Publikationer 2001 2019

2019

A Novel Interaction Network Used by Potyviruses in Virus-Host Interactions at the Protein Level

Ala-Poikela, M., Rajamäki, M. & Valkonen, J., 2019, I : Viruses. 11, 1158, 24 s., 1158.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Phenotyping viral infection in sweetpotato using a high-throughput chlorophyll fluorescence and thermal imaging platform

Wang, L., Poque, S. & Valkonen, J. P. T., 22 okt 2019, I : Plant Methods. 15, 1, 14 s., 116.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Small-RNA analysis of pre-basic mother plants and conserved accessions of plant genetic resources for the presence of viruses

Rajamäki, M-L., Lemmetty, A., Laamanen, J., Roininen, E., Vishwakarma, A., Streng, J., Latvala, S. & Valkonen, J. P. T., 7 aug 2019, I : PLoS One. 14, 8, 21 s., 0220621.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Sunagoke Moss (Racomitrium japonicum) Used for Greening Roofs Is Severely Damaged by Sclerotium delphinii and Protected by a Putative Bacillus amyloliquefaciens Isolate

Tamura, M., Tanabe, M., Valkonen, J. P. T. & Akita, M., 28 feb 2019, I : Frontiers in Microbiology. 10, 10 s., 372.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2018

Editorial: Cooperative Adaptation and Evolution in Plant-Microbe Systems

Matveeva, T., Provorov, N. & Valkonen, J. P. T., 14 aug 2018, I : Frontiers in plant science. 9, 2 s., 1090.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragLedareVetenskaplig

Öppen tillgång
Fil

Molecular detection and characterisation of black raspberry necrosis virus and raspberry bushy dwarf virus isolates in wild raspberries

Susi, H., Rajamäki, M. L., Artola, K., Jayaraj-Mallika, F. R. & Valkonen, J. P. T., sep 2018, I : Annals of Applied Biology. 173, 2, s. 97-111 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Phytotoxin produced by the netted scab pathogen, Streptomyces turgidiscabies strain 65, isolated in Sweden

Natsume, M., Nagagata, A., Aittamaa, M., Okaniwa, N., Somervuo, P., Fiedler, H-P., Kreuze, J. F., Rokka, V-M., Bang, H., Kawaide, H. & Valkonen, J. P. T., mar 2018, I : Journal of General Plant Pathology. 84, 2, s. 108-117 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Sensitivity of Small RNA-Based Detection of Plant Viruses

Santala, J. & Valkonen, J. P. T., 14 maj 2018, I : Frontiers in Microbiology. 9, 7 s., 939.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Sienten biologia

Timonen, S. S. (red.) & Valkonen, J. P. T. (red.), 2018, 2. uudistettu red. Helsinki: Gaudeamus. 454 s.

Forskningsoutput: Bok/rapportBok

Species-specific synergistic effects of two plant growth-Promoting microbes on green roof plant biomass and photosynthetic efficiency

Xie, L., Lehvävirta, S., Timonen, S., Kasurinen, J., Niemikapee, J. & Valkonen, J. P. T., 31 dec 2018, I : PLoS One. 13, 12, 16 s., 0209432.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2017

A Framework for the Evaluation of Biosecurity, Commercial, Regulatory, and Scientific Impacts of Plant Viruses and Viroids Identified by NGS Technologies

Massart, S., Candresse, T., Gil, J., Lacomme, C., Predajna, L., Ravnikar, M., Reynard, J-S., Rumbou, A., Saldarelli, P., Skoric, D., Vainio, E. J., Valkonen, J. P. T., Vanderschuren, H., Varveri, C. & Wetzel, T., 24 jan 2017, I : Frontiers in Microbiology. 8, 7 s., 45.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Differential Requirement of the Ribosomal Protein S6 and Ribosomal Protein S6 Kinase for Plant-Virus Accumulation and Interaction of S6 Kinase with Potyviral VPg

