Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
- 39 resultat
Sökresultat
-
2025
A multiplex single-cell RNA-Seq pharmacotranscriptomics pipeline for drug discovery
Dini, A., Barker, H., Piki, E., Sharma, S., Raivola, J., Murumägi, A. & Ungureanu, D., mars 2025, I: Nature Chemical Biology. 21, 3, s. 432–442 21 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2024
Molecular and functional profiling of primary normal ovarian cells defines insights into cancer development and drug responses
Piki, E., Dini, A., Rantanen, F., Bentz, F., Paavolainen, L., Barker, H., Raivola, J., Hirasawa, A., Kallioniemi, O., Murumägi, A. & Ungureanu, D., 19 dec. 2024, I: Molecular Therapy Oncology. 32, 4, 15 s., 200903.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2023
Comparison of two supporting matrices for patient-derived cancer cells in 3D drug sensitivity and resistance testing assay (3D-DSRT)
Feoforoff, M., Mikkonen, P., Turunen, L., Hassinen, A., Paasonen, L., Paavolainen, L., Potdar, S., Murumagi, A., Kallioniemi, O. & Pietiainen, V., juni 2023, I: SLAS discovery . 28, 4, s. 138-148 11 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Drug response profiles in patient-derived cancer cells across histological subtypes of ovarian cancer: real-time therapy tailoring for a patient with low-grade serous carcinoma
Murumägi, A., Ungureanu, D., Khan, S., Arjama, M., Välimäki, K., Ianevski, A., Ianevski, P., Bergstrom, R., Dini, A., Kanerva, A., Koivisto-Korander, R., Tapper, J., Lassus, H., Loukovaara, M., Mägi, A., Hirasawa, A., Aoki, D., Pietiäinen, V., Pellinen, T. & Butzow, R. & 2 andra, , 16 feb. 2023, I: British Journal of Cancer. 128, 4, s. 678–690 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Novel therapeutic approaches for pleural mesothelioma identified by functional ex vivo drug sensitivity testing
Ollila-Raj, H., Murumägi, A., Pellinen, T., Arjama, M., Sutinen, E., Volmonen, K., Haikala, H. M., Kallioniemi, O., Mäyränpää, M. I. & Ilonen, I., apr. 2023, I: Lung Cancer. 178, 178, s. 213-219 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Protocol for 3D drug sensitivity and resistance testing of patient-derived cancer cells in 384-well plates
Feodoroff, M. J., Mikkonen, P., Arjama, M., Murumägi, A., Kallioniemi, O., Potdar, S., Turunen, L. & Pietiäinen, V., mars 2023, I: SLAS discovery . 28, 2, s. 36-41 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
ROR1-STAT3 signaling contributes to ovarian cancer intra-tumor heterogeneity
Piki, E., Dini, A., Raivola, J., Salokas, K., Zhang, K., Varjosalo, M., Pellinen, T., Välimäki, K., Veskimäe, K. T., Staff, S., Hautaniemi, S., Murumägi, A. & Ungureanu, D., 3 juli 2023, I: Cell death discovery . 9, 1, 10 s., 222.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2022
High-throughput ex vivo drug testing identifies potential drugs and drug combinations for NRAS-positive malignant melanoma
Kohtamäki, L., Arjama, M., Mäkelä, S., Ianevski, P., Välimäki, K., Juteau, S., Ilmonen, S., Ungureanu, D., Kallioniemi, O., Murumägi, A. & Hernberg, M., jan. 2022, I: Translational oncology. 15, 1, 11 s., 101290.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Multiomics characterization implicates PTK7 in ovarian cancer EMT and cell plasticity and offers strategies for therapeutic intervention
Raivola, J., Dini, A., Karvonen, H., Piki, E., Salokas, K., Niininen, W., Kaleva, L., Zhang, K., Arjama, M., Gudoityte, G., Seashore-Ludlow, B., Varjosalo, M., Kallioniemi, O., Hautaniemi, S., Murumagi, A. & Ungureanu, D., 17 aug. 2022, I: Cell Death and Disease. 13, 8, 12 s., 714.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2021
Evaluating Targeted Therapies in Ovarian Cancer Metabolism: Novel Role for PCSK9 and Second Generation mTOR Inhibitors
Sanz, D. J., Raivola, J., Karvonen, H., Arjama, M., Barker, H., Murumägi, A. & Ungureanu, D., aug. 2021, I: Cancers. 13, 15, 20 s., 3727.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
STRN-ALK rearranged pediatric malignant peritoneal mesothelioma - Functional testing of 527 cancer drugs in patient-derived cancer cells
Murumägi, A., Ungureanu, D., Arjama, M., Bützow, R., Lohi, J., Sariola, H., Kanerva, J., Koskenvuo, M. & Kallioniemi, O., apr. 2021, I: Translational oncology. 14, 4, 9 s., 101027.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2020
Glucocorticoids induce differentiation and chemoresistance in ovarian cancer by promoting ROR1-mediated stemness
Karvonen, H., Arjama, M., Kaleva, L., Niininen, W., Barker, H., Koivisto-Korander, R., Tapper, J., Pakarinen, P., Lassus, H., Loukovaara, M., Bützow, R., Kallioniemi, O., Murumägi, A. & Ungureanu, D., 23 sep. 2020, I: Cell Death and Disease. 11, 9, 12 s., 790.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
KIT pathway upregulation predicts dasatinib efficacy in acute myeloid leukemia
Malani, D., Yadav, B., Kumar, A., Potdar, S., Kontro, M., Kankainen, M., Javarappa, K. K., Porkka, K., Wolf, M., Aittokallio, T., Wennerberg, K., Heckman, C. A., Murumägi, A. & Kallioniemi, O., 17 juli 2020, I: Leukemia. 34, 10, s. 2780–2784 4 s., 34.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2019
Anagrelide for Gastrointestinal Stromal Tumor
Pulkka, O.-P., Gebreyohannes, Y. K., Wozniak, A., Mpindi, J.-P., Tynninen, O., Icay, K., Cervera, A., Keskitalo, S., Murumägi, A., Kulesskiy, E., Laaksonen, M., Wennerberg, K., Varjosalo, M., Laakkonen, P., Lehtonen, R., Hautaniemi, S., Kallioniemi, O., Schöffski, P., Sihto, H. & Joensuu, H., 1 mars 2019, I: Clinical Cancer Research. 25, 5, s. 1676-1687 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Wnt5a and ROR1 activate non-canonical Wnt signaling via RhoA in TCF3-PBX1 acute lymphoblastic leukemia and highlight new treatment strategies via Bcl-2 co-targeting
Karvonen, H., Perttila, R., Niininen, W., Hautanen, V., Barker, H., Murumagi, A., Heckman, C. A. & Ungureanu, D., 25 apr. 2019, I: Oncogene. 38, 17, s. 3288-3300 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2018
Colorectal Cancer Consensus Molecular Subtypes Translated to Preclinical Models Uncover Potentially Targetable Cancer Cell Dependencies
Sveen, A., Bruun, J., Eide, P. W., Eilertsen, I. A., Ramirez, L., Murumägi, A., Arjama, M., Danielsen, S. A., Kryeziu, K., Elez, E., Tabernero, J., Guinney, J., Palmer, H. G., Nesbakken, A., Kallioniemi, O., Dienstmann, R. & Lothe, R. A., 15 feb. 2018, I: Clinical Cancer Research. 24, 4, s. 794-806 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Colorectal Cancer Consensus Molecular Subtypes Translated to Preclinical Models Uncover Potentially Targetable Cancer Cell Dependencies.
