• PL 68 (Pietari Kalmin katu 5)

    00014

    Finland

  • Finland

20032019
Om du gjort några ändringar i Pure kommer de visas här snart.

Personlig profil

Information om forskning och undervisning

I am a postdoctoral researcher at the Department of Computer Science. My research interests include string algorithms and bioinformatics. Currently I work especially with problems related to genome assembly.

Vetenskapsgrenar

  • 113 Data- och informationsvetenskap

Internationellt och inhemskt samarbete Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.

Publikationer 2003 2019

Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs

Salmela, L., Walve, R., Rivals, E. & Ukkonen, E., 15 mar 2017, I : Bioinformatics. 33, 6, s. 799-806 8 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Disentangled long-read de Bruijn graphs via optical maps

Alipahani, B., Salmela, L., Puglisi, S. J., Muggli, M. & Boucher, C., 2017, 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, WABI 2017. Schwartz, R. & Reinert, K. (red.). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1:1-1:14 14 s. (Leibniz International Proceedings in Informatics; vol. 88).

Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandlingKonferensbidragVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Variant genotyping with gap filling

Walve, R., Salmela, L. & Mäkinen, V., 8 sep 2017, I : PLoS One. 12, 9, 12 s., e0184608.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Colib'read on galaxy: a tools suite dedicated to biological information extraction from raw NGS reads

Le Bras, Y., Collin, O., Monjeaud, C., Lacroix, V., Rivals, E., Lemaitre, C., Miele, V., Sacomoto, G., Marchet, C., Cazaux, B., El Aabidine, A. Z., Salmela, L., Alves-Carvalho, S., Andrieux, A., Uricaru, R. & Peterlongo, P., 11 feb 2016, I : GigaScience. 5, 14 s., 9.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Gap Filling as Exact Path Length Problem

Salmela, L., Sahlin, K., Mäkinen, V. & Tomescu, A. I., 9 maj 2016, I : Journal of Computational Biology. 23, 5, s. 347-361 15 s.

Forskningsoutput: TidskriftsbidragArtikelVetenskapligPeer review

Öppen tillgång
Fil

Priser

Award for best paper submitted to HiTSeq 2010

Leena Salmela (!!Recipient), 10 jul 2010

Pris: Pris och hedersbetygelser

Aktiviteter 2009 2019

ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics (Evenemang)

Leena Salmela (Medlem av programkommitté)
20 aug 201723 aug 2017

Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbeteReferentgranskning av manuskript

University of Florida

Leena Salmela (Besökande forskare)
24 aug 20171 sep 2017

Aktivitet: Typer för besök till extern institutionAkademisk besök på annan institution

International Workshop on Combinatorial Algorithms

Leena Salmela (Ordförande i organisationskommitté)
17 aug 201619 aug 2016

Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemangArrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium

International Symposium on String Processing and Information Retrieval (Evenemang)

Leena Salmela (Medlem av programkommitté)
2016 → …

Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbeteReferentgranskning av manuskript

Colorado State University

Leena Salmela (Besökande forskare)
23 apr 20165 maj 2016

Aktivitet: Typer för besök till extern institutionAkademisk besök på annan institution

Press / media

Glanville fritillary genome sequenced at the University of Helsinki

Pasi Rastas & Leena Salmela

05/09/2014

2 objekt av Mediabevakning

Press/media: !!Press / Media

Glanville Fritillary Genome Sequenced at the University of Helsinki

Pasi Rastas & Leena Salmela

05/09/2014

1 objekt av Mediabevakning

Press/media: !!Press / Media