Organisationsprofil

Organisationsprofil

Our work aims to understand the structure, assembly and function of biological macromolecule complexes. We embed unstained, unfixed specimens in vitreous ice to preserve their structures. Transmission cryo-electron microscopy is then used to visualize the specimens, but the images recorded are difficult to interpret because they are projections of the specimen degraded by noise. Thus we computationally combine images of the specimen viewed from different angles enabling us to reconstruct a three-dimensional model. Any inherent symmetry present in the structure is also used in this averaging. This method is particularly useful for objects that are too large, unstable or variable to be studied by X-ray crystallography or NMR, such as enveloped viruses.

Vetenskapsgrenar

  • 118 Biovetenskaper

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Utrustning

Instruct-HiLIFE CryoEM core facility

Sarah Butcher (Chef), Ausra Domanska (Operatör), Pasi Laurinmäki (Operatör) & Benita Löflund (Operatör)

Institutet för bioteknik

Utrustning/facilitet: Central servicefacilitet

Projekt

Genetic susceptibility for severe influenza infections

Anastasina, M.

01/01/201231/12/2014

Projekt: Forskningsprojekt

Publikationer

Extracellular vesicles provide a capsid-free vector for oncolytic adenoviral DNA delivery

Saari, H., Turunen, T., Lohmus, A., Turunen, M., Jalasvuori, M., Butcher, S. J., Yla-Herttuala, S., Viitala, T., Cerullo, V., Siljander, P. R. M. & Yliperttula, M., 1 jan 2020, I : Journal of Extracellular Vesicles. 9, 1, 24 s., 1747206.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Membrane-containing icosahedral DNA bacteriophages

Tuma, R., Butcher, S. & Oksanen, H. M., 2020, (!!Accepted/In press) Encyclopedia of Virology, 4th edition. Zuckerman, M. & Bamford, DH. (red.). Elsevier

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingBidrag till uppslagsverk/ordbokVetenskapligPeer review

Tracking self-citations in academic publishing

Kacem, A., Flatt, J. W. & Mayr, P., maj 2020, I : Scientometrics. 123, 2, s. 1157–1165 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

A 2.8-Angstrom-Resolution Cryo-Electron Microscopy Structure of Human Parechovirus 3 in Complex with Fab from a Neutralizing Antibody

Domanska, A., Flatt, J. W., Jukonen, J., Geraets, J. & Butcher, S. J., feb 2019, I : Journal of Virology. 93, 4, 12 s., e01597-18.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Adenovirus Entry: From Infection to Immunity

Greber, U. F. & Flatt, J. W., 2019, ANNUAL REVIEW OF VIROLOGY, VOL 6, 2019. Enquist, L., DiMaio, D. & Demody, T. (red.). Annual Reviews, Vol. 6. s. 177-197 21 s. (Annual Review of Virology; vol. 6).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Aktiviteter

Workshop on cryo-electron microscopy

Benita Löflund (New classification)

4 mar 20198 mar 2019

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

Impact consortium kick-off meeting & cryo-EM course

Lauri Pulkkinen (Närvarande)

14 sep 201921 sep 2019

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

MicroBeta instrument demo

Sergei Gurianov (Närvarande)

3 jan 2019

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

ScanVir2019 conference

Ausra Domanska (Talare: Presentation)

3 jun 20195 jun 2019

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

1st MIBS retreat 2019

Sergei Gurianov (Närvarande)

23 maj 2019

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

Priser

Alfred Kordelin Prize

Butcher, Sarah (!!Recipient), 2017

Pris: Pris och hedersbetygelser

FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG)

Manole, Violeta (!!Recipient), 8 sep 2009

Pris: Pris och hedersbetygelser

Helsingin Yliopiston HEBIOT-koulutusohjelma 800 euroa

Lotta Happonen (!!Recipient), 14 feb 2007

Pris: Pris och hedersbetygelser

Helsingin Yliopiston Juhlarahaston matka-apuraha 2500 euroa

Lotta Happonen (!!Recipient), 26 mar 2009

Pris: Pris och hedersbetygelser

Maikki Friberg award 2013

Butcher, Sarah (!!Recipient), 5 jun 2013

Pris: Pris och hedersbetygelser