Sveen, A., Bruun, J., Eide, P., Eilertsen, I., Ramirez, L., Murumägi, A., Arjama, M. A., Danielsen, S., Kryeziu, K., Elez, E., Tabernero, J., Guinney, J., Palmer, H., Nesbakken, A., Kallioniemi, O., Dienstmann, R. & Lothe, R., 15 feb. 2018, I: Clinical Cancer Research. 15, 24(4), s. 794-806 29242316.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Drug-Sensitivity Screening and Genomic Characterization of 45 HPV-Negative Head and Neck Carcinoma Cell Lines for Novel Biomarkers of Drug Efficacy
Lepikhova, T., Karhemo, P.-R., Louhimo, R., Yadav, B., Murumägi, A., Kulesskiy, E., Kivento, M., Sihto, H., Grenman, R., Syrjänen, S. M., Kallioniemi, O., Aittokallio, T., Wennerberg, K., Joensuu, H. & Monni, O., sep. 2018, I: Molecular Cancer Therapeutics. 17, 9, s. 2060-2071 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2017
Crosstalk between ROR1 and BCR pathways defines novel treatment strategies in mantle cell lymphoma
Karvonen, H., Chiron, D., Niininen, W., Ek, S., Jerkeman, M., Moradi, E., Nykter, M., Heckman, C. A., Kallioniemi, O., Murumägi, A. & Ungureanu, D., 14 nov. 2017, I: Blood advances. 1, 24, s. 2257-2268 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Drug sensitivity and resistance testing identifies PLK1 inhibitors and gemcitabine as potent drugs for malignant peripheral nerve sheath tumors
Kolberg, M., Bruun, J., Murumagi, A., Mpindi, J. P., Bergsland, C. H., Holand, M., Eilertsen, I. A., Danielsen, S. A., Kallioniemi, O. & Lothe, R. A., sep. 2017, I: Molecular oncology. 11, 9, s. 1156-1171 16 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Enhanced sensitivity to glucocorticoids in cytarabine-resistant AML
Malani, D., Murumagi, A., Yadav, B., Kontro, M., Eldfors, S., Kumar, A., Karjalainen, R., Majumder, M. M., Ojamies, P., Pemovska, T., Wennerberg, K., Heckman, C., Porkka, K., Wolf, M., Aittokallio, T. & Kallioniemi, O., maj 2017, I: Leukemia. 31, 5, s. 1187-1195 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2016
Consistency in drug response profiling
Mpindi, J. P., Yadav, B., Ostling, P., Gautam, P., Malani, D., Murumagi, A., Hirasawa, A., Kangaspeska, S., Wennerberg, K., Kallioniemi, O. & Aittokallio, T., 1 dec. 2016, I: Nature. 540, 7631, s. E5-E6 2 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Drug response prediction by inferring pathway-response associations with kernelized Bayesian matrix factorization
Ammad-ud-din, M., Khan, S. A., Malani, D., Murumägi, A., Kallioniemi, O., Aittokallio, T. & Kaski, S., 1 sep. 2016, I: Bioinformatics. 32, 17, s. 455-463 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Intrinsic resistance to PIM kinase inhibition in AML through p38a-mediated feedback activation of mTOR signaling
Brunen, D., Jose Garcia-Barchino, M., Malani, D., Basheer, N. J., Lieftink, C., Beijersbergen, R. L., Murumagi, A., Porkka, K., Wolf, M., Zwaan, C. M., Fornerod, M., Kallioniemi, O., Angel Martinez-Climent, J. & Bernards, R., 21 juni 2016, I: Oncotarget. 7, 25, s. 37407-37419 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2014
Quantitative scoring of differential drug sensitivity for individually optimized anticancer therapies
Yadav, B., Pemovska, T., Szwajda, A., Kulesskiy, E., Kontro, M., Karjalainen, R., Majumder, M. M., Malani, D., Murumagi, A., Knowles, J., Porkka, K., Heckman, C., Kallioniemi, O., Wennerberg, K. & Aittokallio, T., 5 juni 2014, I: Scientific Reports. 4, 10 s., 5193.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
2013
Aneuploidy facilitates oncogenic transformation via specific genetic alterations, including Twist2 upregulation
Hognas, G., Hamalisto, S., Rilla, K., Laine, J. O., Vilkki, V., Murumägi, A., Edgren, H., Kallioniemi, O. & Ivaska, J., sep. 2013, I: Carcinogenesis. 34, 9, s. 2000-2009 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Individualized Systems Medicine Strategy to Tailor Treatments for Patients with Chemorefractory Acute Myeloid Leukemia
Pemovska, T., Kontro, M., Yadav, B., Edgren, H., Eldfors, S., Szwajda, A., Almusa, H., Bespalov, M. M., Ellonen, P., Elonen, E., Gjertsen, B. T., Karjalainen, R., Kulesskiy, E., Lagström, S., Lehto, A., Lepistö, M., Lundan, T., Majumder, M. M., Marti, J. M. L. & Mattila, P. & 16 andra, , dec. 2013, I: Cancer Discovery. 3, 12, s. 1416-1429 14 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2012
