Projekt per år
Organisationsprofil
Organisationsprofil
Microbes have a major effect on the ecosystem and humans. Microbes run biogeochemical cycles of the elements, play a major role in the intestines of animals and biotechnology such as waste water treatment and food production, just to mention some. On the other hand, microbes cause diseases for plants, animals and humans.
The Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology covers the entire field of microbiology, i.e., bacteria, archaea, eukaryotic microorganisms and viruses in any environment where microbes can be found. In addition to basic research in microbiology, it includes applied microbiology which is reflected by including microbiologically relevant biotechnology in the program.
Focus area of the program include:
- environmental microbiology
- microbial biotechnology
- genetics and genomics of microbes
- food microbiology
- human and animal microbiota
- microbe evolution
- microbe-host interactions
- infection microbiology
- virology
The researcher community formed around the program is nationally the most significant unit in its field and the only one in Finland in several sub-fields.
The Faculty of Agriculture & Forestry has main responsibility for the programme.
Samarbeten och ledande forskningsområden under de senaste fem åren
Profiler
-
Bartosz Adamczyk
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person
-
Tero Ahola
- Avdelningen för mikrobiologi - äldre universitetslektor
- Doctoral Programme in Drug Research - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Helsinki One Health (HOH)
- RNA virus replication and antivirals
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU, undervisnings- och forskningspersonal
-
Harri Alenius
- Human Microbiome Research - gästprofessor
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: undervisnings- och forskningspersonal, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Eda Altan Tarakci
- Avdelningen för virologi - forskardoktor
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
- Helsinki One Health (HOH)
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal
Utrustning
-
Cryo-Electron Microscopy Facility (LS-RIA/ Instruct-HiLIFE)
Butcher, S. (Chef), Domanska, A. (Operatör), Laurinmäki, P. (Operatör) & Lak, B. (Operatör)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Microbial Domain Biological Resource Centre HAMBI (LS-RIA/ HUBCRI)
Friman, V.-P. (Chef) & Oivanen, P. (Operatör)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Microbiology
Saris, P. (Chef) & Lundell, T. (Chef)
Avdelningen för mikrobiologiUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Tecno Hub
Alakukku, L. (Chef)
Agrikultur- och forstvetenskapliga fakultetenUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (deltagare) & Kant, R. (Principal Investigator)
01/12/2025 → …
Projekt: Stiftelser och fonder
-
Moody mares - estrous behaviour, social signaling, stress, or pain?
Kareskoski, M. (Projektledare)
01/09/2025 → …
Projekt: Forskningsprojekt
-
Opening Pandora’s Box: Assessing The Risks of Permafrost Thaw to Environment and Human Health
Väliranta, M. (Projektledare), Korhola, A. (Projektledare), Weckström, J. (Principal Investigator), Kontro, M. H. (Principal Investigator), Bianchi, F. (Principal Investigator), Passananti, M. (Co-Principal Investigator), Vapalahti, O. (Principal Investigator), Sironen, T. (Principal Investigator), Korhonen, E. M. (Co-Principal Investigator), Green, S. (Principal Investigator), Toivanen, R. (Principal Investigator), Kiss, E. A. (Co-Principal Investigator), Smura, T. (Co-Principal Investigator), Pilkama, H. E. (Deltagare), Deresh, A. (deltagare), Haglund, A. K. (deltagare) & Karkela, P. K. (deltagare)
01/01/2025 → 31/12/2027
Projekt: Forskningsprojekt
-
Water & Food Futures: Navigating the route to sustainable water-food futures
Hyytiäinen, K. (Projektledare), Friman, A. E. (deltagare), Fu, Y. (deltagare), Lamminen, M. (deltagare), Meinilä, J. (deltagare), Yuhai, K. (deltagare), Alakukku, L. (Deltagare), El Wali, M. (Deltagare), Erkkola, M. (Deltagare), Friman, A. E. (Deltagare), Hyytiä, N. (Deltagare), Irz, X. (Deltagare), Karttunen, A. K. (Deltagare), Lamminen, M. (Deltagare), Mäkelä, P. (Deltagare), Peltonen, H. M. K. (Deltagare), Sandström, V. (Deltagare) & Tuomisto, H. (Deltagare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus
01/12/2024 → 30/11/2027
Projekt: Finlands Akademi: Rådet för strategisk forskning (RSF) finansierad
-
Pipeline for Rapid Diagnostics of Emergency Transboundary Infectious Diseases
Kant, R. (Projektledare), Vapalahti, O. (Deltagare) & Sironen, T. (Principal Investigator)
