Integrative Evolutionary Biology

Publikationer

Forskningsresultat per år 2009 2015 2019 2020 2021 2022 2023 2024 2025

• 35 Artikel
• 9 Översiktsartikel
• 2 Kapitel
• 2 Ledare

Forskningsresultat per år

Forskningsresultat per år

Sökresultat

• 2025

  Reproductive Barriers and Genomic Hotspots of Adaptation During Allopatric Species Divergence

  Deshmukh, R., Baral, S., Kuwalekar, M., Kizhakke, A. G. & Kunte, K., mars 2025, (!!E-pub ahead of print) I: Molecular Ecology. 15 s., e17703.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång
• 2024

  Demography and environment modulate the effects of genetic diversity on extinction risk in a butterfly metapopulation

  DiLeo, M. F., Nair, A., Kardos, M., Husby, A. & Saastamoinen, M., 13 aug. 2024, I: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 121, 33, 12 s., e2309455121.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Ecological drivers of ultraviolet colour evolution in snakes

  Crowell, H. L., Curlis, J. D., Weller, H. I. & Davis Rabosky, A. R., dec. 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 5213.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• recolorize: An R package for flexible colour segmentation of biological images

  Weller, H. I., Hiller, A. E., Lord, N. P. & Van Belleghem, S. M., feb. 2024, I: Ecology Letters. 27, 2, 14 s., e14378.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The rostral micro-tooth morphology of blue marlin, Makaira nigricans

  Pacher, K., Breuker, M., Hansen, M. J., Kurvers, R. H. J. M., Häge, J., Dhellemmes, F., Domenici, P., Steffensen, J. F., Krause, S., Hildebrandt, T., Fritsch, G., Bach, P., Sabarros, P. S., Zaslansky, P., Mahlow, K., Müller, J., Armas, R. G., Ortiz, H. V., Galván-Magaña, F. & Krause, J., mars 2024, I: Journal of Fish Biology. 104, 3, s. 713-722 10 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Turtle Girdles: Comparing the Relationships Between Environment and Behavior on Forelimb Function in Loggerhead Sea Turtles (Caretta caretta) and River Cooters (Pseudemys concinna)

  Mayerl, C. J., Capano, J. G., Mme, N. V. M., Weller, H. I., Kaczmarek, E. B., Chadam, M., Blob, R. W., Brainerd, E. L. & Wyneken, J., dec. 2024, I: Journal of Morphology. 285, 12, 12 s., e70007.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2023

  Analysis of population structure and genetic diversity in low-variance Saimaa ringed seals using low-coverage whole-genome sequence data

  Olkkonen, E. & Löytynoja, A., 15 dec. 2023, I: STAR protocols. 4, 4, 37 s., 102567.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Building and Managing a Tropical Fish Facility: A Do-It-Yourself Guide

  Kratochwil, C. F., Kuwalekar, M., Häge, J. & Karagic, N., 1 sep. 2023, I: arXiv.org . 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig

  Öppen tillgång

  Fil

• East African cichlid fishes

  Santos, M. E., Lopes, J. F. & Kratochwil, C., 5 jan. 2023, I: EvoDevo. 14, 21 s., 1.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Genome editing in East African cichlids and tilapias: state-of-the-art and future directions

  Clark, B., Kuwalekar, M., Fischer, B., Woltering, J., Biran, J., Juntti, S., Kratochwil, C. F., Santos, M. E. & Almeida, M. V., 29 nov. 2023, I: Open biology. 13, 11, 18 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• How genomics can help biodiversity conservation

  Theissinger, K., Fernandes, C., Formenti, G., Bista, I., Berg, P. R., Bleidorn, C., Bombarely, A., Crottini, A., Gallo, G. R., Godoy, J. A., Jentoft, S., Malukiewicz, J., Mouton, A., Oomen, R. A., Paez, S., Palsbøll, P. J., Pampoulie, C., Ruiz-López, M. J., Secomandi, S. & Svardal, H. & 12 andra, Theofanopoulou, C., de Vries, J., Waldvogel, A.-M., Zhang, G., Jarvis, E. D., Bálint, M., Kratochwil, C., Primmer, C., Ciofi, C., Waterhouse, R. M., Mazzoni, C. J. & Höglund, J., juli 2023, I: Trends in Genetics. 39, 7, s. 545-559 15 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Mechanisms Underlying the Formation and Evolution of Vertebrate Color Patterns: Annual Review of Genetics