Rajamaki, M-L., Xi, D., Sikorskaite-Gudziuniene, S., Valkonen, J. P. T. & Whitham, S. A., maj 2017, I : Molecular Plant - Microbe Interactions. 30, 5, s. 374-384 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Graphical genotyping as a method to map Ny ((o,n)sto) and Gpa5 using a reference panel of tetraploid potato cultivars

van Eck, H. J., Vos, P. G., Valkonen, J. P. T., Uitdewilligen, J. G. A. M. L., Lensing, H., de Vetten, N. & Visser, R. G. F., mar 2017, I : Theoretical and Applied Genetics. 130, 3, s. 515-528 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Pathogenic seedborne viruses are rare but Phaseolus vulgaris endornaviruses are common in bean varieties grown in Nicaragua and Tanzania

Nordenstedt, N., Marcenaro, D., Chilagane, D., Mwaipopo, B., Rajamaki, M-L., Nchimbi-Msolla, S., Njau, P. J. R., Mbanzibwa, D. R. & Valkonen, J. P. T., 25 maj 2017, I : PLoS One. 12, 5, 18 s., 0178242.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Repeated Applications of a Nonpathogenic Streptomyces Strain Enhance Development of Suppressiveness to Potato Common Scab

Hiltunen, L. H., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., jan 2017, I : Plant Disease. 101, 1, s. 224-232 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Resistance to potato virus Y in potato

Valkonen, J. P. T., Gebhardt, C., Zimnoch-Guzowska, E. & Watanabe, K., 2017, Potato virus Y: biodiversity, pathogenicity, epidemiology and management. Lacomme, C., Glais, L., Bellstedt, D. U., Dupuis, B., Karasev, A. V. & Jacquot, E. (red.). Cham: Springer, s. 207-241 34 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Strigolactone biosynthesis is evolutionarily conserved, regulated by phosphate starvation and contributes to resistance against phytopathogenic fungi in a moss, Physcomitrella patens

Decker, E. L., Alder, A., Hunn, S., Ferguson, J., Lehtonen, M. T., Scheler, B., Kerres, K. L., Wiedemann, G., Safavi-Rizi, V., Nordzieke, S., Balakrishna, A., Baz, L., Avalos, J., Valkonen, J. P. T., Reski, R. & Al-Babili, S., okt 2017, I : New Phytologist. 216, 2, s. 455-468 14 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Utilization of engineered resistance to viruses in crops of the developing world, with emphasis on sub-Saharan Africa

Kreuze, J. F. & Valkonen, J. PT., 2017, I : Current opinion in virology. 26, s. 90 - 97 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2016

A novel sweet potato potyvirus open reading frame (ORF) is expressed via polymerase slippage and suppresses RNA silencing

Untiveros, M., Olspert, A., Artola, K., Firth, A. E., Kreuze, J. F. & Valkonen, J. P. T., sep 2016, I : Molecular Plant Pathology. 17, 7, s. 1111-1123 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Dissecting Abscisic Acid Signaling Pathways Involved in Cuticle Formation

Cui, F., Brosche, M., Lehtonen, M. T., Amiryousefi, A., Xu, E., Punkkinen, M., Valkonen, J. P. T., Fujii, H. & Overmyer, K., 6 jun 2016, I : Molecular Plant. 9, 6, s. 926-938 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Evaluation of a diagnostic microarray for the detection of major bacterial pathogens of potato from tuber samples

Degefu, Y., Somervuo, P. J., Aittamaa, M., Virtanen, E. & Valkonen, J. P. T., 8 mar 2016, I : EPPO Bulletin. 46, 1, s. 103-111 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Occurrence and genetic diversity of Raspberry leaf blotch virus (RLBV) infecting cultivated and wild Rubus species in Finland

Dong, L., Lemmetty, A., Latvala, S., Samuilova, O. & Valkonen, J. P. T., jan 2016, I : Annals of Applied Biology. 168, 1, s. 122-132 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Seedborne Pathogenic Fungi in Common Bean (Phaseolus vulgaris cv. INTA Rojo) in Nicaragua

