Publikationer 2001 2019

2019

A Festetics rejtély: A Genetika Története és Festetics Imre Elfeledett Hagyatéka

Poczai, P., 2019, Kőszeg: Felsőbbfokú Tanulmányok Intézete . 159 s.

Forskningsoutput: Bok/rapportBokVetenskapligPeer review

An annotated checklist of the bryophytes of Taita Hills region, Kenya

Enroth, J., Pocs, T., He, X., Nyqvist, P., Stam, Å. C. S., Malombe, I. & Rikkinen, J. K., 1 jul 2019, I : Acta Musei Silesiae. Scientiae Naturales. 68, 1-2, s. 53–66 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Effect of water deficit stress on seedling biomass and physio-chemical characteristics in different species of wheat possessing the D genome.

Pour-Aboughadareh, A., Omidi, M., NAGHAVI, M., Etminan, A., MEHRABI, AA., Poczai, P. & BIAT, H., 2019, (Insänt) I : Agronomy.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Exploring plant meiosis: a bioinformatics perspective

Sablok, G., He, X. & Hyvönen, J. T., 2019, (Insänt) I : Frontiers in plant science.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Festetics’ ‘Genetic laws of Nature’ considered in relation to the prevailing concept of blood inheritance.

Wood, R. J., T. Szabó, A. & Poczai, P., 2019, (Insänt) I : Journal of the History of Biology.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Gametophytic transcriptomics of an early embryophyte (Blasia pusilla) and comparative landscape of gametophyte evolution

Sablok, G., He, X., Miranto, M., Peltomaa, E., Flores, J., Sleith, R., Karol, K., Delwiche, C., Bell, N., Paulin, L., Poczai, P. & Hyvönen, J., 26 jun 2019.

Forskningsoutput: KonferensbidragPosterForskningPeer review

Fil

High levels of auxin signalling define the stem-cell organizer of the vascular cambium

Smetana, O., Mäkilä, R., Lyu, M., Amiryousefi, A., Rodriguez, F. S., Wu, M-F., Sole-Gil, A., Gavarron, M. L., Siligato, R., Miyashima, S., Roszak, P., Blomster, T., Reed, J. W., Broholm, S. & Mähönen, A. P., 24 jan 2019, I : Nature. 565, 7740, s. 485-+ 20 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

iPASTIC: An online toolkit to estimate plant abiotic stress indices

Pour-Aboughadareh, A., Yousefian, M., Moradkhani, H., Poczai, P. & Siddique, K. HM., 2019, I : Applications in Plant Sciences. 7, 7, 6 s., e11278.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Mitogenomics of Blasia pusilla as a tool for agricultural productivity

Sablok, G., He, X., Miranto, M. J., Flores, J. R., Peltomaa, E. T., Sleith, R., Karol, K., Delwiche, C., Bell, N., Paulin, L. G., Poczai, P. & Hyvönen, J. T., 24 mar 2019.

Forskningsoutput: KonferensbidragPosterForskningPeer review

Öppen tillgång
Fil

Molecular diversity and phytochemical variability in the Iranian poppy (Papaver bracteatum Lindl.): A baseline for conservation and utilization in future breeding programmes

Qaderi, A., Omidi, M., Pour-Aboughadareh, A., Poczai, P., Shaghaghi, J., MehrAfarin, A., Nohooji, M. G. & Etminan, A., apr 2019, I : Industrial Crops and Products. 130, s. 237-247 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Phylogeny of the family Cladoniaceae (Lecanoromycetes, Ascomycota) based on sequences of multiple loci

Stenroos, S., Pino-Bodas, R., Hyvonen, J., Lumbsch, H. T. & Ahti, T., aug 2019, I : Cladistics - the international journal of the Willi Hennig Society. 35, 4, s. 351-384 34 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Protocols for miRNA Target Prediction in Plants

Sablok, G., Yang, K. & Wen, X., 2019, MicroRNA Target Identification: Methods and Protocols. Laganà, A. (red.). New York: Humana Press, s. 65-73 9 s. (Methods in Molecular Biology ; vol. 1970).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

STABILITYSOFT: a new online program to calculate parametric and non-parametric stability statistics for crop traits

Pour-Aboughadareh, A., Yousefian, M., Moradkhani, H., Poczai, P. & Siddique, K. HM., 15 jan 2019, I : Applications in Plant Sciences. 7, 1, 6 s., 1211.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragLedareVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Testing the feasibility of assisted migration as an ex situ conservation tool on selected threatened bryophytes

Laaka-Lindberg, S. & He, X., 2019, (!!In preparation) I : Biological Conservation.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The emergence of genetics from Festetics’ sheep through Mendel’s peas to Bateson’s chickens

T. Szabó, A. & Poczai, P., jun 2019, I : Journal of Genetics. 98, 2, 7 s., 63.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The Good, the Coachman and the Sheep Breeders’ Society of Moravia: How Political Repression Stifled the Nascent Foundations of Heredity Research Prior to Mendel

Poczai, P., Sekerák, J., Bariska, I. & T. Szabó, A., 2019, (Insänt) I : Journal of the History of Biology.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Unraveling salinity stress responses in ancestral and neglected wheat species: a baseline for conservation and utilization in future wheat improvement programs

Ahmadi, J., Pour-Aboughadareh, A., Fabriki-Ourang, S., Khalili, P. & Poczai, P., 2019, (Insänt) I : Physiology and Molecular Biology of Plants.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2018

A revision of the Old World Black Nightshades (Morelloid clade of Solanum L., Solanaceae)

Särkinen, T., Poczai, P., Barboza, G., van der Weerden, G. M., Baden, M. & Knapp, S., 25 jul 2018, I : PhytoKeys. 106, s. 1-223 223 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Comparative assessment of chloroplast transcriptional responses highlights conserved and unique patterns across Triticeae members under salt stress

Mirzaei, S., Mansouri, M., Mohammadi‐Nejad, G. & Sablok, G., jun 2018, I : Photosynthesis Research. 136, 3, s. 357-369 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

iMEC: Online Marker Efficiency Calculator

Amiryousefi, A., Hyvönen, J. & Poczai, P., jun 2018, I : Applications in Plant Sciences. 6, 6, e1159.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

In silico identification and characterization of a diverse subset of conserved microRNAs in bioenergy crop Arundo donax L.

Jike, W., Sablok, G., Bertorelle, G., Li, M. & Varotto, C., 12 nov 2018, I : Scientific Reports. 8, 13 s., 16667.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

IRscope: An online program to visualize the junction sites of chloroplast genomes

Amiryousefi, A., Hyvönen, J. T. & Poczai, P., 2018, I : Bioinformatics. 34, 17, s. 3030-3031 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

New national and regional biological records for Finland 9. Contributions to Bryophyta and Marchantiophyta 8.

Juutinen, R., Ulvinen, T., Kypärä, T., Huttunen, S., Vuorinen, K., Kuitunen, T., Parnela, A., Korvenpää, T., Syrjänen, K., Pihlaja, K., Köckinger, H., Konstantinova, N. A., Kestilä, A., Ervasti, E., He, X., Häyhä, T., Karttunen, K., Laaka-Lindberg, S., Torniainen, J., Vainio, O. & 2 andraVasander, H. & Vuorinen, E., 30 nov 2018, I : Memoranda Societatis pro Fauna et Flora Fennica. 2018, 94, s. 84-99 16 s., 76604.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

On the identity of Herbertus aduncus (Dicks.) Gray, a taxonomic update

Sun, Y. & He, X., 2018, (Insänt) I : Acta Bryolichenologica Asiatica.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Plastomics of charophycean Coleochaete orbicularis and embryophyte Blasia pusilla

Sablok, G., He, X., Miranto, M. J., Peltomaa, E., Bell, N., Sleith, R., Karol, K., Delwiche, C., Paulin, L. G., Poczai, P. & Hyvönen, J. T., 2018, s. 541. 1 s.

Forskningsoutput: KonferensbidragPosterForskningPeer review

Shedding new light on the origin and spread of the brinjal eggplant (Solanum melongena L.; Solanaceae) and its wild relatives

Aubriot, X., Knapp, S., Syfert, M., Poczai, P. & Buerki, S., jul 2018, I : American Journal of Botany. 105, 7, s. 1175-1187 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Taxonomy based on science is necessary for global conservation

Thomson, S., Pyle, R., T. Ahyong, S., A. Alonso-Zarazaga, M., Ammirati, J., Ascher, J. S., Audisio, T. L., Azvedo-Santos, V. M., Bailly, N., Baker, W. J., Balke, M., Barclay, M. V. L., Barrett, R. L., Benine, R. C., Bickerstaff, J. R. M., Bouchard, P., Bour, R., Bourgoin, T., Boyoko, C. B., Breure, A. S. H. & 168 andraBrothers, D. J., Buffington, M. L., Byng, J. W., Campbell, D., Ceriaco, L. M. P., Cernák, I., Cerretti, P., Chang, C-H., Cho, S., Copus, J. M., Costello, M. J., Cseh, A., Csúzi, C., Culham, A., D'Elia, G., d'Udekem d'Acoz, C., Daneliya, M. E., M. de Vos, J., Dekker, R., Dickinson, E. C., Dickinson, T. A., Dijkstra, K-D. B., Dima, B., Dmitriev, D. A., Duistermaat, L., Dumbacher, J. P., Eiserhardt, W. L., Ekrem, T., Evenhuis, N. L., Faille, A., Fernández-Triana, J. L., Fiesler, E., Fishbein, M., Fordham, B. G., Freitas, A. V. L., Friol, N. R., Fritz, U., Frøslev, T., Funk, V. A., Gaimari, S. D., Garbino, G. S. T., Gardes, M., Garraffoni, A. R. S., Geml, J., C. Gill, A., Gray, A., Grazziotin, F. G., Greenslade, P., Gutiérrez, E. E., Harvey, M. S., Hazevoet, C. J., He, K., He, X., Helfer, S., Helgen, K. M., Heller, K., Garcia, F. H., Holstein, N., Horváth, M. K., Hovenkamp, P. H., Hwang, W. S., Hyvönen, J. T., Islam, M. B., Iverson, J. B., Ivie, M. A., Jaafar, Z., Jackson, M. D., Jayat, J. P., Johnson, N. F., Kaiser, H., Klitgård, B. B., Knapp, D. G., Kojima, J., Kõljalg, U., Kontschán, J., Krell, F-T., Krisai-Greihuber, I., Kullander, S., Latella, L., Lattke, J. E., Lencioni, V., Lewis, G. P., Lhano, M. G., Lujan, N. K., Luksenburg, J. A., Mariaux, J., Marinho-Filho, J., Marshall, C. J., Mate, J. F., McDonough, M. M., Michel, E., Miranda, V. F. O., Mitroiu, M-D., Molinari, J., Monks, S., Moore, A. J., Moratelli, R., Moreau, P-A., Murányi, D., Nakano, T., Nihei, S. S., Noyes, J., Ohl, M., Oleas, N. H., Orrell, T., Páll-Gergely, B., Pape, T., Papp, V., Parenti, L. R., Patterson, D., Pavlinov, I. Y., Pine, R. H., Poczai, P., Prado, J., Prathapan, D., Rabeler, R. K., Randall, J. E., Rheindt, F. E., Rhodin, A. G. J., Rodríguez, S. M., Rogers, D. C., de O. Roque, F., Rowe, K. C., Ruedas, L. A., Salazar-Bravo, J., Salvador, R. B., Sangster, G., Sarmiento, C. E., Schigel, D. S., Schmidt, S., Schueler, F. W., Segers, H., Snow, N., Souza-Dias, P. G. B., Stals, R., Stenroos, S. K., Stone, R. D., Sturm, C. F., Štys, P., Teta, P., Thomas, D. C., Timm, R. M., Tindall, B. J., Todd, J. A., Triebel, D., Valdecasas, A. G., van Dijk, P. P., van Heteren, A. H., Vizzini, A., Vorontsova, M., Wagner, P., Watling, L., Weakley, A., Walter-Schultes, F., Whitmore, D., Wilding, N., Will, K., Williams, J., Wilson, K., Winston, J. E., Wüster, W., Yanega, D., Yeates, D. K., Zaher, H., Zhang, G., Zhang, Z-Q., Zhou, H-Z. & Zhu, C-D., 2018, I : PLoS Biology. 16, 3, e2005075.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The chloroplast genome sequence of bittersweet (Solanum dulcamara): plastid genome structure evolution in Solanaceae

