Publikationer

Filter
Artikel
2020

N-glycomic profiling of colorectal cancer according to tumor stage and location

Holm, M., Nummela, P., Heiskanen, A., Satomaa, T., Kaprio, T., Mustonen, H., Ristimäki, A. & Haglund, C., 29 jun 2020, I : PLoS One. 15, 6, 16 s., 0234989.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Preoperative Radiotherapy Leads to Significant Differences in the Plasma Protein Profile of Rectal Cancer Patients

Holm, M., Joenväärä, S., Saraswat, M., Tohmola, T., Ristimäki, A., Renkonen, R. & Haglund, C., jul 2020, I : Oncology. 98, 7, s. 493-500 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2019

BRAF V600E expression in ameloblastomas-A 36-patient cohort from Helsinki University Hospital

Kelppe, J., Thoren, H., Ristimäki, A., Haglund, C., Sorsa, T. & Hagström, J., maj 2019, I : Oral Diseases. 25, 4, s. 1169-1174 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Differences and overlap in plasma protein expression during colorectal cancer progression

Holm, M., Joenväärä, S., Saraswat, M., Tohmola, T., Ristimäki, A., Renkonen, R. & Haglund, C., 5 aug 2019, I : Translational Medicine Communications. 4, 1, 12 s., 14.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Notum produced by Paneth cells attenuates regeneration of aged intestinal epithelium

Pentinmikko, N., Iqbal, S., Mana, M., Andersson, S., Cognetta, A. B., Suciu, R. M., Roper, J., Luopajärvi, K., Markelin, E., Gopalakrishnan, S., Smolander, O-P., Naranjo, S., Saarinen, T., Juuti, A., Pietiläinen, K., Auvinen, P., Ristimäki, A., Gupta, N., Tammela, T., Jacks, T. & 4 andra, Sabatini, D. M., Cravatt, B. F., Yilmaz, O. H. & Katajisto, P., 18 jul 2019, I : Nature. 571, 7765, s. 398-+ 21 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2018
Öppen tillgång
Fil

Contribution of allelic imbalance to colorectal cancer

Palin, K., Pitkänen, E., Turunen, M., Sahu, B., Pihlajamaa, P., Kivioja, T., Kaasinen, E., Välimäki, N., Hänninen, U. A., Cajuso, T., Aavikko, M., Tuupanen, S., Kilpivaara, O., van den Berg, L., Kondelin, J., Tanskanen, T., Katainen, R., Grau, M., Rauanheimo, H., Plaketti, R-M. & 20 andra, Taira, A., Sulo, P., Hartonen, T., Dave, K., Schmierer, B., Botla, S., Sokolova, M., Vähärautio, A., Gladysz, K., Ongen, H., Dermitzakis, E., Bramsen, J. B., Orntoft, T. F., Andersen, C. L., Ristimäki, A., Lepistö, A., Renkonen-Sinisalo, L., Mecklin, J-P., Taipale, J. & Aaltonen, L. A., 10 sep 2018, I : Nature Communications. 9, 9 s., 3664.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Does a histologically inflamed resection margin increase postoperative complications in patients with Crohn's disease?

Aaltonen, G., Ristimäki, A., Keränen, I., Carpelan-Holmström, M. & Lepistö, A., 2018, I : Scandinavian Journal of Gastroenterology. 53, 3, s. 279-283 5 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Exome-wide somatic mutation characterization of small bowel adenocarcinoma

Hänninen, U. A., Katainen, R., Tanskanen, T., Plaketti, R-M., Laine, R., Hamberg, J., Ristimäki, A., Pukkala, E., Taipale, M., Mecklin, J-P., Forsström, L. M., Pitkänen, E., Palin, K., Välimäki, N., Mäkinen, N. & Aaltonen, L. A., mar 2018, I : PLoS Genetics. 14, 3, 23 s., 1007200.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Glycomic Profiling Highlights Increased Fucosylation in Pseudomyxoma Peritonei

