Pitout, J., Peirano, G., Bonnedahl, J., Dolejska, M., Literak, I., Fuchs, S., Ahmed, N., Grobbel, M., Torres, C., McNally, A., Pickard, D., Ewers, C., Croucher, N. J., Corander, J. & Guenther, S., jun 2019, I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 63, 6, 12 s., e00243-19.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genomic determinants of speciation and spread of the Mycobacterium tuberculosis complex

Chiner-Oms, Á., Sánchez-Busó, L., Corander, J., Gagneux, S., Harris, S. R., Young, D., González-Candelas, F. & Comas, I., jun 2019, I : Science Advances. 5, 6, 14 s., 3307.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genomics of 1 million parent lifespans implicates novel pathways and common diseases and distinguishes survival chances

eQTLGen Consortium, Timmers, P. R. H. J., Kettunen, J., Perola, M. & Ripatti, S., 15 jan 2019, I : eLife. 8, 40 s., 39856.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Geographic Variation and Bias in the Polygenic Scores of Complex Diseases and Traits in Finland

Kerminen, S., Martin, A. R., Koskela, J., Ruotsalainen, S. E., Havulinna, A. S., Surakka, I., Palotie, A., Perola, M., Salomaa, V., Daly, M. J., Ripatti, S. & Pirinen, M., 6 jun 2019, I : American Journal of Human Genetics. 104, 6, s. 1169-1181 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Healthcare costs and outcomes in adult patients with juvenile idiopathic arthritis: a population-based study

Mars, N. J., Kerola, A. M., Kauppi, M. J., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 4 mar 2019, I : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 2, s. 114-120 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Improving Illumina assemblies with Hi-C and long reads: An example with the North African dromedary

Elbers, J. P., Rogers, M. F., Perelman, P. L., Proskuryakova, A. A., Serdyukova, N. A., Johnson, W. E., Horin, P., Corander, J., Murphy, D. & Burger, P. A., jul 2019, I : Molecular Ecology Resources. 19, 4, s. 1015-1026 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Index-based approach for estimating vulnerability of Arctic biota to oil spills

Nevalainen, M. K., Vanhatalo, J. & Helle, I., 18 jun 2019, I : Ecosphere. 10, 6, e02766.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Integrated analysis of population genomics, transcriptomics and virulence provides novel insights into Streptococcus pyogenes pathogenesis

Kachroo, P., Eraso, J. M., Beres, S. B., Olsen, R. J., Zhu, L., Nasser, W., Bernard, P. E., Cantu, C. C., Saavedra, M. O., Arredondo, M. J., Strope, B., Do, H., Kumaraswami, M., Vuopio, J., Gröndahl-Yli-Hannuksela, K., Kristinsson, K. G., Gottfredsson, M., Pesonen, M., Pensar, J., Davenport, E. R. & 11 andraClark, A. G., Corander, J., Caugant, D. A., Gaini, S., Magnussen, M. D., Kubiak, S. L., Nguyen, H. A. T., Long, S. W., Porter, A. R., DeLeo, F. R. & Musser, J. M., mar 2019, I : Nature Genetics. 51, 3, s. 548-563 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Integrating experimental and distribution data to predict future species patterns

Kotta, J., Vanhatalo, J. P., Jänes, H., Orav-Kotta, H., Rugiu, L., Jormalainen, V., Bobsien, I., Viitasalo, M., Virtanen, E., Nyström Sandman, A., Isaeus, M., Leidenberger, S., Jonsson, P. R. & Johannesson, K., 12 feb 2019, I : Scientific Reports. 9, 14 s., 1821.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Laplace approximation and natural gradient for Gaussian process regression with heteroscedastic Student-t model

Hartmann, M. & Vanhatalo, J., jul 2019, I : Statistics and Computing. 29, 4, s. 753–773 21 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Machine learning accelerated likelihood-free event reconstruction in dark matter direct detection

Simola, U., Pelssers, B., Barge, D., Conrad, J. & Corander, J., 6 mar 2019, I : Journal of Instrumentation. 14, 28 s., 03004.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Macroevolution of gastric Helicobacter species unveils interspecies admixture and time of divergence (vol 12, pg 2518, 2018)

Smet, A., Yahara, K., Rossi, M., Tay, A., Backert, S., Ensser, A., Fox, J. G., Flahou, B., Ducatelle, R., Haesebrouck, F. & Corander, J., jul 2019, I : ISME Journal. 13, 7, s. 1890-1890 1 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Non-stationary Gaussian models with physical barriers

Bakka, H., Vanhatalo, J., Illian, J. B., Simpson, D. & Rue, H., mar 2019, I : Spatial statistics. 29, s. 268-288 21 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

PANINI: Pangenome Neighbour Identification for Bacterial Populations

Abudahab, K., Prada, J. M., Yang, Z., Bentley, S. D., Croucher, N. J., Corander, J. & Aanensen, D. M., apr 2019, I : Microbial Genomics. 5, 4, 10 s., 000220.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Patients with rheumatic diseases share similar patterns of healthcare resource utilization

Mars, NJ., Kerola, AM., Kauppi, MJ., Pirinen, M., Elonheimo, O. & Sokka-Isler, T., 2019, I : Scandinavian Journal of Rheumatology. 48, 4, s. 300-307 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Patterns of cross-resistance and collateral sensitivity between clinical antibiotics and natural antimicrobials

Colclough, A., Corander, J., Sheppard, S. K., Bayliss, S. C. & Vos, M., jun 2019, I : Evolutionary Applications. 12, 5, s. 878-887 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Representation transfer for differentially private drug sensitivity prediction