  Kratochwil, C. F. & Mallarino, R., nov. 2023, I: Annual Review of Genetics. 57, 1, s. 135-156 22 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Toward a universal measure of robustness across model organs and systems

  Jernvall, J., Di-Poï, N., Mikkola, M. L. & Kratochwil, C. F., 25 nov. 2023, I: Evolution & Development. 25, 6, s. 410-417 8 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2022

  An intronic transposon insertion associates with a trans-species color polymorphism in Midas cichlid fishes

  Kratochwil, C., Kautt, A. F., Nater, A., Härer, A., Liang, Y., Henning, F. & Meyer, A., 13 jan. 2022, I: Nature Communications. 13, 1, 8 s., 296.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Comparative ontogenetic and transcriptomic analyses shed light on color pattern divergence in cichlid fishes

  Kratochwil, C. F., Liang, Y., Gerwin, J., Franchini, P. & Meyer, A., sep. 2022, I: Evolution and Development. 24, 5, s. 158-170 13 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The era of reference genomes in conservation genomics

  European Reference Genome Atlas (ERGA) Consortium, Formenti, G., Kratochwil, C. F. & Primmer, C. R., mars 2022, I: Trends in Ecology & Evolution. 37, 3, s. 197-202 6 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The repeated evolution of stripe patterns is correlated with body morphology in the adaptive radiations of East African cichlid fishes

  Urban, S., Gerwin, J., Hulsey, C. D., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., feb. 2022, I: Ecology and Evolution. 12, 2, 11 s., e8568.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2021

  Afrikkalaisten kirjoahventen värityksen evoluutio

  Kratochwil, C., dec. 2021, I: Ciklidisti : Suomen kirjoahvenharrastajien jäsenlehti. 3, s. 18-19 2 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Allmänheten

  Öppen tillgång

  Fil

• Different Sources of Allelic Variation Drove Repeated Color Pattern Divergence in Cichlid Fishes

  Urban, S., Nater, A., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., feb. 2021, I: Molecular Biology and Evolution. 38, 2, s. 465-477 13 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Functional conservation and divergence of color-pattern-related agouti family genes in teleost fishes

  Liang, Y., Grauvogl, M., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., juli 2021, I: Journal of Experimental Zoology. Part B: Molecular and Developmental Evolution. 336, 5, s. 443-450 8 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Of bars and stripes: A Malawi cichlid hybrid cross provides insights into genetic modularity and evolution of modifier loci underlying colour pattern diversification

  Gerwin, J., Urban, S., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., okt. 2021, I: Molecular Ecology. 30, 19, s. 4789-4803 15 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil
• 2020

  Contrasting signatures of genomic divergence during sympatric speciation

  Kautt, A. F., Kratochwil, C. F., Nater, A., Machado-Schiaffino, G., Olave, M., Henning, F., Torres-Dowdall, J., Härer, A., Hulsey, C. D., Franchini, P., Pippel, M., Myers, E. W. & Meyer, A., 3 dec. 2020, I: Nature. 588, 7836, s. 106-111 34 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Developmental and Cellular Basis of Vertical Bar Color Patterns in the East African Cichlid Fish Haplochromis latifasciatus

  Liang, Y., Gerwin, J., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., 11 feb. 2020, I: Frontiers in Cell and Developmental Biology. 8, 15 s., 62.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Hierarchically embedded interaction networks represent a missing link in the study of behavioral and community ecology

  Montiglio, P. O., Gotanda, K. M., Kratochwil, C. F., Laskowski, K. L. & Farine, D. R., mars 2020, I: Behavioral Ecology. 31, 2, s. 279-286 8 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Neural innervation as a potential trigger of morphological color change and sexual dimorphism in cichlid fish

