Projekt per år
Organisationsprofil
Our work aims to understand the structure, assembly and function of biological macromolecule complexes. We embed unstained, unfixed specimens in vitreous ice to preserve their structures. Transmission cryo-electron microscopy is then used to visualize the specimens, but the images recorded are difficult to interpret because they are projections of the specimen degraded by noise. Thus we computationally combine images of the specimen viewed from different angles enabling us to reconstruct a three-dimensional model. Any inherent symmetry present in the structure is also used in this averaging. This method is particularly useful for objects that are too large, unstable or variable to be studied by X-ray crystallography or NMR, such as enveloped viruses.
Vetenskapsgrenar
- 118 Biovetenskaper
Internationellt och inhemskt samarbete
Personer
-
Maria Anastasina
- Forskningsprogrammet för molekylära och integrativa biovetenskaper - gästforskare
- Institutet för bioteknik
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: gästforskare, HU
-
Sarah Butcher
- Forskningsprogrammet för molekylära och integrativa biovetenskaper - professor
- Institutet för bioteknik
- Macromolecular structure and function
- Doctoral Programme in Integrative Life Science - Handledare för doktorandprogram
- Doctoral Programme in Microbiology and Biotechnology - Handledare för doktorandprogram
Person: HU, U4 Undervisnings- och forskningspersonal
-
Ausra Domanska
- Forskningsprogrammet för molekylära och integrativa biovetenskaper - gästforskare
- Macromolecular structure and function
Person: gästforskare, HU
-
Sergei Gurianov
- Forskningsprogrammet för molekylära och integrativa biovetenskaper - forskardoktor
- Macromolecular structure and function
Person: U2 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
Utrustning
-
Instruct-ERIC Centre Finland
Sarah Butcher (Chef), Hanna M Oksanen (Annat), Minna Poranen (Annat), Katri Eskelin (Annat), Perttu Permi (Annat), Markku Varjosalo (Annat), Lari Lehtiö (Annat) & Juha Rouvinen (Annat)
Bio- och miljövetenskapliga fakultetenUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Instruct-HiLIFE CryoEM core facility
Sarah Butcher (Chef), Ausra Domanska (Operatör), Pasi Laurinmäki (Operatör) & Behnam Lak (Operatör)
Institutet för bioteknikUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Structural Biology Finland (FINStruct)
Sarah Butcher (Chef), Hanna M Oksanen (Annat), Minna Poranen (Annat), Katri Eskelin (Annat), Tommi Kajander (Annat), Perttu Permi (Annat), Lari Lehtiö (Annat), Juha Rouvinen (Annat), Tiina A Salminen (Annat) & Anastassios Papageorgiou (Annat)
Bio- och miljövetenskapliga fakultetenUtrustning/facilitet: Central servicefacilitet
-
Integrated Structural Biology Infrastructure-European Research Infrastructure Consortium (Instruct-ERIC) / Consortium FINStruct and Instruct-ERIC
Butcher, S., Poranen, M., Varjosalo, M., Kajander, T., Oksanen, H. M., Eskelin , K., Lehtiö, L., Salminen, T. A. & Papageorgiou, A. C.
01/01/2022 → 31/12/2026
Projekt: Finlands Akademi: Forskningsinfrastruktur
-
Instruct-HiLIFE: Integrated structural cell biology research infrastructure platform, HiLIFE, University of Helsinki
Poranen, M., Butcher, S., Iwai, H., Kajander, T., Oksanen, H. M. & Eskelin , K.
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekt: Annan projekt
-
Structural Biology Finland (FINStruct) & Instruct-ERIC Centre FI / Research Infrastructure Roadmap 2021-2024
Butcher, S., Poranen, M., Kajander, T., Iwai, H., Varjosalo, M., Lehtiö, L., Rouvinen, J., Salminen, T. A., Papageorgiou, A. C., Oksanen, H. M. & Eskelin , K.
01/01/2021 → 31/12/2024
Projekt: Finlands Akademi: Forskningsinfrastruktur
-
Integrated Structural Biology Infrastructure / Consortium: Instruct-Suomi
Butcher, S., Kajander, T., Lehtiö, L., Määttä, J. A. E., Papageorgiou, A., Rouvinen, J., Salminen, T., Iwai, H., Poranen, M., Eskelin , K. & Oksanen, H. M.
