• PL 56 (Viikinkaari 5)

    00014

    Finland

20012019
Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Personlig profil

Meritförteckning

My background is in biology and I did my M.Sc. thesis on population genetics. During my Ph.D. I moved to computational analysis and continued on sequence analysis and methods development during my stay at the EMBL-European Bioinformatics Institute.

My research interests are in evolutionary sequence analysis, both the development of advanced analysis methods and their application to biological questions of special importance. Current topics include phylogenetic sequence alignment and homology inference for evolutionary analyses, and the development of methods for comparative analysis of high-throughput sequencing data. Many of these methods are provided for the users through the Wasabi graphical interface available at http://wasabiapp.org.

Utbildning information

Ph.D. in Molecular Biology, Université libre de Bruxelles, Belgium (2003)
M.Sc. in Biology, University of Oulu, Finland (1999)

Externa befattningar

staff member, post-doctoral researcher, EMBL-European Bioinformatics Institute

15 aug 200331 jul 2011

Vetenskapsgrenar

  • 1181 Ekologi, evolutionsbiologi
  • 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi
  • 1184 Genetik, utvecklingsbiologi, fysiologi

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Publikationer 2001 2019

Mechanistic insights into the evolution of DUF26-containing proteins in land plants

Vaattovaara, A., Brandt, B., Rajaraman, S., Safronov, O., Veidenberg, A., Luklová, M., Kangasjärvi, J., Löytynoja, A., Hothorn, M., Salojärvi, J. & Wrzaczek, M., 8 feb 2019, I : Communications Biology. 2, 18 s., 56.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Bracketing phenogenotypic limits of mammalian hybridization

Savriama, Y., Valtonen, M., Kammonen, J. I., Rastas, P., Smolander, O-P., Lyyski, A., Häkkinen, T. J., Corfe, I. J., Gerber, S., Salazar-Ciudad, I., Paulin, L., Holm, L., Löytynoja, A., Auvinen, P. & Jernvall, J., 28 nov 2018, I : Royal Society Open Science. 5, 11, 12 s., 180903.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Short template switch events explain mutation clusters in the human genome

Löytynoja, A. & Goldman, N., jun 2017, I : Genome Research. 27, 6, s. 1039-1049 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

A recurrent copy number variation of the NEB triplicate region: only revealed by the targeted nemaline myopathy CGH array

Kiiski, K., Lehtokari, V-L., Loytynoja, A., Ahlsten, L., Laitila, J., Wallgren-Pettersson, C. & Pelin, K., apr 2016, I : European Journal of Human Genetics. 24, 4, s. 574-580 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Aktiviteter 2012 2018

  • 9 Medlem i doktorsavhandlingskommitté
  • 7 Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
  • 3 Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
  • 2 Handledning av annat kunskapsprov (pro gradu, licentiatavhandling)

Supervision of MSc thesis

Ari Löytynoja (Handledare)
5 okt 201815 apr 2019

Aktivitet: ExaminationstyperHandledning av annat kunskapsprov (pro gradu, licentiatavhandling)

PhD examining committee member

Ari Löytynoja (Handledare)
9 nov 2018

Aktivitet: ExaminationstyperMedlem i doktorsavhandlingskommitté

PhD follow-up group member

Ari Löytynoja (Handledare)
1 jan 201731 dec 2020

Aktivitet: ExaminationstyperMedlem i doktorsavhandlingskommitté

Co-supervisor of Mikko Kivikoski's doctoral thesis

Ari Löytynoja (Handledare)
dec 2017 → …

Aktivitet: ExaminationstyperHandledare eller bihandledare av doktorsavhandling

PhD follow-up group member

Ari Löytynoja (Handledare)
1 jan 201731 dec 2020

Aktivitet: ExaminationstyperMedlem i doktorsavhandlingskommitté