Niinimaki, T., Heikkila, M. A., Honkela, A. & Kaski, S., 5 jul 2019, I : Bioinformatics. 35, 14, s. i218-i224 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

rPinecone: Define sub-lineages of a clonal expansion via a phylogenetic tree

Wailan, A. M., Coll, F., Heinz, E., Tonkin-Hill, G., Corander, J., Feasey, N. A. & Thomson, N. R., apr 2019, I : Microbial Genomics. 5, 4, 9 s., 000264.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Seasonal Variation in Genome-Wide DNA Methylation Patterns and the Onset of Seasonal Timing of Reproduction in Great Tits

Viitaniemi, H. M., Verhagen, I., Visser, M. E., Honkela, A., van Oers, K. & Husby, A., mar 2019, I : Genome Biology and Evolution. 11, 3, s. 970-983 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The Contribution of Genetic Variation of Streptococcus pneumoniae to the Clinical Manifestation of Invasive Pneumococcal Disease

Cremers, A. J. H., Mobegi, F. M., van der Gaast-de Jongh, C., van Weert, M., van Opzeeland, F. J., Vehkala, M., Knol, M. J., Bootsma, H. J., Välimaki, N., Croucher, N. J., Meis, J. F., Bentley, S., van Hijum, S. A. F. T., Corander, J., Zomer, A. L., Ferwerda, G. & de Jonge, M. I., 1 jan 2019, I : Clinical Infectious Diseases. 68, 1, s. 61-69 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Variation in neurosurgical management of traumatic brain injury: a survey in 68 centers participating in the CENTER-TBI study

van Essen, T. A., den Boogert, H. F., Cnossen, M. C., CENTER-TBI Investigators Partici, Kaukonen, M., Kivisaari, R., Piippo-Karjalainen, A., Raj, R., Tanskanen, P., Palotie, A., Pirinen, M. & Ripatti, S., mar 2019, I : Acta Neurochirurgica. 161, 3, s. 435-449 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2018

Analysis of shared heritability in common disorders of the brain

Brainstorm Consortium, Anttila, V., Bulik-Sullivan, B., Finucane, H. K., Walters, R. K., Bras, J., Duncan, L., Escott-Price, V., Falcone, G. J., Gormley, P., Malik, R., Patsopoulos, N. A., Ripke, S., Wei, Z., Yu, D., Lee, P. H., Turley, P., Grenier-Boley, B., Chouraki, V., Kamatani, Y. & 33 andraBerr, C., Letenneur, L., Hannequin, D., Amouyel, P., Boland, A., Deleuze, J-F., Duron, E., Vardarajan, B. N., Reitz, C., Goate, A. M., Huentelman, M. J., Kamboh, M. I., Larson, E. B., Rogaeva, E., St George-Hyslop, P., Hakonarson, H., Kukull, W. A., Palta, P., Wedenoja, J., Artto, V., Kaunisto, M., Vepsäläinen, S., Kurki, M. I., Hämäläinen, E., Kaprio, J., Metspalu, A., Keski-Rahkonen, A., Raevuori, A., Ripatti, S., Lönnqvist, J., Daly, M., Palotie, A. & Neale, B. M., 22 jun 2018, I : Science. 360, 6395, s. 1313-+ 13 s., 8757.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Bacmeta: simulator for genomic evolution in bacterial metapopulations

Sipola, A., Marttinen, P. & Corander, J., 1 jul 2018, I : Bioinformatics. 34, 13, s. 2308-2310 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Common Variant Burden Contributes to the Familial Aggregation of Migraine in 1,589 Families

23 Me Res Team, IHGC, Gormley, P., Kurki, M. I., Hiekkala, M. E., Häppölä, P., Palta, P., Surakka, I., Kaunisto, M. A., Hämäläinen, E., Vepsäläinen, S., Havanka, H., Harno, H., Ilmavirta, M., Nissilä, M., Säkö, E., Sumelahti, M-L., Liukkonen, J., Sillanpaa, M., Metsähonkala, L. & 15 andraKoskinen, S., Lehtimaki, T., Raitakari, O., Männikko, M., Jousilahti, P., Anttila, V., Salomaa, V., Artto, V., Färkkilä, M., Daly, M. J., Neale, B. M., Ripatti, S., Kallela, M., Wessman, M. & Palotie, A., 16 maj 2018, I : Neuron. 98, 4, s. 743–753 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Correcting Boundary Over-Exploration Deficiencies In Bayesian Optimization With Virtual Derivative Sign Observations

Siivola, E., Vehtari, A., Vanhatalo, J., Gonzalez, J. & Andersen, M., nov 2018, 2018 IEEE 28th International Workshop on Machine Learning for Signal Processing (MLSP). Pustelnik, N., Ma, Z., Tan, ZH. & Larsen, J. (red.). IEEE, Vol. 28. 6 s. (IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKonferensbidragVetenskapligPeer review

Deep-coverage whole genome sequences and blood lipids among 16,324 individuals

NHLBI TOPMED Lipids Working Grp, 23 aug 2018, I : Nature Communications. 9, 12 s., 3391.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Differences in the Commonly used Genotype Imputation Algorithms and Their Imputation Accuracy Estimates: 2018 IEEE 14th International Conference on e-Science

Pärn, K., Pirinen, M., Kals, M., Mägi, R., Salomaa, V., Boehnke, M., Hall, I., Stitziel, N., Freimer, N., Daly, M., Palotie, A., Ripatti, S. & Palta, P., 2018, s. 293-294. 2 s.

Forskningsoutput: KonferensbidragKonferenspapperForskningPeer review

Efficient fine-mapping to identify causal genetic variants and quantify their contribution to complex phenotypes

Benner, C., Havulinna, A. S., Salomaa, V., Ripatti, S. & Pirinen, M., okt 2018, I : Genetic Epidemiology. 42, 7, s. 688-689 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragMötesabstraktForskningPeer review