• PL 66 (Agnes Sjöbergin katu 2), 3027

    HELSINGIN YLIOPISTO

    Finland

Publikationer 2015 2019

2019

Biofilm formation, virulence and antimicrobial resistance of different Campylobacter jejuni isolates from a poultry slaughterhouse

García Sánchez, L., Melero, B., Jaime, I., Rossi, M., Ortega, I. & Rovira, J., okt 2019, I : Food Microbiology. 83, s. 193-199 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genetics behind the Biosynthesis of Nonulosonic Acid-Containing Lipooligosaccharides in Campylobacter coli

Kolehmainen, A., Rossi, M., Stupak, J., Li, J., Gilbert, M. & Wakarchuk, W., apr 2019, I : Journal of Bacteriology. 201, 8, 11 s., 00759-18.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Longitudinal Study of Shiga Toxin-Producing Escherichia coli and Campylobacter jejuni on Finnish Dairy Farms and in Raw Milk

Jaakkonen, A., Castro, H., Hallanvuo, S., Ranta, J., Rossi, M., Isidro, J., Lindström, M. & Hakkinen, M., apr 2019, I : Applied and Environmental Microbiology. 85, 7, 17 s., e02910-18.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Macroevolution of gastric Helicobacter species unveils interspecies admixture and time of divergence (vol 12, pg 2518, 2018)

Smet, A., Yahara, K., Rossi, M., Tay, A., Backert, S., Ensser, A., Fox, J. G., Flahou, B., Ducatelle, R., Haesebrouck, F. & Corander, J., jul 2019, I : ISME Journal. 13, 7, s. 1890-1890 1 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Population genetics and characterization of Campylobacter jejuni isolates from western jackdaws and game birds in Finland

Kovanen, S., Rossi, M., Pohja-Mykrä, M., Nieminen, T., Raunio-Saarnisto, M., Sauvala, M., Fredriksson-Ahomaa, M., Hänninen, M-L. & Kivistö, R. I., feb 2019, I : Applied and Environmental Microbiology. 85, 4, 16 s., UNSP e02365-18.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2018

A primer on microbial bioinformatics for nonbioinformaticians

Carrico, J. A., Rossi, M., Moran-Gilad, J., Van Domselaar, G. & Ramirez, M., apr 2018, I : Clinical Microbiology and Infection. 24, 4, s. 342-349 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Chapter 4. Water security in changing world

Levengood, J. M., Hörman, A., Hänninen, M-L. & O'Brien, K., 9 mar 2018, Beond one health: from recognition to results. Herrmann, J. A. & Johnson-Walker, Y. J. (red.). New York: John Wiley & Sons Ltd. , s. 91-115 25 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

chewBBACA: A complete suite for gene-by-gene schema creation and strain identification

Silva, M., Machado, M. P., Silva, D. N., Rossi, M., Moran-Gilad, J., Santos, S., Ramirez, M. & Carrico, J. A., mar 2018, I : Microbial Genomics. 4, 3, 7 s., 000166.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Evidence for a primate origin of zoonotic Helicobacter suis colonizing domesticated pigs

Flahou, B., Rossi, M., Bakker, J., Langermans, J. A. M., Heuvelman, E., Solnick, J. V., Martin, M. E., O'Rourke, J., Le Duc Ngoan, Xuan Hoa, N., Nakamura, M., Overby, A., Matsui, H., Ota, H., Matsumoto, T., Foss, D. L., Kopta, L. A., Omotosho, O., Franciosini, M. P., Proietti, P. C. & 13 andra, Guo, A., Liu, H., Borilova, G., Bracarense, A. P., Linden, S. K., De Bruyckere, S., Zhang, G., De Witte, C., Smet, A., Pasmans, F., Ducatelle, R., Corander, J. & Haesebrouck, F., jan 2018, I : ISME Journal. 12, 1, s. 77-86 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Genome-wide identification of geographical segregated genetic markers in Salmonella enterica serovar Typhimurium variant 4,[5],12:i:-

Palma, F., Manfreda, G., Silva, M., Parisi, A., Barker, D. O. R., Taboada, E. N., Pasquali, F. & Rossi, M., 15 okt 2018, I : Scientific Reports. 8, 12 s., 15251.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

INNUENDO: A cross-sectoral platform for the integration of genomics in the surveillance of food-borne pathogens

Llarena, A-K., Ribeiro-Gonçalves, B. F., Nuno Silva, D., Halkilahti, J., Machado, M. P., Da Silva, M. S., Jaakkonen, A., Isidro, J., Hämäläinen, C., Joenperä, J., Borges, V., Viera, L., Gomes, J. P., Correia, C., Lunden, J., Laukkanen-Ninios, R., Fredriksson-Ahomaa, M., Bikandi, J., Millan, R. S., Martinez-Ballesteros, I. & 11 andra, Laorden, L., Mäesaar, M., Grantina-Ievina, L., Hilbert, F., Garaizar, J., Oleastro, M., Nevas, M., Salmenlinna, S., Hakkinen, M., Carriço, J. A. & Rossi, M., 26 nov 2018, I : EFSA Supporting Publications. 15, 11, s. 1498E 142 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

