Projekt per år
Organisationsprofil
Organisationsprofil
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Internationellt och inhemskt samarbete
Personer
-
Maryam Abidizadegan
- Forskningsprogrammet för ekosystem och miljö - Stipendieforskare
- Centret för hållbarhetsvetenskap (HELSUS)
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology
Person: gästforskare, Doktorand, U5 Övrig undervisnings- och forsknings personal (inkl. deltidsundervisning)
-
Bartosz Adamczyk
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person
-
Tero Ahola
- Avdelningen för mikrobiologi - äldre universitetslektor
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
- Doctoral Programme in Drug Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU, undervisnings- och forskningspersonal
-
Laura Alakukku
- Avdelningen för lantbruksvetenskaper - professor
- Fakultetens gemensamma (Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten) - Titeln docent
- Centret för hållbarhetsvetenskap (HELSUS)
- Agrotechnology Research Group
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
Utrustning
-
Cryo-Electron Microscopy Facility (LS-RIA/ Instruct-HiLIFE)
Butcher, S. (Chef), Domanska, A. (Operatör), Laurinmäki, P. (Operatör) & Lak, B. (Operatör)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Microbial Domain Biological Resource Centre HAMBI (LS-RIA/ HUBCRI)
Friman, V.-P. (Chef) & Oivanen, P. (Operatör)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Opening Pandora’s Box: Assessing The Risks of Permafrost Thaw to Environment and Human Health
Väliranta, M. (Projektledare), Korhola, A. (Projektledare), Weckström, J. (Principal Investigator), Kontro, M. H. (Principal Investigator), Bianchi, F. (Principal Investigator), Passananti, M. (Co-Principal Investigator), Vapalahti, O. (Principal Investigator), Sironen, T. (Principal Investigator), Korhonen, E. M. (Co-Principal Investigator), Green, S. (Principal Investigator), Toivanen, R. (Principal Investigator), Kiss, E. A. (Co-Principal Investigator), Smura, T. (Co-Principal Investigator) & Pilkama, H. E. (Deltagare)
01/01/2025 → 31/12/2027
Projekt: Forskningsprojekt
-
Bataatin viljelytekniikka ja ravitsemuksellinen laatu Suomessa
Edelmann, M. (Deltagare), Uusitupa, J. V. E. (Deltagare), Jokinen, K. (Deltagare), Alakukku, L. (Deltagare) & Mäkelä, P. (Principal Investigator)
01/01/2024 → 31/12/2025
Projekt: Forskningsprojekt
-
Pipeline for Rapid Diagnostics of Emergency Transboundary Infectious Diseases
Kant, R. (Projektledare), Vapalahti, O. (Deltagare) & Sironen, T. (Principal Investigator)
01/09/2023 → 31/08/2027
Projekt: EU Horizon 2020: Innovation Actions (H2020-IA)
-
Antibioottiresistenssin evoluutio maatalouden historiassa
Muurinen, J. (Projektledare), Maunula, M. M. (deltagare) & Mäkinen, T.-M. T. (deltagare)
01/05/2023 → 30/04/2026
Projekt: Stiftelser och fonder
-
METAFUNG: Intracellular metabolism of lignocellulose-derived sugars and aromatic compounds in wood-degrading white rot fungi, Academy of Finland
Mäkelä, M. (Projektledare)
01/09/2022 → 31/08/2026
Projekt: Forskningsprojekt
-
Assessment of Healthcare Workers’ Knowledge of Malaria in Poland
Bogacka, A., Grzybek, J., Krzysztoń, P., Kant, R. & Grzybek, M., mars 2025, (!!Accepted/In press) I: BMC Medical Education.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Faagihoito ratkaisuksi antibioottiresistenssiin?