Cytokinesis failure due to derailed integrin traffic induces aneuploidy and oncogenic transformation in vitro and in vivo
Hognas, G., Tuomi, S., Veltel, S., Mattila, E., Murumägi, A., Edgren, H., Kallioniemi, O. & Ivaska, J., 2012, I: Oncogene. 31, 31, s. 3597-3606 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Reanalysis of RNA-Sequencing Data Reveals Several Additional Fusion Genes with Multiple Isoforms
Kangaspeska, S., Hultsch, S., Edgren, H., Nicorici, D., Murumagi, A. & Kallioniemi, O., 31 okt. 2012, I: PLoS One. 7, 10, s. Article Number: e48745 11 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2011
DNA methylation signatures of the AIRE promoter in thymic epithelial cells, thymomas and normal tissues
Kont, V., Murumagi, A., Tykocinski, L.-O., Kinkel, S. A., Webster, K. E., Kisand, K., Tserel, L., Pihlap, M., Stroebel, P., Scott, H. S., Marx, A., Kyewski, B. & Peterson, P., dec. 2011, I: Molecular Immunology. 49, 3, s. 518-526 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Identification of fusion genes in breast cancer by paired-end RNA-sequencing
Edgren, H., Murumagi, A., Kangaspeska, S., Nicorici, D., Hongisto, V., Kleivi, K., Rye, I. H., Nyberg, S., Wolf, M., Borresen-Dale, A.-L. & Kallioniemi, O., 2011, I: Genome Biology. 12, 1, s. Article Number: R6 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2010
Genome-Wide RNA Interference in Drosophila Cells Identifies G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 as a Conserved Regulator of NF-kappa B Signaling
Valanne, S., Myllymäki, H., Kallio, J., Schmid, M. R., Kleino, A., Murumägi, A., Airaksinen, L., Kotipelto, T., Kaustio, M., Ulvila, J., Esfahani, S. S., Engström, Y., Silvennoinen, O., Hultmark, D., Parikka, M. & Rämet, M., 2010, I: Journal of Immunology. 184, 11, s. 6188-6198 11 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2008
Interferon autoantibodies associated with AIRE deficiency decrease the expression of IFN-stimulated genes
Kisand, K., Link, M., Wolff, A. S. B., Meager, A., Tserel, L., Org, T., Murumägi, A., Uibo, R., Willcox, N., Trebusak Podkrajsek, K., Battelino, T., Lobell, A., Kämpe, O., Lima, K., Meloni, A., Ergun-Longmire, B., Maclaren, N. K., Perheentupa, J., Krohn, K. & Scott, H. S. & 2 andra, , 2008, I: Blood. 112, 7, s. 2657-2666 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2007
Deficiency of the autoimmune regulator AIRE in thymomas is insufficient to elicit autoimmune polyendocrinopathy syndrome type I (APS-I)
Ströbel, P., Murumägi, A., Klein, R., Luster, M., Lahti, M., Krohn, K., Schalke, B., Nix, W., Gold, R., Rieckmann, P., Toyka, K., Burek, C., Rosenwald, A., Müller-Hermelink, H. K., Pujoll-Borrell, R., Meager, A., Willcox, N., Peterson, P. & Marx, A., 2007, I: Journal of Pathology. 211, s. 563-571 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2006
Ets transcription factors regulate AIRE gene promoter
Murumägi, A., Silvennoinen, O. & Peterson, P., 2006, I: Biochemical and Biophysical Research Communications. 348, s. 768-774 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2005
Cooperative activation of transcription by autoimmune regulator AIRE and CBP
Pitkänen, J., Rebane, A., Rowell, J., Murumägi, A., Ströbel, P., Möll, K., Saare, M., Heikkilä, J., Doucas, V., Marx, A. & Peterson, P., 2005, I: Biochemical and Biophysical Research Communications. 333, s. 944-953 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2004
Autoimmune regulator induced changes in the gene expression profile of human monocyte-dendritic cell-lineage
Sillanpää, N., Magureanu, C. G., Murumägi, A., Reinikainen, A., West, A., Manninen, A., Lahti, M., Ranki, A., Saksela, K., Krohn, K., Lahesmaa, R. & Peterson, P., 2004, I: Molecular Immunology. 41, s. 1185-1198 14 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Selective loss of regulatory T cells in thymomas
Ströbel, P., Rosenwald, A., Beyersdorf, N., Kerkau, T., Elert, O., Murumägi, A., Sillanpää, N., Peterson, P., Hummel, V., Rieckmann, P., Burek, C., Schalke, B., Nix, W., Kiefer, R., Müller-Hermelink, H. K. & Marx, A., 2004, I: Annals of Neurology. 56, s. 901-904 4 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
2003
Characterization of regulatory elements and methylation pattern of the autoimmune regulator (AIRE) promoter
Murumägi, A., Vähämurto, P. & Peterson, P., mars 2003, I: Journal of Biological Chemistry. 278, s. 19784-19790 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review