In silico proteomic and phylogenetic analysis of the outer membrane protein repertoire of gastric Helicobacter species

Bauwens, E., Joosten, M., Taganna, J., Rossi, M., Debraekeleer, A., Tay, A., Peters, F., Backert, S., Fox, J., Ducatelle, R., Remaut, H., Haesebrouck, F. & Smet, A., 18 okt 2018, I : Scientific Reports. 8, 14 s., 15453.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Macroevolution of gastric Helicobacter species unveils interspecies admixture and time of divergence

Smet, A., Yahara, K., Rossi, M., Tay, A., Backert, S., Armin, E., Fox, J. G., Flahou, B., Ducatelle, R., Haesebrouck, F. & Corander, J., 25 jun 2018, I : ISME Journal. 12, 10, s. 2518-2531 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Origin, evolution, and distribution of the molecular machinery for biosynthesis of sialylated lipooligosaccharide structures in Campylobacter coli

Culebro, A., Machado, M. P., Carrico, J. A. & Rossi, M., 14 feb 2018, I : Scientific Reports. 8, 9 s., 3028.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2017

A survey for selected avian viral pathogens in backyard chicken farms in Finland

Pohjola, L., Tammiranta, N., Ek-Kommonen, C., Soveri, T., Hänninen, M-L., Ahomaa, M. F. & Huovilainen, A., 2017, I : Avian Pathology. 46, 2, s. 166-172 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Backyard poultry flocks in Finland: an infection risk to commercial poultry or humans?

Pohjola, L. K., 7 apr 2017, Helsinki: University of Helsinki. 152 s.

Forskningsoutput: AvhandlingDoktorsavhandling

Öppen tillgång

Campylobacter jejuni survival in a poultry processing plant environment

Garcia-Sanchez, L., Melero, B., Jaime, I., Hanninen, M-L., Rossi, M. & Rovira, J., aug 2017, I : Food Microbiology. 65, s. 185-192 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Complete genome sequence of the Campylobacter cuniculorum type strain LMG 24588

Miller, W. G., Yee, E., Revez, J., Bono, J. L. & Rossi, M., 2017, I : Genome Announcements. 5, 24, 2 s., e00543-17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Complete genome sequence of the hippuricase-positive Campylobacter avium Type 5 LMG 24591

Miller, W. G., Chapman, M. H., Yee, E., Revez, J., Bono, J. L. & Rossi, M., 2017, I : Genome Announcements. 5, 43, 2 s., e01221-17.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Helicobacter pylori

Arauro Boira, R. & Hänninen, M-L., 2017, Global Water Pathogens Project. http://www.waterpathogens.org: Part 3 Specific excreted pathogens: environmental and epidemiology aspects http://www.waterpathogens.org/book/campylobacter. Pruden, A., Asbolt, N. & Miller, J. (red.). Michigan State University, E. Lansing, MI, UNESCO, 17 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelProfessionell

Öppen tillgång
Fil

Members of the family Campylobacteraceae: Campylobacter jejuni, Campylobacter coli.

Pitkänen, T. & Hänninen, M-L., 2017, Global Water Pathogens Project. http://www.waterpathogens.org: Part 3 Specific excreted pathogens: environmental and epidemiology aspects http://www.waterpathogens.org/book/campylobacter. Pruden, A., Asbolt, N. & Miller, J. (red.). Michigan State University, E. Lansing, MI, UNESCO, 39 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelProfessionell

Öppen tillgång
Fil

Molecular Epidemiology of Campylobacter jejuni in the Genomic Era

Kovanen, S. M., 22 sep 2017, Helsinki: University of Helsinki. 147 s.

Forskningsoutput: AvhandlingDoktorsavhandling

Öppen tillgång

Taudinaiheuttajia kaupunkinaakoissa

Nieminen, T. T., Pohja-Mykrä, M. K., Raunio-Saarnisto, M. & Hänninen, M-L., 2017, I : Suomen eläinlääkärilehti. 2017, 1, s. 36-38

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

Öppen tillgång
Fil

The Helicobacter cinaedi antigen CAIP participates in atherosclerotic inflammation by promoting the differentiation of macrophages in foam cells

D'Elios, M. M., Vallese, F., Capitani, N., Benagiano, M., Bernardini, M. L., Rossi, M., Rossi, G. P., Ferrari, M., Baldari, C. T., Zanotti, G., de Bernard, M. & Codolo, G., 11 jan 2017, I : Scientific Reports. 7, 14 s., 40515.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Whole-Genome Sequencing in Epidemiology of Campylobacter jejuni Infections

Llarena, A-K., Taboada, E. & Rossi, M., maj 2017, I : Journal of Clinical Microbiology. 55, 5, s. 1269-1275 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
2016