Saarinen, L. A., Nummela, P., Leinonen, H., Heiskanen, A., Thiel, A., Haglund, C., Lepistö, A., Satomaa, T., Hautaniemi, S. & Ristimäki, A., 2 aug 2018, I : Molecular & Cellular Proteomics. 17, 11, s. 2107-2118 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2017

A hamartoma presenting as an intramural upper oesophageal tumour

Rasanen, J., Ilonen, I., Ristimaki, A., Salo, J. A. & Makitie, A. A., aug 2017, I : Journal of thoracic disease. 9, 8, s. E698-E701 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Carbonic anhydrase II: a novel biomarker for pseudomyxoma peritonei

Järvinen, P., Kivelä, A., Nummela, P., Lepisto, A., Ristimaki, A. & Parkkila, S., mar 2017, I : APMIS : Acta pathologica, microbiologica et immunologica Scandinavica. 125, 3, s. 207-212 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Correlation of c-Met Expression and Outcome in Patients With Renal Cell Carcinoma Treated With Sunitinib

Peltola, K. J., Penttilä, P., Rautiola, J., Joensuu, H., Hänninen, E., Ristimäki, A. & Bono, P., aug 2017, I : Clinical Genitourinary Cancer. 15, 4, s. 487-494 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

EGFR gene copy number predicts response to anti-EGFR treatment in RAS wild type and RAS/BRAF/PIK3CA wild type metastatic colorectal cancer

Algars, A., Sundstrom, J., Lintunen, M., Jokilehto, T., Kytölä, S., Kaare, M., Vainionpää, R., Orpana, A., Österlund, P., Ristimäki, A., Carpen, O. & Ristamäki, R., 2017, I : International Journal of Cancer. 140, 4, s. 922-929 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Multiple components of PKA and TGF-beta pathways are mutated in pseudomyxoma peritonei

Saarinen, L., Nummela, P., Thiel, A., Lehtonen, R., Järvinen, P., Järvinen, H., Aaltonen, L. A., Lepisto, A., Hautaniemi, S. & Ristimaki, A., 20 apr 2017, I : PLoS One. 12, 4, 16 s., 0174898.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Oncological results of extended resection for locally advanced rectal cancer: the value of postirradiation MRI in predicting local recurrence

Rasanen, M., Ristimaki, A., Savolainen, R., Renkonen-Sinisalo, L. & Lepistö, A., apr 2017, I : Colorectal Disease. 19, 4, s. 339-348 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Recommendations for reporting tumor budding in colorectal cancer based on the International Tumor Budding Consensus Conference (ITBCC) 2016

Lugli, A., Kirsch, R., Ajioka, Y., Bosman, F., Cathomas, G., Dawson, H., El Zimaity, H., Flejou, J-F., Hansen, T. P., Hartmann, A., Kakar, S., Langner, C., Nagtegaal, I., Puppa, G., Riddell, R., Ristimaki, A., Sheahan, K., Smyrk, T., Sugihara, K., Terris, B. & 4 andra, Ueno, H., Vieth, M., Zlobec, I. & Quirke, P., sep 2017, I : Modern Pathology. 30, 9, s. 1299-1311 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
2016

A prospective randomised study of dense Infinity cytological brush versus regularly used brush in pancreaticobiliary malignancy

Kylänpää, M-L., Boyd, S., Ristimaki, A., Lindstrom, O., Udd, M. & Halttunen, J., 3 maj 2016, I : Scandinavian Journal of Gastroenterology. 51, 5, s. 590-593 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Association of Angiopoietin-2 and Ki-67 Expression with Vascular Density and Sunitinib Response in Metastatic Renal Cell Carcinoma

Rautiola, J., Lampinen, A., Mirtti, T., Ristimaki, A., Joensuu, H., Bono, P. & Saharinen, P., 21 apr 2016, I : PLoS One. 11, 4, 15 s., 0153745.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Chronic Activation of Innate Immunity Correlates With Poor Prognosis in Cancer Patients Treated With Oncolytic Adenovirus

Taipale, K., Liikanen, I., Juhila, J., Turkki, R., Tahtinen, S., Kankainen, M., Vassilev, L., Ristimaki, A., Koski, A., Kanerva, A., Diaconu, I., Cerullo, V., Vaha-Koskela, M., Oksanen, M., Linder, N., Joensuu, T., Lundin, J. & Hemminki, A., jan 2016, I : Molecular therapy. 24, 1, s. 175-183 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Desmoid tumor patients carry an elevated risk of familial adenomatous polyposis

Koskenvuo, L., Peltomaki, P., Renkonen-Sinisalo, L., Gylling, A., Nieminen, T. T., Ristimaki, A. & Lepisto, A., 1 feb 2016, I : Journal of Surgical Oncology. 113, 2, s. 209-212 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Diminished salivary epidermal growth factor secretion: a link between Sjogren's syndrome and autoimmune gastritis?

Koskenpato, K., Ainola, M., Przybyla, B., Kouri, V-P., Virkki, L., Koskenpato, J., Ristimaki, A. & Konttinen, Y. T., 3 mar 2016, I : Scandinavian Journal of Rheumatology. 45, 2, s. 118-121 4 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Expression of CEA, CA19-9, CA125, and EpCAM in pseudomyxoma peritonei

Nummela, P., Leinonen, H., Järvinen, P., Thiel, A., Järvinen, H., Lepisto, A. & Ristimaki, A., aug 2016, I : Human Pathology. 54, s. 47-54 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Gene expression analyses of primary melanomas reveal CTHRC1 as an important player in melanoma progression

Eriksson, J., Le Joncour, V., Nummela, P., Jahkola, T., Virolainen, S., Laakkonen, P., Saksela, O. & Hölttä, E., 22 mar 2016, I : Oncotarget. 7, 12, s. 15065-15092 28 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

HuR in pheochromocytomas and paragangliomas - overexpression in verified malignant tumors

Leijon, H., Salmenkivi, K., Heiskanen, I., Hagstrom, J., Louhimo, J., Heikkila, P., Ristimaki, A., Paavonen, T., Metso, S., Maenpaa, H., Haglund, C. & Arola, J., sep 2016, I : APMIS : Acta pathologica, microbiologica et immunologica Scandinavica. 124, 9, s. 757-763 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Levinneen paksusuolisyövän hoidon räätälöinti

Österlund, P., Isoniemi, H., Scheinin, T., Ristimäki, A. & Lantto, E., 2016, I : Duodecim. 132, 12, s. 1177-1184 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

Öppen tillgång
Fil

Mikä määrää peräsuolisyöpäpotilaan primaarihoidon?

Lepistö, A., Kouri, M., Savolainen, R. & Ristimäki, A., 2016, I : Duodecim. 132, 12, s. 1185-1193 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Öppen tillgång
Fil

Nrf2/Keap1 Pathway and Expression of Oxidative Stress Lesions 8-hydroxy-2 '-deoxyguanosine and Nitrotyrosine in Melanoma

Hintsala, H-R., Jokinen, E., Haapasaari, K-M., Moza, M., Ristimaki, A., Soini, Y., Koivunen, J. & Karihtala, P., apr 2016, I : Anticancer Research. 36, 4, s. 1497-1506 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Phase I study with ONCOS-102 for the treatment of solid tumors - an evaluation of clinical response and exploratory analyses of immune markers

Ranki, T., Pesonen, S., Hemminki, A., Partanen, K., Kairemo, K., Alanko, T., Lundin, J., Linder, N., Turkki, R., Ristimäki, A., Jaeger, E., Karbach, J., Wahle, C., Kankainen, M., Backman, C., von Euler, M., Haavisto, E., Hakonen, T., Heiskanen, R., Jaderberg, M. & 6 andra, Juhila, J., Priha, P., Suoranta, L., Vassilev, L., Vuolanto, A. & Joensuu, T., 15 mar 2016, I : Journal for Immunotherapy of Cancer. 4, 18 s., 17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Rapid faecal tests for detecting disease activity in colonic inflammatory bowel disease

