Personlig profil
Information om forskning och undervisning
Jag bedriver proteiningenjörs- och beräkningsstudier av lipidtransportörerna ABCA1 och ABCG1 samt kolesterylestrhydrolaserna CES1 och nCEH1 i makrofager. Mitt arbete omfattar bioinformatiska analyser samt klassiska och kvantmekaniska molekyldynamiksimuleringar med GROMACS och NAMD.
Därutöver medverkar jag i handledningen av kandidat- och masterstudenter inom beräkningsinriktade forskningsprojekt och examensarbeten.
Utbildning / akademisk kvalifikation
Genetics and Molecular Biosciences, Master of Science, Helsingfors universitet
1 aug. 2023 → 30 juni 2025
Tilldelningsdatum: 30 juni 2025
Molecular biology and Genetics, Bachelor of Science, Democritus Univ Thrace, Democritus University of Thrace, Dept Mol Biol & Genet
1 sep. 2018 → 26 juli 2022
Tilldelningsdatum: 26 juli 2022
Vetenskapsgrenar
- 114 Fysik
- 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi
- 317 Farmaci
- 1184 Genetik, utvecklingsbiologi, fysiologi
Samarbeten och ledande forskningsområden under de senaste fem åren
Forskningsresultat
- 2 Artikel
-
Assessment of amino acid charge states based on cryo-electron microscopy and molecular dynamics simulations of respiratory complex I
Lasham, J., Djurabekova, A., Kolypetris, G., Zickermann, V., Vonck, J. & Sharma, V., 1 jan. 2025, I: Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics. 1866, 1, 8 s., 149512.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Exploring the structure and dynamics of peptide nanodiscs through a synergistic approach with NMR spectroscopy, SAS and MD simulations
Nouri, S., Niemelä, T. A. A., Nencini, R., Kolypetris, G., Niemi-Aro, T. J. J., Virtanen, S. I., Ollila, S. & Koivuniemi, A. S., 9 apr. 2026, (!!Accepted/In press) I: Communications chemistry.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Projekt
- 4 Aktiv
-
Resolving the atomic level activation mechanisms of lecithin-cholesterol acyltransferase-targeted therapeutic agents utilising a novel combination of modern computational and experimental techniques
Koivuniemi, A. (Projektledare), Dhakal, S. (deltagare), Ellonen, S. T. S. (deltagare) & Kolypetris, G. (deltagare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus
01/05/2025 → 31/08/2027
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskarens forskningskostnader
-
Computer simulation and cryo EM modeling
Sharma, V. (Projektledare), Kolypetris, G. (deltagare) & Torabi, M. (deltagare)
Suomen Tiedeseura r.y. Finska Vetenskaps-Societeten r.f.
01/04/2025 → 26/06/2026
Projekt: Stiftelser och fonder
-
GeneCellNa: Gene, Cell and Nano Therapy Competence Cluster for the Treatment of Chronic Diseases (GeneCellNano)
Yliperttula, M. (Projektledare), Airavaara, K. L. (deltagare), Benadouda, K. R. (deltagare), Heikkilä, F. L. N. (deltagare), Jokela, A. E. (deltagare), Kiander, W. (deltagare), Klose, A. (deltagare), Koivunotko, E. (deltagare), Kolypetris, G. (deltagare), Künnapuu-Vulli, J. (deltagare), Mohamed, D. A. (deltagare), Monola, J. K. (deltagare), Mozaffari Majd, M. (deltagare), Nouri, S. (deltagare), Pridgeon, C. S. (deltagare), Pörhö, B. M. (deltagare), Rekikoski, A. M. (deltagare), Uoti, A. J. (deltagare) & Zini, J. (deltagare)
Suomen Akatemia Projektilaskutus
01/09/2024 → 30/06/2026
Projekt: Finlands Akademi: Flaggskeppsprogrammet
-
Jusélius/Sharma 2024
Sharma, V. (Projektledare), Abettan, A. (deltagare), Jousmäki, M. A. I. (deltagare), Kolypetris, G. (deltagare) & Laukkanen, J. O. A. (deltagare)
Sigrid Juséliuksen Säätiö @003701165704@
01/05/2024 → 30/04/2027
Projekt: Stiftelser och fonder