Amiryousefi, A., Hyvönen, J. T. & Poczai, P., 2018, I : PLoS One. 13, 4, 23 s., e0196069.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The first draft genome of Blasia pusilla using SMRT sequencing

Sablok, G., He, X., Miranto, M. J., Peltomaa, E., Bell, N., Paulin, L. G., Poczai, P. & Hyvönen, J. T., 2018, s. 74. 1 s.

Forskningsoutput: KonferensbidragPosterForskningPeer review

Fil
2017

Action C.5 Milestone, Bryophyte ex situ conservation scheme

Laaka-Lindberg, S. & He, X., 2017, Helsinki: University of Helsinki. 12 s.

Forskningsoutput: Bok/rapportBeställd rapportProfessionell

Complete chloroplast genome sequence of Coyote tobacco (Nicotiana attenuata, Solanaceae)

Poczai, P., Amiryousefi, A. & Hyvönen, J., 2017, I : Mitochondrial DNA Part B, Resources. 2, 2, s. 761-762 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Description and phylogenetic investigation of Pogonatum shevockii N.E.Bell & Hyvönen (Polytrichaceae), a new East Asian species with a unique leaf morphology

Bell, N. E., Hyvonen, J., Yao, K-Y. & Ma, W-Z., 2017, I : Journal of Bryology. 39, 3, s. 235-246 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Emerging Roles and Landscape of Translating mRNAs in Plants

Sablok, G., Powell, J. J. & Kazan, K., 1 sep 2017, I : Frontiers in plant science. 8, 9 s., 1443.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Genome sequencing and population genomic analyses provide insights into the adaptive landscape of silver birch

Salojärvi, J., Smolander, O-P., Nieminen, K., Rajaraman, S., Safronov, O., Safdari, P., Lamminmäki, A., Immanen, J., Lan, T., Tanskanen, J., Rastas, P., Amiryousefi, A., Jayaprakash, B., Kammonen, J. I., Hagqvist, R., Eswaran, G., Ahonen, V. H., Serra, J. A., Asiegbu, F. O., Barajas-Lopez, J. D. D. & 65 andraBlande, D., Blokhina, O., Blomster, T., Broholm, S., Brosche, M., Cui, F., Dardick, C., Ehonen, S. E., Elomaa, P., Escamez, S., Fagerstedt, K. V., Fujii, H., Gauthier, A., Gollan, P. J., Halimaa, P., Heino, P. I., Himanen, K., Hollender, C., Kangasjarvi, S., Kauppinen, L., Kelleher, C. T., Kontunen-Soppela, S., Koskinen, J. P., Kovalchuk, A., Karenlampi, S. O., Kärkönen, A. K., Lim, K-J., Leppälä, J., Macpherson, L., Mikola, J., Mouhu, K., Mähönen, A. P., Niinemets, U., Oksanen, E., Overmyer, K., Palva, E. T., Pazouki, L., Pennanen, V., Puhakainen, T., Poczai, P., Possen, B. J. H. M., Punkkinen, M., Rahikainen, M. M., Rousi, M., Ruonala, R., van der Schoot, C., Shapiguzov, A., Sierla, M., Sipilä, T. P., Sutela, S., Teeri, T. H., Tervahauta, A. I., Vaattovaara, A., Vahala, J., Vetchinnikova, L., Welling, A., Wrzaczek, M., Xu, E., Paulin, L. G., Schulman, A. H., Lascoux, M., Albert, V. A., Auvinen, P., Helariutta, Y. & Kangasjarvi, J., 8 maj 2017, I : Nature Genetics. 49, 6, s. 904-912 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Global biogeographic patterns in bipolar moss species