Tuomala, H. & Kiljunen, S., 8 apr. 2025, I: Suomen lääkärilehti. 2025, 80, s. 605-608 4 s., 80:e42994.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Functional properties of lactic acid bacteria isolated from raw goat milk and cottage cheese
Ikombayev, T., Ospanova, A., Omarova, A., Horackova, S., Tuganbay, A., Kassenova, G., Zhamurova, V., Sharipova, S. & Suleimenova, Z., juni 2025, I: Journal of Agriculture and Food Research. 21, 11 s., 101822.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Monkeypox Unveiled: Global Epidemiology, Treatment Advances, and Prevention Strategies
Kuna, A., Wroczynska, A., Rymer, W., Grzesiowski, P., Kant, R., Grzybek, M. & Parczewski, M., 11 apr. 2025, (!!E-pub ahead of print) I: One Health. 101030Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
The Skin Microbiome Manual
Salava, A., Fyhrquist, N. & Alenius, H., 2025, The Skin Microbiome Manual. Springer, Cham, s. 155-161Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
Aktiviteter
-
Host-Associated Genomic Variability and Transmission Patterns of Leptospira in Tanzanian Livestock and Rodents
Kant, R. (Handledare) & Sironen, T. (Handledare)
2025 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
-
Urban Rodent Viromics - unravelling the viral landscape and its implications for public health
Kant, R. (Handledare) & Grzybek, M. (Handledare)
2025 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
-
MIBS Science Day 2025
Salomaa, M. M. (Poster presentation)
6 mars 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Virology Days 2025
Salomaa, M. M. (Poster presentation)
6 feb. 2025 → 7 feb. 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Tieteen päivät 2025
Kairavuori, S. (Medlem i organisationskommitté), Rikkinen, J. (Medlem i organisationskommitté), Pirttilä-Backman, A.-M. (Medlem i organisationskommitté), Peltonen, L. M. (Medlem i organisationskommitté), Hiltunen, K. (Medlem i organisationskommitté), Blomster, J. (Medlem i organisationskommitté), Kettunen, H. (Medlem i organisationskommitté) & Karlsson, L. (Medlem i organisationskommitté)
10 jan. 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Priser
-
-
Best Poster Presentation Award at the 7th Annual Meeting of Plant Ecology and Evolution
Christodoulou, M. (!!Recipient), 14 nov. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Doctoral research grant (Finnish Cultural Foundation)
Zhao, H. (!!Recipient), 28 feb. 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
European Culture Collection’s Organization Travel Grant
Christodoulou, M. (!!Recipient), sep. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, K. (!!Recipient), Jouhten, H. (!!Recipient), Ronkainen, A. (!!Recipient), Hartikainen, A. (!!Recipient), Kainulainen, V. (!!Recipient), Jalanka, J. (!!Recipient) & Satokari, R. (!!Recipient), 7 sep. 2020
Pris: Pris och hedersbetygelser
Forskningsdatauppsättningar
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Skapad av), European Nucleotide Archive, 27 aug. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Datauppsättning
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Skapad av), Pessa-Morikawa, T. (Skapad av), Husso, A. (Skapad av) & Iivanainen, A. (Skapad av), EUDAT, 2021
DOI: 10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Datauppsättning
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Skapad av), Alakukku, L. (!!Supervisor), Regina, K. (!!Supervisor) & Heikkinen, J. I. (!!Supervisor), HARVARD UNIVERSITY, 12 okt. 2021
DOI: 10.7910/DVN/0DJGYJ
Datauppsättning
Tidningsurklipp
-
Lohtajalta lähtöisin olevaa väitöskirjatutkijaa kiinnostaa vanhan navetan lanta — Siitä löytyy ihmiskunnalle tärkeää tietoa
25/02/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Researcher from the Division of Tropical Parasitology is co-author of the publication in "Nature"
05/04/2024
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Mitochondrial roles in antiviral immunity modify manifestations of neurological diseases
04/04/2024
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Ravihevosia piinanneen ihotulehdusepidemian aiheuttaja löytyi
Virtanen, J. M. E., Kant, R., Sironen, T. & Kinnunen, P.
08/01/2024
1 Mediabidrag
Press/media: !!Press / Media
-
Tammenlastuja: Menneisyys opettaa
Heikkilä, M., Manninen, M. A., Valtonen, T. A. I., Weckström, J., Oinonen, M., Tallavaara, M., Eronen, J. T., Kahilainen, K., Piro, A., Malinen, T., Hellsten, S., Mykrä, H., Tolonen, K., Harkonen, L. S., Pokka, P. H., Auvinen, P., Väliranta, M., Arppe, L., Ekholm, P., Salonen, J. S., Zimmermann, H., Ribeiro, S., Saarni, S., Vinni, M. & Atti, S. M.
10/10/2023
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media