Organisationsprofil

Organisationsprofil

Our research is focused on molecular biology and functional genomics  of non-pathogenic   (dairy starters, probiotic lactobacilli, propionibacteria) and pathogenic bacteria (streptococci, staphylococci) that are adapted to food-environment.

We exploit gene and omics-level approaches combined with microbiological and biochemical analyses to study cell-physiology in beneficial and pathogenic bacteria in diverse food systems and materials. The ultimate goal of these research projects is to provide novel information to gain maximal benefit of beneficial bacteria as well as to combat pathogens in foods.

Vetenskapsgrenar

  • 412 Djursvetenskap, mjölkproduktlära
  • 413 Veterinärvetenskap
  • 118 Biovetenskaper
  • 416 Livsmedelsvetenskap

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Projekt

Publikationer

Chloroquine fumardiamides as novel quorum sensing inhibitors

Beus, M., Savijoki, K., Patel, J., Yli-Kauhaluoma, J., Fallarero, A. & Zorc, B., 15 aug 2020, I : Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 30, 16, 8 s., 127336.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Complete Genome Sequences and Methylome Analyses of Cutibacterium acnes subsp. acnes Strains DSM 16379 and DSM 1897T

Deptula, P., Laine, P., Auvinen, P., Paulin, L., Roberts, R. J., Johnston, C. D. & Varmanen, P., 16 jul 2020, I : Microbiology Resource Announcements. 9, 29, 3 s., e00705-20.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
Öppen tillgång
Fil

Skin microbiome in cutaneous T cell lymphoma by 16S and whole genome shotgun sequencing

Salava, A., Deptula, P., Lyyski, A., Laine, P., Paulin, L., Väkevä, L., Ranki, A., Auvinen, P. & Lauerma, A., 28 apr 2020, I : Journal of Investigative Dermatology.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Aktiviteter

Journal of Microbiological Methods (Tidskrift)

Kirsi Savijoki (Referentgranskare)

2019 → …

Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbeteReferentgranskning av manuskript

Review of PhD-thesis

Pekka Varmanen (Förhandsgranskare)

2018

Aktivitet: ExaminationstyperMedlem i doktorsavhandlingskommitté

PhD thesis supervision, DVM Katja Hautala

Kirsi Savijoki (Bihandledare)

1 aug 2018 → …

Aktivitet: ExaminationstyperHandledare eller bihandledare av doktorsavhandling

12th International Symposium on Lactic Acid Bacteria

Kirsi Savijoki (Poster presentation)

27 aug 201731 aug 2017

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

Review of a research project -proposals

Pekka Varmanen (Deltagare)

2017

Aktivitet: Andra aktivitetstyperAnnan