Forskningsprestation per år
Publikationer 1996 2019
2019
BK polyomavirus viremia and antibody responses of pediatric kidney transplant recipients in Finland
Miettinen, J., Lautenschlager, I., Weissbach, F., Wernli, M., Auvinen, E., Mannonen, L., Lauronen, J., Hirsch, H. H. & Jalanko, H., feb 2019, I : Pediatric Transplantation. 23, 1, 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Mycoplasma pneumoniae outbreak, Southeastern Finland, 2017–2018: molecular epidemiology and laboratory diagnostic lessons
Kurkela, S., Puolakkainen, M., Hokynar, K., Nieminen, T., Saxen, H., Mannonen, L. & Pietikäinen, R., okt 2019, I : European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 38, 10, s. 1867-1871 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Parachlamydia acanthamoebae Detected during a Pneumonia Outbreak in Southeastern Finland, in 2017-2018
Hokynar, K., Kurkela, S., Nieminen, T., Saxen, H., Vesterinen, E. J., Mannonen, L., Pietikäinen, R. & Puolakkainen, M., maj 2019, I : Microorganisms. 7, 5, 9 s., 141.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
The Finnish New Variant of Chlamydia trachomatis with a Single Nucleotide Polymorphism in the 23S rRNA Target Escapes Detection by the Aptima Combo 2 Test
Hokynar, K., Rantakokko-Jalava, K., Hakanen, A., Havana, M., Mannonen, L., Jokela, P., Kurkela, S., Lappalainen, M., Unemo, M. & Puolakkainen, M., aug 2019, I : Microorganisms. 7, 8, 12 s., 227.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Transcriptional Expression of the ompA, cpaf, tarp, and tox Genes of Chlamydia trachomatis Clinical Isolates at Different Stages of the Developmental Cycle
Korhonen, S., Hokynar, K., Mannonen, L., Paavonen, J., Hiltunen-Back, E. & Puolakkainen, M., jun 2019, I : Microorganisms. 7, 6, 11 s., 153.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
2018
BK polyomavirus microRNA expression and sequence variation in polyomavirus-associated nephropathy
Virtanen, E., Seppälä, H., Helanterä, I., Laine, P., Lautenschlager, I., Paulin, L., Mannonen, L., Auvinen, P. & Auvinen, E., maj 2018, I : Journal of Clinical Virology. 102, s. 70-76 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
Genotyping of Hepatitis C virus by nucleotide sequencing: A robust method for a diagnostic laboratory
Virtanen, E., Mannonen, L., Lappalainen, M. & Auvinen, E., 2018, I : MethodsX. 5, s. 414-418 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
Prevalence of Mycoplasma genitalium and mutations associated with macrolide and fluoroquinolone resistance in Finland
Hokynar, K., Hiltunen-Back, E., Mannonen, L. & Puolakkainen, M., aug 2018, I : International Journal of STD & AIDS. 29, 9, s. 904-907 4 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2017
Human herpes virus 6 infection in pediatric organ transplant patients
Ylinen, E., Lehtinen, S., Jahnukainen, T., Karlsson, T., Loginov, R., Mannonen, L., Lautenschlager, I. & Jalanko, H., jun 2017, I : Pediatric Transplantation. 21, 4, 6 s., 12905.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Single-Molecule Sequencing Revealing the Presence of Distinct JC Polyomavirus Populations in Patients With Progressive Multifocal Leukoencephalopathy
Seppälä, H., Virtanen, E., Saarela, M., Laine, P., Paulin, L., Mannonen, L., Auvinen, P. & Auvinen, E., 15 mar 2017, I : Journal of Infectious Diseases. 215, 6, s. 889-895 7 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
2016
High-level JCPyV viruria after kidney transplantation-Clinical and histopathological findings
Helanterä, I., Hirsch, H. H., Auvinen, E., Mannonen, L., Nummi, M., Wernli, M., Ortiz, F., Räisänen-Sokolowski, A., Lempinen, M. & Lautenschlager, I., dec 2016, I : Journal of Clinical Virology. 85, s. 75-79 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
Ripulivirusten pikadiagnostiikka
Loginov, R., Mannonen, L. & Lappalainen, M., 2016, I : Duodecim. 132, 7, s. 648-653 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
Simultaneous BK Polyomavirus (BKPyV)-associated nephropathy and hemorrhagic cystitis after living donor kidney transplantation
Helanterä, I., Hirsch, H. H., Wernli, M., Ortiz, F., Lempinen, M., Räisänen-Sokolowski, A., Auvinen, E., Mannonen, L. & Lautenschlager, I., mar 2016, I : Journal of Clinical Virology. 76, s. 4-7 4 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
2015
Development of a multiplex real-time PCR assay for detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae and mutations associated with macrolide resistance in Mycoplasma pneumoniae from respiratory clinical specimens
Nummi, M., Mannonen, L. & Puolakkainen, M., 10 nov 2015, I : SpringerPlus. 4, 8 s., 684.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
Diffuse gastrointestinal bleeding and BK polyomavirus replication in a pediatric allogeneic haematopoietic stem cell transplant patient
Koskenvuo, M., Lautenschlager, I., Kardas, P., Auvinen, E., Mannonen, L., Huttunen, P., Taskinen, M., Vettenranta, K. & Hirsch, H. H., jan 2015, I : Journal of Clinical Virology. 62, s. 72-74 3 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Expression of BKV and JCV encoded microRNA in human cerebrospinal fluid, plasma and urine
Pietila, T., Nummi, M., Auvinen, P., Mannonen, L. & Auvinen, E., apr 2015, I : Journal of Clinical Virology. 65, s. 1-5 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2014
A Case of Primary JC Polyomavirus Infection-Associated Nephropathy
Lautenschlager, I., Jahnukainen, T., Kardas, P., Lohi, J., Auvinen, E., Mannonen, L., Dumoulin, A., Hirsch, H. H. & Jalanko, H., dec 2014, I : American Journal of Transplantation. 14, 12, s. 2887-2892 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Comparison of Two Quantitative Real-Time CMV-PCR Tests Calibrated Against the 1st WHO International Standard for Viral Load Monitoring of Renal Transplant Patients
Mannonen, L., Loginov, R., Helanterä, I., Dumoulin, A., Vilchez, R. A., Cobb, B., Hirsch, H. H. & Lautenschlager, I., 1 apr 2014, I : Journal of Medical Virology. 86, 4, s. 576-584 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2013
BK polyomavirus-associated hemorrhagic cystitis among pediatric allogeneic bone marrow transplant recipients: Treatment response and evidence for nosocomial transmission
Koskenvuo, M., Dumoulin, A., Lautenschlager, I., Auvinen, E., Mannonen, L., Anttila, V-J., Jahnukainen, K., Saarinen-Pihkala, U. M. & Hirsch, H. H., 1 jan 2013, I : Journal of Clinical Virology. 56, 1, s. 77-81 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2012
BK virus viremia in a well-HLA-matched kidney transplant population mainly on low-dose cyclosporine-based immunosuppression
Helanterä, I., Salmela, K., Kyllönen, L., Räisänen-Sokolowski, A., Auvinen, E., Mannonen, L., Koskinen, P. & Lautenschlager, I., 1 nov 2012, I : Clinical Transplantation. 26, 6, s. E596-E601 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Collaborative study to establish a World Health Organization International genotype panel for parvovirus B19 DNA nucleic acid amplification technology (NAT)-based assays
Baylis, S. A., Ma, L., Padley, D. J., Heath, A. B., Yu, M. W., Collaborative Study Grp, Mannonen, L. E., Lappalainen, M. & Söderlund-Venermo, M., apr 2012, I : Vox Sanguinis. 102, 3, s. 204-211 8 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Development of a new quantitative real-time HHV-6-PCR and monitoring of HHV-6 DNAaemia after liver transplantation
Karlsson, T., Mannonen, L., Loginov, R., Lappalainen, M., Hockerstedt, K. & Lautenschlager, I., 2012, I : Journal of Virological Methods. 181, 1, s. 25-36 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Evaluation of multiplex polymerase chain reaction and microarray-based assay for rapid herpesvirus diagnostics
Mannonen, L., Vainionpaa, R., Kauppinen, J., Lienhard, R., Tritten, M-L., Cannon, G., Hall, W. W., Moilanen, K., Hakkinen, M., Jääskeläinen, A. J., Piiparinen, H., Maki, M., Jarvinen, A-K. & Lappalainen, M., 2012, I : Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 73, 1, s. 74-79 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Performance of the Luminex xTAG Respiratory Viral Panel Fast in a clinical laboratory setting
Jokela, P., Piiparinen, H., Mannonen, L., Auvinen, E. & Lappalainen, M., 2012, I : Journal of Virological Methods. 182, 1-2, s. 82-86 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2011
Analysis of Chlamydia pneumoniae infection in mononuclear cells by reverse transcription-PCR targeted to chlamydial gene transcripts
Mannonen, L., Markkula, E. & Puolakkainen, M., 2011, I : Medical Microbiology and Immunology. 200, 3, s. 143-154 12 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Transcriptional analysis of persistent Chlamydia pneumoniae infection in vitro
Mannonen, L., 2011, Helsinki. 93 s.Forskningsoutput: Avhandling › Doktorsavhandling
Validation and Diagnostic Application of NS and HA Gene-Specific Real-Time Reverse Transcription-PCR Assays for Detection of 2009 Pandemic Influenza A (H1N1) Viruses in Clinical Specimens
Ronkko, E., Ikonen, N., Kontio, M., Haanpaa, M., Kallio-Kokko, H., Mannonen, L., Lappalainen, M., Julkunen, I. & Ziegler, T., 2011, I : Journal of Clinical Microbiology. 49, 5, s. 2009-2011 3 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2010
Genetic Diversity of the 2009 Pandemic Influenza A(H1N1) Viruses in Finland
Ikonen, N., Haanpaa, M., Ronkko, E., Lyytikainen, O., Kuusi, M., Ruutu, P., Kallio-Kokko, H., Mannonen, L., Lappalainen, M., Ziegler, T. & Julkunen, I., 2010, I : PLoS One. 5, 10, s. Article Number: e13329 11 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgång
Fil
2007
Primary human herpesvirus-6 infection in the central nervous system can cause severe disease
Mannonen, L., Herrgård, E., Valmari, P., Rautiainen, P., Uotila, K., Aine, M-R., Karttunen-Lewandowski, P., Sankala, J., Wallden, T. & Koskiniemi, M., 2007, I : Pediatric Neurology. 37, 3, s. 186-191 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Search for Herpesviruses in cerebrospinal fluid of facial palsy patients by PCR
Kanerva, M., Mannonen, L., Piiparinen, H., Peltomaa, M., Vaheri, A. & Pitkäranta, A., 2007, I : Acta Oto-Laryngologica. 127, s. 775-779 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Up-regulation of host cell genes during interferon-gamma-induced persistent Chlamydia pneumoniae infection in HL cells
Mannonen, L., Nikula, T., Haveri, A., Reinikainen, A., Vuola, J. M., Lahesmaa, R. & Puolakkainen, M., 2007, I : Journal of Infectious Diseases. 195, 2, s. 212-219 8 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2004
IFN-gamma induced persistent Chlamydia pneumoniae infection in HL and Mono Mac 6 cells: characterization by real-time quantitative PCR and culture
Mannonen, L., Kamping, E., Penttila, T. & Puolakkainen, M., 2004, I : Microbial Pathogenesis. 36, s. 41-50 10 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2001
Infections of the central nervous system of suspected viral origin: A collaborative study from Finland
Koskiniemi, M., Rantalaiho, T., Piiparinen, H., von Bonsdorff, C. H., Farkkila, M., Jarvinen, A., Kinnunen, E., Koskiniemi, S., Mannonen, L., Muttilainen, M., Linnavuori, K., Porras, J., Puolakkainen, M., Raiha, K., Salonen, E. M., Ukkonen, P., Vaheri, A., Valtonen, V. & Study Grp, 2001, I : Journal of NeuroVirology. 7, s. 400-408 9 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
2000
Keskushermoston virusinfektiot Suomessa
Rantalaiho, T., Bonsdorff, C-H. V., Färkkilä, M., Järvinen, A., Kinnunen, E., Koskiniemi, M-L., Mannonen, L., Muttilainen, M., Linnavuori, K., Porras, J., Puolakkainen, M., Räihä, K., Salonen, E-M., Ukkonen, P., Vaheri, A. & Valtonen, V., 2000, I : Suomen lääkärilehti. s. 2413-20Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig
1999
Geenimonistusmenetelmät virusdiagnostiikassa
Lappalainen, M., Söderlund, M., Piiparinen, H., Puolakkainen, M., Mannonen, L., Suni, J., Bonsdorff, C-H. V., Koskiniemi, M., Hyypiä, T., Vaheri, A. & Hedman, K., 1999, I : Duodecim. 115, 9, s. 1031-1036 6 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig
1997
Chlamydia trachomatis detected in human placenta
Gencay, M., Puolakkainen, M., Wahlstrom, T., Ammala, P., Mannonen, L., Vaheri, A. & Koskiniemi, M. L., 1997, I : American Journal of Clinical Pathology. 50, s. 852-855 4 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
1996
Herpes encephalitis is a disease of middle aged and elderly people: Polymerase chain reaction for detection of herpes simplex virus in the CSF of 516 patients with encephalitis
Koskiniemi, M., Piiparinen, H., Mannonen, L., Rantalaiho, T., Vaheri, A., Mannila, S., Uotila, K., Koivu, M., Mustonen, K., Junes, M., Keranen, ML., Aine, MR., Nyman, D., Udd, B., Byring, R., Valpas, J., Saari, R., Taalas, J., Selonen, A., Myllyla, V. & 30 andra, , feb 1996, I : Journal of Neurology, Neurosurgery and Psychiatry. 60, 2, s. 174-178 5 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review