Projekt per år
Organisationsprofil
Organisationsprofil
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Samarbeten och ledande forskningsområden under de senaste fem åren
Profiler
-
Bartosz Adamczyk
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person
-
Tero Ahola
- Avdelningen för mikrobiologi - äldre universitetslektor
- Doctoral Programme in Drug Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU, undervisnings- och forskningspersonal
-
Laura Alakukku
- Fakultetens gemensamma (Agrikultur-forstvetenskapliga fakulteten) - Titeln docent
- Avdelningen för lantbruksvetenskaper - professor
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Sustainable Use of Renewable Natural Resources - Handledare för doktorandprogram
- Centret för hållbarhetsvetenskap (HELSUS)
- Agrotechnology Research Group
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Harri Alenius
- Human Microbiome Research - forskningsdirektör
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: undervisnings- och forskningspersonal, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
Utrustning
-
Cryo-Electron Microscopy Facility (LS-RIA/ Instruct-HiLIFE)
Butcher, S. (Chef), Domanska, A. (Operatör), Laurinmäki, P. (Operatör) & Lak, B. (Operatör)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Microbial Domain Biological Resource Centre HAMBI (LS-RIA/ HUBCRI)
Friman, V.-P. (Chef) & Oivanen, P. (Operatör)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Microbiology
Saris, P. (Chef) & Lundell, T. (Chef)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Tecno Hub
Alakukku, L. (Chef)
Agrikultur- och forstvetenskapliga fakultetenUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (deltagare) & Kant, R. (Principal Investigator)
01/12/2025 → …
Projekt: Stiftelser och fonder
-
Opening Pandora’s Box: Assessing The Risks of Permafrost Thaw to Environment and Human Health
Väliranta, M. (Projektledare), Korhola, A. (Projektledare), Weckström, J. (Principal Investigator), Kontro, M. H. (Principal Investigator), Bianchi, F. (Principal Investigator), Passananti, M. (Co-Principal Investigator), Vapalahti, O. (Principal Investigator), Sironen, T. (Principal Investigator), Korhonen, E. M. (Co-Principal Investigator), Green, S. (Principal Investigator), Toivanen, R. (Principal Investigator), Kiss, E. A. (Co-Principal Investigator), Smura, T. (Co-Principal Investigator), Pilkama, H. E. (Deltagare), Deresh, A. (deltagare), Haglund, A. K. (deltagare) & Karkela, P. K. (deltagare)
01/01/2025 → 31/12/2027
Projekt: Forskningsprojekt
-
Water & Food Futures: Navigating the route to sustainable water-food futures
Hyytiäinen, K. (Projektledare), Friman, A. E. (deltagare), Fu, Y. (deltagare), Lamminen, M. (deltagare), Meinilä, J. (deltagare), Yuhai, K. (deltagare), Alakukku, L. (Deltagare), El Wali, M. (Deltagare), Erkkola, M. (Deltagare), Friman, A. E. (Deltagare), Hyytiä, N. (Deltagare), Irz, X. (Deltagare), Karttunen, A. K. (Deltagare), Lamminen, M. (Deltagare), Mäkelä, P. (Deltagare), Peltonen, H. M. K. (Deltagare), Sandström, V. (Deltagare) & Tuomisto, H. (Deltagare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus
01/12/2024 → 30/11/2027
Projekt: Finlands Akademi: Rådet för strategisk forskning (RSF) finansierad
-
Bataatin viljelytekniikka ja ravitsemuksellinen laatu Suomessa
Edelmann, M. (Deltagare), Uusitupa, J. V. E. (Deltagare), Jokinen, K. (Deltagare), Alakukku, L. (Deltagare) & Mäkelä, P. (Principal Investigator)
01/01/2024 → 31/12/2025
Projekt: Forskningsprojekt
-
Pipeline for Rapid Diagnostics of Emergency Transboundary Infectious Diseases
Kant, R. (Projektledare), Vapalahti, O. (Deltagare) & Sironen, T. (Principal Investigator)
01/09/2023 → 31/08/2027
Projekt: EU Innovation Actions (IA)
-
Annual (2024) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae
Kuhn, J. H., Adkins, S., Alkhovsky, S. V., An, W., Avšič‐Županc, T., Ayllón, M. A., Bačnik, K., Bahl, J., Balkema‐Buschmann, A., Ballinger, M. J., Beer, M., Bejerman, N., Bergeron, É., Biedenkopf, N., Blair, C. D., Blasdell, K. R., Bradfute, S. B., Briese, T., Brown, K. & Brown, P. A. & 78 andra, , 13 juni 2025, I: Journal of General Virology. 106, 6, 70 s., 002077.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Cell culture persistence, timing of co- and superinfections, and their impact to tropism of segmented viruses : reptarenaviruses as a model
Lintala, A., 2025, Helsinki.Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling › Samling av artiklar
Öppen tillgång -
Changes in serum basal insulin concentration during estrous cycle in healthy mares
Karikoski, N., Lautala, E. A. & Kareskoski, M., 2025.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Poster
-
Changes in Serum Basal Insulin Concentration during Estrous Cycles in Healthy Mares
Karikoski, N., Lautala, E. A. & Kareskoski, M., 2025.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Poster › Peer review
-
Checklist for providing open access to research data
Hepolehto, I. A. J., Kuusniemi, M. E. & Käkelä, T. M., 2025Forskningsoutput: Övriga bidrag
Öppen tillgång
Aktiviteter
-
Lammin biologisen aseman ympäristötutkimuksen Säätiö
Auvinen, P. (!!Keynote speaker) & Duplouy, A. (!!Invited speaker)
14 apr. 2025Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Invited talk
Fil -
The 17th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology
Markkanen, M. A. (!!Speaker)
2 juli 2025Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
4th World Conference on Forests and Parks for Public Health
Manninen, J. (Poster presentation)
21 maj 2025 → 24 maj 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
RESET Research Symposium 2025
Manninen, J. (Poster presentation)
8 maj 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Virology Days 2025
Salomaa, M. M. (Poster presentation)
6 feb. 2025 → 7 feb. 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Priser
-
-
Best Poster Presentation Award at the 7th Annual Meeting of Plant Ecology and Evolution
Christodoulou, M. (!!Recipient), 14 nov. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Doctoral research grant (Finnish Cultural Foundation)
Zhao, H. (!!Recipient), 28 feb. 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
European Culture Collection’s Organization Travel Grant
Christodoulou, M. (!!Recipient), sep. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, K. (!!Recipient), Jouhten, H. (!!Recipient), Ronkainen, A. (!!Recipient), Hartikainen, A. (!!Recipient), Kainulainen, V. (!!Recipient), Jalanka, J. (!!Recipient) & Satokari, R. (!!Recipient), 7 sep. 2020
Pris: Pris och hedersbetygelser
Forskningsdatauppsättningar
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Skapad av), European Nucleotide Archive, 27 aug. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Datauppsättning
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Skapad av), Pessa-Morikawa, T. (Skapad av), Husso, A. (Skapad av) & Iivanainen, A. (Skapad av), EUDAT, 2021
DOI: 10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Datauppsättning
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Skapad av), Alakukku, L. (!!Supervisor), Regina, K. (!!Supervisor) & Heikkinen, J. I. (!!Supervisor), HARVARD UNIVERSITY, 12 okt. 2021
DOI: 10.7910/DVN/0DJGYJ
Datauppsättning
Tidningsurklipp
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
27/08/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
The Washington Post interview: 4 ways to make your house germier – in a good way
15/05/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Lohtajalta lähtöisin olevaa väitöskirjatutkijaa kiinnostaa vanhan navetan lanta — Siitä löytyy ihmiskunnalle tärkeää tietoa
25/02/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Researcher from the Division of Tropical Parasitology is co-author of the publication in "Nature"
05/04/2024
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Mitochondrial roles in antiviral immunity modify manifestations of neurological diseases
04/04/2024
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media