Forskningsresultat per år
Forskningsresultat per år
Personlig profil
Information om forskning och undervisning
I am a postdoctoral researcher at the Department of Computer Science. My research interests include string algorithms and bioinformatics. Currently I work especially with problems related to genome assembly.
Vetenskapsgrenar
- 113 Data- och informationsvetenskap
Internationellt och inhemskt samarbete
Publikationer och projekt inom de senaste fem åren.
-
Accurate self-correction of errors in long reads using de Bruijn graphs
Salmela, L., Walve, R., Rivals, E. & Ukkonen, E., 15 mars 2017, I: Bioinformatics. 33, 6, s. 799-806 8 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Disentangled long-read de Bruijn graphs via optical maps
Alipahani, B., Salmela, L., Puglisi, S. J., Muggli, M. & Boucher, C., 2017, 17th International Workshop on Algorithms in Bioinformatics, WABI 2017. Schwartz, R. & Reinert, K. (red.). Dagstuhl: Schloss Dagstuhl - Leibniz-Zentrum für Informatik, s. 1:1-1:14 14 s. (Leibniz International Proceedings in Informatics; vol. 88).Forskningsoutput: Kapitel i bok/rapport/konferenshandling › Konferensbidrag › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Variant genotyping with gap filling
Walve, R., Salmela, L. & Mäkinen, V., 8 sep. 2017, I: PLoS One. 12, 9, 12 s., e0184608.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Colib'read on galaxy: a tools suite dedicated to biological information extraction from raw NGS reads
Le Bras, Y., Collin, O., Monjeaud, C., Lacroix, V., Rivals, E., Lemaitre, C., Miele, V., Sacomoto, G., Marchet, C., Cazaux, B., El Aabidine, A. Z., Salmela, L., Alves-Carvalho, S., Andrieux, A., Uricaru, R. & Peterlongo, P., 11 feb. 2016, I: GigaScience. 5, 14 s., 9.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil -
Gap Filling as Exact Path Length Problem
Salmela, L., Sahlin, K., Mäkinen, V. & Tomescu, A. I., 9 maj 2016, I: Journal of Computational Biology. 23, 5, s. 347-361 15 s.Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review
Öppen tillgångFil
Priser
-
Award for best paper submitted to HiTSeq 2010
Salmela, Leena (!!Recipient), 10 juli 2010
Pris: Pris och hedersbetygelser
Aktiviteter
-
ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics (Evenemang)
Leena Salmela (Medlem av programkommitté)
20 aug. 2017 → 23 aug. 2017Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
University of Florida
Leena Salmela (Besökande forskare)
24 aug. 2017 → 1 sep. 2017Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution
-
International Workshop on Combinatorial Algorithms
Leena Salmela (Ordförande i organisationskommitté)
17 aug. 2016 → 19 aug. 2016Aktivitet: Typer för deltagande i eller organisering av evenemang › Arrangemang av och deltagande i konferens/workshop/kurs/seminarium
-
International Symposium on String Processing and Information Retrieval (Evenemang)
Leena Salmela (Medlem av programkommitté)
2016 → …Aktivitet: Typer för peer review av output och redaktionsarbete › Referentgranskning av manuskript
-
Colorado State University
Leena Salmela (Besökande forskare)
23 apr. 2016 → 5 maj 2016Aktivitet: Typer för besök till extern institution › Akademisk besök på annan institution