Projekt per år
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
Personer
-
Jarno Alanko
- Avdelningen för datavetenskap - forskardoktor
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
Veli Mäkinen
- Avdelningen för datavetenskap - professor, Titeln docent
- Forskningsinstitutet för informationsteknologi
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Algorithmic Bioinformatics
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Computer Science - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Tuukka Norri
- ATG - Applied Tumor Genomics - forskardoktor
- Veli Mäkinen / Ansvarig forskare
- Algorithmic Bioinformatics
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
Projekt
- 2 Slutfört
-
Sekvenssianalyysin uudet menetelmät ja laajennukset
01/09/2017 → 31/08/2021
Projekt: Forskningsprojekt
-
Algoritmeja ja tietorakenteita yksilöiden genomien tutkimukseen
01/08/2010 → 31/12/2012
Projekt: Forskningsprojekt
-
Eulertigs: Minimum Plain Text Representation of k-mer Sets Without Repetitions in Linear Time
Schmidt, S. S. & Alanko, J., 2022, 22nd International Workshop on Algorithms in Bioinformatics (WABI 2022). Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 2:1-2:21 (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); vol. 242).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Indexable Elastic Founder Graphs of Minimum Height
Rizzo, N. & Mäkinen, V., juni 2022, 33rd Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (CPM 2022). Bannai, H. & Holub, J. (red.). Dagstuhl, Germany: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 19:1–19:19 19 s. (Leibniz International Proceedings in Informatics (LIPIcs); nr. 223).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Linear Time Construction of Indexable Elastic Founder Graphs
Rizzo, N. & Mäkinen, V., 2022, IWOCA 2022: Combinatorial Algorithms. Bazgan, C. & Fernau, H. (red.). Cham: Springer, s. 480-493 14 s. (Lecture Notes in Computer Science; vol. 13270).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Linear-time Minimization of Wheeler DFAs
Alanko, J., Cotumaccio, N. & Prezza, N., 2022, DCC 2022: 2022 DATA COMPRESSION CONFERENCE (DCC). Bilgin, A., Marcellin, MW., Serra-Sagrista, J. & Storer, JA. (red.). IEEE, s. 53-62 10 s. (IEEE Data Compression Conference).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Syotti: scalable bait design for DNA enrichment
Alanko, J. N., Slizovskiy, I. B., Lokshtanov, D., Gagie, T., Noyes, N. R. & Boucher, C., 24 juni 2022, I: Bioinformatics. 38, SUPPL 1, s. 177-184 8 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
ACM-SIAM Symposium on Discrete Algorithms (SODA 2023) (Evenemang)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
aug. 2022Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Algorithms for Molecular Biology (Tidskrift)
Veli Mäkinen (Referentgranskare)
jan. 2022Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Alignments on pangenome representations
Veli Mäkinen (!!Speaker)
4 juli 2022 → 7 juli 2022Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
ISMB 2022
Veli Mäkinen (Medlem av vetenskaplig kommitté)
feb. 2022Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
External examiner for PhD thesis
Veli Mäkinen (Förhandsgranskare)
jan. 2022Aktivitet: Examinationstyper › Förhandsgranskare av doktorsavhandling
Priser
-
Google Scholarship for Students with Disabilities 2015
Kuosmanen, Anna (!!Recipient), 27 maj 2015
Pris: Pris och hedersbetygelser
-