  Liang, Y., Meyer, A. & Kratochwil, C. F., 23 juli 2020, I: Scientific Reports. 10, 1, 16 s., 12329.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Postmitotic Hoxa5 Expression Specifies Pontine Neuron Positional Identity and Input Connectivity of Cortical Afferent Subsets

  Maheshwari, U., Kraus, D., Vilain, N., Holwerda, S. J. B., Cankovic, V., Maiorano, N. A., Kohler, H., Satoh, D., Sigrist, M., Arber, S., Kratochwil, C. F., Di Meglio, T., Ducret, S. & Rijli, F. M., 16 juni 2020, I: Cell Reports. 31, 11, 25 s., 107767.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• The Cre/Lox System to Assess the Development of the Mouse Brain

  Kratochwil, C. F. & Rijli, F. M., 2020, Brain Development: Methods and Protocols. Sprecher, S. (red.). New York, NY: Humana press, s. 491-512 22 s. (Methods in Molecular Biology; vol. 2047).

  Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig
• 2019

  Evolutionary Dynamics of Structural Variation at a Key Locus for Color Pattern Diversification in Cichlid Fishes

  Kratochwil, C. F., Liang, Y., Urban, S., Torres-Dowdall, J. & Meyer, A., dec. 2019, I: Genome Biology and Evolution. 11, 12, s. 3452-3465 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

  Öppen tillgång

  Fil

• Fragile DNA contributes to repeated evolution

  Kratochwil, C. F. & Meyer, A., 21 feb. 2019, I: Genome Biology. 20, 4 s., 39.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Ledare › Vetenskaplig

  Öppen tillgång

  Fil

• Genome of the Malawi golden cichlid fish (Melanochromis auratus) reveals exon loss of oca2 in an amelanistic morph

  Kratochwil, C. F., Urban, S. & Meyer, A., sep. 2019, I: Pigment Cell & Melanoma Research. 32, 5, s. 719-723 5 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Molecular mechanisms of convergent color pattern evolution

  Kratochwil, C. F., juni 2019, I: Zoology. 134, s. 66-68 3 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel
• 2018

  Agouti-related peptide 2 facilitates convergent evolution of stripe patterns across cichlid fish radiations

  Kratochwil, C. F., Liang, Y., Gerwin, J., Woltering, J. M., Urban, S., Henning, F., Machado-Schiaffino, G., Hulsey, C. D. & Meyer, A., 26 okt. 2018, I: Science. 362, 6413, s. 457-+ 4 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Early developmental and allometric patterns in the electric yellow cichlid Labidochromis caeruleus

  Saemi-Komsari, M., Mousavi-Sabet, H., Kratochwil, C. F., Sattari, M., Eagderi, S. & Meyer, A., juni 2018, I: Journal of Fish Biology. 92, 6, s. 1888-1901 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Mimicry in butterflies: co-option and a bag of magnificent developmental genetic tricks

  Deshmukh, R., Baral, S., Gandhimathi, A., Kuwalekar, M. & Kunte, K., 1 jan. 2018, I: Wiley Interdisciplinary Reviews: Developmental Biology. 7, 1, e291.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review
• 2017

  A mutant with bilateral whisker to barrel inputs unveils somatosensory mapping rules in the cerebral cortex

  Renier, N., Dominici, C., Erzurumlu, R. S., Kratochwil, C. F., Rijli, F. M., Gaspar, P. & Chedotal, A., 28 mars 2017, I: eLife. 6, 19 s., 23494.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• The Long Journey of Pontine Nuclei Neurons: From Rhombic Lip to Cortico-Ponto-Cerebellar Circuitry

  Kratochwil, C. F., Maheshwari, U. & Rijli, F. M., 17 maj 2017, I: Frontiers in neural circuits. 11, 19 s., 33.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

• Tol2 transposon-mediated transgenesis in the Midas cichlid (Amphilophus citrinellus) - towards understanding gene function and regulatory evolution in an ecological model system for rapid phenotypic diversification

  Kratochwil, C. F., Sefton, M. M., Liang, Y. & Meyer, A., 23 nov. 2017, I: BMC Developmental Biology. 17, 11 s., 15.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2015

  Closing the genotype-phenotype gap: Emerging technologies for evolutionary genetics in ecological model vertebrate systems

  Kratochwil, C. F. & Meyer, A., feb. 2015, I: BioEssays. 37, 2, s. 213-226 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Översiktsartikel › Peer review

• Embryonic and larval development in the Midas cichlid fish species flock (Amphilophus spp.): a new evo-devo model for the investigation of adaptive novelties and species differences

  Kratochwil, C. F., Sefton, M. M. & Meyer, A., 26 feb. 2015, I: BMC Developmental Biology. 15, 15 s., 12.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Evolution: Tinkering within Gene Regulatory Landscapes

  Kratochwil, C. F. & Meyer, A., 30 mars 2015, I: Current Biology. 25, 7, s. R285-R288 5 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Ledare › Vetenskaplig

• Hoxa2 Selects Barrelette Neuron Identity and Connectivity in the Mouse Somatosensory Brainstem

  Bechara, A., Laumonnerie, C., Vilain, N., Kratochwil, C. F., Cankovic, V., Maiorano, N. A., Kirschmann, M. A., Ducret, S. & Rijli, F. M., 27 okt. 2015, I: Cell Reports. 13, 4, s. 783-797 15 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Mapping active promoters by ChIP-seq profiling of H3K4me3 in cichlid fish - a first step to uncover cis-regulatory elements in ecological model teleosts

  Kratochwil, C. F. & Meyer, A., juli 2015, I: Molecular Ecology Resources. 15, 4, s. 761-771 11 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Molecular Evolution of the Neural Crest Regulatory Network in Ray-Finned Fish

  Kratochwil, C. F., Geissler, L., Irisarri, I. & Meyer, A., nov. 2015, I: Genome Biology and Evolution. 7, 11, s. 3033-3046 14 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2014

  The Cre/Lox System to Assess the Development of the Mouse Brain

  Kratochwil, C. F. & Rijli, F. M., 2014, Brain Development: Methods and Protocols: Methods in Molecular Biology. Sprecher, S. (red.). Totowa, NJ: Humana press, Vol. 1082. s. 295-313 19 s.

  Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig

• 2013

  Ezh2 Orchestrates Topographic Migration and Connectivity of Mouse Precerebellar Neurons

  Di Meglio, T., Kratochwil, C. F., Vilain, N., Loche, A., Vitobello, A., Yonehara, K., Hrycaj, S. M., Roska, B., Peters, A. H. F. M., Eichmann, A., Wellik, D., Ducret, S. & Rijli, F. M., 11 jan. 2013, I: Science. 339, 6116, s. 204-207 4 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

• Mouse Hoxa2 mutations provide a model for microtia and auricle duplication

  Minoux, M., Kratochwil, C. F., Ducret, S., Amin, S., Kitazawa, T., Kurihara, H., Bobola, N., Vilain, N. & Rijli, F. M., 1 nov. 2013, I: Development. 140, 21, s. 4386-4397 12 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2010

  Genetic Dissection of Dopaminergic and Noradrenergic Contributions to Catecholaminergic Tracts in Early Larval Zebrafish

  Kastenhuber, E., Kratochwil, C. F., Ryu, S., Schweitzer, J. & Driever, W., 15 feb. 2010, I: Journal of Comparative Neurology. 518, 4, s. 439-458 20 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
• 2009

  Aberrant differentiation of glutamatergic cells in neocortex of mouse model for fragile X syndrome

  Tervonen, T. A., Louhivuori, V., Sun, X., Hokkanen, M.-E., Kratochwil, C. F., Zebryk, P., Castren, E. & Castren, M., 2009, I: Neurobiology of Disease. 33, 2, s. 250-259 10 s.

  Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review