01/01/2020 → 31/12/2022
Projekt: Annan projekt
-
Genetic susceptibility for severe influenza infections
01/01/2012 → 31/12/2014
Projekt: Forskningsprojekt
-
Simultaneous membrane and RNA binding by Tick-Borne Encephalitis Virus capsid protein
Pulkkinen, L. I. A., Barrass, S. V., Lindgren, M. K., Pace, H., Overby, A. K., Anastasina, M., Bally, M., Lundmark, R. M. & Butcher, S. J. M., feb. 2023, I: PLoS Pathogens. 19, 2, 24 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Structural basis for different membrane-binding properties of E. coli anaerobic and human mitochondrial β-oxidation trifunctional enzymes
Sah-Teli, S. K., Pinkas, M., Hynönen, M. J., Butcher, S. J., Wierenga, R. K., Novacek, J. & Venkatesan, R., 6 juli 2023, I: Structure. 31, 7, s. 812-+ 21 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Molecular Organisation of Tick-Borne Encephalitis Virus
Pulkkinen, L. I. A., Barrass, S., Domanska, A., Overby, A. K., Anastasina, M. & Butcher, S. J., apr. 2022, I: Viruses (Basel). 14, 4, 17 s., 792.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
SARS-CoV-2 Production, Purification Methods and UV Inactivation for Proteomics and Structural Studies
Plavec, Z., Domanska, A., Liu, X., Laine, P., Paulin, L., Varjosalo, M., Auvinen, P., Wolf, S. G., Anastasina, M. & Butcher, S. J., sep. 2022, I: Viruses-Basel. 14, 9, 12 s., 1989.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Structural Studies Reveal that Endosomal Cations Promote Formation of Infectious Coxsackievirus A9 A-Particles, Facilitating RNA and VP4 Release
Domanska, A., Plavec, Z., Ruokolainen, V., Löflund, B., Marjomaki, V. & Butcher, S., 21 dec. 2022, I: Journal of Virology. 96, 4, 20 s., e0136722.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
Instruct-ERIC course on macromolecular X-ray, electron, and neutron crystallography 2023
Sergei Gurianov (Närvarande)
29 maj 2023 → 2 juni 2023Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Pathogens (Tidskrift)
Ausra Domanska (Referentgranskare)
18 jan. 2023Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Catarina Paiva
Hanna M Oksanen (Värd), Sarah Butcher (Värd), Minna Poranen (Värd) & Katri Eskelin (Värd)
aug. 2022 → nov. 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
ERKKO consortium meeting Konevesi, 2022
Ausra Domanska (Talare: Presentation), Sarah Butcher (Talare: Ordförande), Zlatka Plavec (Talare: Presentation) & Valtteri Juho Aleksanteri Leppilampi (Talare: Presentation)
15 juni 2022 → 16 juni 2022Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Ana Catarina Paiva
Ausra Domanska (Värd) & Sarah Butcher (Värd)
15 aug. 2022 → 11 nov. 2022Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
Priser
-
-
FEMS Young Scientist Meeting Grant (YSMG)
Manole, Violeta (!!Recipient), 8 sep. 2009
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Helsingin Yliopiston HEBIOT-koulutusohjelma 800 euroa
Happonen, Lotta (!!Recipient), 14 feb. 2007
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Helsingin Yliopiston Juhlarahaston matka-apuraha 2500 euroa
Happonen, Lotta (!!Recipient), 26 mars 2009
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Tidningsurklipp
-
Hong Kong pro-democracy lawmakers to resign as Beijing moves to quash opposition
11/11/2020
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Structure of SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA polymerase published
15/04/2020
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
-UNIVERSITY OF HELSINKI: A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
Sarah Butcher & Hanna M Oksanen
24/02/2020
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
A new research infrastructure, Instruct Centre Finland, part of Instruct-ERIC, opens to scientists
Sarah Butcher & Hanna M Oksanen
21/02/2020
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media
-
Scientists make major breakthrough that could pave the way for cure to common cold
18/12/2019
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media