Projekt per år
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
Personer
-
Jarno Alanko
- Avdelningen för datavetenskap - forskardoktor
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
Veli Mäkinen
- Avdelningen för datavetenskap - professor, Titeln docent
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Forskningsinstitutet för informationsteknologi
- Algorithmic Bioinformatics
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
Projekt
- 2 Slutfört
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekt: Forskningsprojekt
-
Algoritmeja ja tietorakenteita yksilöiden genomien tutkimukseen
01/08/2010 → 31/12/2012
Projekt: Forskningsprojekt
-
Accurate spliced alignment of long RNA sequencing reads
Sahlin, K. & Mäkinen, V., 15 dec 2021, I: Bioinformatics. 37, 24, s. 4643-4651 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Peer review
Öppen tillgångFil -
Algorithms and Complexity on Indexing Elastic Founder Graphs
Equi, M., Norri, T., Alanko, J., Cazaux, B., Tomescu, A. & Mäkinen, V., 30 nov 2021, 32nd International Symposium on Algorithms and Computation (ISAAC 2021). Ahn, H-K. & Sadakane, K. (red.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, 18 s. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); vol. 212).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Buffering updates enables efficient dynamic de Bruijn graphs
Alanko, J., Alipanahi, B., Settle, J., Boucher, C. & Gagie, T., 2021, I: Computational and Structural Biotechnology Journal. 19, s. 4067-4078 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Distributed hybrid-indexing of compressed pan-genomes for scalable and fast sequence alignment
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Mäkinen, V. & Heljanko, K., 3 aug 2021, I: PLoS One. 16, 8, 19 s., 0255260.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Peer review
Öppen tillgångFil -
Founder reconstruction enables scalable and seamless pangenomic analysis
Norri, T., Cazaux, B., Dönges, S., Valenzuela, D. & Mäkinen, V., 15 dec 2021, I: Bioinformatics. 37, 24, s. 4611-4619 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
Algorithms for Molecular Biology (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
jan 2022Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
BMC Bioinformatics (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
apr 2021Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Algorithms and Complexity on Indexing Founder Graphs
Veli Mäkinen (!!Speaker)
30 mar 2021Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
nov 2021 → …Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Bioinformatics (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
jan 2021Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
Priser
-
Google Scholarship for Students with Disabilities 2015
Kuosmanen, Anna (!!Recipient), 27 maj 2015
Pris: Pris och hedersbetygelser
-