Marcenaro, D. & Valkonen, J. P. T., 2016, I : PLoS One. 11, 12, 18 s., 0168662.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

The adoption of cv. Igorota in the Philippines and Vietnam

Chien, D. H., Ganga, Z. N., Simongo, D. K., Kiswa, C. G., Gonzales, I. C., Perez, J., Tung, P. X., Hau, N. T., Artola, K., Valkonen, J. P. T., Li, C. & VanderZaag, P., 2016, I : American Journal of Potato Research. 93, 3, s. 296-301 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Transmission of the viruses commonly detected in sweetpotatoes and wild species of Convolvulaceae in East Africa: many gaps to fill.

Tugume, A. K., Mukasa, S. B. & Valkonen, J. P. T., 2016, Vector-Mediated Transmission of Plant Pathogens. Brown, J. K. (red.). St. Paul, Minnesota: American Phytopathological Society, s. 447-452 6 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Viral RNase3 Co-Localizes and Interacts with the Antiviral Defense Protein SGS3 in Plant Cells

Weinheimer, I., Haikonen, T., Ala-Poikela, M., Moser, M., Streng, J., Rajamaki, M-L. & Valkonen, J. P. T., 8 jul 2016, I : PLoS One. 11, 7, 16 s., 0159080.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2015

Biologisesta torjunnasta apua ruvenhallintaan

Hiltunen, L., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., 2015, I : Tuottava peruna. 42, 2, s. 4-6 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

Comparative Analysis of Prokaryotic Communities Associated with Organic and Conventional Farming Systems

Pershina, E., Valkonen, J. P. T., Kurki, P., Ivanova, E., Chirak, E., Korvigo, I., Provorov, N. & Andronov, E., 18 dec 2015, I : PLoS One. 10, 12, 16 s., 0145072.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Control of downy mildew (Peronospora sparsa) in arctic bramble (Rubus arcticus ssp arcticus)

Kostamo, K., Toljamo, A., Palonen, P., Valkonen, J. P. T., Karenlampi, S. O. & Kokko, H., 2015, I : Annals of Applied Biology. 167, 1, s. 90-101 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Diagnosis and discovery of fungal viruses using deep sequencing of small RNAs

Vainio, E. J., Jurvansuu, J., Streng, J., Rajamaki, M-L., Hantula, J. & Valkonen, J. P. T., 2015, I : Journal of General Virology. 96, s. 714-725 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Disease management, especially viruses in potato and sweetpotato

Valkonen, J. P. T., Kreuze, J. & Ndunguru, J., 2015, Potato and sweetpotato in Africa: Transforming the value chains for food and nutrition security. Low, J., M. N., Quinn, S. & Parker, M. (red.). Wallingford: CABI, s. 339-349 11 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Diversity and evolution of potato mop-top virus

Beuch, U., Berlin, S., Akerblom, J., Nicolaisen, M., Nielsen, S. L., Crosslin, J. M., Hamm, P. B., Santala, J., Valkonen, J. P. T. & Kvarnheden, A., 2015, I : Archives of Virology. 160, 5, s. 1345-1351 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Elucidation of virus-host interactions to enhance resistance breeding for control of virus diseases in potato

Valkonen, J. P. T., 2015, I : Breeding Science. 65, 1, s. 69-76 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragÖversiktsartikelVetenskapligPeer review

Suppression of RNAi by dsRNA-Degrading RNaseIII Enzymes of Viruses in Animals and Plants

Weinheimer, I., Jiu, Y., Rajamäki, M., Matilainen, O., Kallijärvi, J., Cuellar, W., Lu, R., Saarma, M., Holmberg, C. I., Jäntti, J. & Valkonen, J., 6 mar 2015, I : PLoS Pathogens. 11, 3, 25 s., e1004711.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2014

Analysis of Potato virus Y Coat Protein Epitopes Recognized by Three Commercial Monoclonal Antibodies