Bacterial quality and safety of packaged fresh leafy vegetables at the retail level in Finland

Nousiainen, L. -L., Joutsen, S., Lunden, J., Hänninen, M. -L. & Fredriksson-Ahomaa, M., 2 sep 2016, I : International Journal of Food Microbiology. 232, s. 73-79 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Campylobacteriosis: the role of poultry meat

Skarp, C. P. A., Hanninen, M-L. & Rautelin, H. I., feb 2016, I : Clinical Microbiology and Infection. 22, 2, s. 103-109 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Chondroitinase AC: a host-associated genetic feature of Helicobacter bizzozeronii

Namburi, R. B., Berteau, O., Spillmann, D. & Rossi, M., 2016, I : Veterinary Microbiology. 186, s. 21-27 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Divergence between the highly virulent zoonotic pathogen Helicobacter heilmannii and its closest relative, the low-virulence “Helicobacter ailurogastricus” sp. nov.

Joosten, M., Lindén, S., Rossi, M., Chin Yen Tay, A., Skoog, E., Padra, M., Peters, F., Perkins, T., Vandamme, P., Van Nieuwerburgh, F., D'Herde, K., Van den Broeck, W., Flahou, B., Deforce, D., Ducatelle, R., Marshall, B., Haesebrouck, F. & Smet, A., jan 2016, I : Infection and Immunity. 84, 1, s. 293-306 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Functional genomics in Campylobacter coli identified a novel streptomycin resistance gene located in a hypervariable genomic region

Olkkola, S., Culebro Escandon y Perez, A., Juntunen, P., Hänninen, M-L. & Rossi, M., jul 2016, I : Microbiology. 162, s. 1157-1166 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Large Sequence Diversity within the Biosynthesis Locus and Common Biochemical Features of Campylobacter coli Lipooligosaccharides

Culebro, A., Revez, J., Pascoe, B., Friedmann, Y., Hitchings, M. D., Stupak, J., Sheppard, S. K., Li, J. & Rossi, M., okt 2016, I : Journal of Bacteriology. 198, 20, s. 2829-2840 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Monomorphic genotypes within a generalist lineage of Campylobacter jejuni show signs of global dispersion

Llarena, A-K., Zhang, J., Vehkala, M., Välimäki, N., Hakkinen, M., Hänninen, M-L., Roasto, M., Mäesaar, M., Taboada, E., Barker, D., Garofolo, G., Cammà, C., Di Giannatale, E., Corander, J. & Rossi, M., 1 okt 2016, I : Microbial Genomics. 2, 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

One Health : ihmisten, eläinten ja ympäristön yhteinen terveys

Sukura, A. & Hänninen, M-L., 2016, I : Duodecim. 132, 13-14, s. 1223-1229 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Taudinaiheuttajien esiintyminen kaupunkinaakoissa

Nieminen, T. T., Kovanen, S. M., Pohja-Mykrä, M. K., Raunio-Saarnisto, M., Kivistö, R. I. & Hänninen, M-L., 2016, I : Ympäristö ja terveys. 47, 2, s. 46-50 5 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

The Helicobacter heilmannii hofE and hofF Genes are Essential for Colonization of the Gastric Mucosa and Play a Role in IL-1-Induced Gastric MUC13 Expression

Cheng, L., Rossi, M., Sara, L., Medea, P., Caroline, B., Eva, B., Myrthe, J., Bram, F., Wim, V. D. B., Richard, D., Freddy, H. & Annemieke, S., dec 2016, I : Helicobacter (Oxford). 21, 6, s. 504-522 19 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Tracing isolates from domestic human Campylobacter jejuni infections to chicken slaughter batches and swimming water using whole-genome multilocus sequence typing

Kovanen, S., Kivisto, R., Llarena, A-K., Zhang, J., Karkkainen, U-M., Tuuminen, T., Uksila, J., Hakkinen, M., Rossi, M. & Hanninen, M-L., 2 jun 2016, I : International Journal of Food Microbiology. 226, s. 53-60 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Zoonotic Public Health Hazards in Backyard Chickens

Pohjola, L., Nykäsenoja, S., Kivistö, R., Soveri, T., Huovilainen, A., Hänninen, M. L. & Fredriksson-Ahomaa, M., aug 2016, I : Zoonoses and Public Health. 63, 5, s. 420-430 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2015

Antimicrobial resistance and Campylobacter jejuni and C. coli

Rossi, M., Olkkola, S., Roasto, M., Kivistö, R. & Hänninen, M-L., 2015, Antimicrobial Resistance and Food Safety: Methods and Techniques. Chen, C-Y., Yan, X. & Jackson, C. R. (red.). London, UK: Elsevier Academic Press, s. 55-75 21 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Refinement of Whole-Genome Multilocus Sequence Typing Analysis by Addressing Gene Paralogy

Zhang, J., Halkilahti, J., Hänninen, M-L. & Rossi, M., maj 2015, I : Journal of Clinical Microbiology. 53, 5, s. 1765-1767 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review