Personlig profil
Vetenskapsgrenar
- 113 Data- och informationsvetenskap
-
Pan-cancer tumor microenvironment profiling with multiplexed immunofluorescence microscopy and self-supervised learning
Atarsaikhan, G., Mogollon Figueroa, I., Välimäki, K. E., Mirtti, T., Pellinen, T. & Paavolainen, L., 22 mars 2024.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Sammanfattning › Peer review
-
Application of Self Supervised Vision Transformers for Multiplexed Microscopy Images and Its Challenges
Atarsaikhan, G., Mogollon Figueroa, I., Välimäki, K., Pellinen, T., Mirtti, T. & Paavolainen, L., 16 dec. 2023.Forskningsoutput: Konferensbidrag › Konferenspapper › Peer review
Öppen tillgångFil -
Deep attentive time warping
Matsuo, S., Wu, X., Atarsaikhan, G., Kimura, A., Kashino, K., Iwana, B. K. & Uchida, S., apr. 2023, I: Pattern Recognition. 136, 13 s., 109201.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Typographic Design Generation Using Neural Style Transfer
Atarsaikhan, G., 22 mars 2022Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling › Monografi
-
Attention to Warp: Deep Metric Learning for Multivariate Time Series
Matsuo, S., Wu, X., Atarsaikhan, G., Kimura, A., Kashino, K., Iwana, B. K. & Uchida, S., 2021, Document Analysis and Recognition - ICDAR 2021 - 16th International Conference, Proceedings. Lladós, J., Lopresti, D. & Uchida, S. (red.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, s. 350-365 16 s. (Lecture Notes in Computer Science (including subseries Lecture Notes in Artificial Intelligence and Lecture Notes in Bioinformatics); vol. 12823 LNCS).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
-
Uncovering patterns in cancer cells with visual representation learning
Paavolainen, L. (Projektledare), Atarsaikhan, G. (deltagare), Bourgogne, E. A. (deltagare) & Mogollon Figueroa, I. (deltagare)
01/09/2024 → 31/08/2026
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskarens forskningskostnader
-
PanCanPro: Decoding pan-cancer tumor microenvironment with integrative single-cell spatial profiling
Paavolainen, L. (Projektledare), Atarsaikhan, G. (deltagare) & Mahdavi, F. (deltagare)
01/09/2024 → 31/08/2028
Projekt: Finlands Akademi: Akademiprojektsbidrag
-
iCAN-DIP: AI-driven deep image-based profiling of pan-cancer tumor microenvironment
Atarsaikhan, G. (Deltagare) & Paavolainen, L. (Principal Investigator)
01/01/2023 → 31/12/2026
Projekt: Forskningsprojekt
-
iCAN - Digital precision cancer medicine for discoveries and improved treatments
Mäkelä, T. (Projektledare), Adhikari, S. (deltagare), Aldahdooh, J. M. F. (deltagare), Ariotta, V. (deltagare), Arjama, M. A. (deltagare), Atarsaikhan, G. (deltagare), Bao, J. (deltagare), Barreiro, K. (deltagare), Bhalke, M. S. (deltagare), Bollepalli, S. (deltagare), Brandt, J. A. J. (deltagare), Chernenko, A. (deltagare), Dashi, G. (deltagare), Eloranta, K. (deltagare), Eriksson, M. R. (deltagare), Feodoroff, M. J. (deltagare), Fey, E. (deltagare), Gerber, L. J. (deltagare), Grönholm, M. (deltagare), Hannula, S. A. (deltagare), Heistman, V. (deltagare), Henriksson, M. E. J. (deltagare), Hiitola, E. T. J. (deltagare), Huttunen, A. T. (deltagare), Hyyppä, S. P. P. (deltagare), Högel-Starck, C. S. P. (deltagare), Ianevski, A. (deltagare), Ikonen, N. (deltagare), Jansouz, S. (deltagare), Jha, S. (deltagare), Junquera Mencía, A. (deltagare), Kalashnikov, I. (deltagare), Kampanellou, E. (deltagare), Karabayev, D. (deltagare), Karhemo, P.-R. (deltagare), Karling, T. S. (deltagare), Kekkonen, J. (deltagare), Kolikova, Y. (deltagare), Krami Senhaji, O. (deltagare), Kuijjer, M. (deltagare), Kuisma-van der Linden, M. S. (deltagare), Kumari, R. (deltagare), Kuosmanen, A. (deltagare), Kurki, V. (deltagare), Kuusela, S. (deltagare), Kücükel, H. (deltagare), Langohr, L. (deltagare), Lavikka, K. A. (deltagare), Le Joncour, V. (deltagare), Lehto, T.-P. (deltagare), Leivonen, S.