01/09/2023 → 31/08/2027
Projekt: EU Innovation Actions (IA)
-
Advances in Extracellular Vesicle Research: Tools and Techniques
Fatima, H., Chen, X., Li, Q., Nie, X., Xie, J. & Nie, S., 2026, I: Nanoscale horizons.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
-
Combination of vemurafenib, pleconaril, and AG7404 attenuates enterovirus replication in vitro and in vivo
Ravlo, E., Ianevski, A., Wolska, W., Schjølberg, J.-O., Cámara-Quílez, M., Nordli, I. E. O., Sæther, I. B., Lysvand, H., Oksenych, V., Vähä-Koskela, M. J. V., Vainionpää, S. A. A., Seppänen, H. E., Smura, T., Vauhkonen, H. K., Odai, R., Stoyanova, A., Galabov, A. S., Galabov, A. S., Plevka, P. & Nekoua, M. P. & 3 andra, , 2026, I: NAR Molecular Medicine. ugaf046.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
From dysbiosis to dysfunction: Specific gut microbes and metabolites in the pathogenesis of Parkinson’s disease
Chi, F., 10 jan. 2026, I: Sustainable microbiology.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
LazypipeX: Customizable Virome Analysis Pipeline Enabling Fast and Sensitive Virus Discovery from NGS data
Pljusnin, I., Vapalahti, O., Kant, R. & Smura, T., 19 jan. 2026, (Insänt) I: bioRxiv : the preprint server for biology .Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Sugarcane bagasse arabinoxylan alleviated dextran sulfate sodium-induced mice colitis by modulating gut microbiota
Chen, C., Nie, Q., Zhong, Y., Teng, Y., Wang, Z., Yang, F., Chen, X., Wei, X., Zhang, W. & Nie, S., 2026, I: Food & Function.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Aktiviteter
-
Use of pharmacologically induced ejaculation to obtain semen from stallions unable to mount a mare/dummy
Kareskoski, M. (!!Speaker)
2026 → …Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Invited talk
-
Co-supervisor of Tomas Laamanen's PhD thesis
Butcher, S. (Handledare) & Tang, J. (Handledare)
jan. 2026 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
-
Näkökulmia pedagogiseen johtamiseen yliopistossa
Kareskoski, M. (Närvarande)
11 dec. 2025Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Host-Associated Genomic Variability and Transmission Patterns of Leptospira in Tanzanian Livestock and Rodents
Kant, R. (Handledare) & Sironen, T. (Handledare)
2025 → …Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
-
ISER Society Awards Committee (Extern organisation)
Kareskoski, M. (Styrelsemedlem)
2025 → …Aktivitet: Medlemskapstyper › Medlemskap eller annan role i inhemsk/internationell kommitté, råd, styrelse
Priser
-
-
Best Poster Presentation Award at the 7th Annual Meeting of Plant Ecology and Evolution
Christodoulou, M. (!!Recipient), 14 nov. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Doctoral research grant (Finnish Cultural Foundation)
Zhao, H. (!!Recipient), 28 feb. 2021
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
European Culture Collection’s Organization Travel Grant
Christodoulou, M. (!!Recipient), sep. 2023
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Nutrients 2020 Best Paper Awards
Hiippala, K. (!!Recipient), Jouhten, H. (!!Recipient), Ronkainen, A. (!!Recipient), Hartikainen, A. (!!Recipient), Kainulainen, V. (!!Recipient), Jalanka, J. (!!Recipient) & Satokari, R. (!!Recipient), 7 sep. 2020
Pris: Pris och hedersbetygelser
Forskningsdatauppsättningar
-
Early development of the intestinal microbiota in horses, and associations with mare microbiotas
Niku, M. (Skapad av), European Nucleotide Archive, 27 aug. 2019
https://www.ebi.ac.uk/ena/data/view/PRJEB32017
Datauppsättning
-
Metabolomic signature of the maternal microbiota in the fetus
Niku, M. (Skapad av), Pessa-Morikawa, T. (Skapad av), Husso, A. (Skapad av) & Iivanainen, A. (Skapad av), EUDAT, 2021
DOI: 10.23728/b2share.4be0ea9f87b84a06be960d6a1c4b0b42
Datauppsättning
-
Effect of controlled drainage on the carbon balance of a cultivated peat soil in Finland
Karim, R. (Skapad av), Alakukku, L. (!!Supervisor), Regina, K. (!!Supervisor) & Heikkinen, J. I. (!!Supervisor), HARVARD UNIVERSITY, 12 okt. 2021
DOI: 10.7910/DVN/0DJGYJ
Datauppsättning
Tidningsurklipp
-
-
Study Visit at the University of Helsinki: Transcriptomics and Metagenomic Research
14/12/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Lasten kysymykset/ "Miksi maailmassa on pöpöjä? Mitä hyötyä niistä on?"
17/10/2025
1 Mediabidrag
Press/media: !!Press / Media
-
Esiintyminen Ylen tiede-televisio-ohjelmassa Jälkikaronkka
27/08/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
The Washington Post interview: 4 ways to make your house germier – in a good way
15/05/2025
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media