Biersma, E. M., Jackson, J. A., Hyvonen, J., Koskinen, S., Linse, K., Griffiths, H. & Convey, P., jul 2017, I : Royal Society Open Science. 4, 7, 13 s., 170147.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Rare sporophyte found in Europe for Herbertus sendtneri with a range expansion to Africa and Malesia

He, X. & Sun, Y., 6 okt 2017, I : Phytotaxa. 324, 1, s. 42-50 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

The complete chloroplast genome sequence of the CAM epiphyte Spanish moss (Tillandsia usneoides, Bromeliaceae) and its comparative analysis

Poczai, P. & Hyvönen, J. T., 2017, I : PLoS One. 12, 11, 25 s., e0187199.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The plastid genome of the invasive plant common ragweed (Ambrosia artemisiifolia, Asteraceae)

Amiryousefi, A., Hyvönen, J. & Poczai, P., 2017, I : Mitochondrial DNA Part B, Resources. 22, s. 753-754 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The plastid genome of Vanillon (Vanilla pompona, Orchidaceae)

Amiryousefi, A., Hyvönen, J. & Poczai, P., 2017, I : Mitochondrial DNA Part B, Resources. 2, 2, s. 689-691 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

tRNA Derived smallRNAs: smallRNAs Repertoire Has Yet to Be Decoded in Plants

Sablok, G., Yang, K., Chen, R. & Wen, X., 25 jul 2017, I : Frontiers in plant science. 8, 4 s., 1167.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2016

Hitupihtisammalta etsimässä

Laaka-Lindberg, S., Ryömä, R. & He, X., aug 2016, Metsän salainen elämä. Hallanaro, E-L., Kuusela, S., Juslén, A. & Ryttäri, T. (red.). Helsinki: Gaudeamus Helsinki University Press, s. 126-137 12 s. 9

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelAllmänheten

Liverworts collected from Tuntsa, Eastern Finnish Lapland in 2016.

He, X., 2016, I : Bryobrotherella. 19, s. 44-51 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Metsäteiden maksasammalia Pohjois-Karjalassa ja huomioita aiemmin heimoon Jungermanniaceae kuuluneiden lajien taksonomiasta

Laaka-Lindberg, S., Räsänen, J. & He, X., 2016, I : Bryobrotherella. 19, s. 62–70 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

New national and regional biological records for Finland 7. Contributions to Bryophyta and Marchantiophyta

Juutinen, R., Ulvinen, T., Syrjänen, K., Kypärä, T., Kuitunen, T., Parnela, A., Heikkilä, R., Suoknuuti, R., Marsh, T., Arkkio, H., He, X., Huttunen, S., Tahvanainen, T., Häyhä, T., Jääskeläinen, K. J. & Vainio, O., 2016, I : Memoranda Societatis pro Fauna et Flora Fennica. 92, s. 35–47 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Rusorahtusammal ja sen kaverit

Oldén, A., Ryömä, R., He, X. & Laaka-Lindberg, S., aug 2016, Metsän salainen elämä. Hallanaro, E-L., Kuusela, S., Juslén, A. & Ryttäri, T. (red.). Helsinki: Gaudeamus Helsinki University Press, s. 348-359 12 s. 26

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelAllmänheten

Will bryophytes survive in a warming world?

He, X., He, K. S. & Hyvönen, J., apr 2016, I : Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics. 19, s. 49-60 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Willi Hennig’s legacy in the Nordic countries

Seberg, O., Ekrem, T., Hyvönen, J. T. & Sundberg, P., jul 2016, The Future of Phylogenetic Systematics: The Legacy of Willi Hennig. Williams, D. (red.). London: Cambridge University Press, s. 31-69 39 s. 3. (The Systematics Association Special Volume Series).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review