Tian, Y-P., Hepojoki, J., Ranki, H., Lankinen, H. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : PLoS One. 9, 12, 20 s., 0115766.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Binding and processing of small dsRNA molecules by the class 1 RNase III protein encoded by sweet potato chlorotic stunt virus

Weinheimer, I., Boonrod, K., Moser, M., Wassenegger, M., Krczal, G., Butcher, S. J. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : Journal of General Virology. 95, s. 486-495 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Comparison of Straw Mulch, Insecticides, Mineral Oil, and Birch Extract for Control of Transmission of Potato virus Y in Seed Potato Crops

Kirchner, S. M., Hiltunen, L. H., Santala, J., Doering, T. F., Ketola, J., Kankaala, A., Virtanen, E. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : Potato Research. 57, 1, s. 59-75 17 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Composite potato plants with transgenic roots on non-transgenic shoots: a model system for studying gene silencing in roots

Horn, P., Santala, J., Nielsen, S. L., Huehns, M., Broer, I. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : Plant Cell Reports. 33, 12, s. 1977-1992 16 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

First Report of Streptomyces europaeiscabiei Causing Common Scab on Potato in Finland.

Hiltunen, L. H., Kelloniemi, J. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : Plant disease. 98, 9, s. 1267-1268 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

fPoxDB: fungal peroxidase database for comparative genomics

Choi, J., Detry, N., Kim, K-T., Asiegbu, F. O., Valkonen, J. P. T. & Lee, Y-H., 8 maj 2014, I : BMC Microbiology. 14, 8 s., 117.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Functional diversification of duplicated chalcone synthase genes in anthocyanin biosynthesis of Gerbera hybrida

Deng, X., Bashandy, H., Ainasoja, M., Kontturi, J., Pietiäinen, M., Laitinen, R. A. E., Albert, V. A., Valkonen, J., Elomaa, P. & Teeri, T., 2014, I : New Phytologist. 201, 4, s. 1469-1483 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Global gene expression in the common scab pathogen, Streptomyces scabies, exposed to potato microtubers

Dees, M. W., Lysoe, E., Brurberg, M. B., Somervuo, P., Almvik, M. & Valkonen, J. P. T., 2014, I : Annals of Applied Biology. 165, 1, s. 43-52 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Infection Cycle of Artichoke Italian Latent Virus in Tobacco Plants: Meristem Invasion and Recovery from Disease Symptoms

Santovito, E., Mascia, T., Siddiqui, S. A., Minutillo, S. A., Valkonen, J. P. T. & Gallitelli, D., 9 jun 2014, I : PLoS One. 9, 6, 15 s., 99446.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Kasvivirologian väitöksiä

Rastas, M. & Valkonen, J., 2014, I : Kasvinsuojelulehti. 47, 3, s. 86-88 3 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

Overview of the PMTV situation in Scandinavia

Valkonen, J., 2014, Proceedings Crop Protection in Northern Britain 2014. Dundee, Scotland, s. 201-202 3 s.

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKonferensbidragVetenskaplig

Physcomitrella patens Has Kinase-LRR R Gene Homologs and Interacting Proteins

Tanigaki, Y., Ito, K., Obuchi, Y., Kosaka, A., Yamato, K. T., Okanami, M., Lehtonen, M. T., Valkonen, J. P. T. & Akita, M., 18 apr 2014, I : PLoS One. 9, 4, 10 s., 95118.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Protein Secretome of Moss Plants (Physcomitrella patens) with Emphasis on Changes Induced by a Fungal Elicitor

Lehtonen, M. T., Takikawa, Y., Rönnholm, G., Akita, M., Kalkkinen, N., Ahola-Iivarinen, E., Somervuo, P., Varjosalo, M. & Valkonen, J. P. T., feb 2014, I : Journal of Proteome Research. 13, 2, s. 447-459 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Secret lifestyles of Neurospora crassa

Kuo, H-C., Sun, H., Choi, J., Asiegbu, F. O., Valkonen, J. P. T. & Lee, Y-H., 30 maj 2014, I : Scientific Reports. 4, 6 s., 5135.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil