Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Meritförteckning
The Biological Physics group led by Ilpo Vattulainen utilizes computational biophysics and scientific computing to promote health and understand biological processes, focusing on high-impact projects that are integrated with experimental research. The group develops new techniques for multi-scale simulations and data analysis (AI/ML). The research topics mainly deal with membrane receptors, lipids, protein function, viruses and signaling, with the aim of elucidating the mechanisms of diseases such as viral diseases, cancers and dry eye syndrome.
Vetenskapsgrenar
- 114 Fysik
- 1182 Biokemi, cell- och molekylärbiologi
- 116 Kemi
- 221 Nanoteknologi
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
Assessing vitamin E acetate as a proxy for E-cigarette additives in a realistic pulmonary surfactant model
Korolainen, H., Olżyńska, A., Pajerski, W., Chytrosz-Wrobel, P., Vattulainen, I., Kulig, W. & Cwiklik, L., dec. 2024, I: Scientific Reports. 14, 1, 11 s., 23805.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Disulfide bridge-dependent dimerization triggers FGF2 membrane translocation into the extracellular space
Lolicato, F., Steringer, J. P., Saleppico, R., Beyer, D., Fernandez-Sobaberas, J., Unger, S., Klein, S., Riegerová, P., Wegehingel, S., Müller, H.-M., Schmitt, X. J., Kaptan, S., Freund, C., Hof, M., Šachl, R., Chlanda, P., Vattulainen, I. & Nickel, W., 22 jan. 2024, I: eLife. 12, 42 s., RP88579.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Exposure to Aldehyde Cherry e-Liquid Flavoring and Its Vaping Byproduct Disrupt Pulmonary Surfactant Biophysical Function
Martin, A., Tempra, C., Yu, Y., Liekkinen, J., Thakker, R., Lee, H., Moreno, B. D. S., Vattulainen, I., Rossios, C., Javanainen, M. & de la Serna, J. B., 8 jan. 2024, I: Environmental Science & Technology. 58, 3, s. 1495-1508 14 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Martini 3 OliGo̅mers: A Scalable Approach for Multimers and Fibrils in GROMACS
Korshunova, K., Kiuru, J., Liekkinen, J., Enkavi, G., Vattulainen, I. & Bruininks, B. M. H., 27 aug. 2024, I: Journal of Chemical Theory and Computation. 20, 17, s. 7635–7645 11 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Membrane remodeling by FAM92A1 during brain development regulates neuronal morphology, synaptic function, and cognition
Wang, L., Yang, Z., Fudo, S., Anthony Raj, X. P., Yan, Z., Vihinen, H., Chen, Y., Zhao, Y., He, X., Bu, Q., Li, H., Zhao, Y., Jiang, L., Qin, F., Dai, Y., Zhang, N., Qin, M., Kuang, W., Zhao, Y. & Jokitalo, E. & 4 andra, , 2024, I: Nature Communications. 15, 1, 30 s., 6209.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
-
Jusélius/Vattulainen 2024-27
Vattulainen, I. T. (Projektledare), Haapanen, O. (deltagare), Hosseinidolama, M. (deltagare), Kiuru, J. O. T. (deltagare), Nieminen, V. M. E. (deltagare), Roschier, M. (deltagare) & Torniainen, M. P. (deltagare)
Sigrid Juséliuksen Säätiö @003701165704@
01/05/2024 → 30/04/2025
Projekt: Stiftelser och fonder
-
BarrierFor: Biological Barrier Mechanics and Disease: From molecular-scale to tissue-level understanding of signal integration and forces (BarrierForce)
Vattulainen, I. T. (Projektledare), Hägg, V. M. L. (deltagare), Korshunova, K. (deltagare), Martikainen, A. O. J. (deltagare), Paajanen, S. E. (deltagare), Soennichsen, C. H. (deltagare), Torniainen, M. P. (deltagare) & Vihuri, S. T. K. (deltagare)
01/01/2024 → 31/12/2026
Projekt: Dinlands Akademi: Spetsforskningsenhet
-
Lundbeck-Castrén
Castrén, E. (Projektledare), Lauri, S. (Projektledare), Vattulainen, I. T. (Projektledare), Didio, G. (deltagare), Kaptan, S. S. (deltagare), Kaurinkoski, K. V. S. (deltagare), Keskinen, R. (deltagare), Kunnari, A.-J. A. (deltagare), Le Joncour, V. (deltagare), Ojanen, S. (deltagare), Shteinikov, V. (deltagare) & Srinivasan, R. (deltagare)
Tuntematon rahoittaja, Lundbeckfonden Lundbeck Foundation
01/04/2023 → 31/03/2028
Projekt: Stiftelser och fonder
-
MOLiNTEL: Molecular Basis of Intelligence
Kaptan, S. S. (Principal Investigator), Eurasto, F. (Deltagare), Paajanen, S. E. (Deltagare), Pirnes, S. J. (Deltagare) & Vattulainen, I. T. (Projektledare)
01/01/2021 → 31/12/2023
Projekt: Helsingfors Universitetets treåriga forskningsprojekt
Aktiviteter
-
Introduction to MD methods
Vattulainen, I. T. (!!Speaker)
2 juli 2017 → 9 juli 2017Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Membrane dynamics with nanoparticles: Roles of electrostatics, glycans, and crowding
Vattulainen, I. T. (!!Speaker)
12 juni 2017 → 16 juni 2017Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Lipids modulating membrane receptor dynamics and function
Vattulainen, I. T. (!!Speaker)
19 maj 2017 → 21 maj 2017Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Cholesterol and polyunsaturated lipids working in concert to modulate G protein-coupled receptors
Vattulainen, I. T. (!!Speaker)
16 juli 2017 → 20 juli 2017Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation
-
Lipids controlling membrane receptor conformation and activation: Perspective through molecular simulations
Vattulainen, I. T. (!!Speaker)
20 sep. 2017 → 22 sep. 2017Aktivitet: Typer för tal eller presentation › !!Oral presentation