Puolanne, A-M., Kolho, K-L., Alfthan, H., Ristimäki, A., Mustonen, H. & Färkkilä, M., okt 2016, I : European Journal of Clinical Investigation. 46, 10, s. 825-832 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2015

Combination of microsatellite instability and BRAF mutation status for subtyping colorectal cancer

Seppala, T. T., Bohm, J. P., Friman, M., Lahtinen, L., Vayrynen, V. M. J., Liipo, T. K. E., Ristimaki, A. P., Kairaluoma, M. V. J., Kellokumpu, I. H., Kuopio, T. H. I. & Mecklin, J-P., 9 jun 2015, I : British Journal of Cancer. 112, 12, s. 1966-1975 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

DNA hypermethylation appears early and shows increased frequency with dysplasia in Lynch syndrome-associated colorectal adenomas and carcinomas

Valo, S., Kaur, S., Ristimaki, A., Renkonen-Sinisalo, L., Järvinen, H., Mecklin, J-P., Nystrom, M. & Peltomäki, P. T., 22 jul 2015, I : Clinical epigenetics. 7, 13 s., 71.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Does Fecal Calprotectin Predict Short-Term Relapse After Stopping Tnfα-Blocking Agents In Inflammatory Bowel Disease Patients In Deep Remission?

Molander, P., Farkkila, M., Ristimaki, A., Salminen, K., Kemppainen, H., Blomster, T., Koskela, R., Jussila, A., Rautiainen, H., Nissinen, M., Haapamaki, J., Arkkila, P., Nieminen, U., Kuisma, J., Punkkinen, J., Kolho, K-L., Mustonen, H. & Sipponen, T., 1 jan 2015, I : Journal of Crohn's and Colitis. 9, 1, s. 33-40 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Exome sequencing reveals three novel candidate predisposition genes for diffuse gastric cancer

Donner, I., Kiviluoto, T., Ristimaki, A., Aaltonen, L. A. & Vahteristo, P., jun 2015, I : Familial Cancer. 14, 2, s. 241-246 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genomic profile of pseudomyxoma peritonei analyzed using next-generation sequencing and immunohistochemistry

Nummela, P., Saarinen, L., Thiel, A., Järvinen, P., Lehtonen, R., Lepisto, A., Järvinen, H., Aaltonen, L. A., Hautaniemi, S. & Ristimaki, A., 1 mar 2015, I : International Journal of Cancer. 136, 5, s. E282-E289 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Immunological data from cancer patients treated with Ad5/3-E2F-Delta 24-GMCSF suggests utility for tumor immunotherapy

Hemminki, O., Parviainen, S., Juhila, J., Turkki, R., Linder, N., Lundin, J., Kankainen, M., Ristimaki, A., Koski, A., Liikanen, I., Oksanen, M., Nettelbeck, D. M., Kairemo, K., Partanen, K., Joensuu, T., Kanerva, A. & Hemminki, A., 28 feb 2015, I : Oncotarget. 6, 6, s. 4467-4481 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Patologin rooli täsmähoitodiagnostiikassa

Ristimäki, A., 2015, I : Moodi.. 39, 6, s. 208-209 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

Prospective immunohistochemical analysis of BRAF V600E mutation in melanoma

Thiel, A., Moza, M., Kytola, S., Orpana, A., Jahkola, T., Hernberg, M., Virolainen, S. & Ristimaki, A., feb 2015, I : Human Pathology. 46, 2, s. 169-175 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Repeated intratumoral administration of ONCOS-102 leads to systemic antitumor CD8(+) T-cell response and robust cellular and transcriptional immune activation at tumor site in a patient with ovarian cancer

Vassilev, L., Ranki, T., Joensuu, T., Jaeger, E., Karbach, J., Wahle, C., Partanen, K., Kairemo, K., Alanko, T., Turkki, R., Linder, N., Lundin, J., Ristimaki, A., Kankainen, M., Hemminki, A., Backman, C., Dienel, K., von Euler, M., Haavisto, E., Hakonen, T. & 5 andra, Juhila, J., Jaderberg, M., Priha, P., Vuolanto, A. & Pesonen, S., 2015, I : OncoImmunology. 4, 7, 5 s., 1017702.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

