Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Vetenskapsgrenar
- 113 Data- och informationsvetenskap
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
Distributed hybrid-indexing of compressed pan-genomes for scalable and fast sequence alignment
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Mäkinen, V. & Heljanko, K., 3 aug. 2021, I: PLoS One. 16, 8, 19 s., 0255260.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Founder reconstruction enables scalable and seamless pangenomic analysis
Norri, T., Cazaux, B., Dönges, S., Valenzuela, D. & Mäkinen, V., 15 dec. 2021, I: Bioinformatics. 37, 24, s. 4611-4619 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Lempel-Ziv parsing for sequences of blocks
Kosolobov, D. & Valenzuela, D., dec. 2021, I: Algorithms. 14, 12, 11 s., 359.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Lempel-Ziv-Like Parsing in Small Space
Kosolobov, D., Valenzuela, D., Navarro, G. & Puglisi, S. J., nov. 2020, I: Algorithmica. 82, 11, s. 3195-3215 21 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Scalable Reference Genome Assembly from Compressed Pan-Genome Index with Spark
Maarala, A. I., Arasalo, O., Valenzuela, D., Heljanko, K. & Mäkinen, V., 18 sep. 2020, Big Data -- BigData 2020. Nepal, S., Cao, W., Nasridinov, A., Bhuiyan, MD. Z. A., Guo, X. & Zhang, L-J. (red.). Cham: Springer International Publishing, s. 68-84 17 s. ( Lecture Notes in Computer Science ; vol. 12402).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Aktiviteter
-
Department of Biosystems Science and Engineering, ETH Zürich, Basel
Daniel Valenzuela (Besökande forskare)
16 apr. 2018 → 20 apr. 2018Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
-
Towards pan-genome read alignment to improve variation calling
Daniel Valenzuela (!!Speaker)
15 jan. 2018Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Hardness of Covering Alignment: Phase Transition in Post-Sequence Genomics
Daniel Valenzuela (!!Speaker)
15 jan. 2018Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
University of Chile
Daniel Valenzuela (Besökande forskare)
22 okt. 2017 → 27 dec. 2018Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
-
International Workshop on Combinatorial Algorithms
Daniel Valenzuela (Närvarande)
1 apr. 2016 → 19 aug. 2017Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium