Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
Personer
-
Juha Kärkkäinen
- Avdelningen för datavetenskap - universitetslektor
- Forskningsinstitutet för informationsteknologi
- Algorithmic Bioinformatics
- Juha Kärkkäinen / Ansvarig forskare
- Bioinformatics
- Doctoral Programme in Computer Science - Handledare för doktorandprogram
Person: U3 Undervisnings- och forskningspersonal, HU
-
String inference from longest-common-prefix array
Kärkkäinen, J., Piątkowski, M. & Puglisi, S. J., 9 jan. 2023, I: Theoretical Computer Science. 942, s. 180-199 20 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Block trees
Belazzougui, D., Caceres, M., Gagie, T., Gawrychowski, P., Kaerkkaeinen, J., Navarro, G., Ordonez, A., Puglisi, S. J. & Tabei, Y., maj 2021, I: Journal of Computer and System Sciences. 117, s. 1-22 22 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Constructing the bijective and the extended burrows-wheeler transform in linear time
Bannai, H., Kärkkäinen, J., Köppl, D. & Piatkowski, M., 1 juli 2021, 32nd Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching, CPM 2021. Gawrychowski, P. & Starikovskaya, T. (red.). Schloss Dagstuhl- Leibniz-Zentrum fur Informatik GmbH, Dagstuhl Publishing, 7. (Leibniz International Proceedings in Informatics, LIPIcs; vol. 191).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Tight Upper and Lower Bounds on Suffix Tree Breadth
Badkobeh, G., Gawrychowski, P., Kärkkäinen, J., Puglisi, S. & Zhukova, B., 16 jan. 2021, I: Theoretical Computer Science. 854, s. 63-67 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Linear-time String Indexing and Analysis in Small Space
Belazzougui, D., Cunial, F., Karkkainen, J. & Makinen, V., mars 2020, I: ACM Transactions on Algorithms. 16, 2, 54 s., 17.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (Evenemang)
Kärkkäinen, J. (Referentgranskare)
2017Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Redaktör för forskningsantologi/samlingsverk/konferenspublikation
-
Danny Dubé
Kärkkäinen, J. (Värd)
12 juli 2017 → 24 juli 2017Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
International Workshop on Combinatorial Algorithms
Kärkkäinen, J. (Närvarande)
17 aug. 2016 → 19 aug. 2016Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Marcin Piatkowski
Kärkkäinen, J. (Värd)
6 nov. 2016 → 26 nov. 2016Aktivitet: Typer för att vara värd för en besökare › Akademiskt besök på HU
-
1st Summer School on Bioinformatics Algorithms
Kärkkäinen, J. (Talare: Inledningsanförande (keynote))
12 aug. 2016Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
Fil
Priser
-
Award: Junior researcher of year 2014 (Department of Computer Science)
Kempa, D. (!!Recipient), 2014
Pris: Pris och hedersbetygelser
-
Award: Outstanding doctoral dissertation award 2016
Kempa, D. (!!Recipient), 2016
Pris: Pris och hedersbetygelser