Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Information om forskning och undervisning
Current areas of research interest:
- Remote sensing:
- Chlorophyll fluorescence, from leaf to landscape
- Field and automated canopy spectroscopy
- Physiological optics (e.g. Photochemical Reflectance Index)
- Physically-based modelling techniques
- Ecophysiology:
- Photosynthesis
- BVOCs
- Modern software and hardware in Environmental Science:
- Data science and associated languages (Python numerical stack and R)
- Affordable instrumentation development (e.g. RPI)
- Promoting up-to-date software practice (e.g. version control)
I am instructing on "Environmental Data Science" which covers some of the practical aspects of working with data in R and Python. We use Jupyter notebooks for course content which you can find on our lab's github:
https://github.com/OptPhotLab/EnvDataSciNotebooks
https://github.com/OptPhotLab/EnvDataSciNotebooksPython
Vetenskapsgrenar
- 1172 Miljövetenskap
- 4112 Skogsvetenskap
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
Uncrewed aircraft system spherical photography for the vertical characterization of canopy structural traits
Costa, V. A. R., Durand, M., Robson, T. M., Porcar-Castell, A., Korpela, I. & Atherton, J., apr. 2022, I: New Phytologist. 234, 2, s. 735-747 13 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
What Does the NDVI Really Tell Us About Crops? Insight from Proximal Spectral Field Sensors
Atherton, J., Zhang, C., Oivukkamäki, J., Kulmala, L., Xu, S., Hakala, T., Honkavaara, E., MacArthur, A. & Porcar-Castell, A., 2022, Springer Optimization and Its Applications. Springer, s. 251-265 15 s. (Springer Optimization and Its Applications; vol. 182).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Kapitel › Vetenskaplig › Peer review
-
Beyond APAR and NPQ: Factors Coupling and Decoupling SIF and GPP Across Scales
Porcar-Castell, A., Malenovský, Z., Magney, T., van Wittenberghe, S., Fernández-Marín, B., Maignan, F., Zhang, Y., Maseyk, K., Atherton, J., Albert, L. P., Robson, T. M., Zhao, F., Garcia-Plazaola, J. I., Ensminger, I., Rajewicz, P. A., Grebe, S., Tikkanen, M., Kellner, J. R., Ihalainen, J. A., Rascher, U., & 1 andra, 2021, 2021 IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium IGARSS. IEEE, s. 1925-1927 3 s.Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
-
Chlorophyll a fluorescence illuminates a path connecting plant molecular biology to Earth-system science
Porcar-Castell, A., Malenovsky, Z., Magney, T., Van Wittenberghe, S., Fernandez-Marin, B., Maignan, F., Zhang, Y., Maseyk, K., Atherton, J., Albert, L. P., Robson, T. M., Zhao, F., Garcia-Plazaola, J-I., Ensminger, I., Rajewicz, P. A., Grebe, S., Tikkanen, M., Kellner, J. R., Ihalainen, J. A., Rascher, U., & 1 andra, 9 aug. 2021, I: Nature plants. 7, 8, s. 998–1009 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Measuring solar-induced fluorescence from unmanned aircraft systems for operational use in plant phenotyping and precision farming
Bendig, J., Chang, C. Y., Wang, N., Atherton, J., Malenovsky, Z. & Rascher, U., 16 juli 2021, IEEE International Geoscience and Remote Sensing Symposium IGARSS. IEEE, s. 1921-1924 4 s. (IGARSS).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
-
MONOCLE: Ympäristövaikutusten kaukokartoittamisen mekanismit
01/09/2022 → 31/08/2027
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskare
-
MONOCLE: Ympäristövaikutusten kaukokartoittamisen mekanismit
Atherton, J. & Alonso Chorda, L.
01/09/2022 → 31/12/2025
Projekt: Finlands Akademi: Akademiforskarens forskningskostnader
-
ATM: 'Ilmakehäntutkimuksen huippuyksikkö - molekyyli- ja biologisista prosesseista globaaliin ilmastotutkimukseen'
Bäck, J., Vesala, T., Mäki, M., Heinonsalo, J., Ojala, A., Matkala, L., Kaukolehto, M., Häme (o.s. Häkkinen), S., Nikinmaa, E., Kulmala, L., Hölttä, T., Paljakka, T. V. S., Salmon, Y., Aalto, J., Porcar-Castell, A., Kieloaho, A., Hari, P., Lintunen, A., Korhonen, J., Pihlatie, M., Pumpanen, J., Juurola, E., Olascoaga Gracia, B., Riikonen, A., Mäkelä, A., Kolari, P., Schiestl-Aalto, P., Peltomaa, E., Berninger, F., Taipale, D., Joensuu, J., Kasurinen, V., Dominguez Carrasco, M., Vanhatalo, A., Lindfors, L., Köster, K., Köster, E., Atherton, J. & Rissanen, K.
01/01/2014 → 31/12/2016
Projekt: Forskningsprojekt
Aktiviteter
-
Birmingham Institute of Forest Research Free-Air Carbon Dioxide Enrichment (FACE) experiment
Jon Atherton (Besökande forskare)
18 sep. 2017 → 23 sep. 2017Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
-
Upscaling the Optical Properties of leaves to model their contribution to canopy light use efficiency and carbon assimilation over vertical and horizontal profiles of spectral irradiance
T Matthew Robson (Handledare), Jonathan Mark Atherton (Handledare) & Anu Heikkilä (Handledare)
1 apr. 2017 → 1 sep. 2021Aktivitet: Examinationstyper › Handledare eller bihandledare av doktorsavhandling
-
Remote Sensing (Tidskrift)
Jon Atherton (Referentgranskare)
2017Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
European Space Agency: Earth Explorer-8 User Consultation Meeting
Jon Atherton (Närvarande)
15 sep. 2015Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
Advanced Analysis of Atmospheric Processes and Feedbacks and Atmosphere-Biosphere Interactions (Winter school 2015)
Jon Atherton (Deltagare)
16 mars 2015 → 26 mars 2015Aktivitet: Andra aktivitetstyper › Typer av övriga aktiviteter - Extern undervisning och koordinering av ämne