Foto på Jenni Hultman
  • PL 56 (Viikinkaari 9)

    00014

    Finland

20052019
Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Publikationer 2005 2019

2019
2018

Construction and characterization of synthetic bacterial community for experimental ecology and evolution

Cairns, J., Jokela, R., Hultman, J., Tamminen, M., Virta, M. & Hiltunen, T., 14 aug 2018, I : Frontiers in Genetics. 9, 12 s., 312.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
Öppen tillgång
Fil

Host range of antibiotic resistance genes in wastewater treatment plant influent and effluent

Hultman, J., Tamminen, M., Pärnänen, K., Cairns, J., Karkman, A. & Virta, M., 1 apr 2018, I : FEMS Microbiology Ecology. 94, 4, s. 1-10 10 s., fiy038.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Maternal gut and breast milk microbiota affect infant gut antibiotic resistome and mobile genetic elements

Pärnänen, K., Karkman, A., Hultman, J., Lyra, C., Bengtsson-Palme, J., Larsson, D. G. J., Rautava, S., Isolauri, E., Salminen, S., Kumar, H., Satokari, R. & Virta, M., 24 sep 2018, I : Nature Communications. 9, 11 s., 3891.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2017

A communal catalogue reveals Earth's multiscale microbial diversity

Thompson, L. R., Sanders, J. G., McDonald, D., Amir, A., Ladau, J., Locey, K. J., Prill, R. J., Tripathi, A., Gibbons, S. M., Ackermann, G., Navas-Molina, J. A., Janssen, S., Kopylova, E., Vazquez-Baeza, Y., Gonzalez, A., Morton, J. T., Mirarab, S., Xu, Z. Z., Jiang, L., Haroon, M. F. & 24 andraKanbar, J., Zhu, Q., Song, S. J., Kosciolek, T., Bokulich, N. A., Lefler, J., Brislawn, C. J., Humphrey, G., Owens, S. M., Hampton-Marcell, J., Berg-Lyons, D., McKenzie, V., Fierer, N., Fuhrman, J. A., Clauset, A., Stevens, R. L., Shade, A., Pollard, K. S., Goodwin, K. D., Jansson, J. K., Gilbert, J. A., Knight, R., Earth Microbiome Project Consortiu & Hultman, J., 23 nov 2017, I : Nature. 551, 7681, s. 457-+ 21 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Exploring lot-to-lot variation in spoilage bacterial communities on commercial modified atmosphere packaged beef

Säde, E. J., Penttinen, K., Björkroth, K. J. & Hultman, J. J., apr 2017, I : Food Microbiology. 62, s. 147–152 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Quantifying uncertainty of taxonomic placement in DNA barcoding and metabarcoding

Somervuo, P., Yu, D. W., Xu, C. C. Y., Ji, Y., Hultman, J., Wirta, H. & Ovaskainen, O., apr 2017, I : Methods in Ecology and Evolution. 8, 4, s. 398-407 10 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2016
Öppen tillgång
Fil

Evaluating the mobility potential of antibiotic resistance genes in environmental resistomes without metagenomics

Pärnänen, K., Karkman, A., Tamminen, M., Lyra, C., Hultman, J., Paulin, L. & Virta, M., 2016, I : Scientific Reports. 6, s. 35790 9 s., 35790.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Pintaa syvemmältä - pintojen lajikirjo paljastuu

Säde, E. & Hultman, J., 2016, I : Kehittyvä Elintarvike. 27, 1, s. 30-31 2 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelProfessionell

2015

Inconsistent Denoising and Clustering Algorithms for Amplicon Sequence Data

Koskinen, K., Auvinen, P., Björkroth, J. & Hultman, J., 1 aug 2015, I : Journal of Computational Biology. 22, 8, s. 743-751 9 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång

Multi-omics of permafrost, active layer and thermokarst bog soil microbiomes

Hultman, J., Waldrop, M. P., Mackelprang, R., David, M. M., McFarland, J., Blazewicz, S. J., Harden, J., Turetsky, M. R., McGuire, A. D., Shah, M. B., VerBerkmoes, N. C., Lee, L. H., Mavrommatis, K. & Jansson, J. K., 14 maj 2015, I : Nature. 521, 7551, s. 208-+ 17 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Preparation and antimicrobial characterization of silver-containing packaging materials for meat

Kuuliala, L., Pippuri, T., Hultman, J., Auvinen, S-M., Kolppo, K., Nieminen, T., Karp, M., Björkroth, J., Kuusipalo, J. & Jääskeläinen, E., dec 2015, I : Food Packaging and Shelf Life. 6, s. 53-60 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2014

Assessments of the Deepwater Horizon oil spill impact on Gulf coast microbial communities

Lamendella, R., Strutt, S., Borglin, S., Chakraborty, R., Tas, N., Mason, O. U., Hultman, J., Prestat, E., Hazen, T. C. & Jansson, J. K., 3 apr 2014, I : Frontiers in Microbiology. 5, 13 s., 130.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Evaluation of Molecular Techniques in Characterization of Deep Terrestrial Biosphere

Bomberg, M., Nyyssönen, M., Nousiainen, A., Hultman, J. J., Paulin, L. G., Auvinen, P. O. V. & Itävaara, M., 2014, I : Open Journal of Ecology. s. 468-487

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

FOAM (Functional Ontology Assignments for Metagenomes): a Hidden Markov Model (HMM) database with environmental focus

Prestat, E., David, M. M., Hultman, J., Tas, N., Lamendella, R., Dvornik, J., Mackelprang, R., Myrold, D. D., Jumpponen, A., Tringe, S. G., Holman, E., Mavromatis, K. & Jansson, J. K., 29 okt 2014, I : Nucleic Acids Research. 42, 19, 7 s., 145.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Taxonomically and functionally diverse microbial communities in deep crystalline rocks of the Fennoscandian shield

Nyyssonen, M., Hultman, J., Ahonen, L., Kukkonen, I., Paulin, L., Laine, P., Itävaara, M. & Auvinen, P., 2014, I : ISME Journal. 8, 1, s. 126-138 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2012

Comparison of microbial communities in marinated and unmarinated broiler meat by metagenomics

Nieminen, T. T., Koskinen, K., Laine, P., Hultman, J., Säde, E., Paulin, L., Paloranta, A., Johansson, P., Björkroth, J. & Auvinen, P., 2012, I : International Journal of Food Microbiology. 157, 2, s. 142-149 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Detection of Human Papillomaviruses by Polymerase Chain Reaction and Ligation Reaction on Universal Microarray

Ritari, J., Hultman, J., Fingerroos, R., Tarkkanen, J., Pullat, J., Paulin, L., Kivi, N., Auvinen, P. & Auvinen, E., 2012, I : PLoS One. 7, 3, s. Article Number: e34211 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Metagenome, metatranscriptome and single-cell sequencing reveal microbial response to Deepwater Horizon oil spill

Mason, O. U., Hazen, T. C., Borglin, S., Chain, P. S. G., Dubinsky, E. A., Fortney, J. L., Han, J., Holman, H-Y. N., Hultman, J., Lamendella, R., Mackelprang, R., Malfatti, S., Tom, L. M., Tringe, S. G., Woyke, T., Zhou, J., Rubin, E. M. & Jansson, J. K., sep 2012, I : ISME Journal. 6, 9, s. 1715-1727 13 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Molecular analysis of meso- and thermophilic microbiota associated with anaerobic biowaste degradation

Ritari, J., Koskinen, K., Hultman, J., Kurola, J. M., Kymäläinen, M., Romantschuk, M., Paulin, L. & Auvinen, P., 2012, I : BMC Microbiology. 12, 14 s., 121.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil
2011

Microbial sampling and analyisis of the Outokumpu deep drill hole biosphere in 2007-2009.

Itävaara, M., Nyyssönen, M., Bomberg, M., Kapanen, A., Nousiainen, A., Ahonen, L., Hultman, J., Paulin, L., Auvinen, P. & Kukkonen, IT., 2011, Outokumpu deep drilling project 2003-2010. Kukkonen, I. T. (red.). s. 199-206 8 s. (Geological survey of Finland. Special paper; vol. 2011, nr. 51).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

Spatially differing bacterial communities in water columns of the northern Baltic Sea

Koskinen, K., Hultman, J., Paulin, L. G., Auvinen, P. & Kankaanpää, H., 2011, I : FEMS Microbiology Ecology. 75, 1, s. 99-110 12 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2010

Bacterial diversity at different stages of the composting process

Partanen, P., Hultman, J., Paulin, L., Auvinen, P. & Romantschuk, M., 2010, I : BMC Microbiology. 10, 94, 11 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Determination of fungal succession during municipal solid waste composting using a cloning-based analysis

Hultman, J., Vasara, T., Partanen, P., Kurola, J., Kontro, M. H., Paulin, L., Auvinen, P. & Romantschuk, M., 2010, I : Journal of Applied Microbiology. 108, 2, s. 472-487 16 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Metagonomiikka avaa uusia ovia mikrobiologiassa

Hultman, J. & Auvinen, P., 2010, I : Duodecim. 126, 11, s. 1278-1285 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

2009

Application of hybridization control probe to increase accuracy on ligation detection or minisequencing diagnostic microarrays

Ritari, J., Paulin, L., Hultman, J. & Auvinen, P., 2009, I : BMC research notes. 2, 249, [7] s

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Mikrobiyhteisöjen tutkiminen metagenomiikan avulla

Hultman, J. & Auvinen, P., 2009, I : Natura. 46, 4, s. 14-18 5 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskaplig

Utility of molecular tools in monitoring large scale composting

Hultman, J., Kurola, J., Rainisalo, A., Kontro, M. & Romantschuk, M., 2009, Microbes at work from wastes to resources. Insam, H., Franke-Whittle, I. & Goberna, M. (red.). Springer-Verlag, s. 135-151

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKapitelVetenskapligPeer review

2008

Probe-based negative selection for underrepresented phylotypes in large environmental clone libraries

Hultman, J., Pitkäranta, M., Romantschuk, M., Auvinen, P. & Paulin, L., 2008, I : Journal of Microbiological Methods. 75, 3, s. 457-463 7 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Universal ligation-detection-reaction microarray applied for compost microbes

Hultman, J., Ritari, J., Romantschuk, M., Paulin, L. & Auvinen, P., 2008, I : BMC Microbiology. 8, 237, 36, s. + 4 liitel 1 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

2005

Activity, diversity and population size of ammonia-oxidising bacteria in oil-contaminated landfarming soil

Kurola, J., Salkinoja-Salonen, M., Aarnio, T., Hultman, J. & Romantschuk, M., 2005, I : FEMS Microbiology Letters. 250, 1, s. 33-38 6 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review