-K. (deltagare), Liljeström, M. (deltagare), Lindfors, I. S. (deltagare), Lindgren, H. (deltagare), Luck, T. J. (deltagare), Lähdeniemi, I. A. K. (deltagare), Maarala, A. I. (deltagare), Maljanen, K. J. (deltagare), Marchi, G. (deltagare), Martikainen, E. M. (deltagare), Meriranta, L. (deltagare), Metsäranta, N. A. C. (deltagare), Miihkinen, M. S. (deltagare), Moradi, N. (deltagare), Nader, K. M. (deltagare), Nagaraj, A. (deltagare), Nguyen, M. (deltagare), Niemeyer, F. (deltagare), Niemiec, I. (deltagare), Nylén, M. M. (deltagare), Palin, K. (deltagare), Palva, A. (deltagare), Parsons, A. O. (deltagare), Peltonen, J. H. H. (deltagare), Perez Villatoro, F. R. (deltagare), Pietiäinen, V. (deltagare), Pirinen, I. E. (deltagare), Pirttikoski, A. A. (deltagare), Pitko, I. M. (deltagare), Polianskyte-Prause, Z. (deltagare), Puhka, M. (deltagare), Quintero, I. B. (deltagare), Rachidi, S. E. (deltagare), Rajalaakso, M. T. (deltagare), Rodosthenous, R. (deltagare), Saad, J. (deltagare), Sanjaya, P. (deltagare), Seppälä, T. T. (deltagare), Seref Vujaklija, C. (deltagare), Shah, S. (deltagare), Sorri, S. P. (deltagare), Suni, V. (deltagare), Suutala, A. (deltagare), Suvela, M. (deltagare), Sysivirta, L. K. M. (deltagare), Udayani, J. E. (deltagare), Verkasalo, H. M. (deltagare), Viiri, L. E. (deltagare), Vilkkavaara Cancocak, Y. (deltagare), Vähärautio, A. (deltagare), Vänttinen, I. M. (deltagare), Västrik, I. (deltagare), Väänänen, J. (deltagare), Wang, W. (deltagare) & Zhang, X. (deltagare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus, Finlands Akademi
01/09/2022 → 31/12/2026
Projekt: Finlands Akademi: Flaggskeppsprogrammet
-
Uncovering patterns in cancer cells with visual representation learning
Paavolainen, L. (Projektledare), Atarsaikhan, G. (Deltagare), Mogollon Figueroa, I. (Deltagare) & Sanian, M. V. (deltagare)
01/09/2021 → 31/08/2026
Projekt: Forskningsprojekt
Forskningsdatauppsättningar
-
Image-based profiling of healthy donor immune cells with Blood Cell Painting
Paavolainen, L. (Skapad av), Högel-Starck, C. S. P. (Skapad av), Timonen, V. A. (Skapad av), Atarsaikhan, G. (Skapad av), Mogollon Figueroa, I. (Skapad av), Polso, M. M. M. (Skapad av), Hassinen, A. (Skapad av), Pietiäinen, V. (Skapad av) & Pitkänen, E. (Skapad av), European Bioinformatics Institute, 14 okt. 2025
DOI: 10.6019/S-BIAD2344
Datauppsättning
Aktiviteter
-
The 16th FCI Symposium “Future of Clinical Decision Making”
Atarsaikhan, G. (Poster presentation)
26 sep. 2024 → 27 sep. 2024Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
EMBO | EMBL Symposium: AI and biology
Atarsaikhan, G. (Poster presentation)
12 mars 2024 → 15 mars 2024Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
AI Day 2024 + Nordic AI Meet
Atarsaikhan, G. (Poster presentation)
21 okt. 2024 → 22 okt. 2024Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
iCAN retreat 2024
Kremneva, E. (Ordförande i organisationskommitté), Kolikova, Y. (Medlem i organisationskommitté), Laakkonen, P. (Medlem i organisationskommitté), Vanharanta, S. (Medlem i organisationskommitté), Varjosalo, M. (Medlem i organisationskommitté), Wahl, H. (Medlem i organisationskommitté), Sankkila-Forsström, S. S. (Medlem i organisationskommitté), Duàn, H. (Talare: Presentation), Karhemo, P.-R. (Talare: Presentation), Miihkinen, M. S. (Talare: Presentation), Liljeström, M. (Medlem i organisationskommitté), Pietiäinen, V. (Talare: Presentation), Ganesan, A. (Poster presentation), Saad, J. (Poster presentation), Holmström, S. (Poster presentation), Brodkin, J. H. (Poster presentation), Mendoza Ortiz, E. D. (Poster presentation), Sundaresan, S. (Poster presentation), Chiaro, J. (Poster presentation), Giannoula, Y. (Poster presentation), Portaankorva, A. M. (Talare: Presentation), Mustjoki, S. (Talare: Presentation), Mäkelä, T. (Talare: Presentation), Atarsaikhan, G. (Poster presentation), Filppu, P. (Poster presentation), Russo, S. (Poster presentation), Pikkusaari, S. K. (Poster presentation), Ryzhenkov, A. (Poster presentation), Newman, R. G. D. (Talare: Presentation), Arffman, M. E. (Talare: Presentation), Kumari, R. (Poster presentation), Leppiniemi, S. A. (Poster presentation), Sanjaya, P. (Poster presentation), Feodoroff, M. J. (Poster presentation), Karabayev, D. (Poster presentation), Jäntti, J. M. (Poster presentation), Wong Ramirez, J. R. C. (Poster presentation), Kalander, K. O. (Poster presentation), Bouhlal, J. O. V. (Talare: Presentation), Kuusela, S. (Talare: Presentation), Fey, E. (Talare: Presentation), Krami Senhaji, O. (Poster presentation), Moradi, N. (Poster presentation), Polso, M. M. M. (Poster presentation), Antignani, G. (Poster presentation), Maljanen, K. J. (Poster presentation), Langohr, L. (Poster presentation), Anil, A. (Poster presentation), Smolander, P. J. (Poster presentation), Feodoroff, M. J. (Poster presentation), Alsaed, B. (Poster presentation), Mogollon Figueroa, I. (Poster presentation), Ryzhenkov, A. (Poster presentation) & Henriksson, M. E. J. (Poster presentation)
3 okt. 2024Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
2023 MAQC SOCIETY 6TH ANNUAL MEETING
Atarsaikhan, G. (Talare: Presentation)
11 sep. 2023 → 12 sep. 2023Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium