Projekt per år
Organisationsprofil
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Internationellt och inhemskt samarbete
Personer
-
Maryam Abidizadegan
Person: Doktorand, U5 Övrig undervisnings- och forsknings personal (inkl. deltidsundervisning)
-
Bartosz Adamczyk
- Fakultetens gemensamma (Bio- och miljövetenskaplig fakulteten) - Titeln docent
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person
-
Tero Ahola
- Avdelningen för mikrobiologi - äldre universitetslektor
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
- Doctoral Programme in Drug Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU, undervisnings- och forskningspersonal
-
Laura Alakukku
- Avdelningen för lantbruksvetenskaper - professor
- Centret för hållbarhetsvetenskap (HELSUS)
- Agrotechnology Research Group
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
Utrustning
-
HAMBI Microbial Culture Collection, University of Helsinki
Pekka Oivanen (Operatör) & Kaarina Sivonen (Chef)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Utrustning
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Sarah Butcher (Chef), Ausra Domanska (Operatör), Pasi Laurinmäki (Operatör) & Behnam Lak (Operatör)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Molecular Interactions - Biacore T100
Minna Poranen (Chef) & Maria Aatonen (Operatör)
Utrustning/facilitet: Utrustning
-
Antibioottiresistenssin evoluutio maatalouden historiassa
01/05/2023 → 30/04/2026
Projekt: Stiftelser och fonder
-
METAFUNG: Intracellular metabolism of lignocellulose-derived sugars and aromatic compounds in wood-degrading white rot fungi, Academy of Finland
01/09/2022 → 31/08/2026
Projekt: Forskningsprojekt
-
ARADOX: Plants as source of novel biocatalysts: exploring Arabidopsis AA3 family enzymes for targeted oxidations of carbohydrates and alcohols
Tenkanen, M., Paasela, T., Zhao, H., Sun, M. & Karppi, J.
01/07/2022 → 30/06/2025
Projekt: Forskningsprojekt
-
Resurssit: Resurssitehokkuuden lisääminen ja GHG päästöjen vähentäminen
Mäkelä, P., Alakukku, L., Simojoki, A. & Juvonen, S. T.
01/06/2022 → 31/05/2025
Projekt: Forskningsprojekt
-
LuoVaMix: Luomuviljelyn viljelyvarmuuden ja ilmastokestävyyden parantaminen sekaviljelyn ja syyskylvöisten valkuaiskasvien avulla
Mäkelä, P., Alakukku, L., Simojoki, A. & Juvonen, S. T.
01/01/2022 → 31/10/2024
Projekt: Forskningsprojekt
-
Abolishment of morphology-based taxa and change to binomial species names: 2022 taxonomy update of the ICTV bacterial viruses subcommittee
Turner, D., Shkoporov, A. N., Lood, C., Millard, A. D., Dutilh, B. E., Alfenas-Zerbini, P., van Zyl, L. J., Aziz, R. K., Oksanen, H. M., Poranen, M., Kropinski, A. M., Barylski, J., Brister, J. R., Chanisvili, N., Edwards, R., Enault, F., Gillis, A., Knezevic, P., Krupovic, M., Kurtboke, I., & 16 andra , 2023, I: Archives of Virology. 168, 74Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
-
Desulfovibrio bacteria enhance alpha-synuclein aggregation in a Caenorhabditis elegans model of Parkinson's disease
Huynh, V. A., Takala, T. M., Murros, K. E., Diwedi, B. & Saris, P. E. J., 1 maj 2023, I: Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 13, 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Dietary micro-fibrillated cellulose improves growth, reduces diarrhea, modulates gut microbiota, and increases butyrate production in post-weaning piglets
Uddin, M. K., Mahmud, M. R., Hasan, S. M. K., Peltoniemi, O. & Oliviero, C., 16 apr. 2023, I: Scientific Reports. 13, 6194, 6194.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Effects of monospecific and mixed-algae culture on performance of algae-sludge membrane bioreactors
Radmehr, S., Peltomaa, E., Kallioinen-Manttari, M. & Manttari, M., mars 2023, I: Bioresource Technology. 371, 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Finger Millet (Eleusine coracana) Plant–Endophyte Dynamics: Plant Growth, Nutrient Uptake, and Zinc Biofortification
Chaudhary, R., Kumar, V., Gupta, S., Naik, B., Prasad, R., Mishra, S., Saris, P. E. & Kumar, V., apr. 2023, I: Microorganisms. 11, 4, 24 s., 973.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
The Finnish Society for the Study of Infectious Diseases (Extern organisation)
Vinaya Venkat (Styrelsemedlem)
1 mars 2023Aktivitet: Medlemskapstyper › Medlemskap eller annan roll i inhemskt/internationellt offentligt organ
-
Member of Noora Salokorpi thesis committee
Ravi Kant (Medlem i avhandlingskommitté)
feb. 2023 → …Aktivitet: Examinationstyper › Medlem i doktorsavhandlingskommitté
-
Characterization of Aspergillus niger sugar transportome
Miia Mäkelä (!!Invited speaker)
2023Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Invited talk
-
Co-supervisor of M Sc thesis of Taru Mäkinen
Melina Adeliina Markkanen (Handledare)
2023 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledning av annat kunskapsprov (pro gradu, licentiatavhandling)
-
Schistosoma haematobium: pathogenicity, co-infection and carcinogenesis
Ravi Kant (Handledare), Tarja Sironen (Handledare) & Seppo Meri (Handledare)
mars 2023 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
Priser
-
-
Doctoral research grant (Finnish Cultural Foundation)
Zhao, Hongbo (!!Recipient), 28 feb. 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, Kaisa (!!Recipient), Jouhten, Hanne (!!Recipient), Ronkainen, Aki (!!Recipient), Hartikainen, Anna (!!Recipient), Kainulainen, Veera (!!Recipient), Jalanka, Jonna (!!Recipient) & Satokari, Reetta (!!Recipient), 7 sep. 2020
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Vanhemman yliopistonlehtorin titteli
Niku, Mikael (!!Recipient), 31 mars 2022
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Forskningsdatauppsättningar
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Skapad av), Pessa-Morikawa, T. (Skapad av), Husso, A. (Skapad av) & Iivanainen, A. (Skapad av), EUDAT, 2021
DOI: http://doi.org/10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Datauppsättning
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Skapad av), European Nucleotide Archive, 27 aug. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Datauppsättning
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Skapad av), Alakukku, L. (!!Supervisor), Regina, K. (!!Supervisor) & Heikkinen, J. I. (!!Supervisor), HARVARD UNIVERSITY, 12 okt. 2021
DOI: https://doi.org/10.7910/DVN/0DJGYJ
Datauppsättning
Tidningsurklipp
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
26/10/2022
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
29/06/2022
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
The coronavirus epidemic of 2020 in Finland began with five virus lineages
Ravi Kant, Teemu Smura, Tarja Sironen, Phuoc Truong & Olli Vapalahti
14/06/2022
1 Mediabidrag
Press/media: !!Press / Media
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
25/05/2022
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Three cases of sell-corona have been found in Finland - these things are known about the new variants
28/09/2021
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media