T-cell Subsets in Peripheral Blood and Tumors of Patients Treated With Oncolytic Adenoviruses

Taipale, K., Liikanen, I., Juuso, J., Aila, K-K., Oksanen, M., Turkki, R., Linder, N., Lundin, J., Ristimäki, A., Kanerva, A., Koski, A., Joensuu, T., Vähä-Koskela, M. & Hemminki, A., maj 2015, I : Molecular therapy. 23, 5, s. 964-973 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Heterogeneous EGFR Gene Copy Number Increase Is Common in Colorectal Cancer and Defines Response to Anti-EGFR Therapy

Algars, A., Avoranta, T., Osterlund, P., Lintunen, M., Sundstrom, J., Jokilehto, T., Ristimaki, A., Ristamaki, R. & Carpen, O., 18 jun 2014, I : PLoS One. 9, 6, 9 s., 99590.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

High frequency of BRAF V600E mutations in ameloblastoma

Kurppa, K. J., Caton, J., Morgan, P. R., Ristimaki, A., Ruhin, B., Kellokoski, J., Elenius, K. & Heikinheimo, K., apr 2014, I : Journal of Pathology. 232, 5, s. 492-498 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Local treatment of a pleural mesothelioma tumor with ONCOS-102 induces a systemic antitumor CD8(+) T-cell response, prominent infiltration of CD8(+) lymphocytes and Th1 type polarization

Ranki, T., Joensuu, T., Jaeger, E., Karbach, J., Wahle, C., Kairemo, K., Alanko, T., Partanen, K., Turkki, R., Linder, N., Lundin, J., Ristimaki, A., Kankainen, M., Hemminki, A., Backman, C., Dienel, K., von Euler, M., Haavisto, E., Hakonen, T., Juhila, J. & 5 andra, Jaderberg, M., Priha, P., Vassilev, L., Vuolanto, A. & Pesonen, S., 2014, I : OncoImmunology. 3, 10, 4 s., 958937.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

VE1 immunohistochemistry accurately detects BRAF V600E mutations in colorectal carcinoma and can be utilized in the detection of poorly differentiated colorectal serrated adenocarcinoma

Sajanti, S., Sirnio, P., Vayrynen, J. P., Tuomisto, A., Klintrup, K., Makela, J., Ristimaki, A. & Makinen, M. J., jun 2014, I : Virchows Archiv. 464, 6, s. 637-643 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2013

BRAF mutation in sporadic colorectal cancer and Lynch syndrome

Thiel, A., Heinonen, M. M., Kantonen, J., Gylling, A., Lahtinen, L., Korhonen, M., Kytola, S., Mecklin, J-P., Orpana, A., Peltomäki, P. T. & Ristimäki, A., nov 2013, I : Virchows Archiv. 463, 5, s. 613-621 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Cause of Death During Long-Term Follow-up for Superficial Esophageal Adenocarcinoma

Kauppi, J., Gockel, I., Rantanen, T., Hansen, T., Ristimäki, A., Lang, H., Sihvo, E., Räsänen, J. V., Junginger, T. & Salo, J. A., jul 2013, I : Annals of Surgical Oncology. 20, 7, s. 2428-2433 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Chk1 Targeting Reactivates PP2A Tumor Suppressor Activity in Cancer Cells

Khanna, A., Kauko, O., Böckelman, C., Laine, A., Schreck, I., Partanen, J. I., Szwajda, A., Bormann, S., Bilgen, T., Helenius, M., Pokharel, Y. R., Pimanda, J., Russel, M. R., Haglund, C., Cole, K. A., Klefstrom, J., Aittokallio, T., Weiss, C., Ristimaki, A., Visakorpi, T. & 1 andra, Westermarck, J., 15 nov 2013, I : Cancer Research. 73, 22, s. 6757-6769 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review