Personlig profil
Vetenskapsgrenar
- 3111 Biomedicinska vetenskaper
Samarbeten och ledande forskningsområden under de senaste fem åren
-
LazypipeX: Customizable Virome Analysis Pipeline Enabling Fast and Sensitive Virus Discovery from NGS data
Pljusnin, I., Vapalahti, O., Kant, R. & Smura, T., 19 jan. 2026, (Insänt) I: bioRxiv : the preprint server for biology .Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
-
Time-series sewage metagenomics distinguishes seasonal, human-derived and environmental microbial communities potentially allowing source-attributed surveillance
Becsei, A., Fuschi, A., Otani, S., Kant, R., Weinstein, I., Alba, P., Steger, J., Visontai, D., Brinch, C., de Graaf, M., Schapendonk, C. M. E., Battisti, A., De Cesare, A., Oliveri, C., Troja, F., Vapalahti, O., Pasquali, F., Banyai, K., Mako, M. & Pollner, P. & 6 andra, , 30 aug. 2024, I: Nature Communications. 15, 7551, 13 s., 7551.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Enhanced Viral Metagenomics with Lazypipe 2
Pljusnin, I., Vapalahti, O., Sironen, T., Kant, R. & Smura, T., 2023, I: Viruses (Basel). 15, 2, 13 s., 431.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång -
Partial genome characterization of a novel potentially zoonotic parapoxvirus in a horse, Finland
Virtanen, J. M. E., Hautaniemi, M., Dutra, L., Pljusnin, I., Smura, T., Vapalahti, O., Sironen, T., Kant, R. & Kinnunen, P. M., 29 sep. 2023, I: Emerging Infectious Diseases. 29, 9, s. 1941-1944 4 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
ClusTRace, a bioinformatic pipeline for analyzing clusters in virus phylogenies
Pljusnin, I., Truong, P., Sironen, T., Vapalahti, O., Smura, T. & Kant, R., 28 maj 2022, I: BMC Bioinformatics. 23, 1, 16 s., 196.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Projekt
- 6 Aktiv
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (deltagare)
01/12/2025 → …
Projekt: Forskningsprojekt
-
A Metagenomic Approach to Canine Viral Infections
Pljusnin, I. (deltagare) & Kant, R. (Principal Investigator)
01/12/2025 → …
Projekt: Stiftelser och fonder
-
SELS 24-25 Ilja Weinstein
Pljusnin, I. (Projektledare)
Suomen eläinlääketieteen säätiö
01/12/2024 → 31/12/2026
Projekt: Stiftelser och fonder
-
JAES Vapalahti 12/24 - 11/27
Vapalahti, O. (Projektledare), Erdin, M. (deltagare), Kirjalainen, L. M. (deltagare), Martikainen, J. K. (deltagare), Olander, V. (deltagare), Pljusnin, I. (deltagare), Sironen, E. V. (deltagare), Smura, T. (deltagare) & Vauhkonen, H. K. (deltagare)
01/12/2024 → 30/11/2027
Projekt: Stiftelser och fonder
-
DURABLE EU Vapalahti Olli 2/23-1/27
Vapalahti, O. (Projektledare), Ahvenainen, E. R. (deltagare), Alburkat, H. A. T. (deltagare), Bogacheva, M. (deltagare), Erdin, M. (deltagare), Kirjalainen, L. M. (deltagare), Pljusnin, I. (deltagare), Smura, T. (deltagare), Suomalainen, N. (deltagare) & Vauhkonen, H. K. (deltagare)
01/02/2023 → 31/01/2027
Projekt: EU4Health programme: EU4H-PJG
Aktiviteter
- 1 Handledning av annat kunskapsprov (pro gradu, licentiatavhandling)
-
haracterization of species-level feline Helicobacter population using 16S MinION nanopore sequencing
Pljusnin, I. (Handledare), Sironen, T. (Handledare) & Kant, R. (Handledare)
2024 → 2025Aktivitet: Examinationstyper › Handledning av annat kunskapsprov (pro gradu, licentiatavhandling)
Tidningsurklipp
-
University of Helsinki researchers developed a sequence analysis pipeline for virus discovery
Pljusnin, I., Kant, R., Smura, T., Sironen, T. & Vapalahti, O.
03/12/2020
1 objekt av Mediabevakning
Press/media: !!Press / Media