Addressing pandemic-wide systematic errors in the SARS-CoV-2 phylogeny

Hunt, M., Hinrichs, A. S., Anderson, D., Karim, L., Dearlove, B. L., Knaggs, J., Constantinides, B., Fowler, P. W., Rodger, G., Street, T. L., Lumley, S. F., Webster, H., Sanderson, T., Ruis, C., Maio, N. D., Amenga-Etego, L. N., Amuzu, D. S., Avaro, M., Awandare, G. A. & Ayivor-Djanie, R. & 76 andra, Bashton, M., Batty, E. M., Bediako, Y., Belder, D. D., Benedetti, E., Bergthaler, A., Boers, S. A., Campos, J., Carr, R. A. A., Cuba, F., Dattero, M. E., Dejnirattisai, W., Dilthey, A. T., Duedu, K. O., Endler, L., Engelmann, I., Francisco, N. M., Fuchs, J., Z., E. G., Groc, S., Gyamfi, J., Heemskerk, D., Houwaart, T., Hsiao, N.-Y., Huska, M., Hoelzer, M., Iranzadeh, A., Jarva, H., Jeewandara, C., Jolly, B., Joseph, R., Kant, R., Ki, K. K. K., Kurkela, S., Lappalainen, M., Lataretu, M., Liu, C., Malavige, G. N., Mashe, T., Mongkolsapaya, J., Montes, B., Molina-Mora, J. A., Morang'a, C. M., Mvula, B., Nagarajan, N., Nelson, A., Ngoi, J. M., Paixao, J. P. D., Panning, M., Poklepovich, T., Quashie, P. K., Ranasinghe, D., Russo, M., San, J. E., Sanderson, N. D., Scaria, V., Screaton, G., Sironen, T., Sisay, A., Smith, D., Smura, T., Supasa, P., Suphavilai, C., Swann, J., Tegally, H., Tegomoh, B., Vapalahti, O., Walker, A., Wilkinson, R., Williamson, C., Consortium, I. L. N., Oliveira, T. D., Peto, T. E., Crook, D., Corbett-Detig, R. & Iqbal, Z., 9 feb. 2026, I: Nature methods.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Influenza A(H5N8) vaccine induces humoral and cell-mediated immunity against highly pathogenic avian influenza clade 2.3.4.4b A(H5N1) viruses in at-risk individuals

Liedes, O., Reinholm, A., Ekström, N., Haveri, A., Solastie, A., Vara, S., Rijnink, W. F., Bestebroer, T. M., Richard, M., de Vries, R. D., Jalkanen, P., Lindh, E., Ikonen, N., Grifoni, A., Sette, A., Laaksonen, T., Holopainen, R. H., Kakkola, L., Lappalainen, M. & Syrjänen, R. K. & 4 andra, Kolehmainen, P., Julkunen, I., Nohynek, H. & Melin, M., jan. 2026, I: Nature Microbiology. 11, 1, s. 155-168 30 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Intrahost Monkeypox Virus Genome Variation in Patient with Early Infection, Finland, 2022

Vauhkonen, H., Kallio-Kokko, H., Hiltunen-Back, E., Lönnqvist, L., Leppäaho-Lakka, J., Mannonen, L., Kant, R., Sironen, T., Kurkela, S., Lappalainen, M., Zorec, T. M., Zakotnik, S., Vlaj, D., Korva, M., Avšič-Županc, T., Poljak, M., Smura, T. & Vapalahti, O., mars 2023, I: Emerging Infectious Diseases. 29, 3, s. 649-652 4 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Brev › Vetenskaplig › Peer review

Long-term outcome of vestibular function and hearing in children with congenital cytomegalovirus infection: a prospective cohort study

Kokkola, E., Niemensivu, R., Lappalainen, M., Palomäki, M., Nieminen, T., Boppana, S., Saxen, H. & Puhakka, L., juli 2023, I: European Archives of Oto-Rhino-Laryngology. 280, 7, s. 3141-3147 7 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review

Low incidence of severe bacterial infections in hospitalised patients with COVID-19: A population-based registry study

Ahava, M. J., Kortela, E., Forsblom, E., Pätäri-Sampo, A., Friberg, N., Meretoja, A., Kivivuori, S.-M., Lappalainen, M., Kurkela, S., Järvinen, A. & Jarva, H., 2023, I: Infectious Diseases. 55, 2, s. 132-141 10 s.

Forskningsoutput: Tidskriftsbidrag › Artikel › Vetenskaplig › Peer review